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UniProtKB/Swiss-Prot P62330 (ARF6_HUMAN)
Last modified
November 25, 2008.
Version 57.
History...
Clusters with 100%,
90%,
50% identity |
Documents (4) |
Third-party data |
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Names and origin
| Protein names | Recommended name: ADP-ribosylation factor 6 | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Homo sapiens (Human) | ||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 175 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | GTP-binding protein that functions as an allosteric activator of the cholera toxin catalytic subunit, an ADP-ribosyltransferase. Involved in protein trafficking; may modulate vesicle budding and uncoating within the Golgi apparatus. |
| Subunit structure | Interacts with ARHGAP21, DDEF2, HERC1, PIP5K1C and UACA. |
| Subcellular location | |
| Sequence similarities | Belongs to the small GTPase superfamily. Arf family. |
Ontologies
Binary interactions
With | Entry | #Exp. | IntAct | Notes |
|---|---|---|---|---|
| ARFIP2 | P53365 | 1 | EBI-638181,EBI-638194 | |
| ATP6V1C1 | P21283 | 4 | EBI-638181,EBI-988663 | |
| DHPS | P49366 | 1 | EBI-638181,EBI-741925 | |
| DYNC1H1 | Q14204 | 1 | EBI-638181,EBI-356015 | |
| EIF6 | P56537 | 1 | EBI-638181,EBI-372243 | |
| EPPK1 | P58107 | 1 | EBI-638181,EBI-297954 | |
| GART | P22102 | 1 | EBI-638181,EBI-356297 | |
| IQGAP1 | P46940 | 1 | EBI-638181,EBI-297509 | |
| LRPPRC | P42704 | 1 | EBI-638181,EBI-1050853 | |
| PABPC4 | Q13310 | 1 | EBI-638181,EBI-372844 | |
| YARS | P54577 | 1 | EBI-638181,EBI-1048893 |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Initiator methionine | 1 | 1 | Removed | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 2 – 175 | 174 | ADP-ribosylation factor 6 | PRO_0000207400 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 20 – 27 | 8 | GTP By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 63 – 67 | 5 | GTP By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 122 – 125 | 4 | GTP By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Lipidation | 2 | 1 | N-myristoyl glycine | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 2 | 1 | G → A: Fails to associate with membranes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 3 – 9 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 14 – 21 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 26 – 32 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 39 – 44 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 47 – 54 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 57 – 65 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 68 – 70 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 71 – 74 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 75 – 77 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 78 – 80 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 83 – 89 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 93 – 95 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 96 – 107 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 110 – 112 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 116 – 122 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 132 – 138 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 141 – 143 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 149 – 153 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 156 – 159 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 162 – 172 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "Molecular identification of ADP-ribosylation factor mRNAs and their expression in mammalian cells." Tsuchiya M., Price S.R., Tsai S.-C., Moss J., Vaughan M. J. Biol. Chem. 266:2772-2777(1991) [PubMed: 1993656] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA]. |
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| [8] | "Golgi-localized GAP for Cdc42 functions downstream of ARF1 to control Arp2/3 complex and F-actin dynamics." Dubois T., Paleotti O., Mironov A.A. Jr., Fraisier V., Stradal T.E.B., De Matteis M.A., Franco M., Chavrier P. Nat. Cell Biol. 7:353-364(2005) [PubMed: 15793564] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH ARHGAP21. |
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| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| M57763 mRNA. Translation: AAA90928.1. AF047432 mRNA. Translation: AAC39877.1. AF493885 mRNA. Translation: AAM12599.1. BC002952 mRNA. No translation available. BC008918 mRNA. Translation: AAH08918.1. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | B23741. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_001654.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.525330 Hs.593068 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IntAct | P62330. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | P62330. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PeptideAtlas | P62330. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENSG00000165527. Homo sapiens. [Contig view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 382. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:382. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| H-InvDB | HIX0011635. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:659. ARF6. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HPA | CAB002778. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MIM | 600464. gene. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA24942. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | P62330. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | P62330. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | P62330. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_ARF6. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000165527. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR006688. ARF. IPR006689. ARF/SAR. IPR001806. Ras_trnsfrmng. IPR005225. Small_GTP_bd. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PANTHER | PTHR11711. ARF/SAR. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF00025. Arf. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRINTS | PR00449. RASTRNSFRMNG. PR00328. SAR1GTPBP. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMART | SM00177. ARF. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR00231. small_GTP. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS01019. ARF. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Resources | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| LinkHub | P62330. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 1599. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | ARF6_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P62330 Secondary accession number(s): P26438 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HPI (Human Proteome Initiative) | ||||||||
Relevant documents
| Human chromosome 14 Human chromosome 14: entries, gene names and cross-references to MIM |
| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

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