Q14315 (FLNC_HUMAN) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
May 1, 2013.
Version 145.
History...
Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Interactions·Alt products·Sequence annotation·Sequences·References·Web links·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize order
Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Interactions·Alt products·Sequence annotation·Sequences·References·Web links·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize orderNames and origin
| Protein names | Recommended name: Filamin-C Short name=FLN-C Short name=FLNc Alternative name(s): ABP-280-like protein ABP-L Actin-binding-like protein Filamin-2 Gamma-filamin | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Reference proteome] | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 2725 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Muscle-specific filamin, which plays a central role in muscle cells, probably by functioning as a large actin-cross-linking protein. May be involved in reorganizing the actin cytoskeleton in response to signaling events, and may also display structural functions at the Z lines in muscle cells. Critical for normal myogenesis and for maintaining the structural integrity of the muscle fibers. |
| Subunit structure | Homodimer. Interacts with KY. Interacts with IGFN1 By similarity. Interacts with FLNB, KCND2, ITGB1A, INPPL1, MYOT, MYOZ1 and MYOZ3. Interacts with sarcoglycans SGCD and SGCG. Interacts (via filament repeats 17-18, 20-21 and 24) with USP25 (isoform USP25m only). Interacts with FBLIM1. Ref.4 Ref.10 Ref.11 Ref.12 Ref.13 Ref.14 Ref.17 Ref.18 Ref.20 Ref.21 Ref.22 Ref.30 |
| Subcellular location | Cytoplasm. Membrane; Peripheral membrane protein. Cytoplasm › cytoskeleton. Cytoplasm › myofibril › sarcomere › Z line. Note: A small amount localizes at membranes. In striated muscle cells, it predominantly localizes in myofibrillar Z lines, while a minor fraction localizes with subsarcolemme. Ref.11 |
| Tissue specificity | Highly expressed in striated muscles. Weakly expressed in thyroid, fetal brain, fetal lung, retina, spinal cord and bone marrow. Not expressed in testis, pancreas, adrenal gland, placenta, liver and kidney. Ref.1 Ref.9 Ref.11 |
| Developmental stage | Expressed in both differentiating and adult muscles. |
| Domain | The intradomain insert is specific to FLNC and mediates the targeting to developing and mature Z lines. Ref.11 Comprised of a N-terminal actin-binding domain, 24 internally homologous repeats and two hinge regions. Repeat 24 and the second hinge domain are important for dimer formation. Ref.11 The filamin 20 repeat mediates interaction with XIRP1. Ref.11 |
| Post-translational modification | Ubiquitinated by FBXL22, leading to proteasomal degradation. Ref.27 |
| Involvement in disease | Myopathy, myofibrillar, 5 (MFM5) [MIM:609524]: A neuromuscular disorder, usually with an adult onset, characterized by focal myofibrillar destruction, pathological cytoplasmic protein aggregations, and clinical features of a limb-girdle myopathy. Myopathy, distal, 4 (MPD4) [MIM:614065]: A slowly progressive muscular disorder characterized by distal muscle weakness and atrophy affecting the upper and lower limbs. Onset occurs around the third to fourth decades of life, and patients remain ambulatory even after long disease duration. Muscle biopsy shows non-specific changes with no evidence of rods, necrosis, or inflammation. |
| Miscellaneous | Silenced in MKN28 and MKN74 gastric cancer cell lines due to aberrant methylation of the gene. |
| Sequence similarities | Belongs to the filamin family. Contains 1 actin-binding domain. Contains 2 CH (calponin-homology) domains. Contains 24 filamin repeats. |
| Sequence caution | The sequence AAD12245.1 differs from that shown. Reason: Erroneous initiation. Translation N-terminally extended. The sequence AAF68195.1 differs from that shown. Reason: Erroneous initiation. Translation N-terminally extended. The sequence AAF80245.1 differs from that shown. Reason: Frameshift at positions 2578, 2580 and 2590. The sequence CAA49688.1 differs from that shown. Reason: Frameshift at positions 778 and 787. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Cellular component | Cytoplasm Cytoskeleton Membrane |
| Coding sequence diversity | Alternative splicing Polymorphism |
| Disease | Disease mutation Myofibrillar myopathy |
| Domain | Repeat |
| Ligand | Actin-binding |
| PTM | Phosphoprotein Ubl conjugation |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Direct protein sequencing Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological_process | cell junction assembly Traceable author statement. Source: Reactome muscle fiber developmentInferred from electronic annotation. Source: Compara |
