P63208 (SKP1_HUMAN) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
May 1, 2013.
Version 105.
History...
Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Interactions·Alt products·Sequence annotation·Sequences·References·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize order
Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Interactions·Alt products·Sequence annotation·Sequences·References·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize orderNames and origin
| Protein names | Recommended name: S-phase kinase-associated protein 1 Alternative name(s): Cyclin-A/CDK2-associated protein p19 Organ of Corti protein 2 Short name=OCP-2 Organ of Corti protein II Short name=OCP-II RNA polymerase II elongation factor-like protein SIII Transcription elongation factor B p19A p19skp1 | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Reference proteome] | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 163 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Essential component of the SCF (SKP1-CUL1-F-box protein) ubiquitin ligase complex, which mediates the ubiquitination of proteins involved in cell cycle progression, signal transduction and transcription. In the SCF complex, serves as an adapter that links the F-box protein to CUL1. The functional specificity of the SCF complex depends on the F-box protein as substrate recognition component. SCF(BTRC) and SCF(FBXW11) direct ubiquitination of CTNNB1 and participate in Wnt signaling. SCF(FBXW11) directs ubiquitination of phosphorylated NFKBIA. SCF(BTRC) directs ubiquitination of NFKBIB, NFKBIE, ATF4, SMAD3, SMAD4, CDC25A, FBXO5 and probably NFKB2. SCF(SKP2) directs ubiquitination of phosphorylated CDKN1B/p27kip and is involved in regulation of G1/S transition. SCF(SKP2) directs ubiquitination of ORC1, CDT1, RBL2, ELF4, CDKN1A, RAG2, FOXO1A, and probably MYC and TAL1. SCF(FBXW7) directs ubiquitination of cyclin E, NOTCH1 released notch intracellular domain (NICD), and probably PSEN1. SCF(FBXW2) directs ubiquitination of GCM1. SCF(FBXO32) directs ubiquitination of MYOD1. SCF(FBXO7) directs ubiquitination of BIRC2 and DLGAP5. SCF(FBXO33) directs ubiquitination of YBX1. SCF(FBXO11) does not seem to direct ubiquitination of TP53. SCF(BTRC) mediates the ubiquitination of NFKBIA at 'Lys-21' and 'Lys-22'; the degradation frees the associated NFKB1-RELA dimer to translocate into the nucleus and to activate transcription. SCF(CCNF) directs ubiquitination of CCP110. SCF(FBXL3) and SCF(FBXL21) direct ubiquitination of CRY1 and CRY2. SCF(FBXO9) direct ubiquitination of TTI1 and TELO2. Ref.18 Ref.21 |
| Pathway | |
| Subunit structure | Component of multiple SCF (SKP1-CUL1-F-box) E3 ubiquitin-protein ligase complexes formed of CUL1, SKP1, RBX1 and a variable F-box domain-containing protein as substrate-specific subunit. Component of the SCF(FBXW11) complex containing FBXW11. Component of the SCF(SKP2) complex containing SKP2, in which it interacts directly with SKP1, SKP2 and RBX1. Component of the SCF(FBXW2) complex containing FBXw2. Component of the SCF(FBXO32) complex containing FBXO32. Component of the probable SCF(FBXO7) complex containing FBXO7. Component of the SCF(FBXO11) complex containing FBXO11. Component of the SCF(FBXO25) complex containing FBXO25. Component of the SCF(FBXO33) complex containing FBXO33. Component of the probable SCF(FBXO4) complex containing FBXO4. Component of the SCF(FBXO44) complex, composed of SKP1, CUL1 and FBXO44. Component of the SCF(BTRC) complex, composed of SKP1, CUL1 and BTRC. This complex binds phosphorylated NFKBIA. Part of a SCF complex consisting of CUL1, RBX1, SKP1 and FBXO2. Component of a SCF(SKP2)-like complex containing CUL1, SKP1, TRIM21 and SKP2. Component of the SCF(FBXO17) complex, composed of SKP1, CUL1 and FBXO17. Component of the SCF(FBXO27) complex, composed of SKP1, CUL1 and FBXO27. Component of the SCF(CCNF) complex consisting of CUL1, RBX1, SKP1 and CCNF. Component of the SCF(FBXL3) complex composed of CUL1, SKP1, RBX1 and FBXL3. Component of the SCF(FBXL21) complex composed of CUL1, SKP1, RBX1 and FBXL21. Component of the SCF(FBXO9) composed of CUL1, SKP1, RBX1 and FBXO9. Component of the SCF(FBXW7) composed of CUL1, SKP1, RBX1 and FBXW7. Ref.7 Ref.8 Ref.9 Ref.10 Ref.11 Ref.18 |
| Sequence similarities | Belongs to the SKP1 family. |
Ontologies
Binary interactions
With | Entry | #Exp. | IntAct | Notes |
|---|---|---|---|---|
| BTRC | Q9Y297 | 4 | EBI-307486,EBI-307461 | |
| CCNF | P41002 | 6 | EBI-307486,EBI-1207574 | |
| CUL1 | Q13616 | 6 | EBI-307486,EBI-359390 | |
| FBXL8 | Q96CD0 | 3 | EBI-307486,EBI-2321097 | |
| FBXO11 | Q86XK2 | 2 | EBI-307486,EBI-1047804 | |
| FBXO46 | Q6PJ61 | 3 | EBI-307486,EBI-2322982 | |
| FBXO7 | Q9Y3I1 | 2 | EBI-307486,EBI-1161222 | |
| FBXW11 | Q9UKB1 | 4 | EBI-307486,EBI-355189 | |
| FBXW2 | Q9UKT8 | 2 | EBI-307486,EBI-914727 | |
| FBXW5 | Q969U6 | 3 | EBI-307486,EBI-741068 | |
| FBXW9 | Q5XUX1 | 3 | EBI-307486,EBI-2322729 | |
