P60842 (IF4A1_HUMAN) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
May 1, 2013.
Version 115.
History...
Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Interactions·Alt products·Sequence annotation·Sequences·References·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize order
Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Interactions·Alt products·Sequence annotation·Sequences·References·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize orderNames and origin
| Protein names | Recommended name: Eukaryotic initiation factor 4A-I Short name=eIF-4A-I Short name=eIF4A-I EC=3.6.4.13 Alternative name(s): ATP-dependent RNA helicase eIF4A-1 | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Reference proteome] | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 406 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | ATP-dependent RNA helicase which is a subunit of the eIF4F complex involved in cap recognition and is required for mRNA binding to ribosome. In the current model of translation initiation, eIF4A unwinds RNA secondary structures in the 5'-UTR of mRNAs which is necessary to allow efficient binding of the small ribosomal subunit, and subsequent scanning for the initiator codon. Ref.18 Ref.19 |
| Catalytic activity | ATP + H2O = ADP + phosphate. |
| Enzyme regulation | Helicase activity and function in translation are inhibited by interaction with PDCD4. Ref.18 Ref.19 |
| Subunit structure | eIF4F is a multi-subunit complex, the composition of which varies with external and internal environmental conditions. It is composed of at least EIF4A, EIF4E and EIF4G1/EIF4G3. Interacts with PAIP1, EIF4E and UPF2. Found in a complex with XPO7, EIF4A1, ARHGAP1, VPS26A, VPS29, VPS35 and SFN. May interact with NOM1. Interacts with PDCD4; this interferes with the interaction between EIF4A and EIF4G. Interacts with RBM4. Interacts with human cytomegalovirus/HHV-5 protein UL69. Ref.7 Ref.8 Ref.9 Ref.10 Ref.11 Ref.12 Ref.15 Ref.18 Ref.19 |
| Sequence similarities | Belongs to the DEAD box helicase family. eIF4A subfamily. Contains 1 helicase ATP-binding domain. Contains 1 helicase C-terminal domain. |
Ontologies
Binary interactions
With | Entry | #Exp. | IntAct | Notes |
|---|---|---|---|---|
| EIF4G1 | Q04637 | 7 | EBI-73449,EBI-73711 | |
| EIF4G2 | P78344 | 2 | EBI-73449,EBI-296519 | |
| EIF4H | Q15056 | 2 | EBI-73449,EBI-748492 |
Alternative products
| This entry describes 2 isoforms produced by alternative splicing. [Align] [Select] | ||||||
| Isoform 1 (identifier: P60842-1) This isoform has been chosen as the 'canonical' sequence. All positional information in this entry refers to it. This is also the sequence that appears in the downloadable versions of the entry. | ||||||
| Isoform 2 (identifier: P60842-2) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 333-406: ARGIDVQQVS...EMPLNVADLI → GKLYPQNRSRWTVWP | ||||||
| Note: No experimental confirmation available. |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Initiator methionine | 1 | 1 | Removed Ref.17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 2 – 406 | 405 | Eukaryotic initiation factor 4A-I | PRO_0000054933 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 63 – 234 | 172 | Helicase ATP-binding | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 245 – 406 | 162 | Helicase C-terminal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 76 – 83 | 8 | ATP By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motif | 32 – 60 | 29 | Q motif | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motif | 182 – 185 | 4 | DEAD box | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 2 | 1 | N-acetylserine Ref.17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 4 | 1 | Phosphoserine Ref.17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 118 | 1 | N6-acetyllysine Ref.14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 174 | 1 | N6-acetyllysine Ref.14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 333 – 406 | 74 | ARGID…VADLI → GKLYPQNRSRWTVWP in isoform 2. | VSP_046032 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 23 – 25 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 34 – 36 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 41 – 50 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 57 – 68 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 72 – 75 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 82 – 93 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 