Skip Header

You are using a version of browser that may not display all the features of this website. Please consider upgrading your browser.
Basket 0
(max 400 entries)x

Your basket is currently empty.

Select item(s) and click on "Add to basket" to create your own collection here
(400 entries max)

P55038

- GLTS_SYNY3

UniProt

P55038 - GLTS_SYNY3

Protein

Ferredoxin-dependent glutamate synthase 2

Gene

gltS

Organism
Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa)
Status
Reviewed - Annotation score: 3 out of 5- Experimental evidence at protein leveli
    • BLAST
    • Align
    • Format
    • Add to basket
    • History
      Entry version 110 (01 Oct 2014)
      Sequence version 2 (01 Nov 1997)
      Previous versions | rss
    • Help video
    • Feedback
    • Comment

    Functioni

    Catalytic activityi

    2 L-glutamate + 2 oxidized ferredoxin = L-glutamine + 2-oxoglutarate + 2 reduced ferredoxin + 2 H+.

    Cofactori

    Binds 1 3Fe-4S cluster.
    FAD.
    FMN.

    Pathwayi

    Sites

    Feature keyPosition(s)LengthDescriptionGraphical viewFeature identifierActions
    Active sitei37 – 371For GATase activityBy similarity
    Metal bindingi1173 – 11731Iron-sulfur (3Fe-4S)By similarity
    Metal bindingi1179 – 11791Iron-sulfur (3Fe-4S)By similarity
    Metal bindingi1184 – 11841Iron-sulfur (3Fe-4S)By similarity

    GO - Molecular functioni

    1. 3 iron, 4 sulfur cluster binding Source: UniProtKB-KW
    2. glutamate synthase (ferredoxin) activity Source: UniProtKB-EC
    3. metal ion binding Source: UniProtKB-KW

    GO - Biological processi

    1. glutamine metabolic process Source: UniProtKB-KW
    2. L-glutamate biosynthetic process Source: UniProtKB-UniPathway

    Keywords - Molecular functioni

    Oxidoreductase

    Keywords - Biological processi

    Amino-acid biosynthesis, Glutamate biosynthesis

    Keywords - Ligandi

    3Fe-4S, FAD, Flavoprotein, FMN, Iron, Iron-sulfur, Metal-binding

    Enzyme and pathway databases

    UniPathwayiUPA00045.
    UPA00634; UER00691.

    Names & Taxonomyi

    Protein namesi
    Recommended name:
    Ferredoxin-dependent glutamate synthase 2 (EC:1.4.7.1)
    Alternative name(s):
    FD-GOGAT
    Gene namesi
    Name:gltS
    Ordered Locus Names:sll1499
    OrganismiSynechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa)
    Taxonomic identifieri1111708 [NCBI]
    Taxonomic lineageiBacteriaCyanobacteriaOscillatoriophycideaeChroococcalesSynechocystis
    ProteomesiUP000001425: Chromosome

    PTM / Processingi

    Molecule processing

    Feature keyPosition(s)LengthDescriptionGraphical viewFeature identifierActions
    Chaini1 – 15561556Ferredoxin-dependent glutamate synthase 2PRO_0000170794Add
    BLAST

    Proteomic databases

    PaxDbiP55038.

    Interactioni

    Protein-protein interaction databases

    IntActiP55038. 4 interactions.
    STRINGi1148.sll1499.

