SubmitCancel

Skip Header

You are using a version of browser that may not display all the features of this website. Please consider upgrading your browser.

P55038

- GLTS_SYNY3

UniProt

P55038 - GLTS_SYNY3

(max 400 entries)x

Your basket is currently empty.

Select item(s) and click on "Add to basket" to create your own collection here
(400 entries max)

Protein
Ferredoxin-dependent glutamate synthase 2
Gene
gltS, sll1499
Organism
Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa)
Status
Reviewed - Annotation score: 3 out of 5 - Experimental evidence at protein leveli

Functioni

Catalytic activityi

2 L-glutamate + 2 oxidized ferredoxin = L-glutamine + 2-oxoglutarate + 2 reduced ferredoxin + 2 H+.

Cofactori

Binds 1 3Fe-4S cluster.
FAD.
FMN.

Pathwayi

Sites

Feature keyPosition(s)LengthDescriptionGraphical viewFeature identifierActions
Active sitei37 – 371For GATase activity By similarity
Metal bindingi1173 – 11731Iron-sulfur (3Fe-4S) By similarity
Metal bindingi1179 – 11791Iron-sulfur (3Fe-4S) By similarity
Metal bindingi1184 – 11841Iron-sulfur (3Fe-4S) By similarity

GO - Molecular functioni

  1. 3 iron, 4 sulfur cluster binding Source: UniProtKB-KW
  2. glutamate synthase (ferredoxin) activity Source: UniProtKB-EC
  3. metal ion binding Source: UniProtKB-KW

GO - Biological processi

  1. L-glutamate biosynthetic process Source: UniProtKB-UniPathway
  2. glutamine metabolic process Source: UniProtKB-KW
Complete GO annotation...

Keywords - Molecular functioni

Oxidoreductase

Keywords - Biological processi

Amino-acid biosynthesis, Glutamate biosynthesis

Keywords - Ligandi

3Fe-4S, FAD, Flavoprotein, FMN, Iron, Iron-sulfur, Metal-binding

Enzyme and pathway databases

UniPathwayiUPA00045.
UPA00634; UER00691.

Names & Taxonomyi

Protein namesi
Recommended name:
Ferredoxin-dependent glutamate synthase 2 (EC:1.4.7.1)
Alternative name(s):
FD-GOGAT
Gene namesi
Name:gltS
Ordered Locus Names:sll1499
OrganismiSynechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa)
Taxonomic identifieri1111708 [NCBI]
Taxonomic lineageiBacteriaCyanobacteriaOscillatoriophycideaeChroococcalesSynechocystis
ProteomesiUP000001425: Chromosome

PTM / Processingi

Molecule processing

Feature keyPosition(s)LengthDescriptionGraphical viewFeature identifierActions
Chaini1 – 15561556Ferredoxin-dependent glutamate synthase 2
PRO_0000170794Add
BLAST

Proteomic databases

PaxDbiP55038.

Interactioni

Protein-protein interaction databases

IntActiP55038. 4 interactions.
STRINGi1148.sll1499.