103 – 106 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 110 – 124 | 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 125 – 128 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 131 – 134 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 143 – 145 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 146 – 149 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 153 – 157 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 159 – 167 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 178 – 183 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 184 – 189 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 190 – 192 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 193 – 202 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 208 – 214 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 218 – 227 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 232 – 235 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 241 – 243 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 246 – 251 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 256 – 269 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 273 – 278 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 282 – 290 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 291 – 296 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 300 – 302 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 312 – 316 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 318 – 320 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 321 – 323 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 325 – 328 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 330 – 333 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 338 – 340 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 342 – 348 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 355 – 360 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 364 – 366 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 370 – 375 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 378 – 391 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "Nucleotide sequence of human cDNA encoding eukaryotic initiation factor 4AI." Kim N.-S., Kato T., Abe N., Kato S. Nucleic Acids Res. 21:2012-2012(1993) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ISOFORM 1). |
| [2] | "Cloning of human full-length CDSs in BD Creator(TM) system donor vector." Kalnine N., Chen X., Rolfs A., Halleck A., Hines L., Eisenstein S., Koundinya M., Raphael J., Moreira D., Kelley T., LaBaer J., Lin Y., Phelan M., Farmer A. Submitted (OCT-2004) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA] (ISOFORM 1). |
| [3] | "Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs." Ota T., Suzuki Y., Nishikawa T., Otsuki T., Sugiyama T., Irie R., Wakamatsu A., Hayashi K., Sato H., Nagai K., Kimura K., Makita H., Sekine M., Obayashi M., Nishi T., Shibahara T., Tanaka T., Ishii S. Sugano S.Nat. Genet. 36:40-45(2004) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA] (ISOFORM 1). Tissue: Heart. |
| [4] | "DNA sequence of human chromosome 17 and analysis of rearrangement in the human lineage." Zody M.C., Garber M., Adams D.J., Sharpe T., Harrow J., Lupski J.R., Nicholson C., Searle S.M., Wilming L., Young S.K., Abouelleil A., Allen N.R., Bi W., Bloom T., Borowsky M.L., Bugalter B.E., Butler J., Chang J.L. Nusbaum C.Nature 440:1045-1049(2006) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. |
| [5] | Mural R.J., Istrail S., Sutton G.G., Florea L., Halpern A.L., Mobarry C.M., Lippert R., Walenz B., Shatkay H., Dew I., Miller J.R., Flanigan M.J., Edwards N.J., Bolanos R., Fasulo D., Halldorsson B.V., Hannenhalli S., Turner R. Venter J.C.Submitted (SEP-2005) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. |
| [6] | "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)." The MGC Project Team Genome Res. 14:2121-2127(2004) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA] (ISOFORMS 1 AND 2). Tissue: Bone marrow and Lung. |
| [7] | "Interaction of polyadenylate-binding protein with the eIF4G homologue PAIP enhances translation." Craig A.W.B., Haghighat A., Yu A.T.K., Sonenberg N. Nature 392:520-523(1998) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH PAIP1. |
| [8] | "Novel Upf2p orthologues suggest a functional link between translation initiation and nonsense surveillance complexes." Mendell J.T., Medghalchi S.M., Lake R.G., Noensie E.N., Dietz H.C. Mol. Cell. Biol. 20:8944-8957(2000) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH UPF2. |