| Cellular_component | Z disc Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-SubCell costamereTraceable author statement PubMed 21223964. Source: BHF-UCL cytoskeletonInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-SubCell cytosolTraceable author statement. Source: Reactome sarcolemmaInferred from direct assay PubMed 21223964. Source: BHF-UCL sarcoplasmInferred from electronic annotation. Source: Compara |
| Complete GO annotation... | |
Binary interactions
With | Entry | #Exp. | IntAct | Notes |
|---|---|---|---|---|
| ABL1 | P00519 | 2 | EBI-489954,EBI-375543 | |
| CRK | P46108 | 2 | EBI-489954,EBI-886 | |
| DYSF | O75923 | 3 | EBI-489954,EBI-2799016 | |
| GRB2 | P62993 | 2 | EBI-489954,EBI-401755 | |
| MYOT | Q9UBF9 | 6 | EBI-489954,EBI-296701 |
Alternative products
| This entry describes 2 isoforms produced by alternative splicing. [Align] [Select] | ||||||
| Isoform 1 (identifier: Q14315-1) This isoform has been chosen as the 'canonical' sequence. All positional information in this entry refers to it. This is also the sequence that appears in the downloadable versions of the entry. | ||||||
| Isoform 2 (identifier: Q14315-2) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 1734-1766: Missing. |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 2725 | 2725 | Filamin-C | PRO_0000087301 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 1 – 259 | 259 | Actin-binding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 36 – 142 | 107 | CH 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 159 – 259 | 101 | CH 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 270 – 368 | 99 | Filamin 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 370 – 468 | 99 | Filamin 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 469 – 565 | 97 | Filamin 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 566 – 658 | 93 | Filamin 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 662 – 758 | 97 | Filamin 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 759 – 861 | 103 | Filamin 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 862 – 960 | 99 | Filamin 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 961 – 1056 | 96 | Filamin 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 1057 – 1149 | 93 | Filamin 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 1150 – 1244 | 95 | Filamin 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 1245 – 1344 | 100 | Filamin 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 1345 – 1437 | 93 | Filamin 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 1438 – 1533 | 96 | Filamin 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 1534 – 1630 | 97 | Filamin 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 1635 – 1734 | 100 | Filamin 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 1759 – 1853 | 95 | Filamin 16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 1854 – 1946 | 93 | Filamin 17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 1947 – 2033 | 87 | Filamin 18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 2036 – 2128 | 93 | Filamin 19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 2244 – 2306 | 63 | Filamin 20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 2309 – 2401 | 93 | Filamin 21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 2403 – 2496 | 94 | Filamin 22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 2500 – 2592 | 93 | Filamin 23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 2630 – 2724 | 95 | Filamin 24 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 1735 – 1758 | 24 | Hinge 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 2162 – 2243 | 82 | Intradomain insert | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 2403 – 2724 | 322 | Interaction with INPPL1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 2593 – 2725 | 133 | Self-association site, tail By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 2593 – 2629 | 37 | Hinge 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 1161 | 1 | Phosphoserine Ref.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 2233 | 1 | Phosphoserine Ref.8 Ref.24 Ref.26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 1734 – 1766 | 33 | Missing in isoform 2. | VSP_007579 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 193 | 1 | A → T in MPD4; results in slightly decreased thermal stability and increased actin-binding activity; results in significantly decreased nuclear localization with formation of intracellular protein aggregates. Ref.32 | VAR_066212 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 251 | 1 | M → T in MPD4; results in slightly decreased thermal stability and increased actin-binding activity; results in the formation of intracellular protein aggregates. Ref.32 | VAR_066213 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 1567 | 1 | R → Q. Corresponds to variant rs2291569 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_015705 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 