Q08881 (ITK_HUMAN) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
January 25, 2012.
Version 133.
History...
Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Interactions·Sequence annotation·Sequences·References·Web links·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize order
Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Interactions·Sequence annotation·Sequences·References·Web links·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize orderNames and origin
| Protein names | Recommended name: Tyrosine-protein kinase ITK/TSK EC=2.7.10.2 Alternative name(s): Interleukin-2-inducible T cell kinase Short name=IL-2-inducible T cell kinase Kinase EMT T-cell-specific kinase Tyrosine-protein kinase Lyk | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 620 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Tyrosine kinase that plays an essential role in regulation of the adaptive immune response. Regulates the development, function and differentiation of conventional T-cells and nonconventional NKT-cells. When antigen presenting cells (APC) activate T-cell receptor (TCR), a series of phosphorylation lead to the recruitment of ITK to the cell membrane, in the vicinity of the stimulated TCR receptor, where it is phosphorylated by LCK. Phosphorylation leads to ITK autophosphorylation and full activation. Once activated, phosphorylates PLCG1, leading to the activation of this lipase and subsequent cleavage of its substrates. In turn, the endoplasmic reticulum releases calcium in the cytoplasm and the nuclear activator of activated T-cells (NFAT) translocates into the nucleus to perform its transcriptional duty. Phosphorylates 2 essential adapter proteins: the linker for activation of T-cells/LAT protein and LCP2. Then, a large number of signaling molecules such as VAV1 are recruited and ultimately lead to lymphokine production, T-cell proliferation and differentiation. Ref.10 Ref.11 Ref.20 |
| Catalytic activity | ATP + a [protein]-L-tyrosine = ADP + a [protein]-L-tyrosine phosphate. |
| Cofactor | Binds 1 zinc ion per subunit By similarity. |
| Subunit structure | Homooligomerizes; this association negatively regulates kinase activity By similarity. Interacts with PPIA/CYPA; this interaction regulates TCR signal strength via a proline-directed conformational switch in ITK. Interacts with THEMIS By similarity. Interacts with FASLG. Interacts with VAV1; this interaction is important for VAV1 localization and TCR-induced actin polarization. Ref.12 Ref.13 Ref.16 |
| Subcellular location | Cytoplasm. Note: Localizes in the vicinity of cell surface receptors in the plasma membrane after receptor stimulation. Ref.14 |
| Tissue specificity | T-cell lines and natural killer cell lines. |
| Induction | Through a myriad of surface receptors including the TCR/CD3 signaling complex, coreceptors, or chemokine receptors. Ref.1 Ref.8 |
| Domain | The N-terminal PH domain allows ITK to be recruited to the plasma membrane by an activated PI3 kinase. This domain contains also a proline-rich region (PRR). The adjoining domain is a SH3 domain, which binds to PRR (from itself or from other proteins). Next, a SH2 domain is required for binding tyrosine-phosphorylated substrates. In the C-terminal region, the kinase domain is required for tyrosine phosphorylation. Ref.9 |
| Post-translational modification | Phosphorylated at Tyr-512 in the activation loop of the kinase domain by LCK. Subsequent autophosphorylation at Tyr-180 leads to the kinase activation. The autophosphorylated Tyr-180 lies within the substrate binding sequence of the SH3 domain. Ref.6 Ref.7 Ref.10 Ref.15 Ref.17 Ref.18 Ref.20 |
| Involvement in disease | Defects in ITK are the cause of lymphoproliferative syndrome EBV-associated autosomal type 1 (LPSA1) [MIM:613011]. LPSA1 is a rare immunodeficiency characterized by extreme susceptibility to infection with Epstein-Barr virus (EBV). Inadequate immune response to EBV can have a fatal outcome. Clinical features include splenomegaly, lymphadenopathy, anemia, thrombocytopenia, pancytopenia, recurrent infections. There is an increased risk for lymphoma. Ref.23 |
| Sequence similarities | Belongs to the protein kinase superfamily. Tyr protein kinase family. TEC subfamily. Contains 1 Btk-type zinc finger. Contains 1 PH domain. Contains 1 protein kinase domain. Contains 1 SH2 domain. Contains 1 SH3 domain. |
Ontologies
Binary interactions
With | Entry | #Exp. | IntAct | Notes |
|---|---|---|---|---|
