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UniProtKB/Swiss-Prot P62826 (RAN_HUMAN)
Last modified
February 9, 2010.
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50% identity |
Documents (6) |
Third-party data |
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Names and origin
| Protein names | Recommended name: GTP-binding nuclear protein Ran Alternative name(s): GTPase Ran Ras-related nuclear protein Ras-like protein TC4 Androgen receptor-associated protein 24 | ||||||
| Gene names |
| ||||||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Complete proteome] | ||||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 216 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | GTP-binding protein involved in nucleocytoplasmic transport. Required for the import of protein into the nucleus and also for RNA export. Involved in chromatin condensation and control of cell cycle By similarity. The complex with BIRC5/ survivin plays a role in mitotic spindle formation by serving as a physical scaffold to help deliver the RAN effector molecule TPX2 to microtubules. Ref.4 Ref.14 Ref.29 Enhances AR-mediated transactivation. Transactivation decreases as the poly-Gln length within AR increases. Ref.4 Ref.14 Ref.29 |
| Subunit structure | Monomer. Also forms a complex with CHC1 and interacts with the AR N-terminal poly-Gln region. The interaction with AR is inversely correlated with the poly-Gln length. Part of a complex consisting of RANBP9, Ran, DYRK1B and COPS5. Found in a nuclear export complex with RANBP3 and XPO1. Component of a nuclear export receptor complex composed of KPNB1, Ran, SNUPN and XPO1. Found in a trimeric export complex with SNUPN, Ran and XPO1. Interacts with RANBP10. In case of HIV-1 infection, found in a complex with HIV-1 Rev, RNAs containing a Rev response element (RRE) and XPO1. Found in a complex with HTLV-1 Rex, RANBP3 and XPO1. Interacts in its GTP-bound form with BIRC5/survivin at S and M phases of the cell cycle. Interacts with TERT; the interaction requires hydrogen peroxide-mediated phosphorylation of TERT and transports TERT to the nucleus. Ref.4 Ref.29 Ref.13 Ref.23 |
| Subcellular location | Nucleus. Cytoplasm. Melanosome. Note: Becomes dispersed throughout the cytoplasm during mitosis. Identified by mass spectrometry in melanosome fractions from stage I to stage IV. Ref.13 Ref.3 Ref.26 |
| Tissue specificity | Expressed in a variety of tissues. Ref.1 |
| Post-translational modification | The N-terminus is blocked. |
| Sequence similarities | Belongs to the small GTPase superfamily. Ran family. |
Ontologies
Binary interactions
With | Entry | #Exp. | IntAct | Notes |
|---|---|---|---|---|
| RANBP3 | Q9H6Z4 | 1 | EBI-286642,EBI-992681 | |
| RCC1 | P18754 | 2 | EBI-286642,EBI-992720 | |
| TNPO1 | Q92973 | 1 | EBI-286642,EBI-286693 | |
| VRK1 | Q99986 | 4 | EBI-286642,EBI-1769146 | |
| VRK2 | Q86Y07-1 | 2 | EBI-286642,EBI-1207633 | |
| VRK2 | Q86Y07-5 | 2 | EBI-286642,EBI-1207649 | |
| VRK3 | Q8IV63 | 1 | EBI-286642,EBI-1795523 |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Initiator methionine | 1 | 1 | Removed Ref.10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 2 – 216 | 215 | GTP-binding nuclear protein Ran | PRO_0000208696 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 17 – 24 | 8 | GTP By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 65 – 69 | 5 | GTP By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 122 – 125 | 4 | GTP By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 2 | 1 | N-acetylalanine Ref.10 Ref.31 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 60 | 1 | N6-acetyllysine Ref.33 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 71 | 1 | N6-acetyllysine Ref.33 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 99 | 1 | N6-acetyllysine Ref.33 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 147 | 1 | Phosphotyrosine Ref.25 Ref.27 Ref.32 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 155 | 1 | Phosphotyrosine Ref.27 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 159 | 1 | N6-acetyllysine Ref.33 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cross-link | 71 | Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in ubiquitin) Ref.28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 95 | 1 | R → I: dbSNP rs11546488. | VAR_051900 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 19 | 1 | G → V: Blocks DNA