1580 | 1 | D → G. Ref.1 Ref.3 Corresponds to variant rs2643766 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_015706 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 1599 | 1 | T → A. Ref.1 Ref.3 Corresponds to variant rs2643767 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_015707 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 2135 | 1 | K → R. Ref.3 Corresponds to variant rs1063261 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_015708 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 2203 | 1 | R → P. Ref.1 Ref.3 Corresponds to variant rs1063262 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_015709 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 2626 | 1 | S → N. Corresponds to variant rs2639142 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_015710 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 2637 | 1 | K → Q. Corresponds to variant rs2291572 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_015711 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 2669 | 1 | M → D: Abolishes dimerization. Ref.28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 138 | 1 | I → T in CAB46442. Ref.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 189 | 1 | K → E in CAB46442. Ref.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 194 | 1 | L → Q in CAB46442. Ref.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 218 | 1 | A → S in AAD12245. Ref.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 218 | 1 | A → S in AAF68195. Ref.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 233 | 1 | Q → L in CAB46442. Ref.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 484 | 1 | L → P in CAB46442. Ref.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 585 | 1 | Q → V in CAA49688. Ref.9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 723 | 1 | D → N in AAD12245. Ref.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 723 | 1 | D → N in AAF68195. Ref.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 723 | 1 | D → N in CAA49688. Ref.9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 1091 | 1 | G → D in CAB46442. Ref.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 1640 | 1 | L → T in CAA49689. Ref.9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 1668 | 1 | V → M in CAB46442. Ref.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 2101 | 1 | C → S in CAB46442. Ref.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 2101 | 1 | C → S in CAA49689. Ref.9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 2321 – 2322 | 2 | GT → RA in AAD12245. Ref.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 2321 – 2322 | 2 | GT → RA in AAF68195. Ref.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 2355 | 1 | S → N in AAF80245. Ref.4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 2382 | 1 | E → K in AAF80245. Ref.4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 2484 | 1 | G → C in AAF80245. Ref.4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 2491 | 1 | P → L in AAF80245. Ref.4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 2499 | 1 | Q → H in AAF80245. Ref.4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 2514 | 1 | G → E in AAF80245. Ref.4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 2528 – 2530 | 3 | VNT → DDH in AAF80245. Ref.4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 2535 | 1 | S → F in AAF80245. Ref.4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 2547 | 1 | K → N in AAF80245. Ref.4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 2557 | 1 | E → G in AAF80245. Ref.4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 2601 – 2602 | 2 | HS → QH in AAF80245. Ref.4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 1539 – 1541 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 1542 – 1547 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 1554 – 1558 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 1560 – 1569 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 1574 – 1579 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 1588 – 1592 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 1594 – 1596 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 1598 – 1602 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 1608 – 1618 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 1625 – 1631 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 1785 – 1789 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 1794 – 1796 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 1798 – 1803 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 1813 – 1816 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 1818 – 1820 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 1822 – 1826 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 1832 – 1843 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 1849 – 1854 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 