Reviewed,
UniProtKB/Swiss-Prot Q00169 (PIPNA_HUMAN)
Last modified
November 25, 2008.
Version 77.
History...
Clusters with 100%,
90%,
50% identity |
Documents (4) |
Third-party data |
Customize display | text xml rdf/xml gff fasta |
Names and origin
| Protein names | Recommended name: Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform Short name=PtdIns transfer protein alpha Short name=PtdInsTP Short name=PI-TP-alpha | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 270 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | Catalyzes the transfer of PtdIns and phosphatidylcholine between membranes. |
| Subcellular location | |
| Tissue specificity | Expressed in a wide range of tissues. |
| Sequence similarities | Belongs to the PtdIns transfer protein family. Class I subfamily. |
Ontologies
Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Transport |
| Cellular component | Cytoplasm |
| Ligand | Lipid-binding |
| PTM | Phosphoprotein |
| Technical term | 3D-structure Direct protein sequencing |
Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | lipid metabolic process Ref.1 Non-traceable author statement. Source: ProtInc transportInferred from electronic annotation. Source: InterPro visual perceptionTraceable author statement. Source: ProtInc |
| Cellular component | cytoplasm Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW nucleusInferred from direct assay. Source: HPA |
| Molecular function | lipid binding Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW phosphatidylcholine transmembrane transporter activity Ref.1Traceable author statement. Source: ProtInc phosphatidylinositol transporter activity Ref.1Traceable author statement. Source: ProtInc protein bindingInferred from physical interaction. Source: IntAct |
| Complete GO annotation... | |
Binary interactions
With | Entry | #Exp. | IntAct | Notes |
|---|---|---|---|---|
| HSDL1 | Q3SXM5 | 1 | EBI-1042490,EBI-1056703 | |
| MLKL | Q8NB16 | 1 | EBI-1042490,EBI-1055040 | |
| MORF4L2 | Q15014 | 1 | EBI-1042490,EBI-399257 | |
| PMVK | Q15126 | 1 | EBI-1042490,EBI-1055562 |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Initiator methionine | 1 | 1 | Removed By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 2 – 270 | 269 | Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform | PRO_0000191639 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 57 | 1 | Phosphotyrosine | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 45 | 1 | N → P in BAA06276. Ref.2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 3 – 13 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 15 – 33 | 19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 38 – 49 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 54 – 65 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 70 – 73 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 81 – 90 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 93 – 99 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 101 – 103 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 106 – 120 | 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 123 – 126 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 130 – 133 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 137 – 141 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 146 – 148 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 151 – 153 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 156 – 158 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 160 – 162 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 166 – 168 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 177 – 182 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 190 – 200 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 203 – 205 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 206 – 230 | 25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 232 – 235 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 240 – 260 | 21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "Sequence of a human cDNA encoding phosphatidylinositol transfer protein and occurrence of a related sequence in widely divergent eukaryotes." Dickeson S.K., Helmkamp G.M. Jr., Yarbrough L.R. Gene 142:301-305(1994) [PubMed: 8194769] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA]. Tissue: Testis. |
| [2] | Tanaka S., Yamashita S., Hosaka K. Submitted (NOV-1995) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA]. Tissue: Brain. |
| [3] | "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)." The MGC Project Team Genome Res. 14:2121-2127(2004) [PubMed: 15489334] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA]. Tissue: Brain and Ovary. |
| [4] | Lubec G., Afjehi-Sadat L. Submitted (MAR-2007) to UniProtKB Cited for: PROTEIN SEQUENCE OF 135-146, MASS SPECTROMETRY. Tissue: Brain and Cajal-Retzius cell. |
| [5] | "Global survey of phosphotyrosine signaling identifies oncogenic kinases in lung cancer." Rikova K., Guo A., Zeng Q., Possemato A., Yu J., Haack H., Nardone J., Lee K., Reeves C., Li Y., Hu Y., Tan Z., Stokes M., Sullivan L., Mitchell J., Wetzel R., Macneill J., Ren J.M. Comb M.J.Cell 131:1190-1203(2007) [PubMed: 18083107] [Abstract] Cited for: PHOSPHORYLATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT TYR-57, MASS SPECTROMETRY. Tissue: Lung. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| M73704 mRNA. Translation: AAA36441.1. D30036 mRNA. Translation: BAA06276.1. BC082976 mRNA. Translation: AAH82976.1. BC045108 mRNA. Translation: AAH45108.1. | |||||||||||||
| PIR | I53775. | ||||||||||||
| RefSeq | NP_006215.1. | ||||||||||||
| UniGene | Hs.429819 | ||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||
| |||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||
| IntAct | Q00169. | ||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||
| PhosphoSite | Q00169. | ||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||
| Ensembl | ENSG00000174238. Homo sapiens. [Contig view] | ||||||||||||
| GeneID | 5306. | ||||||||||||
| KEGG | hsa:5306. | ||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||
| H-InvDB | HIX0013400. | ||||||||||||
| HGNC | HGNC:9001. PITPNA. | ||||||||||||
| MIM | 600174. gene. | ||||||||||||
| PharmGKB | PA33335. | ||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||
| GeneCards | Search... | ||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||
| HOVERGEN | Q00169. | ||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||
| ArrayExpress | Q00169. | ||||||||||||
| CleanEx | HS_PITPNA. | ||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000174238. Homo sapiens. | ||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||
| InterPro | IPR001666. PI_transfer. [Graphical view] | ||||||||||||
| PANTHER | PTHR10658. PI_transfer. 1 hit. | ||||||||||||
| Pfam | PF02121. IP_trans. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| PRINTS | PR00391. PITRANSFER. | ||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||
Other Resources | |||||||||||||
| NextBio | 20510. | ||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||
Entry information
| Entry name | PIPNA_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q00169 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HPI (Human Proteome Initiative) | ||||||||
Relevant documents
| Human chromosome 17 Human chromosome 17: entries, gene names and cross-references to MIM |
| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

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