P62979 (RS27A_HUMAN) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
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May 1, 2013.
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Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Sequence annotation·Sequences·References·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize orderNames and origin
| Protein names | Recommended name: Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a Alternative name(s): Ubiquitin carboxyl extension protein 80 Cleaved into the following 2 chains: | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Reference proteome] | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 156 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Ubiquitin exists either covalently attached to another protein, or free (unanchored). When covalently bound, it is conjugated to target proteins via an isopeptide bond either as a monomer (monoubiquitin), a polymer linked via different Lys residues of the ubiquitin (polyubiquitin chains) or a linear polymer linked via the initiator Met of the ubiquitin (linear polyubiquitin chains). Polyubiquitin chains, when attached to a target protein, have different functions depending on the Lys residue of the ubiquitin that is linked: Lys-6-linked may be involved in DNA repair; Lys-11-linked is involved in ERAD (endoplasmic reticulum-associated degradation) and in cell-cycle regulation; Lys-29-linked is involved in lysosomal degradation; Lys-33-linked is involved in kinase modification; Lys-48-linked is involved in protein degradation via the proteasome; Lys-63-linked is involved in endocytosis, DNA-damage responses as well as in signaling processes leading to activation of the transcription factor NF-kappa-B. Linear polymer chains formed via attachment by the initiator Met lead to cell signaling. Ubiquitin is usually conjugated to Lys residues of target proteins, however, in rare cases, conjugation to Cys or Ser residues has been observed. When polyubiquitin is free (unanchored-polyubiquitin), it also has distinct roles, such as in activation of protein kinases, and in signaling. Ref.12 Ref.16 Ribosomal protein S27a is a component of the 40S subunit of the ribosome. Ref.12 Ref.16 |
| Subunit structure | Ribosomal protein S27a is part of the 40S ribosomal subunit By similarity. |
| Subcellular location | |
| Miscellaneous | Ubiquitin is encoded by 4 different genes. UBA52 and RPS27A genes code for a single copy of ubiquitin fused to the ribosomal proteins L40 and S27a, respectively. UBB and UBC genes code for a polyubiquitin precursor with exact head to tail repeats, the number of repeats differ between species and strains. For a better understanding, features related to ubiquitin are only indicated for the first chain. |
| Sequence similarities | In the N-terminal section; belongs to the ubiquitin family. In the C-terminal section; belongs to the ribosomal protein S27Ae family. Contains 1 ubiquitin-like domain. |
Ontologies
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 76 | 76 | Ubiquitin | PRO_0000396477 | |||||||||||||||||||||
| Chain | 77 – 156 | 80 | 40S ribosomal protein S27a | PRO_0000396478 | |||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||
| Domain | 1 – 76 | 76 | Ubiquitin-like | ||||||||||||||||||||||
| Zinc finger | 121 – 144 | 24 | C4-type | ||||||||||||||||||||||
| Compositional bias | 77 – 99 | 23 | Lys-rich (highly basic) | ||||||||||||||||||||||
Sites | |||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 54 | 1 | Activating enzyme | ||||||||||||||||||||||
| Binding site | 72 | 1 | Activating enzyme | ||||||||||||||||||||||
| Site | 68 | 1 | Essential for function | ||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | |||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 57 | 1 | Phosphoserine By similarity | ||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 104 | 1 | N6-acetyllysine Ref.17 | ||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 113 | 1 | N6-acetyllysine Ref.17 | ||||||||||||||||||||||
| Cross-link | 6 | Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in ubiquitin) Ref.8 | |||||||||||||||||||||||
| Cross-link | 11 | Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in ubiquitin) Ref.8 Ref.12 | |||||||||||||||||||||||
| Cross-link | 27 | Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in ubiquitin) Probable | |||||||||||||||||||||||
| Cross-link | 29 | Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in ubiquitin) Ref.12 | |||||||||||||||||||||||
| Cross-link | 33 | Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in ubiquitin) By similarity | |||||||||||||||||||||||
| Cross-link | 48 | Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in ubiquitin) Ref.8 Ref.12 Ref.14 | |||||||||||||||||||||||
| Cross-link | 63 | Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in ubiquitin) Ref.12 Ref.15 | |||||||||||||||||||||||
| Cross-link | 76 | Glycyl lysine isopeptide (Gly-Lys) (interchain with K-? in acceptor proteins) | |||||||||||||||||||||||
Experimental info | |||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 48 | 1 | K → R: No effect on HLTF-mediated polyubiquitination of PCNA. Ref.15 | ||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 63 | 1 | K → R: Abolishes HLTF-mediated polyubiquitination of PCNA. Ref.15 | ||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 2 – 6 | 5 | |||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 8 – 10 | 3 | |||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 12 – 16 | 5 | |||||||||||||||||||||||
| Helix | 23 – 34 | 12 | |||||||||||||||||||||||
| Helix | 38 – 40 | 3 | |||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 42 – 45 | 4 | |||||||||||||||||||||||
