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UniProtKB/Swiss-Prot P56545 (CTBP2_HUMAN)
Last modified
July 7, 2009.
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Clusters with 100%,
90%,
50% identity |
Documents (6) |
Third-party data |
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Names and origin
| Protein names | Recommended name: C-terminal-binding protein 2 Short name=CtBP2 | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Complete proteome] | ||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 445 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is not processed. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | Corepressor targeting diverse transcription regulators. Isoform 2 probably acts as a scaffold for specialized synapses By similarity. |
| Subunit structure | Interacts with the C-terminus of adenovirus E1A protein. Can form homodimers or heterodimers of CTBP1 and CTBP2. Interacts with HIPK2 By similarity. Interacts with PNN, NRIP1 and WIZ. |
| Subcellular location | Nucleus Potential. Cell junction › synapse By similarity. |
| Tissue specificity | Ubiquitous. Highest levels in heart, skeletal muscle, and pancreas. |
| Post-translational modification | Isoform 2 is phosphorylated upon DNA damage, probably by ATM or ATR at Thr-179; Ser-181 and Ser-185. Phosphorylation by HIPK2 on Ser-428 induces proteasomal degradation By similarity. |
| Sequence similarities | Belongs to the D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family. |
Ontologies
Alternative products
| This entry describes 2 isoforms produced by alternative splicing. [Align] [Select] | |||||||||
| Isoform 1 (identifier: P56545-1) This isoform has been chosen as the 'canonical' sequence. All positional information in this entry refers to it. This is also the sequence that appears in the downloadable versions of the entry. | |||||||||
| Isoform 2 (identifier: P56545-2) Also known as: Ribeye; The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 1-20: MALVDKHKVKRQRLDRICEG → MPVPSRHINI...VSTMLAPEPS | |||||||||
| Note: Contains a phosphothreonine at position 179. Contains a phosphoserine at position 181. Contains a phosphoserine at position 185. | |||||||||
Sequence annotation (Features) | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||
| Sequence conflict | 455 | 1 | Y → H in AAG45951. Ref.2 | ||||||
| Sequence conflict | 539 | 1 | Q → E in AAG45951. Ref.2 | ||||||
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 445 | 445 | C-terminal-binding protein 2 | PRO_0000076044 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 272 | 1 | Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 301 | 1 | Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 321 | 1 | Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 428 | 1 | Phosphoserine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 1 – 20 | 20 | MALVD…RICEG → MPVPSRHINIGRSQSWDAAG WYEGPWENAESLRPLGRRSS LTYGTAEGTWFEPNHRPQDA ALPVAAEPYLYREAVYNSVA ARKGSTPDFTFYDSRQAVMS GRSPLLPREYYSDPSGAARV PKEPPLYRDPGVSRPVPSYG VLGSRTSWDPMQGRSPALQD AGHLYRDPGGKMIPQGRQTQ SRAASPGRYGREQPDTRYGA EVPAYPLSQVFSDISERPID PAPARQVAPTCLVVDPSSAA APEGSTGVAPGALNRGYGPA RESIPSKMAYETYEADLSTF QGPGGKRTVLPEFLAFLRAE GLAEATLGALLQQGFDSPAV LATLEDADIKSVAPNLGQAR VLSRLANSCRTEMQLRRQDR GGPLPRARSSSFSHRSELLH GDLASLGAAAPLQTASPRAG DPARRPSSAPSQHLLETAAT YSAPGVGTHAPHFPSNSGYS SPTPCALTARLSPTYPLQAG VALTNPGPSNPLHPGPRTAY STAYTVPMELLKRERNVAAS PLPSPHGSPQVLRKPGAPLG PSTLPPASQSLHTPHSPYQK VARRTGAPIIVSTMLAPEPS in isoform 2. | VSP_027615 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 47 | 1 | E → D: dbSNP rs3198926. | VAR_033844 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 87 | 1 | L → F in AAG45951. Ref.2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 88 | 1 | T → N in AAG45951. Ref.2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 112 | 1 | D → N in AAG45951. Ref.2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 411 | 1 | I → T in AAH47018. Ref.8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 35 – 38 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 47 – 51 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 52 – 54 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 56 – 59 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 65 – 67 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 70 – 75 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 76 – 81 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 83 – 85 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 89 – 93 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 100 – 106 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 113 – 118 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 122 – 124 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 128 – 130 