##gff-version 3 Q13485 UniProtKB Chain 1 552 . . . ID=PRO_0000090861;Note=Mothers against decapentaplegic homolog 4 Q13485 UniProtKB Domain 18 142 . . . Note=MH1;Ontology_term=ECO:0000255;evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00438 Q13485 UniProtKB Domain 323 552 . . . Note=MH2;Ontology_term=ECO:0000255;evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00439 Q13485 UniProtKB Region 1 322 . . . Note=Mediates interaction with ZBTB7A;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:25514493;Dbxref=PMID:25514493 Q13485 UniProtKB Region 44 69 . . . Note=Required for interaction with TSC22D1;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:15881652;Dbxref=PMID:15881652 Q13485 UniProtKB Region 168 194 . . . Note=Disordered;Ontology_term=ECO:0000256;evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite Q13485 UniProtKB Region 236 256 . . . Note=Disordered;Ontology_term=ECO:0000256;evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite Q13485 UniProtKB Region 275 320 . . . Note=SAD Q13485 UniProtKB Compositional bias 171 194 . . . Note=Polar residues;Ontology_term=ECO:0000256;evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite Q13485 UniProtKB Compositional bias 238 256 . . . Note=Polar residues;Ontology_term=ECO:0000256;evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite Q13485 UniProtKB Binding site 71 71 . . . Ontology_term=ECO:0000250;evidence=ECO:0000250 Q13485 UniProtKB Binding site 115 115 . . . Ontology_term=ECO:0000250;evidence=ECO:0000250 Q13485 UniProtKB Binding site 127 127 . . . Ontology_term=ECO:0000250;evidence=ECO:0000250 Q13485 UniProtKB Binding site 132 132 . . . Ontology_term=ECO:0000250;evidence=ECO:0000250 Q13485 UniProtKB Site 515 515 . . . Note=Necessary for heterotrimerization Q13485 UniProtKB Modified residue 37 37 . . . Note=N6-acetyllysine;Ontology_term=ECO:0007744;evidence=ECO:0007744|PubMed:19608861;Dbxref=PMID:19608861 Q13485 UniProtKB Modified residue 428 428 . . . Note=N6-acetyllysine;Ontology_term=ECO:0007744;evidence=ECO:0007744|PubMed:19608861;Dbxref=PMID:19608861 Q13485 UniProtKB Modified residue 507 507 . . . Note=N6-acetyllysine;Ontology_term=ECO:0007744;evidence=ECO:0007744|PubMed:19608861;Dbxref=PMID:19608861 Q13485 UniProtKB Cross-link 113 113 . . . Note=Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in SUMO2);Ontology_term=ECO:0007744,ECO:0007744,ECO:0007744;evidence=ECO:0007744|PubMed:25218447,ECO:0007744|PubMed:25755297,ECO:0007744|PubMed:28112733;Dbxref=PMID:25218447,PMID:25755297,PMID:28112733 Q13485 UniProtKB Cross-link 519 519 . . . Note=Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in ubiquitin);Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:19135894;Dbxref=PMID:19135894 Q13485 UniProtKB Natural variant 13 13 . . . ID=VAR_066870;Note=Rare variant%3B found in a patient with pulmonary hypertension%3B uncertain significance. N->S;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:21898662;Dbxref=dbSNP:rs281875323,PMID:21898662 Q13485 UniProtKB Natural variant 130 130 . . . ID=VAR_036475;Note=In a colorectal cancer sample%3B somatic mutation. P->S;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:16959974;Dbxref=dbSNP:rs1555685186,PMID:16959974 Q13485 UniProtKB Natural variant 330 330 . . . ID=VAR_022833;Note=In JPS. E->G;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:12417513;Dbxref=dbSNP:rs281875324,PMID:12417513 Q13485 UniProtKB Natural variant 351 351 . . . ID=VAR_036476;Note=In a colorectal cancer sample%3B somatic mutation. D->N;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:16959974;Dbxref=dbSNP:rs1057519739,PMID:16959974 Q13485 UniProtKB Natural variant 352 352 . . . ID=VAR_019571;Note=In JP/HHT and JPS. G->R;Ontology_term=ECO:0000269,ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:12417513,ECO:0000269|PubMed:15031030;Dbxref=dbSNP:rs121912581,PMID:12417513,PMID:15031030 Q13485 UniProtKB Natural variant 361 361 . . . ID=VAR_019572;Note=In JPS. R->C;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:9811934;Dbxref=dbSNP:rs80338963,PMID:9811934 Q13485 UniProtKB Natural variant 361 361 . . . ID=VAR_036477;Note=In a colorectal cancer sample%3B somatic mutation. R->H;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:16959974;Dbxref=dbSNP:rs377767347,PMID:16959974 Q13485 UniProtKB Natural variant 386 386 . . . ID=VAR_019573;Note=In JP/HHT. G->D;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:15031030;Dbxref=dbSNP:rs121912580,PMID:15031030 Q13485 UniProtKB Natural variant 493 493 . . . ID=VAR_011380;Note=In pancreatic carcinoma. D->H;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:8553070;Dbxref=dbSNP:rs121912578,PMID:8553070 Q13485 UniProtKB Natural variant 500 500 . . . ID=VAR_067602;Note=In MYHRS. I->M;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:22158539;Dbxref=dbSNP:rs281875320,PMID:22158539 Q13485 UniProtKB Natural variant 500 500 . . . ID=VAR_067603;Note=In MYHRS%3B there is an enhanced levels of SMAD4 protein with lower levels of ubiquitinated SMAD4 fibroblasts compared to controls suggesting stabilization of the mutant protein%3B 8-fold increase in phosphorylated SMAD2 and SMAD3%3B 11-fold increase in phosphorylated