replication; when associated with L-69. Ref.3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 24 | 1 | T → L: Has low binding affinity for GTP and GDP. Almost completely abolishes interaction with BIRC5. Ref.29 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 69 | 1 | Q → L: Blocks DNA replication; when associated with V-19. Ref.29 Ref.3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 69 | 1 | Q → N: Unable to hydrolyze GTP. Increases binding to BIRC5 and promotes exaggerated spindle formation. Ref.29 Ref.3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 2 | 1 | A → T in AAH72000. Ref.9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 181 | 1 | A → C in AAC99400. Ref.5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 9 – 17 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 23 – 28 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 39 – 42 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 45 – 52 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 59 – 65 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 69 – 72 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 76 – 79 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 80 – 82 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 85 – 91 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 95 – 98 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 101 – 112 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 117 – 122 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 132 – 134 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 136 – 139 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 143 – 150 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 151 – 154 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 156 – 158 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 159 – 169 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 191 – 193 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 196 – 205 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
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| [1] | "Characterization of four novel ras-like genes expressed in a human teratocarcinoma cell line." Drivas G.T., Shih A., Coutavas E., Rush M.G., D'Eustachio P. Mol. Cell. Biol. 10:1793-1798(1990) [PubMed: 2108320] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA], TISSUE SPECIFICITY. Tissue: Teratocarcinoma. |
| [2] | "Premature initiation of mitosis in yeast lacking RCC1 or an interacting GTPase." Matsumoto T., Beach D.H. Cell 66:347-360(1991) [PubMed: 1855255] [Abstract] Cited for: SEQUENCE REVISION TO C-TERMINUS. |
| [3] | "Ran/TC4: a small nuclear GTP-binding protein that regulates DNA synthesis." Ren M., Drivas G.T., D'Eustachio P., Rush M.G. J. Cell Biol. 120:313-323(1993) [PubMed: 8421051] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA], SUBCELLULAR LOCATION, MUTAGENESIS OF GLY-19 AND GLN-69. Tissue: Brain. |
| [4] | "The linkage of Kennedy's neuron disease to ARA24, the first identified androgen receptor polyglutamine region-associated coactivator." Hsiao P.-W., Lin D.-L., Nakao R., Chang C. J. Biol. Chem. 274:20229-20234(1999) [PubMed: 10400640] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA], INTERACTION WITH AR, FUNCTION. Tissue: Brain. |
| [5] | "Cloning and functional analysis of cDNAs with open reading frames for 300 previously undefined genes expressed in CD34+ hematopoietic stem/progenitor cells." Zhang Q.-H., Ye M., Wu X.-Y., Ren S.-X., Zhao M., Zhao C.-J., Fu G., Shen Y., Fan H.-Y., Lu G., Zhong M., Xu X.-R., Han Z.-G., Zhang J.-W., Tao J., Huang Q.-H., Zhou J., Hu G.-X. Chen Z.Genome Res. 10:1546-1560(2000) [PubMed: 11042152] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA]. Tissue: Umbilical cord blood. |
| [6] | "cDNA clones of human proteins involved in signal transduction sequenced by the Guthrie cDNA resource center (www.cdna.org)." Puhl H.L. III, Ikeda S.R., Aronstam R.S. Submitted (MAR-2002) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA]. Tissue: Brain. |
| [7] | "Cloning of human full-length CDSs in BD Creator(TM) system donor vector." Kalnine N., Chen X., Rolfs A., Halleck A., Hines L., Eisenstein S., Koundinya M., Raphael J., Moreira D., Kelley T., LaBaer J., Lin Y., Phelan M., Farmer A. Submitted (MAY-2003) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA]. |
