P66881 (SURE_SALTY) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
May 1, 2013.
Version 57.
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Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Sequence annotation·Sequences·References·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize orderNames and origin
| Protein names | Recommended name: 5'/3'-nucleotidase SurE EC=3.1.3.5 EC=3.1.3.6 | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) [Reference proteome] [HAMAP] | ||||
| Taxonomic identifier | 99287 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Bacteria › Proteobacteria › Gammaproteobacteria › Enterobacteriales › Enterobacteriaceae › Salmonella › ![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 253 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Nucleotidase with a broad substrate specificity as it can dephosphorylate various ribo- and deoxyribonucleoside 5'-monophosphates and ribonucleoside 3'-monophosphates with highest affinity to 3'-AMP. Also hydrolyzes polyphosphate (exopolyphosphatase activity) with the preference for short-chain-length substrates (P20-25). Might be involved in the regulation of dNTP and NTP pools, and in the turnover of 3'-mononucleotides produced by numerous intracellular RNases (T1, T2, and F) during the degradation of various RNAs By similarity. HAMAP-Rule MF_00060 |
| Catalytic activity | A 5'-ribonucleotide + H2O = a ribonucleoside + phosphate. HAMAP-Rule MF_00060 A 3'-ribonucleotide + H2O = a ribonucleoside + phosphate. HAMAP-Rule MF_00060 (Polyphosphate)(n) + H2O = (polyphosphate)(n-1) + phosphate. HAMAP-Rule MF_00060 |
| Cofactor | Binds 1 divalent metal cation per subunit By similarity. |
| Subcellular location | Cytoplasm Potential HAMAP-Rule MF_00060. |
| Sequence similarities | Belongs to the SurE nucleotidase family. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Cellular component | Cytoplasm |
| Ligand | Metal-binding Nucleotide-binding |
| Molecular function | Hydrolase |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Cellular_component | cytoplasm Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-SubCell |
| Molecular_function | 3'-nucleotidase activity Inferred from electronic annotation. Source: HAMAP 5'-nucleotidase activityInferred from electronic annotation. Source: HAMAP exopolyphosphatase activityInferred from electronic annotation. Source: HAMAP metal ion bindingInferred from electronic annotation. Source: HAMAP nucleotide bindingInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 253 | 253 | 5'/3'-nucleotidase SurE HAMAP-Rule MF_00060 | PRO_0000111839 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 8 | 1 | Divalent metal cation By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 9 | 1 | Divalent metal cation By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 39 | 1 | Divalent metal cation By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 92 | 1 | Divalent metal cation By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 2 – 6 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 14 – 23 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 24 – 26 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 27 – 36 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 52 – 55 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 61 – 64 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 68 – 77 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 80 – 82 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 85 – 94 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 98 – 103 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 105 – 111 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 112 – 115 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 116 – 118 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 120 – 129 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 131 – 147 | 17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 154 – 160 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 165 – 167 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 171 – 173 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 178 – 180 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 185 – 189 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 195 – 199 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 205 – 207 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 213 – 218 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 222 – 227 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 234 – 236 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 237 – 247 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| [1] | "Complete genome sequence of Salmonella enterica serovar Typhimurium LT2." McClelland M., Sanderson K.E., Spieth J., Clifton S.W., Latreille P., Courtney L., Porwollik S., Ali J., Dante M., Du F., Hou S., Layman D., Leonard S., Nguyen C., Scott K., Holmes A., Grewal N., Mulvaney E. Wilson R.K.Nature 413:852-856(2001) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. Strain: LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | AE006468 Genomic DNA. Translation: AAL21807.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_461848.1. NC_003197.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | P66881. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| STRING | 99287.STM2927. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | P66881. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| EnsemblBacteria | AAL21807; AAL21807; STM2927. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 1254450. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | stm:STM2927. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| PATRIC | 32384539. VBISalEnt20916_3081. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | HOG000122500. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| KO | K03787. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| OMA | LGSNMGE. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtClustDB | PRK00346. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | 3.40.1210.10. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| HAMAP | MF_00060. SurE. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR002828. SurE-like_Pase/nucleotidase. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF01975. SurE. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||
| SUPFAM | SSF64167. SurE-like_Pase/nucleotidase. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR00087. surE. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||
Other | |||||||||||||||||||||||||||||||
| EvolutionaryTrace | P66881. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | SURE_SALTY | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P66881 Secondary accession number(s): Q8XFG4 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Prokaryotic Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with
