Q12737 (BLRO_MYRVE) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
September 21, 2011.
Version 59.
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| Protein names | Recommended name: Bilirubin oxidase EC=1.3.3.5 |
| Organism | Myrothecium verrucaria |
| Taxonomic identifier | 5532 [NCBI] |
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Fungi › Dikarya › Ascomycota › Pezizomycotina › Sordariomycetes › Hypocreomycetidae › Hypocreales › mitosporic Hypocreales › Myrothecium |
Protein attributes
| Sequence length | 572 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Oxidation of bilirubin and other tetrapyrroles. |
| Catalytic activity | 2 bilirubin + O2 = 2 biliverdin + 2 H2O. |
| Cofactor | Binds 4 copper ions per monomer By similarity. |
| Sequence similarities | Belongs to the multicopper oxidase family. Contains 2 plastocyanin-like domains. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Domain | Repeat Signal |
| Ligand | Copper Metal-binding |
| Molecular function | Oxidoreductase |
| PTM | Cleavage on pair of basic residues Glycoprotein |
| Technical term | 3D-structure Direct protein sequencing |
| Gene Ontology (GO) | |
| Molecular function | bilirubin oxidase activity Inferred from electronic annotation. Source: EC copper ion bindingInferred from electronic annotation. Source: InterPro |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Signal peptide | 1 – 19 | 19 | Probable | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Propeptide | 20 – 38 | 19 | PRO_0000002910 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 39 – 572 | 534 | Bilirubin oxidase | PRO_0000002911 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 98 – 194 | 97 | Plastocyanin-like 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 404 – 526 | 123 | Plastocyanin-like 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 132 | 1 | Copper 1; type 2 By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 134 | 1 | Copper 2; type 3 By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 172 | 1 | Copper 2; type 3 By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 174 | 1 | Copper 3; type 3 By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 436 | 1 | Copper 4; type 1 By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 439 | 1 | Copper 1; type 2 By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 441 | 1 | Copper 3; type 3 By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 494 | 1 | Copper 3; type 3 By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 495 | 1 | Copper 4; type 1 By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 496 | 1 | Copper 2; type 3 By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 500 | 1 | Copper 4; type 1 By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 505 | 1 | Copper 4; type 1 By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 510 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 520 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 75 – 81 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 108 – 112 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 117 – 123 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 125 – 127 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 131 – 134 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 140 – 142 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 158 – 160 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 164 – 166 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 168 – 173 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 179 – 184 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 191 – 194 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 196 – 200 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 214 – 219 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 241 – 244 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 256 – 265 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 279 – 281 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 288 – 292 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 302 – 305 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 314 – 320 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 328 – 332 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 345 – 347 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 348 – 350 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 351 – 357 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 388 – 391 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 422 – 429 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 438 – 442 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 445 – 450 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 467 – 470 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 476 – 483 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 491 – 496 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 498 – 502 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 506 – 511 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 525 – 529 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| [1] | "Molecular cloning of the gene for bilirubin oxidase from Myrothecium verrucaria and its expression in yeast." Koikeda S., Ando K., Kaji H., Inoue T., Murao S., Takeuchi K., Samejima T. J. Biol. Chem. 268:18801-18809(1993) [PubMed: 8360171] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA / MRNA], PARTIAL PROTEIN SEQUENCE. Strain: MT-1. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | D14081 Genomic DNA. Translation: BAA03166.1. D12579 mRNA. Translation: BAA02123.1. | ||||||||||||||||||
| PIR | B48521. | ||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | Q12737. | ||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||
| InterPro | IPR001117. Cu-oxidase. IPR011706. Cu-oxidase_2. IPR011707. Cu-oxidase_3. IPR008972. Cupredoxin. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:2.60.40.420. Cupredoxin. 3 hits. | ||||||||||||||||||
| Pfam | PF00394. Cu-oxidase. 1 hit. PF07731. Cu-oxidase_2. 1 hit. PF07732. Cu-oxidase_3. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| SUPFAM | SSF49503. Cupredoxin. 3 hits. | ||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | BLRO_MYRVE | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q12737 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Fungal Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with