Structurei

Secondary structure

Legend: HelixTurnBeta strand
Show more details
Feature keyPosition(s)LengthDescriptionGraphical viewFeature identifierActions
Beta strandi38 – 436
Beta strandi45 – 473
Helixi52 – 6312
Helixi64 – 674
Beta strandi74 – 785
Beta strandi80 – 856
Helixi88 – 9710
Helixi105 – 1073
Beta strandi109 – 1157
Helixi119 – 13517
Beta strandi139 – 1457
Helixi150 – 1523
Helixi155 – 1606
Beta strandi163 – 1708
Helixi177 – 19115
Helixi192 – 1943
Beta strandi199 – 21517
Helixi217 – 2193
Helixi220 – 2234
Helixi225 – 2284
Beta strandi234 – 2418
Beta strandi245 – 2473
Helixi251 – 2533
Beta strandi254 – 2563
Beta strandi258 – 2647
Helixi269 – 27911
Helixi280 – 2823
Helixi290 – 2967
Helixi306 – 31914
Helixi324 – 3318
Helixi340 – 3423
Helixi346 – 35510
Turni356 – 3583
Beta strandi364 – 3718
Beta strandi373 – 3808
Beta strandi389 – 3935
Beta strandi398 – 4036
Helixi411 – 4133
Beta strandi414 – 4196
Beta strandi425 – 4295
Turni430 – 4334
Beta strandi434 – 4363
Helixi438 – 4469
Helixi451 – 4588
Beta strandi459 – 4624
Helixi476 – 48510
Helixi490 – 4956
Helixi497 – 5037
Turni518 – 5203
Helixi527 – 5304
Beta strandi531 – 5333
Beta strandi538 – 5403
Turni545 – 5484
Helixi549 – 5513
Beta strandi556 – 5594
Beta strandi564 – 5663
Helixi569 – 5724
Beta strandi574 – 5785
Helixi584 – 5929
Beta strandi593 – 5953
Beta strandi597 – 6015
Beta strandi603 – 6053
Beta strandi607 – 6093
Helixi612 – 62817
Beta strandi632 – 6398
Helixi640 – 6423
Beta strandi646 – 6483
Beta strandi649 – 6513
Helixi654 – 66714
Helixi671 – 6733
Beta strandi675 – 6795
Helixi686 – 6949
Beta strandi698 – 7014
Helixi703 – 71311
Helixi716 – 7227
Turni723 – 7253
Helixi732 – 75322
Helixi759 – 7635
Beta strandi768 – 7736
Helixi775 – 7817
Helixi794 – 80815
Beta strandi809 – 8113
Beta strandi820 – 8234
Beta strandi826 – 8283
Helixi835 – 84713
Helixi862 – 87110
Helixi878 – 8814
Beta strandi882 – 8843
Helixi893 – 8953
Helixi899 – 9035
Turni913 – 9153
Helixi918 – 93114
Helixi944 – 9474
Beta strandi960 – 9623
Beta strandi977 – 9815
Helixi990 – 9956
Beta strandi997 – 10026
Helixi1017 – 10193
Helixi1022 – 10287
Helixi1048 – 106114
Beta strandi1065 – 10728
Helixi1077 – 108610
Beta strandi1090 – 10956
Beta strandi1102 – 11054
Helixi1106 – 11116
Helixi1116 – 112914
Helixi1133 – 11353
Beta strandi1137 – 11437
Helixi1147 – 11559
Beta strandi1159 – 11624
Helixi1165 – 11706
Helixi1179 – 11813
Beta strandi1187 – 11893
Helixi1193 – 11964
Helixi1203 – 122422
Helixi1229 – 12324
Helixi1236 – 12383
Beta strandi1239 – 12413
Beta strandi1248 – 12514
Helixi1256 – 12594
Helixi1269 – 12713
Helixi1283 – 12897
Helixi1291 – 12999
Beta strandi1302 – 13098
Helixi1318 – 132811
Turni1329 – 13313
Beta strandi1336 – 134510
Turni1347 – 13526
Beta strandi1357 – 13659
Turni1369 – 13724
Beta strandi1375 – 13817
Helixi1390 – 13923
Turni1400 – 14034
Beta strandi1408 – 14147
Turni1419 – 14224
Beta strandi1427 – 14315
Turni1437 – 14404
Beta strandi1442 – 14487
Beta strandi1454 – 14563
Turni1457 – 14593
Beta strandi1462 – 14687
Beta strandi1470 – 14723
Helixi1474 – 14774
Turni1480 – 14823
Beta strandi1484 – 14863
Helixi1491 – 150818
Helixi1511 – 15188
Helixi1520 – 15245
Beta strandi1527 – 15315
Turni1533 – 15375
Turni1539 – 15413

3D structure databases

Select the link destinations:
PDBe
RCSB PDB
PDBj
Links Updated
EntryMethodResolution (Å)ChainPositionsPDBsum
1LLWX-ray2.70A37-1556[»]
1LLZX-ray3.00A37-1556[»]
1LM1X-ray2.80A37-1556[»]
1OFDX-ray2.00A/B37-1556[»]
1OFEX-ray2.45A/B37-1556[»]
ProteinModelPortaliP55038.

