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UniProtKB/Swiss-Prot Q07923 (LOT6_YEAST)
Last modified
March 2, 2010.
Version 63.
History...
Clusters with 100%,
90%,
50% identity |
Documents (2) |
Third-party data |
Customize display | text xml rdf/xml gff fasta |
Names and origin
| Protein names | Recommended name: NAD(P)H-dependent FMN reductase LOT6 Short name=FMN reductase LOT6 EC=1.5.1.29 Alternative name(s): Azoreductase LOT6 Low temperature response protein 6 | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Saccharomyces cerevisiae (Baker's yeast) [Complete proteome] | ||||
| Taxonomic identifier | 4932 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Fungi › Dikarya › Ascomycota › Saccharomycotina › Saccharomycetes › Saccharomycetales › Saccharomycetaceae › Saccharomyces |
Protein attributes
| Sequence length | 191 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | Has several reductase activities that are NAD(P)H-dependent and involve FMN as a cofactor, ferricyanide being the best substrate for reduction. May be involved in ferric iron assimilation. Ref.6 |
| Catalytic activity | FMNH2 + NAD(P)+ = FMN + NAD(P)H. |
| Subunit structure | Homodimer. Ref.6 |
| Subcellular location | |
| Induction | Induced by low temperature and by cycloheximide. Ref.3 |
| Miscellaneous | Present with 1270 molecules/cell in log phase SD medium. Ref.5 |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Cellular component | Cytoplasm Nucleus |
| Ligand | FMN Flavoprotein NAD NADP |
| Molecular function | Oxidoreductase |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | cytoplasmic sequestering of transcription factor Inferred from direct assay. Source: SGD oxidation reductionInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW response to oxidative stressInferred from mutant phenotype. Source: SGD |
| Cellular component | cytosol Inferred from direct assay. Source: SGD nucleus Ref.4Inferred from direct assay. Source: SGD |
| Molecular function | FMN reductase activity Inferred from electronic annotation. Source: EC NAD(P)H dehydrogenase (quinone) activityInferred from direct assay. Source: SGD transcription factor bindingInferred from direct assay. Source: SGD |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 191 | 191 | NAD(P)H-dependent FMN reductase LOT6 | PRO_0000234661 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 94 – 97 | 4 | FMN binding | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 11 | 1 | FMN | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 124 | 1 | FMN | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 2 – 7 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 16 – 28 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 31 – 37 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 39 – 43 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 45 – 48 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 61 – 63 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 67 – 69 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 73 – 83 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 86 – 93 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 101 – 108 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 112 – 116 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 118 – 125 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 126 – 129 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 130 – 142 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 146 – 154 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 164 – 166 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 168 – 173 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 174 – 184 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | Z73183 Genomic DNA. Translation: CAA97533.1. AY558199 Genomic DNA. Translation: AAS56525.1. | ||||||||||||
| PIR | S64833. | ||||||||||||
| RefSeq | NP_013111.1. | ||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||
| DIP | DIP-4604N. | ||||||||||||
| IntAct | Q07923. 4 interactions. | ||||||||||||
| STRING | Q07923. | ||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||
| PRIDE | Q07923. | ||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||
| Ensembl | YLR011W; YLR011W; YLR011W; Saccharomyces cerevisiae. [Genome view] | ||||||||||||
| GeneID | 850698. | ||||||||||||
| GenomeReviews | Gene locus YLR011W in contig Y13138_GR. | ||||||||||||
| KEGG | sce:YLR011W. | ||||||||||||
| NMPDR | fig|4932.3.peg.4102. | ||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||
| CYGD | YLR011w. | ||||||||||||
| SGD | S000004001. LOT6. | ||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||
| eggNOG | fuNOG11552. | ||||||||||||
| HOGENOM | HBG697130. | ||||||||||||
| OMA | TPQYNWG. | ||||||||||||
| OrthoDB | EOG9NCNWJ. | ||||||||||||
| PhylomeDB | Q07923. | ||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||
| BRENDA | 1.5.1.29. 250. | ||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||
| ArrayExpress | Q07923. | ||||||||||||
| Genevestigator | Q07923. | ||||||||||||
| GermOnline | YLR011W. Saccharomyces cerevisiae. | ||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||
Other Resources | |||||||||||||
| NextBio | 966730. | ||||||||||||
Entry information
| Entry name | LOT6_YEAST | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q07923 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | FPAP (Fungal Proteome Annotation Project) | ||||||||
Relevant documents
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| Yeast Yeast (Saccharomyces cerevisiae): entries, gene names and cross-references to SGD |

Clusters with