1863 – 1866 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 1867 – 1870 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 1871 – 1873 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 1878 – 1883 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 1885 – 1887 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 1895 – 1900 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 1910 – 1918 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 1924 – 1929 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 1931 – 1934 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 1941 – 1947 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 2303 – 2308 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 2313 – 2316 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 2318 – 2322 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 2323 – 2325 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 2332 – 2338 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 2344 – 2355 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 2358 – 2362 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 2365 – 2374 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 2377 – 2389 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 2396 – 2404 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 2407 – 2410 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 2427 – 2432 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 2440 – 2445 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 2447 – 2449 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 2463 – 2468 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 2474 – 2484 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 2491 – 2496 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 2505 – 2507 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 2509 – 2512 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 2513 – 2515 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 2517 – 2519 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 2524 – 2529 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 2531 – 2533 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 2538 – 2546 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 2549 – 2555 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 2558 – 2564 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 2569 – 2580 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 2587 – 2594 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 2635 – 2637 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 2639 – 2642 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 2643 – 2645 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 2654 – 2659 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 2663 – 2665 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 2668 – 2673 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 2675 – 2677 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 2680 – 2686 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 2691 – 2697 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 2702 – 2710 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 2719 – 2724 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "Molecular cloning of human ABPL, an actin-binding protein homologue." Xie Z.-W., Xu W.-F., Davie E.W., Chung D.W. Biochem. Biophys. Res. Commun. 251:914-919(1998) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ISOFORM 1), TISSUE SPECIFICITY, VARIANTS GLY-1580; ALA-1599 AND PRO-2203. Tissue: Heart. |
| [2] | "Genomic structure and fine mapping of the two human filamin gene paralogues FLNB and FLNC and comparative analysis of the filamin gene family." Chakarova C., Wehnert M.S., Uhl K., Sakthivel S., Vosberg H.-P., van der Ven P.F.M., Fuerst D.O. Hum. Genet. 107:597-611(2000) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA] (ISOFORM 1), GENE ORGANIZATION, SIMILARITY TO OTHER MEMBERS OF THE FAMILY. |
| [3] | "Characterization of muscle filamin isoforms suggests a possible role of gamma-filamin/ABP-L in sarcomeric Z-disc formation." van der Ven P.F.M., Obermann W.M.J., Lemke B., Gautel M., Weber K., Fuerst D.O. Cell Motil. Cytoskeleton 45:149-162(2000) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ISOFORM 2), VARIANTS GLY-1580; ALA-1599; ARG-2135 AND PRO-2203. |
| [4] | "Filamin 2 (FLN2): a muscle-specific sarcoglycan interacting protein." Thompson T.G., Chan Y.-M., Hack A.A., Brosius M., Rajala M., Lidov H.G.W., McNally E.M., Watkins S., Kunkel L.M. J. Cell Biol. 148:115-126(2000) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ISOFORM 2), INTERACTION WITH SGCD AND SGCG. Tissue: Skeletal muscle. |
| [5] | Kato S. Submitted (DEC-2007) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ISOFORM 1). |