| [8] | "Cloning of human full open reading frames in Gateway(TM) system entry vector (pDONR201)." Ebert L., Schick M., Neubert P., Schatten R., Henze S., Korn B. Submitted (MAY-2004) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA]. |
| [9] | "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)." The MGC Project Team Genome Res. 14:2121-2127(2004) [PubMed: 15489334] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA]. Tissue: Lymph, Ovary, Skin and Uterus. |
| [10] | Bienvenut W.V., Claeys D. Submitted (FEB-2006) to UniProtKB Cited for: PROTEIN SEQUENCE OF 2-23 AND 143-166, CLEAVAGE OF INITIATOR METHIONINE, ACETYLATION AT ALA-2, MASS SPECTROMETRY. Tissue: Platelet. |
| [11] | Lubec G., Afjehi-Sadat L. Submitted (MAR-2007) to UniProtKB Cited for: PROTEIN SEQUENCE OF 39-56 AND 153-166, MASS SPECTROMETRY. Tissue: Brain and Cajal-Retzius cell. |
| [12] | "Identification of immuno-peptidmics that are recognized by tumor-reactive CTL generated from TIL of colon cancer patients." Shichijo S., Itoh K. Submitted (MAY-2001) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA] OF 65-216. Tissue: Colon adenocarcinoma. |
| [13] | "Mitotic regulator protein RCC1 is complexed with a nuclear ras-related polypeptide." Bischoff F.R., Ponstingl H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88:10830-10834(1991) [PubMed: 1961752] [Abstract] Cited for: PROTEIN SEQUENCE OF 65-76; 90-125; 128-147 AND 154-216, INTERACTION WITH CHC1, SUBCELLULAR LOCATION. Tissue: Cervix carcinoma. |
| [14] | "Nuclear protein import: Ran-GTP dissociates the karyopherin alphabeta heterodimer by displacing alpha from an overlapping binding site on beta." Moroianu J., Blobel G., Radu A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93:7059-7062(1996) [PubMed: 8692944] [Abstract] Cited for: FUNCTION. |
| [15] | "CRM1 is an export receptor for leucine-rich nuclear export signals." Fornerod M., Ohno M., Yoshida M., Mattaj I.W. Cell 90:1051-1060(1997) [PubMed: 9323133] [Abstract] Cited for: IDENTIFICATION IN A NUCLEAR EXPORT COMPLEX WITH XPO1. |
| [16] | "The specificity of the CRM1-Rev nuclear export signal interaction is mediated by RanGTP." Askjaer P., Jensen T.H., Nilsson J., Englmeier L., Kjems J. J. Biol. Chem. 273:33414-33422(1998) [PubMed: 9837918] [Abstract] Cited for: IDENTIFICATION IN A COMPLEX WITH HIV-1 REV; HIV-1 REV RESPONSE ELEMENT AND XPO1. |
| [17] | "CRM1-mediated recycling of snurportin 1 to the cytoplasm." Paraskeva E., Izaurralde E., Bischoff F.R., Huber J., Kutay U., Hartmann E., Luehrmann R., Goerlich D. J. Cell Biol. 145:255-264(1999) [PubMed: 10209022] [Abstract] Cited for: IDENTIFICATION IN A NUCLEAR EXPORT RECEPTOR COMPLEX, IDENTIFICATION IN A TRIMERIC EXPORT COMPLEX WITH SNUPN AND XPO1. |
| [18] | "RanBP3 influences interactions between CRM1 and its nuclear protein export substrates." Englmeier L., Fornerod M., Bischoff F.R., Petosa C., Mattaj I.W., Kutay U. EMBO Rep. 2:926-932(2001) [PubMed: 11571268] [Abstract] Cited for: IDENTIFICATION IN A NUCLEAR EXPORT COMPLEX WITH RANBP3 AND XPO1. |
| [19] | "Ran-binding protein 3 is a cofactor for Crm1-mediated nuclear protein export." Lindsay M.E., Holaska J.M., Welch K., Paschal B.M., Macara I.G. J. Cell Biol. 153:1391-1402(2001) [PubMed: 11425870] [Abstract] Cited for: IDENTIFICATION IN A NUCLEAR EXPORT COMPLEX WITH RANBP3 AND XPO1. |
| [20] | "Serine/threonine kinase Mirk/Dyrk1B is an inhibitor of epithelial cell migration and is negatively regulated by the Met adaptor Ran-binding protein M." Zou Y., Lim S., Lee K., Deng X., Friedman E. J. Biol. Chem. 278:49573-49581(2003) [PubMed: 14500717] [Abstract] Cited for: IDENTIFICATION IN A COMPLEX WITH COPS5; RANBP9 AND DYRK1B. |
| [21] | "Hydrogen peroxide triggers nuclear export of telomerase reverse transcriptase via Src kinase family-dependent phosphorylation of tyrosine 707." Haendeler J., Hoffmann J., Brandes R.P., Zeiher A.M., Dimmeler S. Mol. Cell. Biol. 23:4598-4610(2003) [PubMed: 12808100] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH TERT. |
| [22] | "A multifunctional domain in human CRM1 (exportin 1) mediates RanBP3 binding and multimerization of human T-cell leukemia virus type 1 Rex protein." Hakata Y., Yamada M., Shida H. Mol. Cell. Biol. 23:8751-8761(2003) [PubMed: 14612415] [Abstract] Cited for: IDENTIFICATION IN A COMPLEX WITH HTLV-1 REX; RANBP3 AND XPO1. |