| FASLG | P48023 | 3 | EBI-968552,EBI-495538 |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 620 | 620 | Tyrosine-protein kinase ITK/TSK | PRO_0000088106 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 4 – 111 | 108 | PH | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 171 – 231 | 61 | SH3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 239 – 338 | 100 | SH2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 363 – 615 | 253 | Protein kinase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Zinc finger | 113 – 149 | 37 | Btk-type | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 369 – 377 | 9 | ATP By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 482 | 1 | Proton acceptor By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 121 | 1 | Zinc By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 132 | 1 | Zinc By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 133 | 1 | Zinc By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 143 | 1 | Zinc By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 391 | 1 | ATP By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 180 | 1 | Phosphotyrosine; by autocatalysis Ref.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 296 | 1 | N6-acetyllysine Ref.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 512 | 1 | Phosphotyrosine; by LCK Ref.15 Ref.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 565 | 1 | Phosphoserine Ref.15 Ref.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 19 | 1 | R → K in a metastatic melanoma sample; somatic mutation. Ref.22 | VAR_041710 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 23 | 1 | P → L in a metastatic melanoma sample; somatic mutation. Ref.22 | VAR_041711 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 193 | 1 | R → Q. Corresponds to variant rs17054374 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_051696 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 335 | 1 | R → W in LPSA1; shows nearly undetectable mutant ITK protein consistent with severe protein instability. Ref.23 Corresponds to variant rs121908191 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_063424 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 451 | 1 | R → Q in a gastric adenocarcinoma sample; somatic mutation. Ref.22 | VAR_041712 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 581 | 1 | R → W. Ref.22 Corresponds to variant rs34482255 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_041713 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 587 | 1 | V → I. Ref.22 Corresponds to variant rs56005928 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_041714 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 288 | 1 | P → G: Complete loss of interaction with PPIA/CYPA. Ref.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 171 – 172 | 2 | PE → GS AA sequence Ref.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 331 | 1 | V → W in AAB28072. Ref.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 127 – 133 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 148 – 152 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 171 – 173 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 175 – 180 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 187 – 189 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 197 – 202 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 205 – 212 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 214 – 216 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 218 – 222 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 223 – 225 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 226 – 228 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 363 – 370 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 377 – 382 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 383 – 385 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 386 – 392 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 395 – 398 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 400 – 412 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 421 – 425 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 427 – 430 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 432 – 436 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 443 – 448 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 449 – 452 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 456 – 475 | 20 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 485 – 487 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 488 – 490 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 