| Helix | 57 – 59 | 3 | |||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 66 – 70 | 5 | |||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "Effect of ubiquitin on platelet functions: possible identity with platelet activity suppressive lymphokine (PASL)." Pancre V., Pierce R.J., Fournier F., Mehtali M., Delanoye A., Capron A., Auriault C. Eur. J. Immunol. 21:2735-2741(1991) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA]. |
| [2] | "Differential expression of translation-associated genes in benign and malignant human breast tumours." Adams S.M., Sharp M.G., Walker R.A., Brammar W.J., Varley J.M. Br. J. Cancer 65:65-71(1992) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA]. |
| [3] | "Generation and annotation of the DNA sequences of human chromosomes 2 and 4." Hillier L.W., Graves T.A., Fulton R.S., Fulton L.A., Pepin K.H., Minx P., Wagner-McPherson C., Layman D., Wylie K., Sekhon M., Becker M.C., Fewell G.A., Delehaunty K.D., Miner T.L., Nash W.E., Kremitzki C., Oddy L., Du H. Wilson R.K.Nature 434:724-731(2005) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. |
| [4] | "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)." The MGC Project Team Genome Res. 14:2121-2127(2004) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA]. Tissue: Placenta and Skin. |
| [5] | "Characterization of the human small-ribosomal-subunit proteins by N-terminal and internal sequencing, and mass spectrometry." Vladimirov S.N., Ivanov A.V., Karpova G.G., Musolyamov A.K., Egorov T.A., Thiede B., Wittmann-Liebold B., Otto A. Eur. J. Biochem. 239:144-149(1996) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: PROTEIN SEQUENCE OF 1-98. Tissue: Placenta. |
| [6] | "Hybrid troponin reconstituted from vertebrate and arthropod subunits." Schlesinger D.H., Goldstein G. Nature 255:423-424(1975) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: PROTEIN SEQUENCE OF 1-74. |
| [7] | Lubec G., Chen W.-Q., Sun Y. Submitted (DEC-2008) to UniProtKB Cited for: PROTEIN SEQUENCE OF 1-27; 30-42 AND 55-72, MASS SPECTROMETRY. Tissue: Fetal brain cortex. |
| [8] | "Alzheimer disease-specific conformation of hyperphosphorylated paired helical filament-tau is polyubiquitinated through Lys-48, Lys-11, and Lys-6 ubiquitin conjugation." Cripps D., Thomas S.N., Jeng Y., Yang F., Davies P., Yang A.J. J. Biol. Chem. 281:10825-10838(2006) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: PROTEIN SEQUENCE OF 1-27 AND 43-54, UBIQUITINATION AT LYS-6; LYS-11 AND LYS-48, MASS SPECTROMETRY. |
| [9] | "The human ribosomal protein genes: sequencing and comparative analysis of 73 genes." Yoshihama M., Uechi T., Asakawa S., Kawasaki K., Kato S., Higa S., Maeda N., Minoshima S., Tanaka T., Shimizu N., Kenmochi N. Genome Res. 12:379-390(2002) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA] OF 1-34. |
| [10] | "Nucleotide sequence analysis of a cDNA encoding human ubiquitin reveals that ubiquitin is synthesized as a precursor." Lund P.K., Moats-Staats B.M., Simmons J.G., Hoyt E., D'Ercole A.J., Martin F., van Wyk J.J. J. Biol. Chem. 260:7609-7613(1985) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] OF 5-156. |
| [11] | "A map of 75 human ribosomal protein genes." Kenmochi N., Kawaguchi T., Rozen S., Davis E., Goodman N., Hudson T.J., Tanaka T., Page D.C. Genome Res. 8:509-523(1998) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA] OF 98-148. |
| [12] | "Differential regulation of EGF receptor internalization and degradation by multiubiquitination within the kinase domain." Huang F., Kirkpatrick D., Jiang X., Gygi S.P., Sorkin A. Mol. Cell 21:737-748(2006) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: FUNCTION, UBIQUITINATION AT LYS-11; LYS-29; LYS-48 AND LYS-63, MASS SPECTROMETRY. |
| [13] | "Functional regulation of FEZ1 by the U-box-type ubiquitin ligase E4B contributes to neuritogenesis." Okumura F., Hatakeyama S., Matsumoto M., Kamura T., Nakayama K. J. Biol. Chem. 279:53533-53543(2004) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: UBIQUITINATION AT LYS-27. |
| [14] | "The proteomic reactor facilitates the analysis of affinity-purified proteins by mass spectrometry: application for identifying ubiquitinated proteins in human cells." Vasilescu J., Zweitzig D.R., Denis N.J., Smith J.C., Ethier M., Haines D.S., Figeys D. J. Proteome Res. 6:298-305(2007) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: UBIQUITINATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT LYS-48, MASS SPECTROMETRY. Tissue: Lung adenocarcinoma. |
| [15] | "Polyubiquitination of proliferating cell nuclear antigen by HLTF and SHPRH prevents genomic instability from stalled replication forks." Motegi A., Liaw H.-J., Lee K.-Y., Roest H.P., Maas A., Wu X., Moinova H., Markowitz S.D., Ding H., Hoeijmakers J.H.J., Myung K. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 105:12411-12416(2008) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: UBIQUITINATION AT LYS-63, MUTAGENESIS OF LYS-48 AND LYS-63. |
| [16] | "The emerging complexity of protein ubiquitination." Komander D. Biochem. Soc. Trans. 37:937-953(2009) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: REVIEW, FUNCTION. |
| [17] | "Lysine acetylation targets protein complexes and co-regulates major cellular functions." Choudhary C., Kumar C., Gnad F., Nielsen M.L., Rehman M., Walther T.C., Olsen J.V., Mann M. Science 325:834-840(2009) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: ACETYLATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT LYS-104 AND LYS-113, MASS SPECTROMETRY. |