    Structurei

    Secondary structure

    1
    1556
    Legend: HelixTurnBeta strand
    Show more details
    Feature keyPosition(s)LengthDescriptionGraphical viewFeature identifierActions
    Beta strandi38 – 436
    Beta strandi45 – 473
    Helixi52 – 6312
    Helixi64 – 674
    Beta strandi74 – 785
    Beta strandi80 – 856
    Helixi88 – 9710
    Helixi105 – 1073
    Beta strandi109 – 1157
    Helixi119 – 13517
    Beta strandi139 – 1457
    Helixi150 – 1523
    Helixi155 – 1606
    Beta strandi163 – 1708
    Helixi177 – 19115
    Helixi192 – 1943
    Beta strandi199 – 21517
    Helixi217 – 2193
    Helixi220 – 2234
    Helixi225 – 2284
    Beta strandi234 – 2418
    Beta strandi245 – 2473
    Helixi251 – 2533
    Beta strandi254 – 2563
    Beta strandi258 – 2647
    Helixi269 – 27911
    Helixi280 – 2823
    Helixi290 – 2967
    Helixi306 – 31914
    Helixi324 – 3318
    Helixi340 – 3423
    Helixi346 – 35510
    Turni356 – 3583
    Beta strandi364 – 3718
    Beta strandi373 – 3808
    Beta strandi389 – 3935
    Beta strandi398 – 4036
    Helixi411 – 4133
    Beta strandi414 – 4196
    Beta strandi425 – 4295
    Turni430 – 4334
    Beta strandi434 – 4363
    Helixi438 – 4469
    Helixi451 – 4588
    Beta strandi459 – 4624
    Helixi476 – 48510
    Helixi490 – 4956
    Helixi497 – 5037
    Turni518 – 5203
    Helixi527 – 5304
    Beta strandi531 – 5333
    Beta strandi538 – 5403
    Turni545 – 5484
    Helixi549 – 5513
    Beta strandi556 – 5594
    Beta strandi564 – 5663
    Helixi569 – 5724
    Beta strandi574 – 5785
    Helixi584 – 5929
    Beta strandi593 – 5953
    Beta strandi597 – 6015
    Beta strandi603 – 6053
    Beta strandi607 – 6093
    Helixi612 – 62817
    Beta strandi632 – 6398
    Helixi640 – 6423
    Beta strandi646 – 6483
    Beta strandi649 – 6513
    Helixi654 – 66714
    Helixi671 – 6733
    Beta strandi675 – 6795
    Helixi686 – 6949
    Beta strandi698 – 7014
    Helixi703 – 71311
    Helixi716 – 7227
    Turni723 – 7253
    Helixi732 – 75322
    Helixi759 – 7635
    Beta strandi768 – 7736
    Helixi775 – 7817
    Helixi794 – 80815
    Beta strandi809 – 8113
    Beta strandi820 – 8234
    Beta strandi826 – 8283
    Helixi835 – 84713
    Helixi862 – 87110
    Helixi878 – 8814
    Beta strandi882 – 8843
    Helixi893 – 8953
    Helixi899 – 9035
    Turni913 – 9153
    Helixi918 – 93114
    Helixi944 – 9474
    Beta strandi960 – 9623
    Beta strandi977 – 9815
    Helixi990 – 9956
    Beta strandi997 – 10026
    Helixi1017 – 10193
    Helixi1022 – 10287
    Helixi1048 – 106114
    Beta strandi1065 – 10728
    Helixi1077 – 108610
    Beta strandi1090 – 10956
    Beta strandi1102 – 11054
    Helixi1106 – 11116
    Helixi1116 – 112914
    Helixi1133 – 11353
    Beta strandi1137 – 11437
    Helixi1147 – 11559
    Beta strandi1159 – 11624
    Helixi1165 – 11706
    Helixi1179 – 11813
    Beta strandi1187 – 11893
    Helixi1193 – 11964
    Helixi1203 – 122422
    Helixi1229 – 12324
    Helixi1236 – 12383
    Beta strandi1239 – 12413
    Beta strandi1248 – 12514
    Helixi1256 – 12594
    Helixi1269 – 12713
    Helixi1283 – 12897
    Helixi1291 – 12999
    Beta strandi1302 – 13098
    Helixi1318 – 132811
    Turni1329 – 13313
    Beta strandi1336 – 134510
    Turni1347 – 13526
    Beta strandi1357 – 13659
    Turni1369 – 13724
    Beta strandi1375 – 13817
    Helixi1390 – 13923
    Turni1400 – 14034
    Beta strandi1408 – 14147
    Turni1419 – 14224
    Beta strandi1427 – 14315
    Turni1437 – 14404
    Beta strandi1442 – 14487
    Beta strandi1454 – 14563
    Turni1457 – 14593
    Beta strandi1462 – 14687
    Beta strandi1470 – 14723
    Helixi1474 – 14774
    Turni1480 – 14823
    Beta strandi1484 – 14863
    Helixi1491 – 150818
    Helixi1511 – 15188
    Helixi1520 – 15245
    Beta strandi1527 – 15315
    Turni1533 – 15375
    Turni1539 – 15413

    3D structure databases

    Select the link destinations:
    PDBe
    RCSB PDB
    PDBj
    Links Updated
    EntryMethodResolution (Å)ChainPositionsPDBsum
    1LLWX-ray2.70A37-1556[»]
    1LLZX-ray3.00A37-1556[»]
    1LM1X-ray2.80A37-1556[»]
    1OFDX-ray2.00A/B37-1556[»]
    1OFEX-ray2.45A/B37-1556[»]
    ProteinModelPortaliP55038.
    ModBaseiSearch...
    MobiDBiSearch...