| [6] | "The DNA sequence of human chromosome 7." Hillier L.W., Fulton R.S., Fulton L.A., Graves T.A., Pepin K.H., Wagner-McPherson C., Layman D., Maas J., Jaeger S., Walker R., Wylie K., Sekhon M., Becker M.C., O'Laughlin M.D., Schaller M.E., Fewell G.A., Delehaunty K.D., Miner T.L. Wilson R.K.Nature 424:157-164(2003) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. |
| [7] | Mural R.J., Istrail S., Sutton G.G., Florea L., Halpern A.L., Mobarry C.M., Lippert R., Walenz B., Shatkay H., Dew I., Miller J.R., Flanigan M.J., Edwards N.J., Bolanos R., Fasulo D., Halldorsson B.V., Hannenhalli S., Turner R. Venter J.C.Submitted (JUL-2005) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. |
| [8] | Bienvenut W.V., Pchelintsev N., Adams P.D. Submitted (OCT-2009) to UniProtKB Cited for: PROTEIN SEQUENCE OF 70-81; 165-183; 335-343; 350-377; 422-437; 559-573; 576-588; 718-727; 880-895; 900-911; 917-968; 978-991; 1015-1027; 1074-1088; 1147-1157; 1242-1278; 1300-1313; 1355-1367; 1377-1394; 1475-1494; 1568-1586; 1616-1627; 1658-1671; 1714-1719; 1809-1825; 1840-1860; 1886-1901; 1932-1945; 1954-1968; 2000-2008; 2031-2043; 2050-2083; 2114-2127; 2231-2291; 2294-2316; 2327-2356; 2411-2437; 2577-2589; 2597-2616; 2642-2653 AND 2691-2699, PHOSPHORYLATION AT SER-2233, MASS SPECTROMETRY. Tissue: Lung fibroblast. |
| [9] | "Mapping of two genes encoding isoforms of the actin binding protein ABP-280, a dystrophin like protein, to Xq28 and to chromosome 7." Maestrini E., Patrosso C., Mancini M., Rivella S., Rocchi M., Repetto M., Villa A., Frattini A., Zoppe M., Vezzoni P., Toniolo D. Hum. Mol. Genet. 2:761-766(1993) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] OF 585-815 AND 1638-2101 (ISOFORM 2), TISSUE SPECIFICITY. |
| [10] | "FATZ, a filamin-, actinin-, and telethonin-binding protein of the Z-disc of skeletal muscle." Faulkner G., Pallavicini A., Comelli A., Salamon M., Bortoletto G., Ievolella C., Trevisan S., Kojic' S., Dalla Vecchia F., Laveder P., Valle G., Lanfranchi G. J. Biol. Chem. 275:41234-41242(2000) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH MYOZ1. |
| [11] | "Indications for a novel muscular dystrophy pathway: gamma-filamin, the muscle-specific filamin isoform, interacts with myotilin." van der Ven P.F.M., Wiesner S., Salmikangas P., Auerbach D., Himmel M., Kempa S., Hayess K., Pacholsky D., Taivainen A., Schroeder R., Carpen O., Fuerst D.O. J. Cell Biol. 151:235-248(2000) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: SUBCELLULAR LOCATION, TISSUE SPECIFICITY, DOMAIN, INTERACTION WITH MYOT. |
| [12] | "Localization and enhanced current density of the Kv4.2 potassium channel by interaction with the actin-binding protein filamin." Petrecca K., Miller D.M., Shrier A. J. Neurosci. 20:8736-8744(2000) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH KCND2. |
| [13] | "Myozenin: an alpha-actinin- and gamma-filamin-binding protein of skeletal muscle Z lines." Takada F., Vander Woude D.L., Tong H.-Q., Thompson T.G., Watkins S.C., Kunkel L.M., Beggs A.H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98:1595-1600(2001) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH MYOZ1. |
| [14] | "The SH2-containing inositol polyphosphate 5-phosphatase, SHIP-2, binds filamin and regulates submembraneous actin." Dyson J.M., O'Malley C.J., Becanovic J., Munday A.D., Berndt M.C., Coghill I.D., Nandurkar H.H., Ooms L.M., Mitchell C.A. J. Cell Biol. 155:1065-1079(2001) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH INPPL1. |
| [15] | "Filamins as integrators of cell mechanics and signalling." Stossel T.P., Condeelis J., Cooley L., Hartwig J.H., Noegel A., Schleicher M., Shapiro S.S. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2:138-145(2001) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: REVIEW. |
| [16] | "Identification of silencing of nine genes in human gastric cancers." Kaneda A., Kaminishi M., Yanagihara K., Sugimura T., Ushijima T. Cancer Res. 62:6645-6650(2002) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: SILENCING IN CANCER CELL LINES MKN28 AND MKN74. |
| [17] | "Calsarcin-3, a novel skeletal muscle-specific member of the calsarcin family, interacts with multiple Z-disc proteins." Frey N., Olson E.N. J. Biol. Chem. 277:13998-14004(2002) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH MYOZ3. |
| [18] | "The limits of promiscuity: isoform-specific dimerization of filamins." Himmel M., van der Ven P.F.M., Stoecklein W., Fuerst D.O. Biochemistry 42:430-439(2003) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: DIMERIZATION, INTERACTION WITH FLNB. |
| [19] | "A mutation in the dimerization domain of filamin C causes a novel type of autosomal dominant myofibrillar myopathy." Vorgerd M., van der Ven P.F.M., Bruchertseifer V., Loewe T., Kley R.A., Schroeder R., Lochmueller H., Himmel M., Koehler K., Fuerst D.O., Huebner A. Am. J. Hum. Genet. 77:297-304(2005) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: INVOLVEMENT IN MFM5. |
