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UniProtKB/Swiss-Prot Q00534 (CDK6_HUMAN)
Last modified
November 25, 2008.
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Names and origin · Protein attributes · General annotation (Comments) · Ontologies · Binary interactions · Sequence annotation (Features) · Sequences · References · Cross-references · Entry information · Relevant documents
Names and origin
| Protein names | Recommended name: Cell division protein kinase 6 EC=2.7.11.22 Alternative name(s): Serine/threonine-protein kinase PLSTIRE | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Homo sapiens (Human) | ||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 326 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is not processed. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | Probably involved in the control of the cell cycle. Interacts with D-type G1 cyclins. |
| Catalytic activity | ATP + a protein = ADP + a phosphoprotein. |
| Sequence similarities | Belongs to the protein kinase superfamily. CMGC Ser/Thr protein kinase family. CDC2/CDKX subfamily. Contains 1 protein kinase domain. |
Ontologies
Binary interactions
With | Entry | #Exp. | IntAct | Notes |
|---|---|---|---|---|
| CCND1 | P24385 | 1 | EBI-295663,EBI-375001 | |
| CCND3 | P30281 | 1 | EBI-295663,EBI-375013 | |
| CDC37 | Q16543 | 1 | EBI-295663,EBI-295634 | |
| CDKN1A | P38936 | 1 | EBI-295663,EBI-375077 | |
| CDKN2A | O77617-1 | 1 | EBI-295663,EBI-1542248 | From a different organism. |
| CDKN2A | P42771 | 5 | EBI-295663,EBI-375053 | |
| CDKN2C | P42773 | 2 | EBI-295663,EBI-711290 | |
| Cdkn2d | Q60773 | 1 | EBI-295663,EBI-1027163 | From a different organism. |
| MCM10 | Q7L590 | 1 | EBI-295663,EBI-374912 | |
| MCM2 | P49736 | 1 | EBI-295663,EBI-374819 |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 326 | 326 | Cell division protein kinase 6 | PRO_0000085789 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 13 – 300 | 288 | Protein kinase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 19 – 27 | 9 | ATP By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 145 | 1 | Proton acceptor | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 43 | 1 | ATP By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 13 | 1 | Phosphotyrosine | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 24 | 1 | Phosphotyrosine | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 110 | 1 | D → N | VAR_041978 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 199 | 1 | P → L in a metastatic melanoma sample; somatic mutation. | VAR_041979 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 9 – 11 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 13 – 22 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 25 – 32 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 33 – 37 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 39 – 49 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 58 – 70 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 79 – 87 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 89 – 99 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 105 – 111 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 119 – 138 | 20 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 148 – 150 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 151 – 153 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 159 – 161 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 172 – 176 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 188 – 191 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 199 – 214 | 16 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 224 – 235 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 240 – 242 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 251 – 253 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 262 – 264 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 271 – 280 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 285 – 287 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 291 – 295 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 298 – 300 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
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| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| X66365 mRNA. Translation: CAA47008.1. AY128534 Genomic DNA. Translation: AAM76970.1. AC000065 Genomic DNA. No translation available. AC004128 Genomic DNA. No translation available. AC004011 Genomic DNA. No translation available. BC052264 mRNA. Translation: AAH52264.1. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | S23387. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_001250.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.119882 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DIP | DIP:687N. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IntAct | Q00534. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | Q00534. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NIEHS-SNPs | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PeptideAtlas | Q00534. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENSG00000105810. Homo sapiens. [Contig view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 1021. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:1021. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| H-InvDB | HIX0006844. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:1777. CDK6. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HPA | CAB004363. HPA002637. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MIM | 603368. gene. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA103. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | Q00534. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | Q00534. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Reactome | REACT_152. Cell Cycle, Mitotic. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | Q00534. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_CDK6. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000105810. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR000719. Prot_kinase_core. IPR017441. Protein_kinase_ATP_bd_CS. IPR017442. Se/Thr_pkinase-rel. IPR008271. Ser_thr_pkin_AS. IPR002290. Ser_thr_pkinase. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF00069. Pkinase. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProDom | PD000001. Prot_kinase. 1 hit. [Graphical view] [Entries sharing at least one domain] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMART | SM00220. S_TKc. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS00107. PROTEIN_KINASE_ATP. 1 hit. PS50011. PROTEIN_KINASE_DOM. 1 hit. PS00108. PROTEIN_KINASE_ST. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Resources | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BindingDB | Q00534. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| LinkHub | Q00534. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 4291. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||

Clusters with