Reviewed,
UniProtKB/Swiss-Prot Q13526 (PIN1_HUMAN)
Last modified
November 25, 2008.
Version 81.
History...
Clusters with 100%,
90%,
50% identity |
Documents (4) |
Third-party data |
Customize display | text xml rdf/xml gff fasta |
Names and origin
| Protein names | Recommended name: Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 1 EC=5.2.1.8 Alternative name(s): Rotamase Pin1 PPIase Pin1 | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Homo sapiens (Human) | ||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 163 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is not processed. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | Essential PPIase that regulates mitosis presumably by interacting with NIMA and attenuating its mitosis-promoting activity. Displays a preference for an acidic residue N-terminal to the isomerized proline bond. Catalyzing pSer/Thr-Pro cis/trans isomerizations. |
| Catalytic activity | Peptidylproline (omega=180) = peptidylproline (omega=0). |
| Subunit structure | Interacts with STIL By similarity. Interacts with MPHOSPH1. |
| Subcellular location | |
| Domain | The WW domain is required for the interaction with STIL and MPHOSPH1. |
| Post-translational modification | Phosphorylated upon DNA damage, probably by ATM or ATR. |
| Sequence similarities | Contains 1 PpiC domain. Contains 1 WW domain. |
Ontologies
Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Cell cycle |
| Cellular component | Nucleus |
| Molecular function | Isomerase Rotamase |
| PTM | Phosphoprotein |
| Technical term | 3D-structure |
Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | protein folding Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW regulation of mitosisTraceable author statement. Source: ProtInc |
| Cellular component | nucleus Ref.1 Traceable author statement. Source: ProtInc |
| Molecular function | peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW phosphoserine bindingInferred from direct assay. Source: UniProtKB phosphothreonine bindingInferred from direct assay. Source: UniProtKB |
| Complete GO annotation... | |
Binary interactions
With | Entry | #Exp. | IntAct | Notes |
|---|---|---|---|---|
| NEK6 | Q9HC98 | 2 | EBI-714158,EBI-740364 | |
| VHL | P40337 | 1 | EBI-714158,EBI-301246 |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 163 | 163 | Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 1 | PRO_0000193435 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 5 – 39 | 35 | WW | |||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 52 – 163 | 112 | PpiC | |||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 108 | 1 | Phosphoserine | |||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 23 | 1 | Y → A: Reduced affinity for MPHOSPH1 | |||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 11 – 15 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 22 – 26 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 27 – 29 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 32 – 35 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 55 – 62 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 67 – 69 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 75 – 77 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 82 – 98 | 17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 99 – 101 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 103 – 110 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 114 – 118 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 121 – 125 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 132 – 140 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 156 – 163 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "A human peptidyl-prolyl isomerase essential for regulation of mitosis." Lu K.P., Hanes S.D., Hunter T. Nature 380:544-547(1996) [PubMed: 8606777] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA]. |
| [2] | "Cloning of human full open reading frames in Gateway(TM) system entry vector (pDONR201)." Ebert L., Schick M., Neubert P., Schatten R., Henze S., Korn B. Submitted (MAY-2004) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA]. |
| [3] | "Cloning of human full-length CDSs in BD Creator(TM) system donor vector." Kalnine N., Chen X., Rolfs A., Halleck A., Hines L., Eisenstein S., Koundinya M., Raphael J., Moreira D., Kelley T., LaBaer J., Lin Y., Phelan M., Farmer A. Submitted (OCT-2004) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA]. |
| [4] | "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)." The MGC Project Team Genome Res. 14:2121-2127(2004) [PubMed: 15489334] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA]. Tissue: Lung. |
| [5] | "Identification of a novel kinesin-related protein, KRMP1, as a target for mitotic peptidyl-prolyl isomerase Pin1." Kamimoto T., Zama T., Aoki R., Muro Y., Hagiwara M. J. Biol. Chem. 276:37520-37528(2001) [PubMed: 11470801] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH MPHOSPH1, MUTAGENESIS OF TYR-23. |
| [6] | "ATM and ATR substrate analysis reveals extensive protein networks responsive to DNA damage." Matsuoka S., Ballif B.A., Smogorzewska A., McDonald E.R. III, Hurov K.E., Luo J., Bakalarski C.E., Zhao Z., Solimini N., Lerenthal Y., Shiloh Y., Gygi S.P., Elledge S.J. Science 316:1160-1166(2007) [PubMed: 17525332] [Abstract] Cited for: PHOSPHORYLATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT SER-108, MASS SPECTROMETRY. |
| [7] | "Structural and functional analysis of the mitotic rotamase Pin1 suggests substrate recognition is phosphorylation dependent." Ranganathan R., Lu K.P., Hunter T., Noel J.P. Cell 89:875-886(1997) [PubMed: 9200606] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (1.35 ANGSTROMS). |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| U49070 mRNA. Translation: AAC50492.1. CR407654 mRNA. Translation: CAG28582.1. BT019331 mRNA. Translation: AAV38138.1. BC002899 mRNA. Translation: AAH02899.1. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | S68520. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_006212.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.465849 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IntAct | Q13526. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | Q13526. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PeptideAtlas | Q13526. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENSG00000127445. Homo sapiens. [Contig view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 5300. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:5300. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| H-InvDB | HIX0014730. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:8988. PIN1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HPA | CAB004528. CAB009326. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MIM | 601052. gene. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA134978864. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | Q13526. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | Q13526. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | Q13526. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_PIN1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000127445. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR000297. PPIase_PpiC. IPR002349. WW. IPR001202. WW_Rsp5_WWP. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF00639. Rotamase. 1 hit. PF00397. WW. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRINTS | PR00403. WWDOMAIN. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMART | SM00456. WW. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS01096. PPIC_PPIASE_1. 1 hit. PS50198. PPIC_PPIASE_2. 1 hit. PS01159. WW_DOMAIN_1. 1 hit. PS50020. WW_DOMAIN_2. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Resources | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| LinkHub | Q13526. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 20486. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | PIN1_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q13526 Secondary accession number(s): Q53X75 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HPI (Human Proteome Initiative) | ||||||||
Relevant documents
| Human chromosome 19 Human chromosome 19: entries, gene names and cross-references to MIM |
| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with


