Q16655 (MAR1_HUMAN) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
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December 14, 2011.
Version 83.
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| Protein names | Recommended name: Melanoma antigen recognized by T-cells 1 Short name=MART-1 Alternative name(s): Antigen LB39-AA Antigen SK29-AA Protein Melan-A | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 118 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Involved in melanosome biogenesis by ensuring the stability of GPR143. Plays a vital role in the expression, stability, trafficking, and processing of melanocyte protein PMEL, which is critical to the formation of stage II melanosomes. Ref.6 Ref.7 |
| Subunit structure | |
| Subcellular location | Endoplasmic reticulum membrane; Single-pass type III membrane protein. Golgi apparatus. Golgi apparatus › trans-Golgi network membrane. Melanosome. Note: Also found in small vesicles and tubules dispersed over the entire cytoplasm. A small fraction of the protein is inserted into the membrane in an inverted orientation. Inversion of membrane topology results in the relocalization of the protein from a predominant Golgi/post-Golgi area to the endoplasmic reticulum. Melanoma cells expressing the protein with an inverted membrane topology are more effectively recognized by specific cytolytic T-lymphocytes than those expressing the protein in its native membrane orientation. Ref.4 Ref.5 Ref.6 |
| Tissue specificity | Expression is restricted to melanoma and melanocyte cell lines and retina. |
| Post-translational modification | Acylated. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Cellular component | Endoplasmic reticulum Golgi apparatus Membrane |
| Domain | Transmembrane Transmembrane helix |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Cellular component | endoplasmic reticulum membrane Inferred from direct assay Ref.6. Source: UniProtKB integral to plasma membraneTraceable author statement. Source: ProtInc melanosomeInferred from direct assay Ref.6. Source: UniProtKB trans-Golgi networkInferred from direct assay Ref.5. Source: UniProtKB |
| Molecular function | protein binding Inferred from physical interaction Ref.6Ref.7. Source: UniProtKB |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
Sequences
References
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| [1] | "Cloning of the gene coding for a shared human melanoma antigen recognized by autologous T cells infiltrating into tumor." Kawakami Y., Eliyahu S., Delgado C.H., Robbins P.F., Rivoltini L., Topalian S.L., Miki T., Rosenberg S.A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91:3515-3519(1994) [PubMed: 8170938] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA]. Tissue: Melanoma. |
| [2] | "A new gene coding for a differentiation antigen recognized by autologous cytolytic T lymphocytes on HLA-A2 melanomas." Coulie P.G., Brichard V., van Pel A., Woelfel T., Schneider J., Traversari C., Mattei S., de Plaen E., Lurquin C., Szikora J.-P., Renauld J.-C., Boon T. J. Exp. Med. 180:35-42(1994) [PubMed: 8006593] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA]. |
| [3] | "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)." The MGC Project Team Genome Res. 14:2121-2127(2004) [PubMed: 15489334] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA]. Tissue: Skin. |
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| [6] | "MART-1 is required for the function of the melanosomal matrix protein PMEL17/GP100 and the maturation of melanosomes." Hoashi T., Watabe H., Muller J., Yamaguchi Y., Vieira W.D., Hearing V.J. J. Biol. Chem. 280:14006-14016(2005) [PubMed: 15695812] [Abstract] Cited for: FUNCTION, SUBCELLULAR LOCATION, INTERACTION WITH SILV. |
| [7] | "The ocular albinism type 1 (OA1) G-protein-coupled receptor functions with MART-1 at early stages of melanogenesis to control melanosome identity and composition." Giordano F., Bonetti C., Surace E.M., Marigo V., Raposo G. Hum. Mol. Genet. 18:4530-4545(2009) [PubMed: 19717472] [Abstract] Cited for: FUNCTION, INTERACTION WITH GPR143. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | U06452 mRNA. Translation: AAA19238.1. U06654 mRNA. Translation: AAA20389.1. BC014423 mRNA. Translation: AAH14423.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IPI | IPI00003426. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | A55253. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_005502.1. NM_005511.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.154069. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
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| ProteinModelPortal | Q16655. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IntAct | Q16655. 1 interaction. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| STRING | Q16655. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | Q16655. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DMDM | 2833278. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | Q16655. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENST00000381471; ENSP00000370880; ENSG00000120215. ENST00000381476; ENSP00000370885; ENSG00000120215. ENST00000381477; ENSP00000370886; ENSG00000120215. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 2315. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:2315. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UCSC | uc003zjo.1. human. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CTD | 2315. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | GC09P005846. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| H-InvDB | HIX0007904. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:7124. MLANA. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HPA | CAB000057. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MIM | 605513. gene. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| neXtProt | NX_Q16655. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA30842. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| eggNOG | prNOG20940. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | HBG715506. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | HBG006327. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InParanoid | Q16655. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OMA | IHAGTQS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OrthoDB | EOG4FTW23. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PhylomeDB | Q16655. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | Q16655. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Bgee | Q16655. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_MLANA. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genevestigator | Q16655. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000120215. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 9401. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | MAR1_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q16655 | ||||||||
| Entry history |
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| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Chordata Protein Annotation Program | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
Relevant documents
| Human chromosome 9 Human chromosome 9: entries, gene names and cross-references to MIM |
| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |

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