Q05193 (DYN1_HUMAN) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
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January 25, 2012.
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| Protein names | Recommended name: Dynamin-1 EC=3.6.5.5 | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 864 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Microtubule-associated force-producing protein involved in producing microtubule bundles and able to bind and hydrolyze GTP. Most probably involved in vesicular trafficking processes. Involved in receptor-mediated endocytosis. |
| Catalytic activity | GTP + H2O = GDP + phosphate. |
| Subunit structure | Interacts with CAV1 and SH3GLB1. Binds SH3GL1, SH3GL2 and SH3GL3 By similarity. Interacts with PHOCN By similarity. Interacts with SNX9. Ref.4 |
| Subcellular location | Cytoplasm. Cytoplasm › cytoskeleton. Note: Microtubule-associated. Ref.4 |
| Sequence similarities | Belongs to the dynamin family. Contains 1 GED domain. Contains 1 PH domain. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Endocytosis |
| Cellular component | Cytoplasm Cytoskeleton Microtubule |
| Coding sequence diversity | Alternative splicing Polymorphism |
| Ligand | GTP-binding Nucleotide-binding |
| Molecular function | Hydrolase Motor protein |
| PTM | Nitration Phosphoprotein |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | endosome organization Inferred from mutant phenotype. Source: BHF-UCL receptor-mediated endocytosisInferred from mutant phenotype. Source: UniProtKB |
| Cellular component | microtubule Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Molecular function | GTP binding Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW GTPase activityTraceable author statement. Source: ProtInc |
| Complete GO annotation... | |
Binary interactions
With | Entry | #Exp. | IntAct | Notes |
|---|---|---|---|---|
| itself | 5 | EBI-713135,EBI-713135 | ||
| FNBP1 | Q96RU3 | 5 | EBI-713135,EBI-1111248 | |
| GRB2 | P62993 | 3 | EBI-713135,EBI-401755 | |
| NCK1 | P16333 | 2 | EBI-713135,EBI-389883 |
Alternative products
| This entry describes 5 isoforms produced by alternative splicing. [Align] [Select] | ||||||
| Isoform 1 (identifier: Q05193-1) This isoform has been chosen as the 'canonical' sequence. All positional information in this entry refers to it. This is also the sequence that appears in the downloadable versions of the entry. | ||||||
| Isoform 2 (identifier: Q05193-2) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 407-444: MAFETIVKKQ...LISTVRQCTK → LAFEATVKKQ...LTATIRKCSE | ||||||
| Isoform 3 (identifier: Q05193-3) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 845-864: SRSGQASPSRPESPRPPFDL → RITISDP | ||||||
| Isoform 4 (identifier: Q05193-4) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 846-864: RSGQASPSRPESPRPPFDL → QPIGSGKSIPS | ||||||
| Isoform 5 (identifier: Q05193-5) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 407-444: MAFETIVKKQ...LISTVRQCTK → LAFEATVKKQ...LTATIRKCSE 845-864: SRSGQASPSRPESPRPPFDL → RITISDP |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 864 | 864 | Dynamin-1 | PRO_0000206563 | ||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 519 – 625 | 107 | PH | |||||||||||||||||||||||
| Domain | 659 – 750 | 92 | GED | |||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 38 – 45 | 8 | GTP By similarity | |||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 136 – 140 | 5 | GTP By similarity | |||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 205 – 208 | 4 | GTP By similarity | |||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 80 | 1 | Phosphotyrosine By similarity | |||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 125 | 1 | Nitrated tyrosine By similarity | |||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 125 | 1 | Phosphotyrosine By similarity | |||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 354 | 1 | Phosphotyrosine Ref.5 | |||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 774 | 1 | Phosphoserine Ref.6 | |||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 776 | 1 | Phosphothreonine Ref.6 | |||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 778 | 1 | Phosphoserine Ref.6 | |||||||||||||||||||||||
Natural variations | ||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 407 – 444 | 38 | MAFET…RQCTK → LAFEATVKKQVQKLKEPSIK CVDMVVSELTATIRKCSE in isoform 2 and isoform 5. | VSP_031518 | ||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 845 – 864 | 20 | SRSGQ…PPFDL → RITISDP in isoform 3 and isoform 5. | VSP_031519 | ||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 846 – 864 | 19 | RSGQA…PPFDL → QPIGSGKSIPS in isoform 4. | VSP_031520 | ||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 744 | 1 | D → N. Ref.1 Corresponds to variant rs1042007 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_048904 | ||||||||||||||||||||||
Experimental info | ||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 44 | 1 | K → A: Inhibits receptor-mediated endocytosis. Ref.1 | |||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 188 | 1 | K → E in AAH50279. Ref.3 | |||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 287 | 1 | N → D in AAH50279. Ref.3 | |||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 809 | 1 | L → M in AAH50279. Ref.3 | |||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 520 – 529 | 10 | ||||||||||||||||||||||||