| [18] | "Initial characterization of the human central proteome." Burkard T.R., Planyavsky M., Kaupe I., Breitwieser F.P., Buerckstuemmer T., Bennett K.L., Superti-Furga G., Colinge J. BMC Syst. Biol. 5:17-17(2011) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: IDENTIFICATION BY MASS SPECTROMETRY [LARGE SCALE ANALYSIS]. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | X63237 mRNA. Translation: CAA44911.1. S79522 mRNA. Translation: AAB21188.1. AC012358 Genomic DNA. No translation available. BC001392 mRNA. Translation: AAH01392.1. BC066293 mRNA. Translation: AAH66293.1. AB062071 Genomic DNA. Translation: BAB79490.1. M10939 mRNA. Translation: AAA36788.1. AB007163 Genomic DNA. Translation: BAA25826.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IPI | IPI00179330. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_001129064.1. NM_001135592.2. NP_001170884.1. NM_001177413.1. NP_002945.1. NM_002954.5. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.311640. Hs.546292. Hs.708727. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | P62979. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMR | P62979. Positions 1-76, 102-150. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IntAct | P62979. 12 interactions. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MINT | MINT-1138719. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| STRING | 9606.ENSP00000272317. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | P62979. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DMDM | 302393745. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2D gel databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UCD-2DPAGE | P02248. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PaxDb | P62979. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | P62979. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DNASU | 6233. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENST00000272317; ENSP00000272317; ENSG00000143947. ENST00000402285; ENSP00000383981; ENSG00000143947. ENST00000404735; ENSP00000385659; ENSG00000143947. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 6233. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:6233. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UCSC | uc002ryk.3. human. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CTD | 6233. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | GC02P055459. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| H-InvDB | HIX0161861. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:10417. RPS27A. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HPA | CAB033319. HPA041344. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MIM | 191343. gene. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| neXtProt | NX_P62979. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA34821. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| eggNOG | COG5272. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | HBG079148. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InParanoid | P62979. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KO | K02977. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OMA | KKVYTTP. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OrthoDB | EOG4PZJ82. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PhylomeDB | P62979. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Reactome | REACT_107772. Immune System. REACT_111102. Signal Transduction. REACT_11123. Membrane Trafficking. REACT_115202. Signal Transduction. REACT_115566. Cell Cycle. REACT_116125. Disease. REACT_120956. Cellular responses to stress. REACT_13505. Proteasome mediated degradation of PAK-2p34. REACT_17015. Metabolism of proteins. REACT_1762. 3' -UTR-mediated translational regulation. REACT_2001. Receptor-ligand binding initiates the second proteolytic cleavage of Notch receptor. REACT_21257. Metabolism of RNA. REACT_21300. Mitotic M-M/G1 phases. REACT_216. DNA Repair. REACT_24941. Circadian Clock. REACT_383. DNA Replication. REACT_578. Apoptosis. REACT_6782. TRAF6 Mediated Induction of proinflammatory cytokines. REACT_6850. Cdc20:Phospho-APC/C mediated degradation of Cyclin A. REACT_6900. Immune System. REACT_71. Gene Expression. REACT_8017. APC-Cdc20 mediated degradation of Nek2A. REACT_81380. Receptor-ligand binding initiates the second proteolytic cleavage of Notch receptor. REACT_97910. Signal Transduction. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | P62979. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Bgee | P62979. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_RPS27A. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genevestigator | P62979. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000143947. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR002906. Ribosomal_S27a. IPR000626. Ubiquitin. IPR019954. Ubiquitin_CS. IPR019956. Ubiquitin_subgr. IPR019955. Ubiquitin_supergroup. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF01599. Ribosomal_S27. 1 hit. PF00240. ubiquitin. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRINTS | PR00348. UBIQUITIN. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMART | SM00213. UBQ. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS00299. UBIQUITIN_1. 1 hit. PS50053. UBIQUITIN_2. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ChiTaRS | RPS27A. human. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| EvolutionaryTrace | P62979. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenomeRNAi | 6233. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 24197. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | RS27A_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P62979 Secondary accession number(s): P02248 Q9UPK7 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Chordata Protein Annotation Program | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
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