492 – 494 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 496 – 498 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 527 – 530 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 537 – 552 | 16 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 564 – 572 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 585 – 594 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 599 – 601 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 605 – 618 | 14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "A novel human tyrosine kinase gene inducible in T cells by interleukin 2." Tanaka N., Asao H., Ohtani K., Nakamura M., Sugamura K. FEBS Lett. 324:1-5(1993) [PubMed: 8504851] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA], INDUCTION. |
| [2] | "Identification, cloning, and characterization of a novel human T-cell-specific tyrosine kinase located at the hematopoietin complex on chromosome 5q." Gibson S., Leung B., Squire J.A., Hill M., Arima N., Goss P., Hogg D., Mills G.B. Blood 82:1561-1572(1993) [PubMed: 8364206] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA]. Tissue: Thymus. |
| [3] | "Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs." Ota T., Suzuki Y., Nishikawa T., Otsuki T., Sugiyama T., Irie R., Wakamatsu A., Hayashi K., Sato H., Nagai K., Kimura K., Makita H., Sekine M., Obayashi M., Nishi T., Shibahara T., Tanaka T., Ishii S. Sugano S.Nat. Genet. 36:40-45(2004) [PubMed: 14702039] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA]. Tissue: Thymus. |
| [4] | Mural R.J., Istrail S., Sutton G.G., Florea L., Halpern A.L., Mobarry C.M., Lippert R., Walenz B., Shatkay H., Dew I., Miller J.R., Flanigan M.J., Edwards N.J., Bolanos R., Fasulo D., Halldorsson B.V., Hannenhalli S., Turner R. Venter J.C.Submitted (SEP-2005) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. |
| [5] | "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)." The MGC Project Team Genome Res. 14:2121-2127(2004) [PubMed: 15489334] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA]. |
| [6] | "Identification of phosphorylation sites within the SH3 domains of Tec family tyrosine kinases." Nore B.F., Mattsson P.T., Antonsson P., Backesjo C.-M., Westlund A., Lennartsson J., Hansson H., Low P., Ronnstrand L., Smith C.I.E. Biochim. Biophys. Acta 1645:123-132(2003) [PubMed: 12573241] [Abstract] Cited for: PROTEIN SEQUENCE OF 171-192, PHOSPHORYLATION AT TYR-180. |
| [7] | "Lck phosphorylates the activation loop tyrosine of the Itk kinase domain and activates Itk kinase activity." Heyeck S.D., Wilcox H.M., Bunnell S.C., Berg L.J. J. Biol. Chem. 272:25401-25408(1997) [PubMed: 9312162] [Abstract] Cited for: PHOSPHORYLATION BY LCK. |
| [8] | "CD2-mediated activation of the Tec-family tyrosine kinase ITK is controlled by proline-rich stretch-4 of the CD2 cytoplasmic tail." King P.D., Sadra A., Teng J.M., Bell G.M., Dupont B. Int. Immunol. 10:1009-1016(1998) [PubMed: 9701039] [Abstract] Cited for: INDUCTION. |
| [9] | "Tec kinases: a family with multiple roles in immunity." Yang W.C., Collette Y., Nunes J.A., Olive D. Immunity 12:373-382(2000) [PubMed: 10795735] [Abstract] Cited for: DOMAIN. |
| [10] | "Phosphorylation of the linker for activation of T-cells by Itk promotes recruitment of Vav." Perez-Villar J.J., Whitney G.S., Sitnick M.T., Dunn R.J., Venkatesan S., O'Day K., Schieven G.L., Lin T.A., Kanner S.B. Biochemistry 41:10732-10740(2002) [PubMed: 12186560] [Abstract] Cited for: FUNCTION IN PHOSPHORYLATION OF LAT. |
| [11] | "Inducible T cell tyrosine kinase regulates actin-dependent cytoskeletal events induced by the T cell antigen receptor." Grasis J.A., Browne C.D., Tsoukas C.D. J. Immunol. 170:3971-3976(2003) [PubMed: 12682224] [Abstract] Cited for: FUNCTION. |
| [12] | "Cyclophilin A regulates TCR signal strength in CD4+ T cells via a proline-directed conformational switch in Itk." Colgan J., Asmal M., Neagu M., Yu B., Schneidkraut J., Lee Y., Sokolskaja E., Andreotti A., Luban J. Immunity 21:189-201(2004) [PubMed: 15308100] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH PPIA/CYPA, MUTAGENESIS OF PRO-288. |
| [13] | "Kinase-independent functions for Itk in TCR-induced regulation of Vav and the actin cytoskeleton." Dombroski D., Houghtling R.A., Labno C.M., Precht P., Takesono A., Caplen N.J., Billadeau D.D., Wange R.L., Burkhardt J.K., Schwartzberg P.L. J. Immunol. 174:1385-1392(2005) [PubMed: 15661896] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH VAV1. |