| [20] | "The Z-disc proteins myotilin and FATZ-1 interact with each other and are connected to the sarcolemma via muscle-specific filamins." Gontier Y., Taivainen A., Fontao L., Sonnenberg A., van der Flier A., Carpen O., Faulkner G., Borradori L. J. Cell Sci. 118:3739-3749(2005) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH ITGB1; MYOT AND MYOZ1. |
| [21] | "The ubiquitin-specific protease USP25 interacts with three sarcomeric proteins." Bosch-Comas A., Lindsten K., Gonzalez-Duarte R., Masucci M.G., Marfany G. Cell. Mol. Life Sci. 63:723-734(2006) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH USP25. |
| [22] | "Unusual splicing events result in distinct Xin isoforms that associate differentially with filamin c and Mena/VASP." van der Ven P.F.M., Ehler E., Vakeel P., Eulitz S., Schenk J.A., Milting H., Micheel B., Fuerst D.O. Exp. Cell Res. 312:2154-2167(2006) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH XIRP1. |
| [23] | "Phosphoproteome of resting human platelets." Zahedi R.P., Lewandrowski U., Wiesner J., Wortelkamp S., Moebius J., Schuetz C., Walter U., Gambaryan S., Sickmann A. J. Proteome Res. 7:526-534(2008) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: PHOSPHORYLATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT SER-1161, MASS SPECTROMETRY. Tissue: Platelet. |
| [24] | "Large-scale proteomics analysis of the human kinome." Oppermann F.S., Gnad F., Olsen J.V., Hornberger R., Greff Z., Keri G., Mann M., Daub H. Mol. Cell. Proteomics 8:1751-1764(2009) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: PHOSPHORYLATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT SER-2233, MASS SPECTROMETRY. |
| [25] | "Initial characterization of the human central proteome." Burkard T.R., Planyavsky M., Kaupe I., Breitwieser F.P., Buerckstuemmer T., Bennett K.L., Superti-Furga G., Colinge J. BMC Syst. Biol. 5:17-17(2011) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: IDENTIFICATION BY MASS SPECTROMETRY [LARGE SCALE ANALYSIS]. |
| [26] | "System-wide temporal characterization of the proteome and phosphoproteome of human embryonic stem cell differentiation." Rigbolt K.T., Prokhorova T.A., Akimov V., Henningsen J., Johansen P.T., Kratchmarova I., Kassem M., Mann M., Olsen J.V., Blagoev B. Sci. Signal. 4:RS3-RS3(2011) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: PHOSPHORYLATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT SER-2233, MASS SPECTROMETRY. |
| [27] | "F-box and leucine-rich repeat protein 22 is a cardiac-enriched F-box protein that regulates sarcomeric protein turnover and is essential for maintenance of contractile function in vivo." Spaich S., Will R.D., Just S., Spaich S., Kuhn C., Frank D., Berger I.M., Wiemann S., Korn B., Koegl M., Backs J., Katus H.A., Rottbauer W., Frey N. Circ. Res. 111:1504-1516(2012) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: UBIQUITINATION BY FBXL22. |
| [28] | "Structural basis for vertebrate filamin dimerization." Pudas R., Kiema T.-R., Butler P.J.G., Stewart M., Ylaenne J. Structure 13:111-119(2005) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (1.43 ANGSTROMS) OF 2633-2725, MUTAGENESIS OF MET-2669. |
| [29] | "Solution structure of the filamin domains from human filamin C." RIKEN structural genomics initiative (RSGI) Submitted (NOV-2006) to the PDB data bank Cited for: STRUCTURE BY NMR OF 1536-2599. |
| [30] | "Crystal structure of human filamin C domain 23 and small angle scattering model for filamin C 23-24 dimer." Sjekloca L., Pudas R., Sjoblom B., Konarev P., Carugo O., Rybin V., Kiema T.R., Svergun D., Ylanne J., Djinovic Carugo K. J. Mol. Biol. 368:1011-1023(2007) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.05 ANGSTROMS) OF 2495-2598, SUBUNIT. |
| [31] | "Migfilin, a molecular switch in regulation of integrin activation." Ithychanda S.S., Das M., Ma Y.Q., Ding K., Wang X., Gupta S., Wu C., Plow E.F., Qin J. J. Biol. Chem. 284:4713-4722(2009) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: STRUCTURE BY NMR OF 2302-2415 IN COMPLEX WITH FBLIM1. |
| [32] | "Mutations in the N-terminal actin-binding domain of filamin C cause a distal myopathy." Duff R.M., Tay V., Hackman P., Ravenscroft G., McLean C., Kennedy P., Steinbach A., Schoffler W., van der Ven P.F., Furst D.O., Song J., Djinovic-Carugo K., Penttila S., Raheem O., Reardon K., Malandrini A., Gambelli S., Villanova M. Laing N.G.Am. J. Hum. Genet. 88:729-740(2011) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: VARIANTS MPD4 THR-193 AND THR-251, CHARACTERIZATION OF VARIANTS MPD4 THR-193 AND THR-251. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Web resources