| [9] | "Eukaryotic initiation factors 4A (eIF4A) and 4G (eIF4G) mutually interact in a 1:1 ratio in vivo." Li W., Belsham G.J., Proud C.G. J. Biol. Chem. 276:29111-29115(2001) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH EIF4E. |
| [10] | "Exportin 7 defines a novel general nuclear export pathway." Mingot J.-M., Bohnsack M.T., Jaekle U., Goerlich D. EMBO J. 23:3227-3236(2004) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: IDENTIFICATION IN A COMPLEX WITH XPO7; ARHGAP1; VPS26A; VPS29; VPS35 AND SFN. |
| [11] | "Identification of NOM1, a nucleolar, eIF4A binding protein encoded within the chromosome 7q36 breakpoint region targeted in cases of pediatric acute myeloid leukemia." Simmons H.M., Ruis B.L., Kapoor M., Hudacek A.W., Conklin K.F. Gene 347:137-145(2005) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: POSSIBLE INTERACTION WITH NOM1. |
| [12] | "Cell stress modulates the function of splicing regulatory protein RBM4 in translation control." Lin J.C., Hsu M., Tarn W.Y. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 104:2235-2240(2007) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH RBM4. |
| [13] | "A quantitative atlas of mitotic phosphorylation." Dephoure N., Zhou C., Villen J., Beausoleil S.A., Bakalarski C.E., Elledge S.J., Gygi S.P. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 105:10762-10767(2008) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: IDENTIFICATION BY MASS SPECTROMETRY [LARGE SCALE ANALYSIS]. Tissue: Cervix carcinoma. |
| [14] | "Lysine acetylation targets protein complexes and co-regulates major cellular functions." Choudhary C., Kumar C., Gnad F., Nielsen M.L., Rehman M., Walther T.C., Olsen J.V., Mann M. Science 325:834-840(2009) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: ACETYLATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT LYS-118 AND LYS-174, MASS SPECTROMETRY. |
| [15] | "Human cytomegalovirus UL69 protein facilitates translation by associating with the mRNA cap-binding complex and excluding 4EBP1." Aoyagi M., Gaspar M., Shenk T.E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 107:2640-2645(2010) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH HHV-5 PROTEIN UL69. |
| [16] | "Initial characterization of the human central proteome." Burkard T.R., Planyavsky M., Kaupe I., Breitwieser F.P., Buerckstuemmer T., Bennett K.L., Superti-Furga G., Colinge J. BMC Syst. Biol. 5:17-17(2011) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: IDENTIFICATION BY MASS SPECTROMETRY [LARGE SCALE ANALYSIS]. |
| [17] | "System-wide temporal characterization of the proteome and phosphoproteome of human embryonic stem cell differentiation." Rigbolt K.T., Prokhorova T.A., Akimov V., Henningsen J., Johansen P.T., Kratchmarova I., Kassem M., Mann M., Olsen J.V., Blagoev B. Sci. Signal. 4:RS3-RS3(2011) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: ACETYLATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT SER-2, PHOSPHORYLATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT SER-4, MASS SPECTROMETRY, CLEAVAGE OF INITIATOR METHIONINE. |
| [18] | "Structural basis for translational inhibition by the tumour suppressor Pdcd4." Loh P.G., Yang H.S., Walsh M.A., Wang Q., Wang X., Cheng Z., Liu D., Song H. EMBO J. 28:274-285(2009) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (3.5 ANGSTROMS) IN COMPLEX WITH PDCD4, FUNCTION, SUBUNIT, ENZYME REGULATION. |
| [19] | "Crystal structure of the eIF4A-PDCD4 complex." Chang J.H., Cho Y.H., Sohn S.Y., Choi J.M., Kim A., Kim Y.C., Jang S.K., Cho Y. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 106:3148-3153(2009) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.8 ANGSTROMS) OF 20-406 IN COMPLEX WITH PDCD4, FUNCTION, ENZYME REGULATION, SUBUNIT. |
| [20] | "Comparative structural analysis of human DEAD-box RNA helicases." Schutz P., Karlberg T., van den Berg S., Collins R., Lehtio L., Hogbom M., Holmberg-Schiavone L., Tempel W., Park H.W., Hammarstrom M., Moche M., Thorsell A.G., Schuler H. PLoS ONE 5:E12791-E12791(2010) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.25 ANGSTROMS) OF 20-236. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | D13748 mRNA. Translation: BAA02897.1. BT019880 mRNA. Translation: AAV38683.1. BT019881 mRNA. Translation: AAV38684.1. AK312630 mRNA. Translation: BAG35515.1. AC016876 Genomic DNA. No translation available. CH471108 Genomic DNA. Translation: EAW90167.1. CH471108 Genomic DNA. Translation: EAW90168.1. CH471108 Genomic DNA. Translation: EAW90169.1. BC006210 mRNA. No translation available. BC009585 mRNA. Translation: AAH09585.1. BC073752 mRNA. Translation: AAH73752.1. | ||||||||||||||||||||||||
