Q00855 (ALL2_DERFA) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
May 1, 2013.
Version 77.
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Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Sequence annotation·Sequences·References·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize orderNames and origin
| Protein names | Recommended name: Mite group 2 allergen Der f 2 Alternative name(s): Allergen Der f II Allergen=Der f 2 | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Dermatophagoides farinae (American house dust mite) | ||
| Taxonomic identifier | 6954 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Ecdysozoa › Arthropoda › Chelicerata › Arachnida › Acari › Acariformes › Sarcoptiformes › Astigmata › Psoroptidia › Analgoidea › Pyroglyphidae › Dermatophagoidinae › Dermatophagoides![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 146 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Subcellular location | |
| Allergenic properties | Causes an allergic reaction in human. Common symptoms of mite allergy are bronchial asthma, allergic rhinitis and conjunctivitis. |
| Miscellaneous | The sequence shown here is from clone 2. The N-terminal sequence (AA 1-8) from clone 1 and 11 are not yet known. |
| Sequence similarities | Belongs to the NPC2 family. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Cellular component | Secreted |
| Coding sequence diversity | Polymorphism |
| Disease | Allergen |
| Domain | Signal |
| PTM | Disulfide bond |
| Technical term | 3D-structure Direct protein sequencing |
| Gene Ontology (GO) | |
| Cellular_component | extracellular region Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-SubCell |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Signal peptide | 1 – 17 | 17 | Ref.4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 18 – 146 | 129 | Mite group 2 allergen Der f 2 | PRO_0000019860 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 25 ↔ 136 | Ref.3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 38 ↔ 44 | Ref.3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 90 ↔ 95 | Ref.3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 93 | 1 | M → V in clone 1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 105 | 1 | I → A in clone 11. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 128 | 1 | I → V in clone 11. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 142 | 1 | G → A in clone 11. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 5 – 8 | 4 | ILCL → GTMV in AAB30829. Ref.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 23 – 28 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 30 – 35 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 36 – 38 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 40 – 43 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 44 – 47 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 50 – 59 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 68 – 75 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 78 – 80 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 83 – 85 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 89 – 91 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 92 – 94 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 95 – 97 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 102 – 110 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 121 – 129 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 132 – 139 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 142 – 145 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| [1] | "Cloning and expression of cDNA coding for the major house dust mite allergen Der f II in Escherichia coli." Yuuki T., Okumura Y., Ando T., Yamakawa H., Suko M., Haida M., Okudaira H. Agric. Biol. Chem. 55:1233-1238(1991) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA], PARTIAL PROTEIN SEQUENCE. |
| [2] | "Molecular biology of mite antigens." Okuhira H. Arerugi 43:435-440(1994) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] OF 4-146. |
| [3] | "Determination of three disulfide bonds in a major house dust mite allergen, Der f II." Nishiyama C., Yuuki T., Takai T., Okumura Y., Okudaira H. Int. Arch. Allergy Immunol. 101:159-166(1993) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: DISULFIDE BONDS, PARTIAL PROTEIN SEQUENCE. |
| [4] | "Antigenic and structural analysis of group II allergens (Der f II and Der p II) from house dust mites (Dermatophagoides spp)." Heymann P.W., Chapman M.D., Aalberse R.C., Fox J.W., Platts-Mills T.A.E. J. Allergy Clin. Immunol. 83:1055-1067(1989) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: PROTEIN SEQUENCE OF 18-52. |
| [5] | "Solution structure of Der f 2, the major mite allergen for atopic diseases." Ichikawa S., Hatanaka H., Yuuki T., Iwamoto N., Kojima S., Nishiyama C., Ogura K., Okumura Y., Inagaki F. J. Biol. Chem. 273:356-360(1998) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: STRUCTURE BY NMR. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | D10447 mRNA. Translation: BAA01239.1. D10448 mRNA. Translation: BAA01240.1. D10449 mRNA. Translation: BAA01241.1. S70378 mRNA. Translation: AAB30829.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | JU0394. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | Q00855. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMR | Q00855. Positions 18-146. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein family/group databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Allergome | 1108. Der f 2.0103. 1294. Der f 2.0101. 1295. Der f 2.0102. 302. Der f 2. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | 2.60.40.770. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR014756. Ig_E-set. IPR003172. MD-2_lipid-recog_dom. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF02221. E1_DerP2_DerF2. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMART | SM00737. ML. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SUPFAM | SSF81296. Ig_E-set. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| EvolutionaryTrace | Q00855. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | ALL2_DERFA | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q00855 Secondary accession number(s): P39672, Q26359 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
Relevant documents
| Allergens Nomenclature of allergens and list of entries |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with
