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UniProtKB/Swiss-Prot Q02790 (FKBP4_HUMAN)
Last modified
November 25, 2008.
Version 102.
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Clusters with 100%,
90%,
50% identity |
Documents (4) |
Third-party data |
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Names and origin
| Protein names | Recommended name: FK506-binding protein 4 EC=5.2.1.8 Alternative name(s): Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase Short name=PPIase Short name=Rotamase HSP-binding immunophilin Short name=HBI FKBP52 protein 52 kDa FK506-binding protein FKBP59 p59 protein | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Homo sapiens (Human) | ||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 459 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | Component of unactivated mammalian steroid receptor complexes that sediment at 8-10 S. May have a rotamase activity. May play a role in the intracellular trafficking of heterooligomeric forms of steroid hormone receptors. |
| Catalytic activity | Peptidylproline (omega=180) = peptidylproline (omega=0). |
| Subunit structure | Interacts with NR3C1 and dynein By similarity. Associates with HSP90 and HSP70 in unactivated steroid hormone receptor complexes. Also interacts with peroxisomal phytanoyl-CoA alpha-hydroxylase (PHYH). |
| Subcellular location | |
| Tissue specificity | Widely expressed. |
| Post-translational modification | Phosphorylation by CK2 results in loss of HSP90 binding activity By similarity. Phosphorylated upon DNA damage, probably by ATM or ATR. |
| Sequence similarities | Contains 2 PPIase FKBP-type domains. Contains 3 TPR repeats. |
| Sequence caution | The sequence AAH02887.2 differs from that shown. Reason: Erroneous translation. Wrong choice of frame. |
Ontologies
Keywords | |
|---|---|
| Cellular component | Cytoplasm Nucleus |
| Domain | Repeat TPR repeat |
| Molecular function | Isomerase Rotamase |
| PTM | Acetylation Phosphoprotein |
| Technical term | 3D-structure Direct protein sequencing |
Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | protein folding Ref.1 Traceable author statement. Source: ProtInc |
| Cellular component | cytoplasm Ref.4 Traceable author statement. Source: ProtInc nucleusInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Molecular function | FK506 binding Ref.3 Traceable author statement. Source: UniProtKB peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activityInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW protein binding, bridging Ref.4Traceable author statement. Source: ProtInc |
| Complete GO annotation... | |
Binary interactions
With | Entry | #Exp. | IntAct | Notes |
|---|---|---|---|---|
| LOXHD1 | Q8IVV2 | 1 | EBI-1047444,EBI-1044376 | |
| SAE1 | Q9UBE0 | 1 | EBI-1047444,EBI-743154 |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Initiator methionine | 1 | 1 | Removed | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 2 – 459 | 458 | FK506-binding protein 4 | PRO_0000075318 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 50 – 138 | 89 | PPIase FKBP-type 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 167 – 253 | 87 | PPIase FKBP-type 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 270 – 303 | 34 | TPR 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 319 – 352 | 34 | TPR 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 353 – 386 | 34 | TPR 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 143 | 1 | Phosphothreonine; by CK2 By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 274 | 1 | N6-acetyllysine | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 451 | 1 | Phosphoserine | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 453 | 1 | Phosphoserine | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 30 – 39 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 52 – 61 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 66 – 69 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 77 – 80 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 81 – 84 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 88 – 94 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 102 – 107 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 109 – 111 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 112 – 116 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 119 – 121 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 128 – 138 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 147 – 156 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 169 – 178 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 181 – 191 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 195 – 198 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 202 – 208 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 216 – 221 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 223 – 225 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 226 – 230 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 233 – 235 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 243 – 253 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 258 – 260 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 263 – 283 | 21 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 286 – 299 | 14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 300 – 302 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 309 – 331 | 23 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 335 – 348 | 14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 353 – 365 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 369 – 382 | 14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 387 – 424 | 38 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
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| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| M88279 mRNA. Translation: AAA36111.1. BC001786 mRNA. Translation: AAH01786.1. BC002887 mRNA. Translation: AAH02887.2. Sequence problems. BC007924 mRNA. Translation: AAH07924.1. | |||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | A46372. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_002005.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.524183 | ||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| IntAct | Q02790. | ||||||||||||||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | Q02790. | ||||||||||||||||||||||||||||||
2-D gel databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| REPRODUCTION-2DPAGE | IPI00219005. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| PeptideAtlas | Q02790. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENSG00000004478. Homo sapiens. [Contig view] | ||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 2288. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:2288. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| H-InvDB | HIX0010330. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:3720. FKBP4. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| HPA | CAB017441. HPA006148. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| MIM | 600611. gene. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA28161. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | Q02790. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | Q02790. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | Q02790. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_FKBP4. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000004478. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR001179. PPIase_FKBP. IPR001440. TPR-1. IPR011990. TPR-like_helical. IPR013026. TPR_region. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:1.25.40.10. TPR-like_helical. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| PANTHER | PTHR10516. PPIase_FKBP. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF00254. FKBP_C. 2 hits. PF00515. TPR_1. 3 hits. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||
| SMART | SM00028. TPR. 3 hits. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS50059. FKBP_PPIASE. 2 hits. PS50005. TPR. 3 hits. PS50293. TPR_REGION. 2 hits. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||
Other Resources | |||||||||||||||||||||||||||||||
| DrugBank | DB01093. Dimethyl sulfoxide. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 9299. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | FKBP4_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q02790 Secondary accession number(s): Q9UCP1, Q9UCV7 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HPI (Human Proteome Initiative) | ||||||||
Relevant documents
| Human chromosome 12 Human chromosome 12: entries, gene names and cross-references to MIM |
| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

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