| [14] | "Tec kinase Itk forms membrane clusters specifically in the vicinity of recruiting receptors." Qi Q., Sahu N., August A. J. Biol. Chem. 281:38529-38534(2006) [PubMed: 17060314] [Abstract] Cited for: SUBCELLULAR LOCATION. |
| [15] | "Proteomics analysis of protein kinases by target class-selective prefractionation and tandem mass spectrometry." Wissing J., Jaensch L., Nimtz M., Dieterich G., Hornberger R., Keri G., Wehland J., Daub H. Mol. Cell. Proteomics 6:537-547(2007) [PubMed: 17192257] [Abstract] Cited for: PHOSPHORYLATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT TYR-512 AND SER-565, MASS SPECTROMETRY. Tissue: Leukemic T-cell. |
| [16] | "Identification of SH3 domain interaction partners of human FasL (CD178) by phage display screening." Voss M., Lettau M., Janssen O. BMC Immunol. 10:53-53(2009) [PubMed: 19807924] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH FASLG. |
| [17] | "SH2-dependent autophosphorylation within the Tec family kinase Itk." Joseph R.E., Severin A., Min L., Fulton D.B., Andreotti A.H. J. Mol. Biol. 391:164-177(2009) [PubMed: 19523959] [Abstract] Cited for: AUTOPHOSPHORYLATION. |
| [18] | "Quantitative phosphoproteomic analysis of T cell receptor signaling reveals system-wide modulation of protein-protein interactions." Mayya V., Lundgren D.H., Hwang S.-I., Rezaul K., Wu L., Eng J.K., Rodionov V., Han D.K. Sci. Signal. 2:RA46-RA46(2009) [PubMed: 19690332] [Abstract] Cited for: PHOSPHORYLATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT TYR-512 AND SER-565, MASS SPECTROMETRY. Tissue: Leukemic T-cell. |
| [19] | "Lysine acetylation targets protein complexes and co-regulates major cellular functions." Choudhary C., Kumar C., Gnad F., Nielsen M.L., Rehman M., Walther T., Olsen J.V., Mann M. Science 325:834-840(2009) [PubMed: 19608861] [Abstract] Cited for: ACETYLATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT LYS-296, MASS SPECTROMETRY. |
| [20] | "Sequential phosphorylation of SLP-76 at tyrosine 173 is required for activation of T and mast cells." Sela M., Bogin Y., Beach D., Oellerich T., Lehne J., Smith-Garvin J.E., Okumura M., Starosvetsky E., Kosoff R., Libman E., Koretzky G., Kambayashi T., Urlaub H., Wienands J., Chernoff J., Yablonski D. EMBO J. 30:3160-3172(2011) [PubMed: 21725281] [Abstract] Cited for: FUNCTION IN PHOSPHORYLATION OF LCP2. |
| [21] | "Solution structure of the BTK motif and the SH3 domain of tyrosine-protein kinase ITK from human." RIKEN structural genomics initiative (RSGI) Submitted (OCT-2007) to the PDB data bank Cited for: STRUCTURE BY NMR OF 113-239. |
| [22] | "Patterns of somatic mutation in human cancer genomes." Greenman C., Stephens P., Smith R., Dalgliesh G.L., Hunter C., Bignell G., Davies H., Teague J., Butler A., Stevens C., Edkins S., O'Meara S., Vastrik I., Schmidt E.E., Avis T., Barthorpe S., Bhamra G., Buck G. Stratton M.R.Nature 446:153-158(2007) [PubMed: 17344846] [Abstract] Cited for: VARIANTS [LARGE SCALE ANALYSIS] LYS-19; LEU-23; GLN-451; TRP-581 AND ILE-587. |
| [23] | "Girls homozygous for an IL-2-inducible T cell kinase mutation that leads to protein deficiency develop fatal EBV-associated lymphoproliferation." Huck K., Feyen O., Niehues T., Rueschendorf F., Huebner N., Laws H.-J., Telieps T., Knapp S., Wacker H.-H., Meindl A., Jumaa H., Borkhardt A. J. Clin. Invest. 119:1350-1358(2009) [PubMed: 19425169] [Abstract] Cited for: VARIANT LPSA1 TRP-335, CHARACTERIZATION OF VARIANT LPSA1 TRP-335. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | D13720 mRNA. Translation: BAA02873.1. L10717 mRNA. Translation: AAA36748.1. S65186 mRNA. Translation: AAB28072.2. AK312846 mRNA. Translation: BAG35699.1. CH471062 Genomic DNA. Translation: EAW61608.1. BC109077 mRNA. Translation: AAI09078.1. BC109078 mRNA. Translation: AAI09079.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IPI | IPI00004566. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | S33253. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_005537.3. NM_005546.3. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.558348. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | Q08881. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMR | Q08881. Positions 3-617. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DIP | DIP-29974N. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IntAct | Q08881. 1 interaction. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MINT | MINT-110502. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| STRING | Q08881. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | Q08881. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DMDM | 585361. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PeptideAtlas | Q08881. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | Q08881. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENST00000422843; ENSP00000398655; ENSG00000113263. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 3702. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:3702. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UCSC | uc003lwo.1. human. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CTD | 3702. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | GC05P156607. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| H-InvDB | HIX0024849. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:6171. ITK. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MIM | 186973. gene. 613011. phenotype. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| neXtProt | NX_Q08881. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orphanet | 238505. Autosomal recessive lymphoproliferative disease. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA29968. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| eggNOG | prNOG16075. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | HBG755340. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | HBG008761. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InParanoid | Q08881. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OMA | HVYQIMN. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OrthoDB | EOG48WC1S. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PhylomeDB | Q08881. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BRENDA | 2.7.10.2. 2681. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pathway_Interaction_DB | pi3kcipathway. Class I PI3K signaling events. fcer1pathway. Fc-epsilon receptor I signaling in mast cells. tcrpathway. TCR signaling in naive CD4+ T cells. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Reactome | REACT_6900. Immune System. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | Q08881. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Bgee | Q08881. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_ITK. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genevestigator | Q08881. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000113263. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR011009. Kinase-like_dom. IPR011993. PH_type. IPR001849. Pleckstrin_homology. IPR000719. Prot_kinase_cat_dom. IPR017441. Protein_kinase_ATP_BS. IPR001245. Ser-Thr/Tyr_kinase. IPR000980. SH2. IPR001452. SH3_domain. IPR008266. Tyr_kinase_AS. IPR020635. Tyr_kinase_cat_dom. IPR020697. Tyr_kinase_non-rcpt_ITK/TSK. IPR001562. Znf_Btk_motif. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:2.30.29.30. PH_type. 1 hit. G3DSA:3.30.505.10. SH2. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KO | K07363. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PANTHER | PTHR24418:SF138. PTHR24418:SF138. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF00779. BTK. 1 hit. PF00169. PH. 1 hit. PF07714. Pkinase_Tyr. 1 hit. PF00017. SH2. 1 hit. PF00018. SH3_1. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRINTS | PR00401. SH2DOMAIN. PR00109. TYRKINASE. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMART | SM00107. BTK. 1 hit. SM00233. PH. 1 hit. SM00252. SH2. 1 hit. SM00326. SH3. 1 hit. SM00219. TyrKc. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SUPFAM | SSF56112. Kinase_like. 1 hit. SSF50044. SH3. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS50003. PH_DOMAIN. 1 hit. PS00107. PROTEIN_KINASE_ATP. 1 hit. PS50011. PROTEIN_KINASE_DOM. 1 hit. PS00109. PROTEIN_KINASE_TYR. 1 hit. PS50001. SH2. 1 hit. PS50002. SH3. 1 hit. PS51113. ZF_BTK. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 14507. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | ITK_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q08881 Secondary accession number(s): B2R752, Q32ML7 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Chordata Protein Annotation Program | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
Relevant documents
| Human and mouse protein kinases Human and mouse protein kinases: classification and index |
| Human chromosome 5 Human chromosome 5: entries, gene names and cross-references to MIM |
| Human entries with polymorphisms or disease mutations List of human entries with polymorphisms or disease mutations |
| Human polymorphisms and disease mutations Index of human polymorphisms and disease mutations |
| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with