Miscellaneous databases

EvolutionaryTraceiP55038.

Family & Domainsi

Domains and Repeats

Feature keyPosition(s)LengthDescriptionGraphical viewFeature identifierActions
Domaini37 – 431395Glutamine amidotransferase type-2
Add
BLAST

Sequence similaritiesi

Keywords - Domaini

Glutamine amidotransferase

Phylogenomic databases

eggNOGiCOG0069.
HOGENOMiHOG000031558.
KOiK00284.
OMAiYSVQGVT.
OrthoDBiEOG60W7PX.
PhylomeDBiP55038.

Family and domain databases

Gene3Di2.160.20.60. 1 hit.
3.20.20.70. 2 hits.
3.60.20.10. 1 hit.
InterProiIPR013785. Aldolase_TIM.
IPR017932. GATase_2_dom.
IPR000583. GATase_dom.
IPR002489. Glu_synth_asu_C.
IPR006982. Glu_synth_centr_N.
IPR002932. Glu_synthdom.
IPR029055. Ntn_hydrolases_N.
[Graphical view]
PfamiPF00310. GATase_2. 1 hit.
PF04898. Glu_syn_central. 1 hit.
PF01645. Glu_synthase. 1 hit.
PF01493. GXGXG. 1 hit.
[Graphical view]
SUPFAMiSSF56235. SSF56235. 1 hit.
SSF69336. SSF69336. 1 hit.
PROSITEiPS51278. GATASE_TYPE_2. 1 hit.
[Graphical view]

Sequencei

Sequence statusi: Complete.

P55038-1 [UniParc]FASTAAdd to Basket

« Hide

MSFQYPLLAP MTNSSVATNS NQPFLGQPWL VEERDACGVG FIANLRGKPD     50
HTLVEQALKA LGCMEHRGGC SADNDSGDGA GVMTAIPREL LAQWFNTRNL 100
PMPDGDRLGV GMVFLPQEPS AREVARAYVE EVVRLEKLTV LGWREVPVNS 150
DVLGIQAKNN QPHIEQILVT CPEGCAGDEL DRRLYIARSI IGKKLAEDFY 200
VCSFSCRTIV YKGMVRSIIL GEFYLDLKNP GYTSNFAVYH RRFSTNTMPK 250
WPLAQPMRLL GHNGEINTLL GNINWMAARE KELEVSGWTK AELEALTPIV 300
NQANSDSYNL DSALELLVRT GRSPLEAAMI LVPEAYKNQP ALKDYPEISD 350
FHDYYSGLQE PWDGPALLVF SDGKIVGAGL DRNGLRPARY CITKDDYIVL 400
GSEAGVVDLP EVDIVEKGRL APGQMIAVDL AEQKILKNYQ IKQQAAQKYP 450
YGEWIKIQRQ TVASDSFAEK TLFNDAQTVL QQQAAFGYTA EDVEMVVVPM 500
ASQGKEPTFC MGDDTPLAVL SHKPRLLYDY FKQRFAQVTN PPIDPLRENL 550
VMSLAMFLGK RGNLLEPKAE SARTIKLRSP LVNEVELQAI KTGQLQVAEV 600
STLYDLDGVN SLETALDNLV KTAIATVQAG AEILVLTDRP NGAILTENQS 650
FIPPLLAVGA VHHHLIRAGL RLKASLIVDT AQCWSTHHFA CLVGYGASAI 700
CPYLALESVR QWWLDEKTQK LMENGRLDRI DLPTALKNYR QSVEAGLFKI 750
LSKMGISLLA SYHGAQIFEA IGLGAELVEY AFAGTTSRVG GLTIADVAGE 800
VMVFHGMAFP EMAKKLENFG FVNYRPGGEY HMNSPEMSKS LHKAVAAYKV 850
GGNGNNGEAY DHYELYRQYL KDRPVTALRD LLDFNADQPA ISLEEVESVE 900
SIVKRFCTGG MSLGALSREA HETLAIAMNR LGAKSNSGEG GEDVVRYLTL 950
DDVDSEGNSP TLPHLHGLQN GDTANSAIKQ IASGRFGVTP EYLMSGKQLE 1000
IKMAQGAKPG EGGQLPGKKV SEYIAMLRRS KPGVTLISPP PHHDIYSIED 1050
LAQLIYDLHQ INPEAQVSVK LVAEIGIGTI AAGVAKANAD IIQISGHDGG 1100
TGASPLSSIK HAGSPWELGV TEVHRVLMEN QLRDRVLLRA DGGLKTGWDV 1150
VMAALMGAEE YGFGSIAMIA EGCIMARVCH TNNCPVGVAT QQERLRQRFK 1200
GVPGQVVNFF YFIAEEVRSL LAHLGYRSLD DIIGRTDLLK VRSDVQLSKT 1250
QNLTLDCLLN LPDTKQNRQW LNHEPVHSNG PVLDDDILAD PDIQEAINHQ 1300
TTATKTYRLV NTDRTVGTRL SGAIAKKYGN NGFEGNITLN FQGAAGQSFG 1350
AFNLDGMTLH LQGEANDYVG KGMNGGEIVI VPHPQASFAP EDNVIIGNTC 1400
LYGATGGNLY ANGRAGERFA VRNSVGKAVI EGAGDHCCEY MTGGVIVVLG 1450
PVGRNVGAGM TGGLAYFLDE VGDLPEKINP EIITLQRITA SKGEEQLKSL 1500
ITAHVEHTGS PKGKAILANW SDYLGKFWQA VPPSEKDSPE ANGDVSLTGE 1550
KTLTSV 1556
Length:1,556
Mass (Da):169,499
Last modified:November 1, 1997 - v2
Checksum:i4BDAD5F9A4064D9D
GO