| [23] | "A novel MET-interacting protein shares high sequence similarity with RanBPM, but fails to stimulate MET-induced Ras/Erk signaling." Wang D., Li Z., Schoen S.R., Messing E.M., Wu G. Biochem. Biophys. Res. Commun. 313:320-326(2004) [PubMed: 14684163] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH RANBP9 AND RANBP10. |
| [24] | "Architecture of CRM1/Exportin1 suggests how cooperativity is achieved during formation of a nuclear export complex." Petosa C., Schoehn G., Askjaer P., Bauer U., Moulin M., Steuerwald U., Soler-Lopez M., Baudin F., Mattaj I.W., Mueller C.W. Mol. Cell 16:761-775(2004) [PubMed: 15574331] [Abstract] Cited for: IDENTIFICATION IN A NUCLEAR EXPORT COMPLEX WITH XPO1. |
| [25] | "Immunoaffinity profiling of tyrosine phosphorylation in cancer cells." Rush J., Moritz A., Lee K.A., Guo A., Goss V.L., Spek E.J., Zhang H., Zha X.-M., Polakiewicz R.D., Comb M.J. Nat. Biotechnol. 23:94-101(2005) [PubMed: 15592455] [Abstract] Cited for: PHOSPHORYLATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT TYR-147, MASS SPECTROMETRY. |
| [26] | "Proteomic and bioinformatic characterization of the biogenesis and function of melanosomes." Chi A., Valencia J.C., Hu Z.-Z., Watabe H., Yamaguchi H., Mangini N.J., Huang H., Canfield V.A., Cheng K.C., Yang F., Abe R., Yamagishi S., Shabanowitz J., Hearing V.J., Wu C., Appella E., Hunt D.F. J. Proteome Res. 5:3135-3144(2006) [PubMed: 17081065] [Abstract] Cited for: SUBCELLULAR LOCATION [LARGE SCALE ANALYSIS], MASS SPECTROMETRY. |
| [27] | "Global survey of phosphotyrosine signaling identifies oncogenic kinases in lung cancer." Rikova K., Guo A., Zeng Q., Possemato A., Yu J., Haack H., Nardone J., Lee K., Reeves C., Li Y., Hu Y., Tan Z., Stokes M., Sullivan L., Mitchell J., Wetzel R., Macneill J., Ren J.M. Comb M.J.Cell 131:1190-1203(2007) [PubMed: 18083107] [Abstract] Cited for: PHOSPHORYLATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT TYR-147 AND TYR-155, MASS SPECTROMETRY. |
| [28] | "Quantitative analysis of global ubiquitination in HeLa cells by mass spectrometry." Meierhofer D., Wang X., Huang L., Kaiser P. J. Proteome Res. 7:4566-4576(2008) [PubMed: 18781797] [Abstract] Cited for: UBIQUITINATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT LYS-71, MASS SPECTROMETRY. |
| [29] | "A survivin-ran complex regulates spindle formation in tumor cells." Xia F., Canovas P.M., Guadagno T.M., Altieri D.C. Mol. Cell. Biol. 28:5299-5311(2008) [PubMed: 18591255] [Abstract] Cited for: FUNCTION, INTERACTION WITH BIRC5, MUTAGENESIS OF THR-24 AND GLN-69. |
| [30] | Colinge J., Superti-Furga G., Bennett K.L. Submitted (OCT-2008) to UniProtKB Cited for: IDENTIFICATION [LARGE SCALE ANALYSIS], MASS SPECTROMETRY. |
| [31] | "Lys-N and trypsin cover complementary parts of the phosphoproteome in a refined SCX-based approach." Gauci S., Helbig A.O., Slijper M., Krijgsveld J., Heck A.J., Mohammed S. Anal. Chem. 81:4493-4501(2009) [PubMed: 19413330] [Abstract] Cited for: ACETYLATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT ALA-2, MASS SPECTROMETRY. |
| [32] | "An extensive survey of tyrosine phosphorylation revealing new sites in human mammary epithelial cells." Heibeck T.H., Ding S.-J., Opresko L.K., Zhao R., Schepmoes A.A., Yang F., Tolmachev A.V., Monroe M.E., Camp D.G. II, Smith R.D., Wiley H.S., Qian W.-J. J. Proteome Res. 8:3852-3861(2009) [PubMed: 19534553] [Abstract] Cited for: PHOSPHORYLATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT TYR-147, MASS SPECTROMETRY. Tissue: Mammary epithelium. |
| [33] | "Lysine acetylation targets protein complexes and co-regulates major cellular functions." Choudhary C., Kumar C., Gnad F., Nielsen M.L., Rehman M., Walther T., Olsen J.V., Mann M. Science 325:834-840(2009) [PubMed: 19608861] [Abstract] Cited for: ACETYLATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT LYS-60; LYS-71; LYS-99 AND LYS-159, MASS SPECTROMETRY. |
| [34] | "Crystal structure of the nuclear Ras-related protein Ran in its GDP-bound form." Scheffzek K., Klebe C., Fritz-Wolf K., Kabsch W., Wittinghofer A. Nature 374:378-381(1995) [PubMed: 7885480] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.3 ANGSTROMS). |
| [35] | "Structure of the nuclear transport complex karyopherin-beta2-Ran x GppNHp." Chook Y.M., Blobel G. Nature 399:230-237(1999) [PubMed: 10353245] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (3.0 ANGSTROMS) OF COMPLEX WITH KPNB2. |
