P60763 (RAC3_HUMAN) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
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May 1, 2013.
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| Protein names | Recommended name: Ras-related C3 botulinum toxin substrate 3 Alternative name(s): p21-Rac3 | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Reference proteome] | ||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 192 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Plasma membrane-associated small GTPase which cycles between an active GTP-bound and inactive GDP-bound state. In active state binds to a variety of effector proteins to regulate cellular responses, such as cell spreading and the formation of actin-based protusions including lamellipodia and membrane ruffles. Ref.6 |
| Subunit structure | Interacts with the GEF protein DOCK7, which promotes the exchange between GDP and GTP, and therefore activates it. Interacts with C1D. Ref.5 Ref.6 Ref.7 |
| Subcellular location | Cytoplasm. Endomembrane system. Cell projection › lamellipodium. Note: Membrane-associated when activated. Co-localizes with NRBP to endomembranes and at the cell periphery in lamellipodia. Ref.6 |
| Tissue specificity | Highest levels in brain, also detected in heart, placenta and pancreas. |
| Induction | Expression down-regulated in quiescent fibroblasts and clearly induced by serum stimulation. |
| Sequence similarities | Belongs to the small GTPase superfamily. Rho family. |
Ontologies
Binary interactions
With | Entry | #Exp. | IntAct | Notes |
|---|---|---|---|---|
| ESR1 | P03372 | 5 | EBI-767084,EBI-78473 | |
| NRBP1 | Q9UHY1 | 3 | EBI-767084,EBI-749731 |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 189 | 189 | Ras-related C3 botulinum toxin substrate 3 | PRO_0000198889 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Propeptide | 190 – 192 | 3 | Removed in mature form By similarity | PRO_0000281240 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 10 – 17 | 8 | GTP By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 57 – 61 | 5 | GTP By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 115 – 118 | 4 | GTP By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motif | 32 – 40 | 9 | Effector region Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 189 | 1 | Cysteine methyl ester By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Lipidation | 189 | 1 | S-geranylgeranyl cysteine By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 2 – 10 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 16 – 25 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 36 – 46 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 49 – 58 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 62 – 64 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 65 – 67 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 68 – 71 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 76 – 83 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 87 – 95 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 97 – 104 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 105 – 108 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 110 – 115 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 117 – 119 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 123 – 130 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 131 – 133 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 139 – 148 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 152 – 156 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 159 – 161 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 165 – 177 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "Characterization of RAC3, a novel member of the Rho family." Haataja L., Groffen J., Heisterkamp N. J. Biol. Chem. 272:20384-20388(1997) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA]. |
| [2] | "cDNA clones of human proteins involved in signal transduction sequenced by the Guthrie cDNA resource center (www.cdna.org)." Puhl H.L. III, Ikeda S.R., Aronstam R.S. Submitted (APR-2002) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA]. |
| [3] | "Cloning of human full-length CDSs in BD Creator(TM) system donor vector." Kalnine N., Chen X., Rolfs A., Halleck A., Hines L., Eisenstein S., Koundinya M., Raphael J., Moreira D., Kelley T., LaBaer J., Lin Y., Phelan M., Farmer A. Submitted (OCT-2004) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA]. |
| [4] | "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)." The MGC Project Team Genome Res. 14:2121-2127(2004) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA]. Tissue: Brain. |
| [5] | "Identification of a novel Rac3-interacting protein C1D." Haataja L., Groffen J., Heisterkamp N. Int. J. Mol. Med. 1:665-670(1998) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH C1D. |
| [6] | "Interaction of the small GTPase Rac3 with NRBP, a protein with a kinase-homology domain." De Langhe S., Haataja L., Senadheera D., Groffen J., Heisterkamp N. Int. J. Mol. Med. 9:451-459(2002) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: FUNCTION, SUBCELLULAR LOCATION, INTERACTION WITH NRBP. |
| [7] | "The Rac activator DOCK7 regulates neuronal polarity through local phosphorylation of stathmin/Op18." Watabe-Uchida M., John K.A., Janas J.A., Newey S.E., Van Aelst L. Neuron 51:727-739(2006) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH DOCK7. |
| [8] | "Initial characterization of the human central proteome." Burkard T.R., Planyavsky M., Kaupe I., Breitwieser F.P., Buerckstuemmer T., Bennett K.L., Superti-Furga G., Colinge J. BMC Syst. Biol. 5:17-17(2011) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: IDENTIFICATION BY MASS SPECTROMETRY [LARGE SCALE ANALYSIS]. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | AF008591 mRNA. Translation: AAC51667.1. AF498966 mRNA. Translation: AAM21113.1. BT019443 mRNA. Translation: AAV38250.1. BC009605 mRNA. Translation: AAH09605.1. BC015197 mRNA. Translation: AAH15197.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IPI | IPI00023138. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_005043.1. NM_005052.2. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.45002. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | P60763. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DIP | DIP-33881N. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IntAct | P60763. 16 interactions. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| STRING | 9606.ENSP00000304283. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | P60763. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DMDM | 46397673. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PaxDb | P60763. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | P60763. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DNASU | 5881. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENST00000306897; ENSP00000304283; ENSG00000169750. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 5881. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:5881. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UCSC | uc002kdf.3. human. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CTD | 5881. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | GC17P079989. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:9803. RAC3. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MIM | 602050. gene. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| neXtProt | NX_P60763. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA34164. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| eggNOG | COG1100. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | HOG000233974. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | HBG009351. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InParanoid | P60763. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KO | K07861. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OMA | LCPPPIK. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OrthoDB | EOG466VN1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PhylomeDB | P60763. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BRENDA | 3.6.5.2. 2681. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Reactome | REACT_111102. Signal Transduction. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Bgee | P60763. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_RAC3. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genevestigator | P60763. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000169750. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR005225. Small_GTP-bd_dom. IPR001806. Small_GTPase. IPR003578. Small_GTPase_Rho. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF00071. Ras. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRINTS | PR00449. RASTRNSFRMNG. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMART | SM00174. RHO. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR00231. small_GTP. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS51420. RHO. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ChEMBL | CHEMBL6087. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| EvolutionaryTrace | P60763. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenomeRNAi | 5881. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 22858. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | RAC3_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P60763 Secondary accession number(s): O14658, Q5U0M8 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Chordata Protein Annotation Program | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
Relevant documents
| Human chromosome 17 Human chromosome 17: entries, gene names and cross-references to MIM |
| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

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