Reviewed,
UniProtKB/Swiss-Prot Q05115 (AMDA_BORBR)
Last modified
March 3, 2009.
Version 36.
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Documents (1) |
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Names and origin · Protein attributes · General annotation (Comments) · Ontologies · Sequence annotation (Features) · Sequences · References · Cross-references · Entry information · Relevant documents
Names and origin
| Protein names | Recommended name: Arylmalonate decarboxylase Short name=AMDase EC=4.1.1.76 |
| Organism | Bordetella bronchiseptica (Alcaligenes bronchisepticus) |
| Taxonomic identifier | 518 [NCBI] |
| Taxonomic lineage | Bacteria › Proteobacteria › Betaproteobacteria › Burkholderiales › Alcaligenaceae › Bordetella |
Protein attributes
| Sequence length | 240 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is not processed. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Catalytic activity | 2-aryl-2-methylmalonate = 2-arylpropanoate + CO2. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Molecular function | Decarboxylase Lyase |
| Technical term | 3D-structure Direct protein sequencing |
| Gene Ontology (GO) | |
| Molecular function | arylmalonate decarboxylase activity Inferred from electronic annotation. Source: EC |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 240 | 240 | Arylmalonate decarboxylase | PRO_0000064576 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 8 – 15 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 22 – 25 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 33 – 37 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 48 – 65 | 18 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 67 – 72 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 75 – 79 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 83 – 97 | 15 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 101 – 103 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 104 – 114 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 119 – 126 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 128 – 140 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 144 – 150 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 154 – 157 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 164 – 177 | 14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 182 – 188 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 196 – 204 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 208 – 210 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 211 – 223 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 235 – 238 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| [1] | "Cloning and heterologous expression of a novel arylmalonate decarboxylase gene from Alcaligenes bronchisepticus KU 1201." Miyamoto K., Ohta H. Appl. Microbiol. Biotechnol. 38:234-238(1992) [PubMed: 1369144] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA], PROTEIN SEQUENCE OF 1-10. Strain: KU 1201. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| S54007 Genomic DNA. Translation: AAC60426.1. D13116 Genomic DNA. Translation: BAA02419.1. | |||||||||||||||||||
| PIR | JS0754. A48374. | ||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||
| InterPro | IPR015942. Asp/Glu/hydantoin_racemase. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| Pfam | PF01177. Asp_Glu_race. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | AMDA_BORBR | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q05115 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HAMAP (High-quality Automated and Manual Annotation of microbial Proteomes) | ||||||||

Clusters with