    Miscellaneous databases

    EvolutionaryTraceiP55038.

    Family & Domainsi

    Domains and Repeats

    Feature keyPosition(s)LengthDescriptionGraphical viewFeature identifierActions
    Domaini37 – 431395Glutamine amidotransferase type-2PROSITE-ProRule annotationAdd
    BLAST

    Sequence similaritiesi

    Belongs to the glutamate synthase family.Curated
    Contains 1 glutamine amidotransferase type-2 domain.PROSITE-ProRule annotation

    Keywords - Domaini

    Glutamine amidotransferase

    Phylogenomic databases

    eggNOGiCOG0069.
    HOGENOMiHOG000031558.
    KOiK00284.
    OMAiYSVQGVT.
    OrthoDBiEOG60W7PX.
    PhylomeDBiP55038.

    Family and domain databases

    Gene3Di2.160.20.60. 1 hit.
    3.20.20.70. 2 hits.
    3.60.20.10. 1 hit.
    InterProiIPR013785. Aldolase_TIM.
    IPR017932. GATase_2_dom.
    IPR000583. GATase_dom.
    IPR002489. Glu_synth_asu_C.
    IPR006982. Glu_synth_centr_N.
    IPR002932. Glu_synthdom.
    IPR029055. Ntn_hydrolases_N.
    [Graphical view]
    PfamiPF00310. GATase_2. 1 hit.
    PF04898. Glu_syn_central. 1 hit.
    PF01645. Glu_synthase. 1 hit.
    PF01493. GXGXG. 1 hit.
    [Graphical view]
    SUPFAMiSSF56235. SSF56235. 1 hit.
    SSF69336. SSF69336. 1 hit.
    PROSITEiPS51278. GATASE_TYPE_2. 1 hit.
    [Graphical view]

    Sequencei

    Sequence statusi: Complete.

    P55038-1 [UniParc]FASTAAdd to Basket

    « Hide

    MSFQYPLLAP MTNSSVATNS NQPFLGQPWL VEERDACGVG FIANLRGKPD     50
    HTLVEQALKA LGCMEHRGGC SADNDSGDGA GVMTAIPREL LAQWFNTRNL 100
    PMPDGDRLGV GMVFLPQEPS AREVARAYVE EVVRLEKLTV LGWREVPVNS 150
    DVLGIQAKNN QPHIEQILVT CPEGCAGDEL DRRLYIARSI IGKKLAEDFY 200
    VCSFSCRTIV YKGMVRSIIL GEFYLDLKNP GYTSNFAVYH RRFSTNTMPK 250
    WPLAQPMRLL GHNGEINTLL GNINWMAARE KELEVSGWTK AELEALTPIV 300
    NQANSDSYNL DSALELLVRT GRSPLEAAMI LVPEAYKNQP ALKDYPEISD 350
    FHDYYSGLQE PWDGPALLVF SDGKIVGAGL DRNGLRPARY CITKDDYIVL 400
    GSEAGVVDLP EVDIVEKGRL APGQMIAVDL AEQKILKNYQ IKQQAAQKYP 450
    YGEWIKIQRQ TVASDSFAEK TLFNDAQTVL QQQAAFGYTA EDVEMVVVPM 500
    ASQGKEPTFC MGDDTPLAVL SHKPRLLYDY FKQRFAQVTN PPIDPLRENL 550
    VMSLAMFLGK RGNLLEPKAE SARTIKLRSP LVNEVELQAI KTGQLQVAEV 600
    STLYDLDGVN SLETALDNLV KTAIATVQAG AEILVLTDRP NGAILTENQS 650
    FIPPLLAVGA VHHHLIRAGL RLKASLIVDT AQCWSTHHFA CLVGYGASAI 700
    CPYLALESVR QWWLDEKTQK LMENGRLDRI DLPTALKNYR QSVEAGLFKI 750
    LSKMGISLLA SYHGAQIFEA IGLGAELVEY AFAGTTSRVG GLTIADVAGE 800
    VMVFHGMAFP EMAKKLENFG FVNYRPGGEY HMNSPEMSKS LHKAVAAYKV 850
    GGNGNNGEAY DHYELYRQYL KDRPVTALRD LLDFNADQPA ISLEEVESVE 900
    SIVKRFCTGG MSLGALSREA HETLAIAMNR LGAKSNSGEG GEDVVRYLTL 950
    DDVDSEGNSP TLPHLHGLQN GDTANSAIKQ IASGRFGVTP EYLMSGKQLE 1000
    IKMAQGAKPG EGGQLPGKKV SEYIAMLRRS KPGVTLISPP PHHDIYSIED 1050
    LAQLIYDLHQ INPEAQVSVK LVAEIGIGTI AAGVAKANAD IIQISGHDGG 1100
    TGASPLSSIK HAGSPWELGV TEVHRVLMEN QLRDRVLLRA DGGLKTGWDV 1150
    VMAALMGAEE YGFGSIAMIA EGCIMARVCH TNNCPVGVAT QQERLRQRFK 1200
    GVPGQVVNFF YFIAEEVRSL LAHLGYRSLD DIIGRTDLLK VRSDVQLSKT 1250
    QNLTLDCLLN LPDTKQNRQW LNHEPVHSNG PVLDDDILAD PDIQEAINHQ 1300
    TTATKTYRLV NTDRTVGTRL SGAIAKKYGN NGFEGNITLN FQGAAGQSFG 1350
    AFNLDGMTLH LQGEANDYVG KGMNGGEIVI VPHPQASFAP EDNVIIGNTC 1400
    LYGATGGNLY ANGRAGERFA VRNSVGKAVI EGAGDHCCEY MTGGVIVVLG 1450
    PVGRNVGAGM TGGLAYFLDE VGDLPEKINP EIITLQRITA SKGEEQLKSL 1500
    ITAHVEHTGS PKGKAILANW SDYLGKFWQA VPPSEKDSPE ANGDVSLTGE 1550
    KTLTSV 1556
    Length:1,556
    Mass (Da):169,499
    Last modified:November 1, 1997 - v2
    Checksum:i4BDAD5F9A4064D9D
    GO