| Helix | 533 – 535 | 3 | ||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 537 – 555 | 19 | ||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 561 – 566 | 6 | ||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 570 – 574 | 5 | ||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 579 – 582 | 4 | ||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 584 – 590 | 7 | ||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 601 – 609 | 9 | ||||||||||||||||||||||||
| Helix | 610 – 622 | 13 | ||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
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| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | L07807 mRNA. Translation: AAA02803.1. L07808 mRNA. Translation: AAA02804.1. L07809 mRNA. Translation: AAA02805.1. L07810 mRNA. Translation: AAA02806.1. AL590708 Genomic DNA. Translation: CAI13837.1. AL590708 Genomic DNA. Translation: CAI13839.2. BC050279 mRNA. Translation: AAH50279.2. BC063850 mRNA. Translation: AAH63850.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IPI | IPI00413140. IPI00657691. IPI00816287. IPI00887273. IPI00888758. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | A40671. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_001005336.1. NM_001005336.1. NP_004399.2. NM_004408.2. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.522413. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | Q05193. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMR | Q05193. Positions 6-746. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IntAct | Q05193. 17 interactions. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MINT | MINT-233135. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| STRING | Q05193. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | Q05193. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DMDM | 172046078. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | Q05193. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENST00000372923; ENSP00000362014; ENSG00000106976. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 1759. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:1759. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UCSC | uc010mxs.1. human. uc010mxv.1. human. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CTD | 1759. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | GC09P130965. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:2972. DNM1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HPA | CAB005920. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MIM | 602377. gene. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| neXtProt | NX_Q05193. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA27440. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| eggNOG | prNOG05496. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | HBG434086. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | HBG107833. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OMA | DMILTFI. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PhylomeDB | Q05193. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pathway_Interaction_DB | ephbfwdpathway. EPHB forward signaling. ephrinbrevpathway. Ephrin B reverse signaling. trkrpathway. Neurotrophic factor-mediated Trk receptor signaling. txa2pathway. Thromboxane A2 receptor signaling. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Reactome | REACT_111045. Developmental Biology. REACT_111102. Signal Transduction. REACT_11123. Membrane Trafficking. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | Q05193. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Bgee | Q05193. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_DNM1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genevestigator | Q05193. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000106976. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR022812. Dynamin. IPR000375. Dynamin_central. IPR001401. Dynamin_GTPase. IPR019762. Dynamin_GTPase_CS. IPR003130. GED. IPR020850. GTPase_effector_domain_GED. IPR011993. PH_type. IPR001849. Pleckstrin_homology. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:2.30.29.30. PH_type. 2 hits. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KO | K01528. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF01031. Dynamin_M. 1 hit. PF00350. Dynamin_N. 1 hit. PF02212. GED. 1 hit. PF00169. PH. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRINTS | PR00195. DYNAMIN. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMART | SM00053. DYNc. 1 hit. SM00302. GED. 1 hit. SM00233. PH. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS00410. DYNAMIN. 1 hit. PS51388. GED. 1 hit. PS50003. PH_DOMAIN. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 7163. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | DYN1_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q05193 Secondary accession number(s): A6NLM6 Q86VD2 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Chordata Protein Annotation Program | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
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