P62161 (CALM_RAT) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
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November 16, 2011.
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| Protein names | Recommended name: Calmodulin Short name=CaM | ||||||||||||||
| Gene names |
| ||||||||||||||
| Organism | Rattus norvegicus (Rat) | ||||||||||||||
| Taxonomic identifier | 10116 [NCBI] | ||||||||||||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Glires › Rodentia › Sciurognathi › Muroidea › Muridae › Murinae › Rattus |
Protein attributes
| Sequence length | 149 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Calmodulin mediates the control of a large number of enzymes, ion channels and other proteins by Ca2+, AND MASS SPECTROMETRY. Among the enzymes to be stimulated by the calmodulin-Ca2+ complex are a number of protein kinases and phosphatases. Together with CEP110 and centrin, is involved in a genetic pathway that regulates the centrosome cycle and progression through cytokinesis By similarity. |
| Subunit structure | Interacts with CEP97, CEP110, MYO1C, TTN/titin and SRY By similarity. Interacts with RRAD. Interacts with USP6; the interaction is calcium dependent By similarity. Interacts with CDK5RAP2. Interacts with SCN5A By similarity. Ref.10 |
| Subcellular location | Cytoplasm › cytoskeleton › spindle. Cytoplasm › cytoskeleton › spindle pole. Note: Distributed throughout the cell during interphase, but during mitosis becomes dramatically localized to the spindle poles and the spindle microtubules By similarity. |
| Post-translational modification | Ubiquitination results in a strongly decreased activity By similarity. Phosphorylation results in a decreased activity. |
| Miscellaneous | This protein has four functional calcium-binding sites. |
| Sequence similarities | Belongs to the calmodulin family. Contains 4 EF-hand domains. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Cellular component | Cytoplasm Cytoskeleton |
| Domain | Repeat |
| Ligand | Calcium |
| PTM | Acetylation Isopeptide bond Methylation Phosphoprotein Ubl conjugation |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Direct protein sequencing Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Cellular component | spindle pole Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-SubCell |
| Molecular function | calcium channel regulator activity Non-traceable author statement. Source: RGD calcium-dependent protein bindingInferred from physical interaction. Source: RGD phosphatidylinositol 3-kinase bindingInferred from physical interaction. Source: RGD |
| Complete GO annotation... | |
Binary interactions
With | Entry | #Exp. | IntAct | Notes |
|---|---|---|---|---|
| EGFR | P00533 | 6 | EBI-397530,EBI-297353 | From a different organism. |
| GRB7 | Q14451 | 9 | EBI-397530,EBI-970191 | From a different organism. |
| Hmox2 | P23711 | 2 | EBI-397530,EBI-2910092 | |
| Kcnn2 | P70604 | 2 | EBI-397530,EBI-1031103 |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Initiator methionine | 1 | 1 | Removed Ref.7 | |||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 2 – 149 | 148 | Calmodulin | PRO_0000198227 | ||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 8 – 43 | 36 | EF-hand 1 | |||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 44 – 79 | 36 | EF-hand 2 | |||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 81 – 116 | 36 | EF-hand 3 | |||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 117 – 149 | 33 | EF-hand 4 | |||||||||||||||||||||||||||
| Calcium binding | 21 – 32 | 12 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||
| Calcium binding | 57 – 68 | 12 | 2 | |||||||||||||||||||||||||||
| Calcium binding | 94 – 105 | 12 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||
| Calcium binding | 130 – 141 | 12 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 2 | 1 | N-acetylalanine Ref.7 Ref.11 | |||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 14 | 1 | N6-acetyllysine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 22 | 1 | N6-acetyllysine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 45 | 1 | Phosphothreonine; by CaMK4 Ref.9 | |||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 95 | 1 | N6-acetyllysine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 100 | 1 | Phosphotyrosine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 116 | 1 | N6,N6,N6-trimethyllysine Ref.7 | |||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 139 | 1 | Phosphotyrosine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||
| Cross-link | 22 | Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in ubiquitin) By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 7 – 19 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 24 – 29 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 30 – 32 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 33 – 39 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 46 – 56 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 61 – 65 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 66 – 76 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 83 – 91 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 97 – 102 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 103 – 110 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 119 – 129 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 133 – 138 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 139 – 147 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
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| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | M16659 mRNA. Translation: AAA40864.1. X13817 mRNA. Translation: CAA32050.1. M19312 mRNA. Translation: AAA40862.1. M17069 mRNA. Translation: AAA40863.1. X13933 mRNA. Translation: CAA32120.1. X13931, X13932, X05117 Genomic DNA. Translation: CAA32119.1. X13833, X13834, X13835 Genomic DNA. Translation: CAA32062.1. X14265 Genomic DNA. Translation: CAA32478.1. AF178845 mRNA. Translation: AAD55398.1. BC058485 mRNA. Translation: AAH58485.1. BC063187 mRNA. Translation: AAH63187.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IPI | IPI00231955. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | MCRT. S03206. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_036650.1. NM_012518.3. NP_059022.1. NM_017326.1. NP_114175.1. NM_031969.2. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Rn.216430. Rn.2892. Rn.4166. Rn.5968. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
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| ProteinModelPortal | P62161. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMR | P62161. Positions 2-148. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DIP | DIP-29528N. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IntAct | P62161. 9 interactions. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MINT | MINT-268601. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| STRING | P62161. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | P62161. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | P62161. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENSRNOT00000022603; ENSRNOP00000022603; ENSRNOG00000016770. ENSRNOT00000064679; ENSRNOP00000063822; ENSRNOG00000004060. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 24242. 24244. 50663. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | rno:24242. rno:24244. rno:50663. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UCSC | M16659. rat. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CTD | 801. 805. 808. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RGD | 2257. Calm1. 2258. Calm2. 2259. Calm3. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| eggNOG | maNOG12102. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneTree | ENSGT00560000076590. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | HBG012180. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InParanoid | P62161. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OrthoDB | EOG4001KK. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PhylomeDB | P62161. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | P62161. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genevestigator | P62161. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSRNOG00000004060. Rattus norvegicus. ENSRNOG00000016770. Rattus norvegicus. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR018248. EF-hand. IPR011992. EF-hand-like_dom. IPR018247. EF_Hand_1_Ca_BS. IPR018249. EF_HAND_2. IPR002048. EF_hand_Ca-bd. IPR001125. Recoverin. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:1.10.238.10. EF-Hand_type. 2 hits. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KO | K02183. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF00036. efhand. 4 hits. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRINTS | PR00450. RECOVERIN. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMART | SM00054. EFh. 4 hits. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS00018. EF_HAND_1. 4 hits. PS50222. EF_HAND_2. 4 hits. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 602729. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | CALM_RAT | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P62161 Secondary accession number(s): P02593 Q61380 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Chordata Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with