P65762 (PPIA_MYCTU) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
January 25, 2012.
Version 52.
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| Protein names | Recommended name: Probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A Short name=PPIase A EC=5.2.1.8 Alternative name(s): Rotamase A | ||||||
| Gene names |
| ||||||
| Organism | Mycobacterium tuberculosis | ||||||
| Taxonomic identifier | 1773 [NCBI] | ||||||
| Taxonomic lineage | Bacteria › Actinobacteria › Actinobacteridae › Actinomycetales › Corynebacterineae › Mycobacteriaceae › Mycobacterium › Mycobacterium tuberculosis complex |
Protein attributes
| Sequence length | 182 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | PPIases accelerate the folding of proteins. It catalyzes the cis-trans isomerization of proline imidic peptide bonds in oligopeptides By similarity. |
| Catalytic activity | Peptidylproline (omega=180) = peptidylproline (omega=0). |
| Subcellular location | Cytoplasm By similarity. |
| Sequence similarities | Belongs to the cyclophilin-type PPIase family. Contains 1 PPIase cyclophilin-type domain. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Cellular component | Cytoplasm |
| Molecular function | Isomerase Rotamase |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | protein folding Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW response to iron ionInferred from expression pattern. Source: MTBBASE |
| Cellular component | cytosol Inferred from direct assay. Source: MTBBASE extracellular regionInferred from direct assay. Source: MTBBASE plasma membraneInferred from direct assay. Source: MTBBASE |
| Molecular function | peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity Inferred from direct assay. Source: MTBBASE |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 182 | 182 | Probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A | PRO_0000064209 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 13 – 181 | 169 | PPIase cyclophilin-type | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 16 – 21 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 24 – 30 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 32 – 34 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 36 – 46 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 59 – 63 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 69 – 75 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 76 – 78 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 79 – 82 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 87 – 90 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 109 – 115 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 123 – 125 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 127 – 132 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 135 – 137 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 138 – 140 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 143 – 147 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 150 – 160 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 170 – 172 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | BX842572 Genomic DNA. Translation: CAB02430.1. AE000516 Genomic DNA. Translation: AAK44233.1. | ||||||||||||
| PIR | G70698. | ||||||||||||
| RefSeq | NP_214523.1. NC_000962.2. NP_334419.1. NC_002755.2. | ||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||
| ProteinModelPortal | P65762. | ||||||||||||
| SMR | P65762. Positions 12-182. | ||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||
| EnsemblBacteria | EBMYCT00000003596; EBMYCP00000003596; EBMYCG00000003594. EBMYCT00000070037; EBMYCP00000068096; EBMYCG00000070032. | ||||||||||||
| GeneID | 887087. 922451. | ||||||||||||
| GenomeReviews | Gene locus MT0011 in contig AE000516_GR. Gene locus Rv0009 in contig AL123456_GR. | ||||||||||||
| KEGG | mtc:MT0011. mtu:Rv0009. | ||||||||||||
| PATRIC | 18121752. VBIMycTub22151_0012. | ||||||||||||
| TIGR | MT0011. | ||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||
| TubercuList | Rv0009. | ||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||
| GeneTree | EBGT00050000015125. | ||||||||||||
| HOGENOM | HBG610621. | ||||||||||||
| OMA | HQDVPRE. | ||||||||||||
| PhylomeDB | P65762. | ||||||||||||
| ProtClustDB | CLSK790189. | ||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||
| BRENDA | 5.2.1.8. 3445. | ||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||
| InterPro | IPR002130. Cyclophilin-like_PPIase_dom. IPR024936. Cyclophilin-type_PPIase. IPR020892. Cyclophilin-type_PPIase_CS. [Graphical view] | ||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:2.40.100.10. PPIase_cyclophilin. 1 hit. | ||||||||||||
| KO | K03767. | ||||||||||||
| Pfam | PF00160. Pro_isomerase. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| PIRSF | PIRSF001467. Peptidylpro_ismrse. 1 hit. | ||||||||||||
| PRINTS | PR00153. CSAPPISMRASE. | ||||||||||||
| SUPFAM | SSF50891. CSA_PPIase. 1 hit. | ||||||||||||
| PROSITE | PS00170. CSA_PPIASE_1. 1 hit. PS50072. CSA_PPIASE_2. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||
Entry information
| Entry name | PPIA_MYCTU | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P65762 Secondary accession number(s): P71578 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Prokaryotic Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with