Reviewed,
UniProtKB/Swiss-Prot Q13423 (NNTM_HUMAN)
Last modified
June 16, 2009.
Version 94.
History...
Clusters with 100%,
90%,
50% identity |
Documents (4) |
Third-party data |
Customize display | text xml rdf/xml gff fasta |
Names and origin
| Protein names | Recommended name: NAD(P) transhydrogenase, mitochondrial EC=1.6.1.2 Alternative name(s): Nicotinamide nucleotide transhydrogenase Pyridine nucleotide transhydrogenase | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Homo sapiens (Human) | ||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 1086 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | The transhydrogenation between NADH and NADP is coupled to respiration and ATP hydrolysis and functions as a proton pump across the membrane. |
| Catalytic activity | NADPH + NAD+ = NADP+ + NADH. |
| Subunit structure | Homodimer By similarity. |
| Subcellular location | Mitochondrion inner membrane; Multi-pass membrane protein; Matrix side Potential. |
| Sequence similarities | In the N-terminal section; belongs to the AlaDH/PNT family. In the C-terminal section; belongs to the PNT beta subunit family. |
Ontologies
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Transit peptide | 1 – 43 | 43 | Mitochondrion By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 44 – 1086 | 1043 | NAD(P) transhydrogenase, mitochondrial | PRO_0000001055 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 44 – 474 | 431 | Mitochondrial matrix | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transmembrane | 475 – 493 | 19 | Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transmembrane | 501 – 521 | 21 | Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transmembrane | 527 – 546 | 20 | Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transmembrane | 558 – 578 | 21 | Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 579 – 595 | 17 | Mitochondrial matrix | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transmembrane | 596 – 616 | 21 | Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transmembrane | 622 – 642 | 21 | Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transmembrane | 646 – 666 | 21 | Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transmembrane | 672 – 691 | 20 | Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transmembrane | 702 – 722 | 21 | Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 723 – 739 | 17 | Cytoplasmic | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transmembrane | 740 – 760 | 21 | Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transmembrane | 778 – 797 | 20 | Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transmembrane | 801 – 819 | 19 | Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transmembrane | 833 – 853 | 21 | Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transmembrane | 857 – 879 | 23 | Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 880 – 1086 | 207 | Mitochondrial matrix | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 229 – 259 | 31 | NAD By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 176 | 1 | A → T in CAA90428. Ref.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 212 | 1 | G → E in CAD38536. Ref.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 246 | 1 | A → E in AAC51914. Ref.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 262 | 1 | A → S in AAC51914. Ref.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 706 | 1 | F → S in AAC51914. Ref.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 731 | 1 | T → P in AAC51914. Ref.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 810 | 1 | S → A in CAA90428. Ref.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 824 | 1 | A → P in CAA90428. Ref.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 871 | 1 | I → P in AAC51914. Ref.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 929 | 1 | I → F in AAC51914. Ref.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 1059 | 1 | K → R in CAD38536. Ref.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 904 – 912 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 914 – 923 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 925 – 931 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 933 – 938 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 941 – 953 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 957 – 962 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 967 – 969 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 972 – 979 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 984 – 986 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 987 – 989 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 990 – 993 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 994 – 999 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 1001 – 1007 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 1010 – 1012 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 1015 – 1018 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 1023 – 1026 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 1032 – 1034 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 1035 – 1045 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 1055 – 1058 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 1062 – 1067 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 1069 – 1081 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "Cloning and deduced amino acid sequence of human nicotinamide nucleotide transhydrogenase." Ware J., Zieger B. DNA Seq. 7:369-374(1997) [PubMed: 9524818] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA]. |
| [2] | "The cDNA sequence of proton-pumping nicotinamide nucleotide transhydrogenase from man and mouse." Lagberg E.M., Betsholtz C., Rydstrom J. Biochim. Biophys. Acta 1273:203-205(1996) [PubMed: 8616157] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA]. Tissue: Heart. |
| [3] | "The full-ORF clone resource of the German cDNA consortium." Bechtel S., Rosenfelder H., Duda A., Schmidt C.P., Ernst U., Wellenreuther R., Mehrle A., Schuster C., Bahr A., Blocker H., Heubner D., Hoerlein A., Michel G., Wedler H., Kohrer K., Ottenwalder B., Poustka A., Wiemann S., Schupp I. BMC Genomics 8:399-399(2007) [PubMed: 17974005] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA]. Tissue: Skeletal muscle. |
| [4] | "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)." The MGC Project Team Genome Res. 14:2121-2127(2004) [PubMed: 15489334] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA]. |
| [5] | Colinge J., Superti-Furga G., Bennett K.L. Submitted (OCT-2008) to UniProtKB Cited for: IDENTIFICATION [LARGE SCALE ANALYSIS], MASS SPECTROMETRY. |
| [6] | "The high-resolution structure of the NADP(H)-binding component (dIII) of proton-translocating transhydrogenase from human heart mitochondria." White S.A., Peake S.J., McSweeney S., Leonard G., Cotton N.P.J., Jackson J.B. Structure 8:1-12(2000) [PubMed: 10673423] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.0 ANGSTROMS) OF 880-1086. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| U40490 mRNA. Translation: AAC51914.1. Z50101 mRNA. Translation: CAA90428.1. AL831822 mRNA. Translation: CAD38536.1. BC110543 mRNA. Translation: AAI10544.1. | |||||||||||||||||||||||||
| IPI | IPI00337541. | ||||||||||||||||||||||||
| PIR | G02257. | ||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_036475.3. NP_892022.2. | ||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.482043 | ||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | Q13423. | ||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||
| PeptideAtlas | Q13423. | ||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | Q13423. | ||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENSG00000112992. Homo sapiens. [Contig view] | ||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 23530. | ||||||||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:23530. | ||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | GC05P043638. | ||||||||||||||||||||||||
| H-InvDB | HIX0019972. HIX0032203. | ||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:7863. NNT. | ||||||||||||||||||||||||
| HPA | CAB004975. HPA004829. | ||||||||||||||||||||||||
| MIM | 607878. gene. | ||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA31667. | ||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | Q13423. | ||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | Q13423. | ||||||||||||||||||||||||
| OMA | Q13423. LAFSQMV. | ||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||
| BRENDA | 1.6.1.2. 247. | ||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | Q13423. | ||||||||||||||||||||||||
| Bgee | Q13423. | ||||||||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_NNT. | ||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000112992. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR007698. Ala_DH/PNT_C. IPR008142. Ala_DH/PNT_CS1. IPR008143. Ala_DH/PNT_CS2. IPR007886. Ala_DH/PNT_N. IPR016040. NAD(P)-bd_dom. IPR004571. NADP_transhyd_a. IPR004003. NADP_transhyd_b. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:3.40.50.720. NAD(P)-bd. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF01262. AlaDh_PNT_C. 1 hit. PF05222. AlaDh_PNT_N. 1 hit. PF02233. PNTB. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR00561. pntA. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS00836. ALADH_PNT_1. 1 hit. PS00837. ALADH_PNT_2. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Other Resources | |||||||||||||||||||||||||
| DrugBank | DB00157. NADH. | ||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 46004. | ||||||||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | NNTM_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q13423 Secondary accession number(s): Q16796, Q2TB60, Q8N3V4 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HPI (Human Proteome Initiative) | ||||||||
Relevant documents
| Human chromosome 5 Human chromosome 5: entries, gene names and cross-references to MIM |
| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with