| PPP1CA | P62136 | 3 | EBI-307486,EBI-357253 | |
| SKP2 | Q13309 | 6 | EBI-307486,EBI-456291 |
Alternative products
| This entry describes 2 isoforms produced by alternative splicing. [Align] [Select] | ||||||
| Isoform 1 (identifier: P63208-1) This isoform has been chosen as the 'canonical' sequence. All positional information in this entry refers to it. This is also the sequence that appears in the downloadable versions of the entry. | ||||||
| Isoform 2 (identifier: P63208-2) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 154-163: RKENQWCEEK → GSTQFCL | ||||||
| Note: No experimental confirmation available. |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Initiator methionine | 1 | 1 | Removed Ref.5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 2 – 163 | 162 | S-phase kinase-associated protein 1 | PRO_0000187251 | |||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 104 – 163 | 60 | Interaction with the F-box domain of F-box proteins By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 131 | 1 | Phosphothreonine Ref.12 Ref.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 154 – 163 | 10 | RKENQWCEEK → GSTQFCL in isoform 2. | VSP_007555 | |||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 14 | 1 | F → L. Corresponds to variant rs11538034 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_051999 | |||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 3 – 7 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 13 – 17 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 18 – 22 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 25 – 33 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 43 – 46 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 47 – 50 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 52 – 65 | 14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 81 – 83 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 87 – 92 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 97 – 110 | 14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 113 – 127 | 15 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 128 – 130 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 132 – 138 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 149 – 156 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 157 – 159 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "p19Skp1 and p45Skp2 are essential elements of the cyclin A-CDK2 S phase kinase." Zhang H., Kobayashi R., Galaktionov K., Beach D. Cell 82:915-925(1995) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ISOFORM 1). |
| [2] | "A novel cDNA with homology to an RNA polymerase II elongation factors maps to human chromosome 5q31 (TCEB1L) and to mouse chromosome 11 (Tceb1l)." Sowden J., Morrison K., Schofield J., Putt W., Edwards Y. Genomics 29:145-151(1995) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ISOFORM 1). |
| [3] | Mural R.J., Istrail S., Sutton G.G., Florea L., Halpern A.L., Mobarry C.M., Lippert R., Walenz B., Shatkay H., Dew I., Miller J.R., Flanigan M.J., Edwards N.J., Bolanos R., Fasulo D., Halldorsson B.V., Hannenhalli S., Turner R. Venter J.C.Submitted (SEP-2005) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. |
| [4] | "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)." The MGC Project Team Genome Res. 14:2121-2127(2004) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA] (ISOFORMS 1 AND 2). Tissue: Lung, Skin and Uterus. |
| [5] | Golaz O., Hughes G.J., Frutiger S., Paquet N., Bairoch A., Pasquali C., Sanchez J.-C., Tissot J.-D., Appel R.D., Walzer C., Balant L., Hochstrasser D.F. Submitted (FEB-1994) to UniProtKB Cited for: PROTEIN SEQUENCE OF 2-11. Tissue: Erythrocyte. |
| [6] | "Human inner ear OCP2 cDNA maps to 5q22-5q35.2 with related sequences on chromosomes 4p16.2-4p14, 5p13-5q22, 7pter-q22, 10 and 12p13-12qter." Liang Y., Chen H., Asher J.H. Jr., Chang C.-C., Friedman T.B. Gene 184:163-167(1997) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] OF 14-163 (ISOFORM 1). Tissue: Inner ear. |
| [7] | "CUL7: a DOC domain-containing cullin selectively binds Skp1.Fbx29 to form an SCF-like complex." Dias D.C., Dolios G., Wang R., Pan Z.Q. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99:16601-16606(2002) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH FBXW8, IDENTIFICATION IN SCF-LIKE COMPLEX. |
| [8] | "Siah-1, SIP, and Ebi collaborate in a novel pathway for beta-catenin degradation linked to p53 responses." Matsuzawa S., Reed J.C. Mol. Cell 7:915-926(2001) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: SUBUNIT OF A COMPLEX WITH SIAH1; CACYBP; UBE2D1; APC AND TBL1X. |
| [9] | "Regulation of p27 degradation and S-phase progression by Ro52 RING finger protein." Sabile A., Meyer A.M., Wirbelauer C., Hess D., Kogel U., Scheffner M., Krek W. Mol. Cell. Biol. 26:5994-6004(2006) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH THE SCF(SKP2)-LIKE COMPLEX, INTERACTION WITH TRIM21. |