Sequence conflict

Feature keyPosition(s)LengthDescriptionGraphical viewFeature identifierActions
Sequence conflicti491 – 4911E → Q in CAA63218. 1 Publication
Sequence conflicti570 – 5723ESA → NPR in CAA63218. 1 Publication
Sequence conflicti642 – 6509GAILTENQS → RRNIGLRIKV in CAA63218. 1 Publication
Sequence conflicti659 – 6591G → E in CAA63218. 1 Publication
Sequence conflicti940 – 9412GG → PP in CAA63218. 1 Publication
Sequence conflicti1059 – 10591H → L in CAA63218. 1 Publication
Sequence conflicti1295 – 12951E → RK in CAA63218. 1 Publication
Sequence conflicti1310 – 13101V → D in CAA63218. 1 Publication
Sequence conflicti1323 – 13231A → S in CAA63218. 1 Publication
Sequence conflicti1531 – 15311Missing in CAA63218. 1 Publication

Sequence databases

Select the link destinations:
EMBL
GenBank
DDBJ
Links Updated
X92480 Genomic DNA. Translation: CAA63218.1.
D78371 Genomic DNA. Translation: BAA11379.1.
BA000022 Genomic DNA. Translation: BAA18693.1.
PIRiS76781.
RefSeqiNP_442881.1. NC_000911.1.
YP_005652942.1. NC_017277.1.
YP_007452757.1. NC_020286.1.

Genome annotation databases

EnsemblBacteriaiBAA18693; BAA18693; BAA18693.
GeneIDi952019.
KEGGisyn:sll1499.
syy:SYNGTS_2989.
syz:MYO_130230.
PATRICi23843556. VBISynSp132158_3309.

Cross-referencesi

Sequence databases

Select the link destinations:
EMBL
GenBank
DDBJ
Links Updated
X92480 Genomic DNA. Translation: CAA63218.1 .
D78371 Genomic DNA. Translation: BAA11379.1 .
BA000022 Genomic DNA. Translation: BAA18693.1 .
PIRi S76781.
RefSeqi NP_442881.1. NC_000911.1.
YP_005652942.1. NC_017277.1.
YP_007452757.1. NC_020286.1.

