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UniProtKB/Swiss-Prot P55899 (FCGRN_HUMAN)
Last modified
July 7, 2009.
Version 80.
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Clusters with 100%,
90%,
50% identity |
Documents (4) |
Third-party data |
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Names and origin
| Protein names | Recommended name: IgG receptor FcRn large subunit p51 Short name=FcRn Alternative name(s): Neonatal Fc receptor IgG Fc fragment receptor transporter alpha chain | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Complete proteome] | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 365 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | Binds to the Fc region of monomeric immunoglobulins gamma. Mediates the uptake of IgG from milk. Possible role in transfer of immunoglobulin G from mother to fetus. |
| Subunit structure | FcRn complex consist of two subunits: p51, and p14 which is equivalent to beta-2-microglobulin. It forms an MHC class I-like heterodimer By similarity. |
| Subcellular location | Cell membrane; Single-pass type I membrane protein By similarity. |
| Sequence similarities | Belongs to the immunoglobulin superfamily. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Cellular component | Cell membrane Membrane |
| Domain | Immunoglobulin domain Signal Transmembrane |
| Ligand | IgG-binding protein |
| Molecular function | Receptor |
| PTM | Disulfide bond Glycoprotein |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Direct protein sequencing |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | antigen processing and presentation Inferred from electronic annotation. Source: InterPro female pregnancy Ref.1Traceable author statement. Source: ProtInc immune response Ref.1Traceable author statement. Source: ProtInc |
| Cellular component | MHC class I protein complex Inferred from electronic annotation. Source: InterPro integral to membraneInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Molecular function | IgG binding Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW receptor activity Ref.1Traceable author statement. Source: ProtInc |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Signal peptide | 1 – 23 | 23 | Ref.5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 24 – 365 | 342 | IgG receptor FcRn large subunit p51 | PRO_0000015157 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 24 – 297 | 274 | Extracellular Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transmembrane | 298 – 321 | 24 | Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 322 – 365 | 44 | Cytoplasmic Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 24 – 110 | 87 | Alpha-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 111 – 200 | 90 | Alpha-2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 201 – 290 | 90 | Alpha-3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 291 – 297 | 7 | Connecting peptide | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 125 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 119 ↔ 182 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 221 ↔ 275 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 101 – 103 | 3 | Missing in AAG31421. Ref.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 201 | 1 | E → G in AAF72596. Ref.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 29 – 39 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 46 – 53 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 56 – 62 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 63 – 65 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 85 – 103 | 19 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 112 – 121 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 127 – 135 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 138 – 144 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 145 – 148 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 149 – 151 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 155 – 165 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 170 – 179 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 181 – 191 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 194 – 197 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 204 – 211 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 216 – 229 | 14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 231 – 237 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 249 – 251 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 257 – 266 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 270 – 272 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 273 – 279 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 282 – 284 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 286 – 289 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "A major histocompatibility complex class I-like Fc receptor cloned from human placenta: possible role in transfer of immunoglobulin G from mother to fetus." Story C.M., Mikulska J., Simister N.E. J. Exp. Med. 180:2377-2381(1994) [PubMed: 7964511] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA]. Tissue: Placenta. |
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| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| U12255 mRNA. Translation: AAA58958.1. AF220542 Genomic DNA. Translation: AAF72596.1. AF200220, AF200219 Genomic DNA. Translation: AAG31421.1. BC008734 mRNA. Translation: AAH08734.1. | |||||||||||||
| IPI | IPI00026646. | ||||||||||||
| PIR | I38720. | ||||||||||||
| RefSeq | NP_001129491.1. NP_004098.1. | ||||||||||||
| UniGene | Hs.111903 | ||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||
| |||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||
| DIP | DIP:6165N. | ||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||
| PRIDE | P55899. | ||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||
| Ensembl | ENSG00000104870. Homo sapiens. [Contig view] | ||||||||||||
| GeneID | 2217. | ||||||||||||
| KEGG | hsa:2217. | ||||||||||||
| UCSC | uc002poe.1. human. | ||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||
| GeneCards | GC19P054707. | ||||||||||||
| H-InvDB | HIX0015331. | ||||||||||||
| HGNC | HGNC:3621. FCGRT. | ||||||||||||
| HPA | HPA012122. HPA015130. | ||||||||||||
| MIM | 601437. gene. | ||||||||||||
| PharmGKB | PA28067. | ||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||
| HOGENOM | P55899. | ||||||||||||
| HOVERGEN | P55899. | ||||||||||||
| OMA | P55899. WYWEKET. | ||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||
| ArrayExpress | P55899. | ||||||||||||
| Bgee | P55899. | ||||||||||||
| CleanEx | HS_FCGRT. | ||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000104870. Homo sapiens. | ||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||
| InterPro | IPR007110. Ig-like. IPR013783. Ig-like_fold. IPR003006. Ig/MHC_CS. IPR003597. Ig_C1-set. IPR011161. MHC_I-like_Ag-recog. IPR001039. MHC_I_a_a1/a2. [Graphical view] | ||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:2.60.40.10. Ig-like_fold. 1 hit. G3DSA:3.30.500.10. MHC_I-like_Ag-recog. 1 hit. | ||||||||||||
| Pfam | PF07654. C1-set. 1 hit. PF00129. MHC_I. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| SMART | SM00407. IGc1. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| PROSITE | PS50835. IG_LIKE. 1 hit. PS00290. IG_MHC. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||
Other Resources | |||||||||||||
| NextBio | 8991. | ||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||
Entry information
| Entry name | FCGRN_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P55899 Secondary accession number(s): Q9HBV7, Q9NZ19 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HPI (Human Proteome Initiative) | ||||||||
Relevant documents
| Human chromosome 19 Human chromosome 19: entries, gene names and cross-references to MIM |
| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

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