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | AF089841 mRNA. Translation: AAD12245.1. Different initiation. AF184126 AF184125 Genomic DNA. Translation: AAF68195.1. Different initiation.AF252549 Genomic DNA. Translation: AAF67190.1. AJ132990 Genomic DNA. Translation: CAB51535.1. AJ012737 mRNA. Translation: CAB46442.1. AB371585 mRNA. Translation: BAG48314.1. AC025594 Genomic DNA. No translation available. CH471070 Genomic DNA. Translation: EAW83691.1. AF146692 mRNA. Translation: AAF80245.1. Frameshift. X70083 mRNA. Translation: CAA49688.1. Frameshift. X70084 mRNA. Translation: CAA49689.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IPI | IPI00178352. IPI00413958. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | S37775. S37778. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_001120959.1. NM_001127487.1. NP_001449.3. NM_001458.4. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.58414. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | Q14315. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DIP | DIP-33398N. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IntAct | Q14315. 32 interactions. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MINT | MINT-5004555. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| STRING | 9606.ENSP00000327145. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | Q14315. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DMDM | 254763419. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PaxDb | Q14315. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | Q14315. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENST00000325888; ENSP00000327145; ENSG00000128591. ENST00000346177; ENSP00000344002; ENSG00000128591. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 2318. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:2318. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UCSC | uc003vnz.4. human. uc003voa.4. human. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CTD | 2318. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | GC07P128470. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:3756. FLNC. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HPA | HPA006135. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MIM | 102565. gene. 609524. phenotype. 614065. phenotype. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| neXtProt | NX_Q14315. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orphanet | 63273. Distal myopathy with posterior leg and anterior hand involvement. 171445. Muscle filaminopathy. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA28174. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| eggNOG | COG5069. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | HBG004163. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InParanoid | Q14315. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KO | K04437. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OMA | EPTGCIV. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OrthoDB | EOG4JWVCJ. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Reactome | REACT_111155. Cell-Cell communication. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | Q14315. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Bgee | Q14315. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_FLNC. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genevestigator | Q14315. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000128591. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | 1.10.418.10. 2 hits. 2.60.40.10. 24 hits. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR001589. Actinin_actin-bd_CS. IPR001715. CH-domain. IPR003961. Fibronectin_type3. IPR001298. Filamin. IPR017868. Filamin/ABP280_repeat-like. IPR013783. Ig-like_fold. IPR014756. Ig_E-set. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF00307. CH. 2 hits. PF00630. Filamin. 23 hits. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMART | SM00033. CH. 2 hits. SM00060. FN3. 2 hits. SM00557. IG_FLMN. 24 hits. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SUPFAM | SSF47576. Calponin-homology. 1 hit. SSF81296. Ig_E-set. 24 hits. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS00019. ACTININ_1. 1 hit. PS00020. ACTININ_2. 1 hit. PS50021. CH. 2 hits. PS50194. FILAMIN_REPEAT. 24 hits. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| EvolutionaryTrace | Q14315. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenomeRNAi | 2318. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 9413. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | FLNC_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q14315 Secondary accession number(s): B2ZZ88 Q9Y503 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Chordata Protein Annotation Program | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
Relevant documents
| Human chromosome 7 Human chromosome 7: entries, gene names and cross-references to MIM |
| Human entries with polymorphisms or disease mutations List of human entries with polymorphisms or disease mutations |
| Human polymorphisms and disease mutations Index of human polymorphisms and disease mutations |
| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with