SMAD1%2C SMAD5 and SMAD8 in cell nuclei compared to controls. I->T;Ontology_term=ECO:0000269,ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:22158539,ECO:0000269|PubMed:22243968;Dbxref=dbSNP:rs281875321,PMID:22158539,PMID:22243968 Q13485 UniProtKB Natural variant 500 500 . . . ID=VAR_067604;Note=In MYHRS. I->V;Ontology_term=ECO:0000269,ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:22158539,ECO:0000269|PubMed:22243968;Dbxref=dbSNP:rs281875322,PMID:22158539,PMID:22243968 Q13485 UniProtKB Mutagenesis 416 416 . . . Note=No effect on heterotrimerization. Partially diminished transcriptional activation. R->S;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:11224571;Dbxref=PMID:11224571 Q13485 UniProtKB Mutagenesis 496 496 . . . Note=No effect on heterotrimerization. Partially diminished transcriptional activation. R->S Q13485 UniProtKB Mutagenesis 502 502 . . . Note=No effect on heterotrimerization. Greatly reduced transcriptional activation. R->S;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:11224571;Dbxref=PMID:11224571 Q13485 UniProtKB Mutagenesis 515 515 . . . Note=Reduced heterotrimerization. R->S;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:11224571;Dbxref=PMID:11224571 Q13485 UniProtKB Mutagenesis 519 519 . . . Note=Abolishes ubiquitination. K->R;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:19135894;Dbxref=PMID:19135894 Q13485 UniProtKB Helix 16 24 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:5MEY Q13485 UniProtKB Beta strand 29 31 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:5MEY Q13485 UniProtKB Helix 33 47 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:5MEY Q13485 UniProtKB Helix 51 62 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:5MEY Q13485 UniProtKB Turn 63 65 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:5MEY Q13485 UniProtKB Beta strand 73 75 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:5MEY Q13485 UniProtKB Beta strand 78 80 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:5MEY Q13485 UniProtKB Beta strand 82 84 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:5MEY Q13485 UniProtKB Beta strand 87 89 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:5MEY Q13485 UniProtKB Helix 91 99 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:5MEY Q13485 UniProtKB Beta strand 109 111 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:5MEY Q13485 UniProtKB Helix 119 121 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:5MEY Q13485 UniProtKB Beta strand 124 127 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:5MEY Q13485 UniProtKB Helix 130 132 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:5MEY Q13485 UniProtKB Beta strand 133 135 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:5MEY Q13485 UniProtKB Helix 143 145 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:5UWU Q13485 UniProtKB Beta strand 288 291 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:1DD1 Q13485 UniProtKB Beta strand 321 330 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:1YGS Q13485 UniProtKB Beta strand 333 342 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:1YGS Q13485 UniProtKB Beta strand 346 353 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:1YGS Q13485 UniProtKB Beta strand 359 363 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:1YGS Q13485 UniProtKB Helix 364 366 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:1U7F Q13485 UniProtKB Helix 374 380 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:1YGS Q13485 UniProtKB Turn 381 385 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:1YGS Q13485 UniProtKB Beta strand 387 392 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:1YGS Q13485 UniProtKB Turn 393 395 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:1YGS Q13485 UniProtKB Beta strand 396 401 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:1YGS Q13485 UniProtKB Beta strand 403 405 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:1YGS Q13485 UniProtKB Beta strand 407 410 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:1YGS Q13485 UniProtKB Helix 412 416 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:1YGS Q13485 UniProtKB Turn 417 419 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:1YGS Q13485 UniProtKB Beta strand 427 429 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:1YGS Q13485 UniProtKB Beta strand 434 438 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:1YGS Q13485 UniProtKB Helix 440 454 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:1YGS Q13485 UniProtKB Turn 455 458 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:1DD1 Q13485 UniProtKB Helix 461 464 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:1DD1 Q13485 UniProtKB Helix 493 497 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:1YGS Q13485 UniProtKB Beta strand 500 506 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:1YGS Q13485 UniProtKB Helix 518 520 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:1YGS Q13485 UniProtKB Beta strand 521 529 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:1YGS Q13485 UniProtKB Helix 530 541 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:1YGS