    Experimental Info

    Feature keyPosition(s)LengthDescriptionGraphical viewFeature identifierActions
    Sequence conflicti491 – 4911E → Q in CAA63218. (PubMed:7727752)Curated
    Sequence conflicti570 – 5723ESA → NPR in CAA63218. (PubMed:7727752)Curated
    Sequence conflicti642 – 6509GAILTENQS → RRNIGLRIKV in CAA63218. (PubMed:7727752)Curated
    Sequence conflicti659 – 6591G → E in CAA63218. (PubMed:7727752)Curated
    Sequence conflicti940 – 9412GG → PP in CAA63218. (PubMed:7727752)Curated
    Sequence conflicti1059 – 10591H → L in CAA63218. (PubMed:7727752)Curated
    Sequence conflicti1295 – 12951E → RK in CAA63218. (PubMed:7727752)Curated
    Sequence conflicti1310 – 13101V → D in CAA63218. (PubMed:7727752)Curated
    Sequence conflicti1323 – 13231A → S in CAA63218. (PubMed:7727752)Curated
    Sequence conflicti1531 – 15311Missing in CAA63218. (PubMed:7727752)Curated

    Sequence databases

    Select the link destinations:
    EMBL
    GenBank
    DDBJ
    Links Updated
    X92480 Genomic DNA. Translation: CAA63218.1.
    D78371 Genomic DNA. Translation: BAA11379.1.
    BA000022 Genomic DNA. Translation: BAA18693.1.
    PIRiS76781.
    RefSeqiNP_442881.1. NC_000911.1.
    YP_005652942.1. NC_017277.1.
    YP_007452757.1. NC_020286.1.

    Genome annotation databases

    EnsemblBacteriaiBAA18693; BAA18693; BAA18693.
    GeneIDi952019.
    KEGGisyn:sll1499.
    syy:SYNGTS_2989.
    syz:MYO_130230.
    PATRICi23843556. VBISynSp132158_3309.

    Cross-referencesi

    Sequence databases

    Select the link destinations:
    EMBL
    GenBank
    DDBJ
    Links Updated
    X92480 Genomic DNA. Translation: CAA63218.1 .
    D78371 Genomic DNA. Translation: BAA11379.1 .
    BA000022 Genomic DNA. Translation: BAA18693.1 .
    PIRi S76781.
    RefSeqi NP_442881.1. NC_000911.1.
    YP_005652942.1. NC_017277.1.
    YP_007452757.1. NC_020286.1.

