Q14116 (IL18_HUMAN) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
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January 25, 2012.
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| Protein names | Recommended name: Interleukin-18 Short name=IL-18 Alternative name(s): Iboctadekin Interferon gamma-inducing factor Short name=IFN-gamma-inducing factor Interleukin-1 gamma Short name=IL-1 gamma | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 193 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Augments natural killer cell activity in spleen cells and stimulates interferon gamma production in T-helper type I cells. |
| Subcellular location | |
| Sequence similarities | Belongs to the IL-1 family. |
Ontologies
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Propeptide | 1 – 36 | 36 | By similarity | PRO_0000015343 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 37 – 193 | 157 | Interleukin-18 | PRO_0000015344 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 66 | 1 | F → L in AAC27787. Ref.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 86 | 1 | S → R in AAC27787. Ref.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 191 | 1 | N → S in AAC27787. Ref.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 40 – 49 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 55 – 58 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 64 – 67 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 74 – 77 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 84 – 88 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 96 – 98 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 100 – 102 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 104 – 106 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 108 – 112 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 114 – 120 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 129 – 132 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 137 – 141 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 145 – 147 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 149 – 155 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 160 – 166 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 169 – 175 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 183 – 185 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 187 – 191 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "Cloning of the cDNA for human IFN-gamma-inducing factor, expression in Escherichia coli, and studies on the biologic activities of the protein." Ushio S., Namba M., Okura T., Hattori K., Nukada Y., Akita K., Tanabe F., Konishi K., Micallef M., Fujii M., Torigoe K., Tanimoto T., Fukuda S., Ikeda M., Okamura H., Kurimoto M. J. Immunol. 156:4274-4279(1996) [PubMed: 8666798] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA]. Tissue: Liver. |
| [2] | "Cloning and sequencing of the cDNA for precursor hIL-18." Yong D., Guixin D., Lihua H., Haitao W. Submitted (JUL-1998) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA]. |
| [3] | "Cloning of human interleukin 18 cDNA." Liu J., Peng X., Yuan J., Qiang B. Submitted (JUL-2001) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA]. |
| [4] | "Cloning of human full open reading frames in Gateway(TM) system entry vector (pDONR201)." Ebert L., Schick M., Neubert P., Schatten R., Henze S., Korn B. Submitted (JUN-2004) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA]. |
| [5] | "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)." The MGC Project Team Genome Res. 14:2121-2127(2004) [PubMed: 15489334] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA]. Tissue: Urinary bladder. |
| [6] | Conti B., Kim S.J., Tinti C., Chun H.S., Joh T.H. Submitted (FEB-1997) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] OF 2-193. Tissue: Peripheral blood. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Web resources
| Wikipedia Interleukin-1 entry |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | D49950 mRNA. Translation: BAA08706.1. AF077611 mRNA. Translation: AAC27787.1. AY044641 mRNA. Translation: AAK95950.1. CR541973 mRNA. Translation: CAG46771.1. CR542001 mRNA. Translation: CAG46798.1. BC007007 mRNA. Translation: AAH07007.1. BC007461 mRNA. Translation: AAH07461.1. U90434 mRNA. Translation: AAB50010.1. | ||||||||||||||||||||||||
| IPI | IPI00290198. | ||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_001230140.1. NM_001243211.1. NP_001553.1. NM_001562.3. | ||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.83077. | ||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | Q14116. | ||||||||||||||||||||||||
| SMR | Q14116. Positions 37-193. | ||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||
| DIP | DIP-3785N. | ||||||||||||||||||||||||
| IntAct | Q14116. 1 interaction. | ||||||||||||||||||||||||
| STRING | Q14116. | ||||||||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | Q14116. | ||||||||||||||||||||||||
Polymorphism databases | |||||||||||||||||||||||||
| DMDM | 3219817. | ||||||||||||||||||||||||
2D gel databases | |||||||||||||||||||||||||
| OGP | Q14116. | ||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | Q14116. | ||||||||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENST00000280357; ENSP00000280357; ENSG00000150782. | ||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 3606. | ||||||||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:3606. | ||||||||||||||||||||||||
| UCSC | uc001pnb.1. human. | ||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||
| CTD | 3606. | ||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | GC11M112013. | ||||||||||||||||||||||||
| H-InvDB | HIX0010123. | ||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:5986. IL18. | ||||||||||||||||||||||||
| HPA | CAB007772. CAB027385. HPA003980. | ||||||||||||||||||||||||
| MIM | 600953. gene. | ||||||||||||||||||||||||
| neXtProt | NX_Q14116. | ||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA29802. | ||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||
| eggNOG | prNOG19678. | ||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | HBG283751. | ||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | HBG000388. | ||||||||||||||||||||||||
| InParanoid | Q14116. | ||||||||||||||||||||||||
| OMA | IFFQRSV. | ||||||||||||||||||||||||
| OrthoDB | EOG4B8JFJ. | ||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||
| Pathway_Interaction_DB | anthraxpathway. Cellular roles of Anthrax toxin. il12_stat4pathway. IL12 signaling mediated by STAT4. il12_2pathway. IL12-mediated signaling events. il23pathway. IL23-mediated signaling events. il27pathway. IL27-mediated signaling events. | ||||||||||||||||||||||||
| Reactome | REACT_6900. Immune System. | ||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | Q14116. | ||||||||||||||||||||||||
| Bgee | Q14116. | ||||||||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_IL18. | ||||||||||||||||||||||||
| Genevestigator | Q14116. | ||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000150782. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR008996. Cytokine_IL1-like. IPR000975. Interleukin_1. IPR015529. Interleukin_18. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| KO | K05482. | ||||||||||||||||||||||||
| PANTHER | PTHR11326. Interleukin_18. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF00340. IL1. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| PIRSF | PIRSF015162. Interleukin_18. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||
| PRINTS | PR01933. INTRLEUKIN18. | ||||||||||||||||||||||||
| SMART | SM00125. IL1. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| SUPFAM | SSF50353. Cytok_IL1_like. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Other | |||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 14093. | ||||||||||||||||||||||||
| PMAP-CutDB | Q14116. | ||||||||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | IL18_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q14116 Secondary accession number(s): O75599, Q6FGY3 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Chordata Protein Annotation Program | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
Relevant documents
| Human chromosome 11 Human chromosome 11: entries, gene names and cross-references to MIM |
| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with