| [36] | "Structure of a Ran-binding domain complexed with Ran bound to a GTP analogue: implications for nuclear transport." Vetter I.R., Nowak C., Nishimoto T., Kuhlmann J., Wittinghofer A. Nature 398:39-46(1999) [PubMed: 10078529] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.96 ANGSTROMS) OF COMPLEX WITH NUP358. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | M31469 mRNA. Translation: AAA36546.1. AF052578 mRNA. Translation: AAC05840.1. AF054183 mRNA. Translation: AAC99400.1. AF501887 mRNA. Translation: AAM15923.1. BT007271 mRNA. Translation: AAP35935.1. CR450347 mRNA. Translation: CAG29343.1. BC004272 mRNA. Translation: AAH04272.3. BC014518 mRNA. Translation: AAH14518.1. BC014901 mRNA. Translation: AAH14901.1. BC016654 mRNA. Translation: AAH16654.1. BC051908 mRNA. Translation: AAH51908.2. BC072000 mRNA. Translation: AAH72000.1. AB062399 mRNA. Translation: BAB93486.1. Different initiation. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IPI | IPI00643041. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | TVHUC3. A44393. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_006316.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.10842 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
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| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DIP | DIP-5929N. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IntAct | P62826. 25 interactions. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| STRING | P62826. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | P62826. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2-D gel databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OGP | P62826. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| REPRODUCTION-2DPAGE | P62826. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | P62826. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENST00000392369; ENSP00000376176; ENSG00000132341; Homo sapiens. [Genome view] ENST00000448750; ENSP00000396127; ENSG00000132341; Homo sapiens. [Genome view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 5901. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:5901. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UCSC | uc001uir.1. human. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CTD | 5901. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | GC12P129881. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| H-InvDB | HIX0011136. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:9846. RAN. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MIM | 601179. gene. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA34205. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| eggNOG | prNOG13266. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | P62826. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InParanoid | P62826. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PhylomeDB | P62826. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pathway_Interaction_DB | aurora_a_pathway. Aurora A signaling. nfkappabcanonicalpathway. Canonical NF-kappaB pathway. wnt_canonical_pathway. Canonical Wnt signaling pathway. foxopathway. FoxO family signaling. nfat_3pathway. Role of Calcineurin-dependent NFAT signaling in lymphocytes. hdac_classi_pathway. Signaling events mediated by HDAC Class I. hdac_classii_pathway. Signaling events mediated by HDAC Class II. ranbp2pathway. Sumoylation by RanBP2 regulates transcriptional repression. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Reactome | REACT_12472. Regulatory RNA pathways. REACT_6167. Influenza Infection. REACT_6185. HIV Infection. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| PRINTS | PR00627. GTPRANTC4. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMART | SM00176. RAN. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR00231. small_GTP. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Other Resources | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Entry information
| Entry name | RAN_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P62826 Secondary accession number(s): P17080 Q9UEU9 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HPI (Human Proteome Initiative) | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
Relevant documents
| Human chromosome 12 Human chromosome 12: entries, gene names and cross-references to MIM |
| Human entries with polymorphisms or disease mutations List of human entries with polymorphisms or disease mutations |
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