    3D structure databases

    Select the link destinations:
    PDBe
    RCSB PDB
    PDBj
    Links Updated
    Entry Method Resolution (Å) Chain Positions PDBsum
    1LLW X-ray 2.70 A 37-1556 [» ]
    1LLZ X-ray 3.00 A 37-1556 [» ]
    1LM1 X-ray 2.80 A 37-1556 [» ]
    1OFD X-ray 2.00 A/B 37-1556 [» ]
    1OFE X-ray 2.45 A/B 37-1556 [» ]
    ProteinModelPortali P55038.
    ModBasei Search...
    MobiDBi Search...

    Protein-protein interaction databases

    IntActi P55038. 4 interactions.
    STRINGi 1148.sll1499.

    Proteomic databases

    PaxDbi P55038.

    Protocols and materials databases

    Structural Biology Knowledgebase Search...

    Genome annotation databases

    EnsemblBacteriai BAA18693 ; BAA18693 ; BAA18693 .
    GeneIDi 952019.
    KEGGi syn:sll1499.
    syy:SYNGTS_2989.
    syz:MYO_130230.
    PATRICi 23843556. VBISynSp132158_3309.

    Phylogenomic databases

    eggNOGi COG0069.
    HOGENOMi HOG000031558.
    KOi K00284.
    OMAi YSVQGVT.
    OrthoDBi EOG60W7PX.
    PhylomeDBi P55038.

    Enzyme and pathway databases

    UniPathwayi UPA00045 .
    UPA00634 ; UER00691 .

    Miscellaneous databases

    EvolutionaryTracei P55038.

    Family and domain databases

    Gene3Di 2.160.20.60. 1 hit.
    3.20.20.70. 2 hits.
    3.60.20.10. 1 hit.
    InterProi IPR013785. Aldolase_TIM.
    IPR017932. GATase_2_dom.
    IPR000583. GATase_dom.
    IPR002489. Glu_synth_asu_C.
    IPR006982. Glu_synth_centr_N.
    IPR002932. Glu_synthdom.
    IPR029055. Ntn_hydrolases_N.
    [Graphical view ]
    Pfami PF00310. GATase_2. 1 hit.
    PF04898. Glu_syn_central. 1 hit.
    PF01645. Glu_synthase. 1 hit.
    PF01493. GXGXG. 1 hit.
    [Graphical view ]
    SUPFAMi SSF56235. SSF56235. 1 hit.
    SSF69336. SSF69336. 1 hit.
    PROSITEi PS51278. GATASE_TYPE_2. 1 hit.
    [Graphical view ]
    ProtoNeti Search...

    Publicationsi

    1. "Existence of two ferredoxin-glutamate synthases in the cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803. Isolation and insertional inactivation of gltB and gltS genes."
      Navarro F., Chavez S., Candau P., Florencio F.J.
      Plant Mol. Biol. 27:753-767(1995) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract]
      Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA].
    2. Terauchi K., Ikeuchi M., Ohmori M.
      Submitted (DEC-1995) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases
      Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA].
    3. "Sequence analysis of the genome of the unicellular cyanobacterium Synechocystis sp. strain PCC6803. II. Sequence determination of the entire genome and assignment of potential protein-coding regions."
      Kaneko T., Sato S., Kotani H., Tanaka A., Asamizu E., Nakamura Y., Miyajima N., Hirosawa M., Sugiura M., Sasamoto S., Kimura T., Hosouchi T., Matsuno A., Muraki A., Nakazaki N., Naruo K., Okumura S., Shimpo S.
      , Takeuchi C., Wada T., Watanabe A., Yamada M., Yasuda M., Tabata S.
      DNA Res. 3:109-136(1996) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract]
      Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA].
      Strain: PCC 6803 / Kazusa.

    Entry informationi

    Entry nameiGLTS_SYNY3
    AccessioniPrimary (citable) accession number: P55038
    Secondary accession number(s): Q59980
    Entry historyi
    Integrated into UniProtKB/Swiss-Prot: October 1, 1996
    Last sequence update: November 1, 1997
    Last modified: October 1, 2014
    This is version 110 of the entry and version 2 of the sequence. [Complete history]
    Entry statusiReviewed (UniProtKB/Swiss-Prot)
    Annotation programProkaryotic Protein Annotation Program

    Miscellaneousi

    Keywords - Technical termi

    3D-structure, Complete proteome, Reference proteome

    Documents

    1. PATHWAY comments
      Index of metabolic and biosynthesis pathways
    2. PDB cross-references
      Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references
    3. SIMILARITY comments
      Index of protein domains and families
    4. Synechocystis PCC 6803
      Synechocystis (strain PCC 6803): entries and gene names

    External Data

    Dasty 3