| [10] | "Diversity in tissue expression, substrate binding, and SCF complex formation for a lectin family of ubiquitin ligases." Glenn K.A., Nelson R.F., Wen H.M., Mallinger A.J., Paulson H.L. J. Biol. Chem. 283:12717-12729(2008) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH FBXO44; FBXO17 AND FBXO27, IDENTIFICATION IN SCF-COMPLEX. |
| [11] | "SCF(Cyclin F) controls centrosome homeostasis and mitotic fidelity through CP110 degradation." D'Angiolella V., Donato V., Vijayakumar S., Saraf A., Florens L., Washburn M.P., Dynlacht B., Pagano M. Nature 466:138-142(2010) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: IDENTIFICATION IN THE SCF(CCNF) COMPLEX. |
| [12] | "Quantitative phosphoproteomics reveals widespread full phosphorylation site occupancy during mitosis." Olsen J.V., Vermeulen M., Santamaria A., Kumar C., Miller M.L., Jensen L.J., Gnad F., Cox J., Jensen T.S., Nigg E.A., Brunak S., Mann M. Sci. Signal. 3:RA3-RA3(2010) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: PHOSPHORYLATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT THR-131, MASS SPECTROMETRY. Tissue: Cervix carcinoma. |
| [13] | "Initial characterization of the human central proteome." Burkard T.R., Planyavsky M., Kaupe I., Breitwieser F.P., Buerckstuemmer T., Bennett K.L., Superti-Furga G., Colinge J. BMC Syst. Biol. 5:17-17(2011) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: IDENTIFICATION BY MASS SPECTROMETRY [LARGE SCALE ANALYSIS]. |
| [14] | "System-wide temporal characterization of the proteome and phosphoproteome of human embryonic stem cell differentiation." Rigbolt K.T., Prokhorova T.A., Akimov V., Henningsen J., Johansen P.T., Kratchmarova I., Kassem M., Mann M., Olsen J.V., Blagoev B. Sci. Signal. 4:RS3-RS3(2011) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: PHOSPHORYLATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT THR-131, MASS SPECTROMETRY. |
| [15] | "Insights into SCF ubiquitin ligases from the structure of the Skp1-Skp2 complex." Schulman B.A., Carrano A.C., Jeffrey P.D., Bowen Z., Kinnucan E.R.E., Finnin M.S., Elledge S.J., Harper J.W., Pagano M., Pavletich N.P. Nature 408:381-386(2000) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (1.8 ANGSTROMS) OF THE SKP1-SKP2 COMPLEX. |
| [16] | "Structure of the Cul1-Rbx1-Skp1-F box Skp2 SCF ubiquitin ligase complex." Zheng N., Schulman B.A., Song L., Miller J.J., Jeffrey P.D., Wang P., Chu C., Koepp D.M., Elledge S.J., Pagano M., Conaway R.C., Conaway J.W., Harper J.W., Pavletich N.P. Nature 416:703-709(2002) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (3.0 ANGSTROMS) IN SCF COMPLEX WITH CUL1; RBX1 AND SKP2. |
| [17] | "Structure of a beta-TrCP1-Skp1-beta-catenin complex: destruction motif binding and lysine specificity of the SCF(beta-TrCP1) ubiquitin ligase." Wu G., Xu G., Schulman B.A., Jeffrey P.D., Harper J.W., Pavletich N.P. Mol. Cell 11:1445-1456(2003) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.95 ANGSTROMS) IN COMPLEX WITH 176-606 OF BTRC AND CTNNB1. |
| [18] | "Structural basis of the Cks1-dependent recognition of p27(Kip1) by the SCF(Skp2) ubiquitin ligase." Hao B., Zheng N., Schulman B.A., Wu G., Miller J.J., Pagano M., Pavletich N.P. Mol. Cell 20:9-19(2005) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.3 ANGSTROMS) OF 3-159 IN COMPLEX WITH SKP2; CKS1B AND CDKN1B PHOSPHOPEPTIDE, SUBUNIT, FUNCTION. |
| [19] | "Structure of a Fbw7-Skp1-cyclin E complex: multisite-phosphorylated substrate recognition by SCF ubiquitin ligases." Hao B., Oehlmann S., Sowa M.E., Harper J.W., Pavletich N.P. Mol. Cell 26:131-143(2007) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.5 ANGSTROMS) IN COMPLEX WITH FBXW7 AND CCNE PEPTIDE. |
| [20] | "Structural basis for the selection of glycosylated substrates by SCF(Fbs1) ubiquitin ligase." Mizushima T., Yoshida Y., Kumanomidou T., Hasegawa Y., Suzuki A., Yamane T., Tanaka K. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 104:5777-5781(2007) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.4 ANGSTROMS) IN COMPLEX WITH FBXO2. |
| [21] | "Structural basis of dimerization-dependent ubiquitination by the SCF(Fbx4) ubiquitin ligase." Li Y., Hao B. J. Biol. Chem. 285:13896-13906(2010) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.8 ANGSTROMS) IN COMPLEX WITH FBXO4, FUNCTION. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | U33760 mRNA. Translation: AAC50241.1. Z47087 mRNA. Translation: CAA87392.1. CH471062 Genomic DNA. Translation: EAW62270.1. CH471062 Genomic DNA. Translation: EAW62271.1. CH471062 Genomic DNA. Translation: EAW62272.1. CH471062 Genomic DNA. Translation: EAW62276.1. BC009839 mRNA. Translation: AAH09839.1. BC020798 mRNA. Translation: AAH20798.1. BC025673 mRNA. Translation: AAH25673.1. BC065730 mRNA. Translation: AAH65730.1. U37558 mRNA. Translation: AAA79202.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IPI | IPI00172421. IPI00301364. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | I39170. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_008861.2. NM_006930.3. NP_733779.1. NM_170679.2. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.171626. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | P63208. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DIP | DIP-31606N. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IntAct | P63208. 52 interactions. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MINT | MINT-5001195. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| STRING | 9606.ENSP00000231487. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | P63208. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DMDM | 52783797. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2D gel databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SWISS-2DPAGE | P63208. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PaxDb | P63208. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PeptideAtlas | P63208. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | P63208. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DNASU | 6500. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENST00000353411; ENSP00000231487; ENSG00000113558. ENST00000517625; ENSP00000429961; ENSG00000113558. ENST00000522552; ENSP00000429472; ENSG00000113558. ENST00000522855; ENSP00000429686; ENSG00000113558. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 6500. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:6500. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UCSC | uc003kzc.4. human. uc003kzd.4. human. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CTD | 6500. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | GC05M133521. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| H-InvDB | HIX0129723. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:10899. SKP1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HPA | CAB012982. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MIM | 601434. gene. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| neXtProt | NX_P63208. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA162403424. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| eggNOG | COG5201. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | HOG000172184. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | HBG057008. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InParanoid | P63208. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KO | K03094. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OMA | VIQWCTY. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OrthoDB | EOG498V26. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PhylomeDB | P63208. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Reactome | REACT_111102. Signal Transduction. REACT_115566. Cell Cycle. REACT_116125. Disease. REACT_24941. Circadian Clock. REACT_6900. Immune System. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniPathway | UPA00143. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | P63208. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Bgee | P63208. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_SKP1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genevestigator | P63208. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000113558. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | 3.30.710.10. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR011333. BTB/POZ_fold. IPR016897. E3_ubiquit_lig_SCF_Skp. IPR001232. Skp1_comp. IPR016072. Skp1_comp_dimer. IPR016073. Skp1_comp_POZ. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PANTHER | PTHR11165. PTHR11165. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF01466. Skp1. 1 hit. PF03931. Skp1_POZ. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIRSF | PIRSF028729. E3_ubiquit_lig_SCF_Skp. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMART | SM00512. Skp1. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SUPFAM | SSF54695. BTB/POZ_fold. 1 hit. SSF81382. Skp1_comp_dimer. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ChiTaRS | SKP1. human. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| EvolutionaryTrace | P63208. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenomeRNAi | 6500. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 25267. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | SKP1_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P63208 Secondary accession number(s): D3DQ97 Q8TAY2 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Chordata Protein Annotation Program | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
Relevant documents
| Human chromosome 5 Human chromosome 5: entries, gene names and cross-references to MIM |
| Human entries with polymorphisms or disease mutations List of human entries with polymorphisms or disease mutations |
| Human polymorphisms and disease mutations Index of human polymorphisms and disease mutations |
| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PATHWAY comments Index of metabolic and biosynthesis pathways |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with