| IPI | IPI00025491. | ||||||||||||||||||||||||
| PIR | S33681. | ||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_001191439.1. NM_001204510.1. NP_001407.1. NM_001416.3. | ||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.129673. | ||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | P60842. | ||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||
| DIP | DIP-29755N. | ||||||||||||||||||||||||
| IntAct | P60842. 34 interactions. | ||||||||||||||||||||||||
| MINT | MINT-5001111. | ||||||||||||||||||||||||
| STRING | 9606.ENSP00000293831. | ||||||||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | P60842. | ||||||||||||||||||||||||
Polymorphism databases | |||||||||||||||||||||||||
| DMDM | 46397463. | ||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||
| PaxDb | P60842. | ||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | P60842. | ||||||||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||||||||
| DNASU | 1973. | ||||||||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENST00000293831; ENSP00000293831; ENSG00000161960. ENST00000577269; ENSP00000463486; ENSG00000161960. | ||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 1973. | ||||||||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:1973. | ||||||||||||||||||||||||
| UCSC | uc002gho.2. human. | ||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||
| CTD | 1973. | ||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | GC17P007476. | ||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:3282. EIF4A1. | ||||||||||||||||||||||||
| HPA | CAB011689. | ||||||||||||||||||||||||
| MIM | 602641. gene. | ||||||||||||||||||||||||
| neXtProt | NX_P60842. | ||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA27710. | ||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||
| eggNOG | COG0513. | ||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | HOG000268797. | ||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | HBG107989. | ||||||||||||||||||||||||
| KO | K03257. | ||||||||||||||||||||||||
| OMA | IKMFILD. | ||||||||||||||||||||||||
| OrthoDB | EOG4640C1. | ||||||||||||||||||||||||
| PhylomeDB | P60842. | ||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||
| Pathway_Interaction_DB | mtor_4pathway. mTOR signaling pathway. | ||||||||||||||||||||||||
| Reactome | REACT_17015. Metabolism of proteins. REACT_1762. 3' -UTR-mediated translational regulation. REACT_21257. Metabolism of RNA. REACT_6900. Immune System. REACT_71. Gene Expression. | ||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | P60842. | ||||||||||||||||||||||||
| Bgee | P60842. | ||||||||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_EIF4A1. | ||||||||||||||||||||||||
| Genevestigator | P60842. | ||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000161960. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR011545. DNA/RNA_helicase_DEAD/DEAH_N. IPR014001. Helicase_ATP-bd. IPR001650. Helicase_C. IPR000629. RNA-helicase_DEAD-box_CS. IPR014014. RNA_helicase_DEAD_Q_motif. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF00270. DEAD. 1 hit. PF00271. Helicase_C. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| SMART | SM00487. DEXDc. 1 hit. SM00490. HELICc. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS00039. DEAD_ATP_HELICASE. 1 hit. PS51192. HELICASE_ATP_BIND_1. 1 hit. PS51194. HELICASE_CTER. 1 hit. PS51195. Q_MOTIF. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Other | |||||||||||||||||||||||||
| ChiTaRS | EIF4A1. human. | ||||||||||||||||||||||||
| EvolutionaryTrace | P60842. | ||||||||||||||||||||||||
| GenomeRNAi | 1973. | ||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 35536557. | ||||||||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | IF4A1_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P60842 Secondary accession number(s): B2R6L8 Q61516 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Chordata Protein Annotation Program | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
Relevant documents
| Translation initiation factors List of translation initiation factor entries |
| Human chromosome 17 Human chromosome 17: entries, gene names and cross-references to MIM |
| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with
