Reviewed,
UniProtKB/Swiss-Prot P73925 (GLBN_SYNY3)
Last modified
November 3, 2009.
Version 66.
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Documents (3) |
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Names and origin · Protein attributes · General annotation (Comments) · Ontologies · Sequence annotation (Features) · Sequences · References · Cross-references · Entry information · Relevant documents
Names and origin
| Protein names | Recommended name: Cyanoglobin Alternative name(s): Hemoglobin Short name=Hb | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Synechocystis sp. (strain PCC 6803) [Complete proteome] [HAMAP] | ||||
| Taxonomic identifier | 1148 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Bacteria › Cyanobacteria › Chroococcales › Synechocystis |
Protein attributes
| Sequence length | 124 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is not processed. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | Forms a very stable complex with oxygen. The oxygen dissociation rate is 0.011 s(-1). |
| Subunit structure | Monomer. |
| Sequence similarities | Belongs to the protozoan/cyanobacterial globin family. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Oxygen transport Transport |
| Ligand | Heme Iron Metal-binding |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | oxygen transport Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Molecular function | heme binding Inferred from electronic annotation. Source: InterPro oxygen bindingInferred from electronic annotation. Source: InterPro oxygen transporter activityInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 124 | 124 | Cyanoglobin | PRO_0000162646 | |||||||||||||||||||||||||||
Sites | |||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 46 | 1 | Iron (heme distal ligand) | ||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 70 | 1 | Iron (heme proximal ligand) Potential | ||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 117 | 1 | Heme (covalent; via tele nitrogen) | ||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | |||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 46 | 1 | H → A: Changes iron coordination. Ref.2 | ||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 4 – 8 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 11 – 26 | 16 | |||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 29 – 31 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 32 – 35 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 40 – 55 | 16 | |||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 58 – 60 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 63 – 69 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 71 – 76 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 81 – 96 | 16 | |||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 97 – 99 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 102 – 112 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 115 – 121 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "Sequence analysis of the genome of the unicellular cyanobacterium Synechocystis sp. strain PCC6803. II. Sequence determination of the entire genome and assignment of potential protein-coding regions." Kaneko T., Sato S., Kotani H., Tanaka A., Asamizu E., Nakamura Y., Miyajima N., Hirosawa M., Sugiura M., Sasamoto S., Kimura T., Hosouchi T., Matsuno A., Muraki A., Nakazaki N., Naruo K., Okumura S., Shimpo S. Tabata S.DNA Res. 3:109-136(1996) [PubMed: 8905231] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. |
| [2] | "Structural investigations of the hemoglobin of the cyanobacterium Synechocystis PCC6803 reveal a unique distal heme pocket." Couture M., Das T.K., Savard P.Y., Ouellet Y., Wittenberg J.B., Wittenberg B.A., Rousseau D.L., Guertin M. Eur. J. Biochem. 267:4770-4780(2000) [PubMed: 10903511] [Abstract] Cited for: CHARACTERIZATION, MUTAGENESIS OF HIS-46. |
| [3] | "Cloning, expression, purification, and preliminary characterization of a putative hemoglobin from the cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803." Scott N.L., Lecomte J.T.J. Protein Sci. 9:587-597(2000) [PubMed: 10752621] [Abstract] Cited for: CHARACTERIZATION. |
| [4] | "Novel histidine-heme covalent linkage in a hemoglobin." Vu B.C., Jones A.D., Lecomte J.T.J. J. Am. Chem. Soc. 124:8544-8545(2002) [PubMed: 12121092] [Abstract] Cited for: COVALENT HEME ATTACHMENT. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| BA000022 Genomic DNA. Translation: BAA17991.1. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | S75129. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_441311.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| STRING | P73925. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 954656. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenomeReviews | Gene locus slr2097 in contig BA000022_GR. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | syn:slr2097. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NMPDR | fig|1148.1.peg.1412. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CMR | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | P73925. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OMA | VDIFYRK. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BioCyc | SSP1148:SLR2097-MON. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR012292. Globin. IPR019795. Globin_bac-like_CS. IPR001486. Globin_trunc_bac-like. IPR016339. Globin_trunc_bac-like_HbN/cyan. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:1.10.490.10. Globin_related. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF01152. Bac_globin. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIRSF | PIRSF002030. Globin_Protozoa/Cyanobacteria. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProDom | PD004840. Bac_globin. 1 hit. [Graphical view] [Entries sharing at least one domain] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS01213. GLOBIN_FAM_2. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | GLBN_SYNY3 | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P73925 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HAMAP (High-quality Automated and Manual Annotation of microbial Proteomes) | ||||||||
Relevant documents
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |
| Synechocystis PCC 6803 Synechocystis (strain PCC 6803): entries and gene names |

Clusters with


