P68807 (GATC_STAAM) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
January 25, 2012.
Version 44.
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| Protein names | Recommended name: Aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit C Short name=Asp/Glu-ADT subunit C EC=6.3.5.- | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Staphylococcus aureus (strain Mu50 / ATCC 700699) [Complete proteome] [HAMAP] | ||||
| Taxonomic identifier | 158878 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Bacteria › Firmicutes › Bacillales › Staphylococcus |
Protein attributes
| Sequence length | 100 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Allows the formation of correctly charged Asn-tRNA(Asn) or Gln-tRNA(Gln) through the transamidation of misacylated Asp-tRNA(Asn) or Glu-tRNA(Gln) in organisms which lack either or both of asparaginyl-tRNA or glutaminyl-tRNA synthetases. The reaction takes place in the presence of glutamine and ATP through an activated phospho-Asp-tRNA(Asn) or phospho-Glu-tRNA(Gln) By similarity. HAMAP MF_00122 |
| Catalytic activity | ATP + L-glutamyl-tRNA(Gln) + L-glutamine = ADP + phosphate + L-glutaminyl-tRNA(Gln) + L-glutamate. HAMAP MF_00122 ATP + L-aspartyl-tRNA(Asn) + L-glutamine = ADP + phosphate + L-asparaginyl-tRNA(Asn) + L-glutamate. HAMAP MF_00122 |
| Subunit structure | Heterotrimer of A, B and C subunits By similarity. HAMAP MF_00122 |
| Sequence similarities | Belongs to the GatC family. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Protein biosynthesis |
| Ligand | ATP-binding Nucleotide-binding |
| Molecular function | Ligase |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | regulation of translational fidelity Inferred from electronic annotation. Source: InterPro translationInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Molecular function | ATP binding Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW ligase activityInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 100 | 100 | Aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit C HAMAP MF_00122 | PRO_0000105330 | ||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||
| Helix | 6 – 16 | 11 | ||||||||||||||||
| Helix | 22 – 39 | 18 | ||||||||||||||||
| Helix | 40 – 44 | 5 | ||||||||||||||||
| Helix | 74 – 78 | 5 | ||||||||||||||||
| Beta strand | 82 – 92 | 11 | ||||||||||||||||
Sequences
References
| [1] | "Whole genome sequencing of meticillin-resistant Staphylococcus aureus." Kuroda M., Ohta T., Uchiyama I., Baba T., Yuzawa H., Kobayashi I., Cui L., Oguchi A., Aoki K., Nagai Y., Lian J.-Q., Ito T., Kanamori M., Matsumaru H., Maruyama A., Murakami H., Hosoyama A., Mizutani-Ui Y. Hiramatsu K.Lancet 357:1225-1240(2001) [PubMed: 11418146] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. Strain: Mu50 / ATCC 700699. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | BA000017 Genomic DNA. Translation: BAB58063.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_372425.1. NC_002758.2. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | P68807. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMR | P68807. Positions 2-100. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| STRING | P68807. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| EnsemblBacteria | EBSTAT00000007984; EBSTAP00000007802; EBSTAG00000007983. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 1121914. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenomeReviews | Gene locus SAV1901 in contig BA000017_GR. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | sav:SAV1901. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PATRIC | 19564656. VBIStaAur52173_1968. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CMR | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| eggNOG | COG0721. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneTree | EBGT00050000024331. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | HBG586403. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OMA | HAVPLTN. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PhylomeDB | P68807. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtClustDB | PRK00034. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BioCyc | SAUR158878:SAV1901-MONOMER. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HAMAP | MF_00122. GatC. [Tree] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR003837. Glu-tRNAGlntrans. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KO | K02435. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF02686. Glu-tRNAGln. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR00135. GatC. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | GATC_STAAM | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P68807 Secondary accession number(s): Q9RF08 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Prokaryotic Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with