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UniProtKB/Swiss-Prot Q00535 (CDK5_HUMAN)
Last modified
November 25, 2008.
Version 98.
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Clusters with 100%,
90%,
50% identity |
Documents (7) |
Third-party data |
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Names and origin
| Protein names | Recommended name: Cell division protein kinase 5 EC=2.7.11.22 Alternative name(s): Cyclin-dependent kinase 5 Tau protein kinase II catalytic subunit Short name=TPKII catalytic subunit Serine/threonine-protein kinase PSSALRE | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Homo sapiens (Human) | ||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 292 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is not processed. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | Probably involved in the control of the cell cycle. Interacts with D1 and D3-type G1 cyclins. Can phosphorylate histone H1, tau, MAP2 and NF-H and NF-M. Also interacts with p35 which activates the kinase. |
| Catalytic activity | ATP + a protein = ADP + a phosphoprotein. |
| Subunit structure | Heterodimer of a catalytic subunit and a regulatory subunit (p35). Found in a trimolecular complex with CABLES1 and ABL1. Interacts with CABLES1 By similarity. Interacts with AATK. |
| Subcellular location | CytoplasmBy similarity. Cell projection › lamellipodiumBy similarity. Cell projection › growth coneBy similarity. Note= In axonal growth cone with extension to the peripheral lamellipodia By similarity. |
| Sequence similarities | Belongs to the protein kinase superfamily. CMGC Ser/Thr protein kinase family. CDC2/CDKX subfamily. Contains 1 protein kinase domain. |
Ontologies
Binary interactions
With | Entry | #Exp. | IntAct | Notes |
|---|---|---|---|---|
| AATK | Q6ZMQ8-1 | 1 | EBI-1041567,EBI-2008436 | |
| AATK | Q6ZMQ8-2 | 1 | EBI-1041567,EBI-2008441 | |
| CDKN1A | P38936 | 1 | EBI-1041567,EBI-375077 | |
| CDKN1B | P46527 | 2 | EBI-1041567,EBI-519280 |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 292 | 292 | Cell division protein kinase 5 | PRO_0000085784 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 4 – 286 | 283 | Protein kinase | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 10 – 18 | 9 | ATP By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 126 | 1 | Proton acceptor By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 33 | 1 | ATP By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 14 | 1 | Phosphothreonine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 15 | 1 | Phosphotyrosine; by ABL1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 159 | 1 | Phosphoserine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 225 | 1 | E → D | VAR_041977 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 4 – 9 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 17 – 23 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 24 – 26 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 29 – 38 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 40 – 42 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 45 – 55 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 66 – 72 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 75 – 81 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 84 – 86 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 87 – 93 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 94 – 96 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 100 – 119 | 20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 129 – 131 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 132 – 134 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 140 – 142 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 145 – 147 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 165 – 167 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 170 – 173 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 182 – 195 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 196 – 198 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 208 – 219 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 224 – 226 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 230 – 232 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 249 – 251 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 257 – 266 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 271 – 273 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 277 – 280 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 284 – 286 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
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| [2] | Meyerson M. Submitted (FEB-1993) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: SEQUENCE REVISION. |
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| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| X66364 mRNA. Translation: CAA47007.1. AY049778 mRNA. Translation: AAL15435.1. BT006680 mRNA. Translation: AAP35326.1. BC005115 mRNA. Translation: AAH05115.1. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | S23386. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_004926.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.647078 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DIP | DIP:24221N. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IntAct | Q00535. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | Q00535. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENSG00000164885. Homo sapiens. [Contig view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 1020. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:1020. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| H-InvDB | HIX0019667. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:1774. CDK5. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HPA | CAB008909. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MIM | 123831. gene. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA26310. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | Q00535. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | Q00535. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | Q00535. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_CDK5. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000164885. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR000719. Prot_kinase_core. IPR017441. Protein_kinase_ATP_bd_CS. IPR017442. Se/Thr_pkinase-rel. IPR008271. Ser_thr_pkin_AS. IPR002290. Ser_thr_pkinase. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF00069. Pkinase. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProDom | PD000001. Prot_kinase. 1 hit. [Graphical view] [Entries sharing at least one domain] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMART | SM00220. S_TKc. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS00107. PROTEIN_KINASE_ATP. 1 hit. PS50011. PROTEIN_KINASE_DOM. 1 hit. PS00108. PROTEIN_KINASE_ST. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Resources | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BindingDB | Q00535. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| LinkHub | Q00535. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 4287. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | CDK5_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q00535 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HPI (Human Proteome Initiative) | ||||||||
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