Q02790 (FKBP4_HUMAN) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
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| Protein names | Recommended name: Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4 Short name=PPIase FKBP4 EC=5.2.1.8 Alternative name(s): 51 kDa FK506-binding protein Short name=FKBP51 52 kDa FK506-binding protein Short name=52 kDa FKBP Short name=FKBP-52 59 kDa immunophilin Short name=p59 FK506-binding protein 4 Short name=FKBP-4 FKBP59 HSP-binding immunophilin Short name=HBI Immunophilin FKBP52 Rotamase Cleaved into the following chain: | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 459 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Immunophilin protein with PPIase and co-chaperone activities By similarity. Component of unliganded steroid receptors heterocomplexes through interaction with heat-shock protein 90 (HSP90). May play a role in the intracellular trafficking of heterooligomeric forms of steroid hormone receptors between cytoplasm and nuclear compartments By similarity. The isomerase activity controls neuronal growth cones via regulation of TRPC1 channel opening. Acts also as a regulator of microtubule dynamics by inhibiting MAPT/TAU ability to promote microtubule assembly. Ref.1 Ref.6 Ref.7 Ref.12 |
| Catalytic activity | Peptidylproline (omega=180) = peptidylproline (omega=0). |
| Enzyme regulation | Inhibited by FK506. Ref.1 |
| Subunit structure | Homodimer. Associates with HSP90 and HSP70 in unactivated steroid hormone receptor complexes. Also interacts with peroxisomal phytanoyl-CoA alpha-hydroxylase (PHYH). Interacts with HSF1 in the HSP90 complex. Associates with tubulin By similarity. Interacts with MAPT/TAU By similarity. Interacts with NR3C1 and dynein By similarity. Interacts (via TPR domain) with S100A1, S100A2 and S100A6; the interaction is Ca2+ dependent. Interaction with S100A1 and S100A2 (but not with S100A6) leads to inhibition of FKBP4-HSP90 interaction. Ref.6 Ref.7 Ref.9 Ref.11 Ref.12 Ref.13 Ref.22 |
| Subcellular location | Cytoplasm › cytosol By similarity. Nucleus. Cytoplasm › cytoskeleton By similarity Ref.7. |
| Tissue specificity | Widely expressed. Ref.1 |
| Domain | The PPIase activity is mainly due to the fisrt PPIase FKBP-type domain (1-138 AA) By similarity. The C-terminal region (AA 375-458) is required to prevent tubulin polymerization By similarity. The chaperone activity resides in the C-terminal region, mainly between amino acids 264 and 400 By similarity. |
| Post-translational modification | Phosphorylation by CK2 results in loss of HSP90 binding activity By similarity. Phosphorylated upon DNA damage, probably by ATM or ATR. Ref.15 Ref.16 Ref.17 Ref.18 |
| Sequence similarities | Contains 2 PPIase FKBP-type domains. Contains 3 TPR repeats. |
Ontologies
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 459 | 459 | Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4 | PRO_0000391468 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Initiator methionine | 1 | 1 | Removed; alternate Ref.5 Ref.6 Ref.7 Ref.8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 2 – 459 | 458 | Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4, N-terminally processed | PRO_0000075318 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 50 – 138 | 89 | PPIase FKBP-type 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 167 – 253 | 87 | PPIase FKBP-type 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 270 – 303 | 34 | TPR 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 319 – 352 | 34 | TPR 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 353 – 386 | 34 | TPR 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 267 – 400 | 134 | Interaction with tubulin By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 1 | 1 | N-acetylmethionine; in FK506-binding protein 4; alternate Ref.5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 2 | 1 | N-acetylthreonine; in FK506-binding protein 4, N-terminally processed; partial Ref.5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 143 | 1 | Phosphothreonine; by CK2 By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 274 | 1 | N6-acetyllysine Ref.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 282 | 1 | N6-acetyllysine Ref.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 451 | 1 | Phosphoserine Ref.15 Ref.16 Ref.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 453 | 1 | Phosphoserine Ref.16 Ref.17 Ref.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 436 | 1 | T → P. Corresponds to variant rs1042228 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_050624 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 67 – 68 | 2 | FD → DV: Decreased catalytic activity toward TRPC1. Ref.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 30 – 39 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 52 – 61 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 66 – 69 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 77 – 80 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 81 – 84 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 88 – 94 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 102 – 107 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 109 – 111 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 112 – 116 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 119 – 121 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 128 – 138 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 147 – 156 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 169 – 178 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 181 – 191 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 195 – 198 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 202 – 208 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 216 – 221 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 223 – 225 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 226 – 230 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 233 – 235 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 243 – 253 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 258 – 260 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 263 – 283 | 21 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 286 – 299 | 14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 300 – 302 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 309 – 331 | 23 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 335 – 348 | 14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 353 – 365 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 369 – 382 | 14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 387 – 424 | 38 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
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| + | Additional computationally mapped references. |
Web resources
| Protein Spotlight A mind astray - Issue 118 of June 2010 |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | M88279 mRNA. Translation: AAA36111.1. AC005841 Genomic DNA. No translation available. CH471116 Genomic DNA. Translation: EAW88889.1. CH471116 Genomic DNA. Translation: EAW88890.1. BC001786 mRNA. Translation: AAH01786.1. BC007924 mRNA. Translation: AAH07924.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| IPI | IPI00219005. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | A46372. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_002005.1. NM_002014.3. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.524183. Hs.713721. | ||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | Q02790. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| SMR | Q02790. Positions 21-427. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| DIP | DIP-50866N. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| IntAct | Q02790. 14 interactions. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| MINT | MINT-3024864. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| STRING | Q02790. | ||||||||||||||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | Q02790. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| DMDM | 399866. | ||||||||||||||||||||||||||||||
2D gel databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| REPRODUCTION-2DPAGE | IPI00219005. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| PeptideAtlas | Q02790. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | Q02790. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENST00000001008; ENSP00000001008; ENSG00000004478. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 2288. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:2288. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| UCSC | uc001qkz.1. human. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| CTD | 2288. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | GC12P002904. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| H-InvDB | HIX0010330. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:3720. FKBP4. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| HPA | CAB017441. HPA006148. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| MIM | 600611. gene. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| neXtProt | NX_Q02790. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA28161. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
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| GeneTree | ENSGT00550000074272. | ||||||||||||||||||||||||||||||
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| HOVERGEN | HBG051624. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| InParanoid | Q02790. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| OMA | ANMFQRL. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| OrthoDB | EOG49GKGJ. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| PhylomeDB | Q02790. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| Pathway_Interaction_DB | ar_pathway. Coregulation of Androgen receptor activity. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | Q02790. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Bgee | Q02790. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_FKBP4. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Genevestigator | Q02790. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000004478. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
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| KO | K09571. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| PANTHER | PTHR10516. PPIase_FKBP. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF00254. FKBP_C. 2 hits. PF00515. TPR_1. 2 hits. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||
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| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||
Other | |||||||||||||||||||||||||||||||
| DrugBank | DB01093. Dimethyl sulfoxide. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 9299. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | FKBP4_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q02790 Secondary accession number(s): D3DUQ1, Q9UCP1, Q9UCV7 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Chordata Protein Annotation Program | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
Relevant documents
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