Q16186 (ADRM1_HUMAN) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
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May 1, 2013.
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| Protein names | Recommended name: Proteasomal ubiquitin receptor ADRM1 Alternative name(s): 110 kDa cell membrane glycoprotein Short name=Gp110 Adhesion-regulating molecule 1 Short name=ARM-1 Proteasome regulatory particle non-ATPase 13 Short name=hRpn13 Rpn13 homolog | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Reference proteome] | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 407 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Functions as a proteasomal ubiquitin receptor. Recruits the deubiquitinating enzyme UCHL5 at the 26S proteasome and promotes its activity. Ref.2 Ref.5 Ref.6 Ref.8 Ref.11 |
| Subunit structure | Interacts with PSMD1, ubiquitin and UCHL5. Ref.2 Ref.5 Ref.6 Ref.8 Ref.11 |
| Subcellular location | |
| Domain | The PH domain mediates interactions with PSMD1 and ubiquitin. Preferential binding to the proximal subunit of K48-linked diubiquitin allows UCHL5 access to the distal subunit By similarity. |
| Sequence similarities | Belongs to the ADRM1 family. Contains 1 PH domain. |
| Caution | Although initially described as a cell membrane glycoprotein, ADRM1 is intracellular and non-glycosylated, and has probably no direct role in cell adhesion. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Cellular component | Cytoplasm Nucleus Proteasome |
| PTM | Isopeptide bond Phosphoprotein Ubl conjugation |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological_process | proteasome assembly Inferred from direct assay Ref.2. Source: UniProtKB transcription elongation from RNA polymerase II promoterInferred from mutant phenotype PubMed 11818576. Source: UniProtKB |
| Cellular_component | cytoplasm Inferred from direct assay. Source: HPA integral to plasma membraneTraceable author statement Ref.1. Source: ProtInc nucleusInferred from direct assay. Source: HPA proteasome complexInferred from direct assay Ref.2. Source: UniProtKB |
| Molecular_function | endopeptidase activator activity Inferred from direct assay Ref.2. Source: UniProtKB proteasome bindingInferred from direct assay PubMed 18162577. Source: UniProtKB |
| Complete GO annotation... | |
Binary interactions
With | Entry | #Exp. | IntAct | Notes |
|---|---|---|---|---|
| UCHL5 | Q9Y5K5 | 7 | EBI-954387,EBI-1051183 |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 407 | 407 | Proteasomal ubiquitin receptor ADRM1 | PRO_0000020631 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 22 – 130 | 109 | PH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 1 – 132 | 132 | Interaction with PSMD1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 362 – 407 | 46 | Interaction with UCHL5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Compositional bias | 135 – 202 | 68 | Gly-rich | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Compositional bias | 193 – 257 | 65 | Ser-rich | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Compositional bias | 203 – 213 | 11 | Poly-Ser | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 211 | 1 | Phosphoserine Ref.12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 213 | 1 | Phosphoserine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 217 | 1 | Phosphothreonine Ref.7 Ref.12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cross-link | 34 | Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in ubiquitin) Ref.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 142 | 1 | S → T in BAA11023. Ref.1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 23 – 26 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 28 – 40 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 45 – 51 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 57 – 66 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 69 – 75 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 79 – 84 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 89 – 91 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 93 – 98 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 99 – 101 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 104 – 109 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 114 – 116 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 117 – 129 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 191 – 195 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 202 – 204 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 249 – 253 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 254 – 256 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 266 – 273 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 276 – 278 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 282 – 284 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 285 – 291 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 294 – 296 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 298 – 302 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 304 – 313 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 324 – 328 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 334 – 348 | 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 350 – 352 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 353 – 358 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 363 – 371 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 374 – 384 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 386 – 388 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
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| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | D64154 mRNA. Translation: BAA11023.1. AL354836 Genomic DNA. Translation: CAC22308.1. BR000321 mRNA. Translation: FAA00246.1. BC010733 mRNA. Translation: AAH10733.1. BC017245 mRNA. Translation: AAH17245.1. | ||||||||||||||||||||||||
| IPI | IPI00033030. | ||||||||||||||||||||||||
| PIR | I52703. | ||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_008933.2. NM_007002.2. NP_783163.1. NM_175573.1. | ||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.90107. | ||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | Q16186. | ||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||
| DIP | DIP-42668N. | ||||||||||||||||||||||||
| IntAct | Q16186. 10 interactions. | ||||||||||||||||||||||||
| MINT | MINT-2869171. | ||||||||||||||||||||||||
| STRING | 9606.ENSP00000253003. | ||||||||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | Q16186. | ||||||||||||||||||||||||
Polymorphism databases | |||||||||||||||||||||||||
| DMDM | 20141265. | ||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||
| PaxDb | Q16186. | ||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | Q16186. | ||||||||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||||||||
| DNASU | 11047. | ||||||||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENST00000253003; ENSP00000253003; ENSG00000130706. | ||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 11047. | ||||||||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:11047. | ||||||||||||||||||||||||
| UCSC | uc002ycn.3. human. | ||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||
| CTD | 11047. | ||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | GC20P060877. | ||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:15759. ADRM1. | ||||||||||||||||||||||||
| HPA | HPA042266. | ||||||||||||||||||||||||
| MIM | 610650. gene. | ||||||||||||||||||||||||
| neXtProt | NX_Q16186. | ||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA24599. | ||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||
| eggNOG | NOG288027. | ||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | HOG000005947. | ||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | HBG073518. | ||||||||||||||||||||||||
| InParanoid | Q16186. | ||||||||||||||||||||||||
| OMA | MNVPAGP. | ||||||||||||||||||||||||
| OrthoDB | EOG4QZ7MN. | ||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||
| Bgee | Q16186. | ||||||||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_ADRM1. | ||||||||||||||||||||||||
| Genevestigator | Q16186. | ||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000130706. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR006773. 26S_Psome_Ubiquitin-recp_Rpn13. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| PANTHER | PTHR12225. PTHR12225. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF04683. Proteasom_Rpn13. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS50003. PH_DOMAIN. False negative. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Other | |||||||||||||||||||||||||
| EvolutionaryTrace | Q16186. | ||||||||||||||||||||||||
| GenomeRNAi | 11047. | ||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 41984. | ||||||||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | ADRM1_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q16186 Secondary accession number(s): A0PKB1, Q96FJ7, Q9H1P2 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Chordata Protein Annotation Program | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
Relevant documents
| Human chromosome 20 Human chromosome 20: entries, gene names and cross-references to MIM |
| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with
