Q09596 (GST5_CAEEL) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
November 16, 2011.
Version 89.
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Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Sequence annotation·Sequences·References·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize orderNames and origin
| Protein names | Recommended name: Probable glutathione S-transferase 5 EC=2.5.1.18 Alternative name(s): GST class-sigma | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Caenorhabditis elegans | ||||
| Taxonomic identifier | 6239 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Nematoda › Chromadorea › Rhabditida › Rhabditoidea › Rhabditidae › Peloderinae › Caenorhabditis |
Protein attributes
| Sequence length | 207 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Conjugation of reduced glutathione to a wide number of exogenous and endogenous hydrophobic electrophiles By similarity. |
| Catalytic activity | RX + glutathione = HX + R-S-glutathione. |
| Sequence similarities | Belongs to the GST superfamily. Sigma family. Contains 1 GST C-terminal domain. Contains 1 GST N-terminal domain. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Molecular function | Transferase |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | apoptotic process Inferred from mutant phenotype. Source: WormBase determination of adult lifespanInferred from mutant phenotype. Source: WormBase |
| Molecular function | glutathione transferase activity Inferred from electronic annotation. Source: EC |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 207 | 207 | Probable glutathione S-transferase 5 | PRO_0000185928 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 2 – 81 | 80 | GST N-terminal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 83 – 207 | 125 | GST C-terminal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 52 – 53 | 2 | Glutathione binding By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 65 – 66 | 2 | Glutathione binding By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 8 | 1 | Glutathione By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 39 | 1 | Glutathione By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 43 | 1 | Glutathione By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 4 – 12 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 13 – 15 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 16 – 25 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 30 – 34 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 36 – 38 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 39 – 44 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 55 – 58 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 61 – 64 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 66 – 76 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 84 – 111 | 28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 119 – 125 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 127 – 145 | 19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 147 – 151 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 157 – 171 | 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 180 – 191 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 193 – 201 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| [1] | "Genome sequence of the nematode C. elegans: a platform for investigating biology." The C. elegans sequencing consortium Science 282:2012-2018(1998) [PubMed: 9851916] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. Strain: Bristol N2. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | Z46828 Genomic DNA. Translation: CAA86859.1. | ||||||||||||
| PIR | T23872. | ||||||||||||
| RefSeq | NP_496357.1. NM_063956.4. | ||||||||||||
| UniGene | Cel.14876. | ||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||
| ProteinModelPortal | Q09596. | ||||||||||||
| SMR | Q09596. Positions 1-207. | ||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||
| DIP | DIP-26899N. | ||||||||||||
| IntAct | Q09596. 27 interactions. | ||||||||||||
| MINT | MINT-1122168. | ||||||||||||
| STRING | Q09596. | ||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||
| PRIDE | Q09596. | ||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||
| EnsemblMetazoa | R03D7.6; R03D7.6; R03D7.6. | ||||||||||||
| GeneID | 187537. | ||||||||||||
| KEGG | cel:R03D7.6. | ||||||||||||
| NMPDR | fig|6239.3.peg.7351. | ||||||||||||
| UCSC | R03D7.6. c. elegans. | ||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||
| CTD | 187537. | ||||||||||||
| WormBase | R03D7.6; CE01613; WBGene00001753; gst-5. | ||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||
| eggNOG | meNOG14525. | ||||||||||||
| GeneTree | EMGT00050000007317. | ||||||||||||
| HOGENOM | HBG563238. | ||||||||||||
| InParanoid | Q09596. | ||||||||||||
| OMA | KIQAIPQ. | ||||||||||||
| PhylomeDB | Q09596. | ||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||
| ArrayExpress | Q09596. | ||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||
| InterPro | IPR010987. Glutathione-S-Trfase_C-like. IPR004045. Glutathione_S-Trfase_N. IPR017933. Glutathione_S_Trfase/Cl_chnl_C. IPR004046. GST_C. IPR012336. Thioredoxin-like_fold. [Graphical view] | ||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:1.20.1050.10. GST_C_like. 1 hit. G3DSA:3.40.30.10. Thioredoxin_fold. 1 hit. | ||||||||||||
| KO | K00799. | ||||||||||||
| Pfam | PF00043. GST_C. 1 hit. PF02798. GST_N. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| SUPFAM | SSF47616. GST_C_like. 1 hit. SSF52833. Thiordxn-like_fd. 1 hit. | ||||||||||||
| PROSITE | PS50405. GST_CTER. 1 hit. PS50404. GST_NTER. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||
Other | |||||||||||||
| NextBio | 935622. | ||||||||||||
Entry information
| Entry name | GST5_CAEEL | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q09596 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Caenorhabditis annotation project | ||||||||
Relevant documents
| Caenorhabditis elegans Caenorhabditis elegans: entries, gene names and cross-references to WormPep |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with