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 131 – 147 | 17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 149 – 157 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 165 – 171 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 172 – 174 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 182 – 186 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 190 – 199 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 200 – 202 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 205 – 209 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 217 – 220 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 229 – 235 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 237 – 241 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 255 – 258 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 265 – 269 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 273 – 275 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 278 – 286 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 289 – 296 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 299 – 302 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 309 – 312 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 314 – 318 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 327 – 346 | 20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 349 – 352 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 354 – 356 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||||||||
References
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| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| AF016507 mRNA. Translation: AAC39603.1. AF222711 mRNA. Translation: AAG45951.1. BT007012 mRNA. Translation: AAP35658.1. AK290390 mRNA. Translation: BAF83079.1. AL833398 mRNA. Translation: CAH10590.1. AL596261, AL731571 Genomic DNA. Translation: CAH72472.1. AL731571, AL596261 Genomic DNA. Translation: CAI16100.1. AL731571 Genomic DNA. Translation: CAI16102.1. CH471066 Genomic DNA. Translation: EAW49247.1. CH471066 Genomic DNA. Translation: EAW49250.1. BC002486 mRNA. Translation: AAH02486.1. BC047018 mRNA. Translation: AAH47018.1. BC052276 mRNA. Translation: AAH52276.1. BC072020 mRNA. Translation: AAH72020.1. | |||||||||||||
| IPI | IPI00010120. IPI00010136. | ||||||||||||
| RefSeq | NP_001077383.1. NP_001320.1. NP_073713.2. | ||||||||||||
| UniGene | Hs.501345 | ||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||
| |||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||
| IntAct | P56545. 7 interactions. | ||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||
| PRIDE | P56545. | ||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||
| Ensembl | ENSG00000175029. Homo sapiens. [Contig view] | ||||||||||||
| GeneID | 1488. | ||||||||||||
| KEGG | hsa:1488. | ||||||||||||
| UCSC | uc001lie.2. human. uc001lif.2. human. | ||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||
| GeneCards | GC10M126666. | ||||||||||||
| H-InvDB | HIX0009290. | ||||||||||||
| HGNC | HGNC:2495. CTBP2. | ||||||||||||
| MIM | 602619. gene. | ||||||||||||
| PharmGKB | PA24460. | ||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||
| HOVERGEN | P56545. | ||||||||||||
| OMA | P56545. GHLYRDP. | ||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||
| Bgee | P56545. | ||||||||||||
| CleanEx | HS_CTBP2. | ||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000175029. Homo sapiens. | ||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||
| InterPro | IPR006139. D-isomer_2_OHA_DH. IPR006140. D-isomer_2_OHA_DH_NAD-bd. IPR016040. NAD(P)-bd_dom. [Graphical view] | ||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:3.40.50.720. NAD(P)-bd. 1 hit. | ||||||||||||
| Pfam | PF00389. 2-Hacid_dh. 1 hit. PF02826. 2-Hacid_dh_C. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| PROSITE | PS00065. D_2_HYDROXYACID_DH_1. False negative. PS00670. D_2_HYDROXYACID_DH_2. False negative. PS00671. D_2_HYDROXYACID_DH_3. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||
Other Resources | |||||||||||||
| NextBio | 6111. | ||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||
Entry information
| Entry name | CTBP2_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P56545 Secondary accession number(s): A8K2X5 Q9H2T8 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HPI (Human Proteome Initiative) | ||||||||
Relevant documents
| Human chromosome 10 Human chromosome 10: entries, gene names and cross-references to MIM |
| Human entries with polymorphisms or disease mutations List of human entries with polymorphisms or disease mutations |
| Human polymorphisms and disease mutations Index of human polymorphisms and disease mutations |
| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
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