P60785 (LEPA_ECOLI) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
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January 25, 2012.
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Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Sequence annotation·Sequences·References·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize orderNames and origin
| Protein names | Recommended name: Elongation factor 4 Short name=EF-4 EC=3.6.5.n1 Alternative name(s): Ribosomal back-translocase LepA | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Escherichia coli (strain K12) | ||||
| Taxonomic identifier | 83333 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Bacteria › Proteobacteria › Gammaproteobacteria › Enterobacteriales › Enterobacteriaceae › Escherichia |
Protein attributes
| Sequence length | 599 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Required for accurate and efficient protein synthesis under certain stress conditions. May act as a fidelity factor of the translation reaction, by catalyzing a one-codon backward translocation of tRNAs on improperly translocated ribosomes. Back-translocation proceeds from a post-translocation (POST) complex to a pre-translocation (PRE) complex, thus giving elongation factor G a second chance to translocate the tRNAs correctly. Binds to ribosomes in a GTP-dependent manner. Ref.7 Ref.8 |
| Catalytic activity | GTP + H2O = GDP + phosphate. Ref.8 |
| Subcellular location | Cell inner membrane; Peripheral membrane protein; Cytoplasmic side Probable Ref.5. |
| Sequence similarities | Belongs to the GTP-binding elongation factor family. LepA subfamily. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Protein biosynthesis |
| Cellular component | Cell inner membrane Cell membrane Membrane |
| Ligand | GTP-binding Nucleotide-binding |
| Molecular function | Hydrolase |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Cellular component | plasma membrane Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-SubCell |
| Molecular function | GTP binding Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW GTPase activityInferred from direct assay Ref.7. Source: EcoCyc translation elongation factor activityInferred from direct assay Ref.7. Source: EcoCyc |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 599 | 599 | Elongation factor 4 HAMAP MF_00071 | PRO_0000176271 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 14 – 19 | 6 | GTP By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 131 – 134 | 4 | GTP By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 156 – 185 | 30 | TDAVR…PPPEG → HRRGALFSENRRWCAGRSRT SGARHSAAGS Ref.1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 156 – 185 | 30 | TDAVR…PPPEG → HRRGALFSENRRWCAGRSRT SGARHSAAGS Ref.2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 266 | 1 | Missing Ref.1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 266 | 1 | Missing Ref.2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 4 – 10 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 20 – 27 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 58 – 64 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 70 – 76 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 82 – 84 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 85 – 93 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 99 – 103 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 110 – 121 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 127 – 131 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 140 – 150 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 159 – 161 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 170 – 179 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 192 – 199 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 207 – 214 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 222 – 226 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 231 – 233 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 239 – 250 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 273 – 279 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 294 – 297 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 300 – 303 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 304 – 306 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 307 – 313 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 317 – 319 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 346 – 357 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 372 – 378 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 381 – 386 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 387 – 389 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 393 – 395 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 396 – 411 | 16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 412 – 414 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 419 – 422 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 423 – 425 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 429 – 434 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 438 – 446 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 447 – 451 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 452 – 454 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 455 – 461 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 470 – 477 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 480 – 487 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 493 – 496 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 497 – 500 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 501 – 503 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 504 – 506 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 510 – 518 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 526 – 531 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 536 – 542 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
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| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | K00426 Genomic DNA. Translation: AAA24063.1. D64044 Genomic DNA. Translation: BAA10916.1. U00096 Genomic DNA. Translation: AAC75622.1. AP009048 Genomic DNA. Translation: BAE76745.1. | ||||||||||||||||||
| PIR | BVECLA. H65034. | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_417064.1. NC_000913.2. | ||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | P60785. | ||||||||||||||||||
| SMR | P60785. Positions 1-555. | ||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||
| DIP | DIP-29868N. | ||||||||||||||||||
| IntAct | P60785. 20 interactions. | ||||||||||||||||||
| MINT | MINT-1225739. | ||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||
| EnsemblBacteria | EBESCT00000000357; EBESCP00000000357; EBESCG00000000291. EBESCT00000016683; EBESCP00000015974; EBESCG00000015742. | ||||||||||||||||||
| GeneID | 947051. | ||||||||||||||||||
| GenomeReviews | Gene locus JW2553 in contig AP009048_GR. Gene locus b2569 in contig U00096_GR. | ||||||||||||||||||
| KEGG | ecj:JW2553. eco:b2569. | ||||||||||||||||||
| PATRIC | 32120537. VBIEscCol129921_2671. | ||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||
| EchoBASE | EB0524. | ||||||||||||||||||
| EcoGene | EG10529. lepA. | ||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||
| eggNOG | COG0481. | ||||||||||||||||||
| GeneTree | EBGT00050000008367. | ||||||||||||||||||
| HOGENOM | HBG286375. | ||||||||||||||||||
| OMA | KCYGGDA. | ||||||||||||||||||
| PhylomeDB | P60785. | ||||||||||||||||||
| ProtClustDB | PRK05433. | ||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||
| BioCyc | EcoCyc:EG10529-MONOMER. | ||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||
| Genevestigator | P60785. | ||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||
| HAMAP | MF_00071. LepA. [Tree] | ||||||||||||||||||
| InterPro | IPR006297. EF-4. IPR009022. Elongation_fac_G/III/V. IPR013842. LepA_GTP-bd_C. IPR000795. ProtSyn_GTP-bd. IPR005225. Small_GTP-bd_dom. IPR000640. Transl_elong_EFG/EF2_C. IPR004161. Transl_elong_EFTu/EF1A_2. IPR009000. Transl_elong_init/rib_B-barrel. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:3.30.70.240. Transl_elong_EFG/EF2_C. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| KO | K03596. | ||||||||||||||||||
| PANTHER | PTHR23115:SF40. PTHR23115:SF40. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| Pfam | PF00679. EFG_C. 1 hit. PF00009. GTP_EFTU. 1 hit. PF03144. GTP_EFTU_D2. 1 hit. PF06421. LepA_C. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| PRINTS | PR00315. ELONGATNFCT. | ||||||||||||||||||
| SMART | SM00838. EFG_C. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| SUPFAM | SSF54980. EFG_III_V. 2 hits. SSF50447. Translat_factor. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR01393. LepA. 1 hit. TIGR00231. Small_GTP. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| PROSITE | PS00301. EFACTOR_GTP. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | LEPA_ECOLI | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P60785 Secondary accession number(s): P07682, P76590, Q2MAG1 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Prokaryotic Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| Escherichia coli Escherichia coli (strain K12): entries and cross-references to EcoGene |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with