3D structure databases

Select the link destinations:
PDBe
RCSB PDB
PDBj
Links Updated
Entry Method Resolution (Å) Chain Positions PDBsum
1LLW X-ray 2.70 A 37-1556 [» ]
1LLZ X-ray 3.00 A 37-1556 [» ]
1LM1 X-ray 2.80 A 37-1556 [» ]
1OFD X-ray 2.00 A/B 37-1556 [» ]
1OFE X-ray 2.45 A/B 37-1556 [» ]
ProteinModelPortali P55038.
ModBasei Search...
MobiDBi Search...

Protein-protein interaction databases

IntActi P55038. 4 interactions.
STRINGi 1148.sll1499.

Proteomic databases

PaxDbi P55038.

Protocols and materials databases

Structural Biology Knowledgebase Search...

Genome annotation databases

EnsemblBacteriai BAA18693 ; BAA18693 ; BAA18693 .
GeneIDi 952019.
KEGGi syn:sll1499.
syy:SYNGTS_2989.
syz:MYO_130230.
PATRICi 23843556. VBISynSp132158_3309.

Phylogenomic databases

eggNOGi COG0069.
HOGENOMi HOG000031558.
KOi K00284.
OMAi YSVQGVT.
OrthoDBi EOG60W7PX.
PhylomeDBi P55038.

Enzyme and pathway databases

UniPathwayi UPA00045 .
UPA00634 ; UER00691 .

Miscellaneous databases

EvolutionaryTracei P55038.

Family and domain databases

Gene3Di 2.160.20.60. 1 hit.
3.20.20.70. 2 hits.
3.60.20.10. 1 hit.
InterProi IPR013785. Aldolase_TIM.
IPR017932. GATase_2_dom.
IPR000583. GATase_dom.
IPR002489. Glu_synth_asu_C.
IPR006982. Glu_synth_centr_N.
IPR002932. Glu_synthdom.
IPR029055. Ntn_hydrolases_N.
[Graphical view ]
Pfami PF00310. GATase_2. 1 hit.
PF04898. Glu_syn_central. 1 hit.
PF01645. Glu_synthase. 1 hit.
PF01493. GXGXG. 1 hit.
[Graphical view ]
SUPFAMi SSF56235. SSF56235. 1 hit.
SSF69336. SSF69336. 1 hit.
PROSITEi PS51278. GATASE_TYPE_2. 1 hit.
[Graphical view ]
ProtoNeti Search...

Publicationsi

« Hide 'large scale' publications
  1. "Existence of two ferredoxin-glutamate synthases in the cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803. Isolation and insertional inactivation of gltB and gltS genes."
    Navarro F., Chavez S., Candau P., Florencio F.J.
    Plant Mol. Biol. 27:753-767(1995) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract]
    Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA].
  2. Terauchi K., Ikeuchi M., Ohmori M.
    Submitted (DEC-1995) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases
    Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA].
  3. "Sequence analysis of the genome of the unicellular cyanobacterium Synechocystis sp. strain PCC6803. II. Sequence determination of the entire genome and assignment of potential protein-coding regions."
    Kaneko T., Sato S., Kotani H., Tanaka A., Asamizu E., Nakamura Y., Miyajima N., Hirosawa M., Sugiura M., Sasamoto S., Kimura T., Hosouchi T., Matsuno A., Muraki A., Nakazaki N., Naruo K., Okumura S., Shimpo S.
    , Takeuchi C., Wada T., Watanabe A., Yamada M., Yasuda M., Tabata S.
    DNA Res. 3:109-136(1996) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract]
    Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA].
    Strain: PCC 6803 / Kazusa.

Entry informationi

Entry nameiGLTS_SYNY3
AccessioniPrimary (citable) accession number: P55038
Secondary accession number(s): Q59980
Entry historyi
Integrated into UniProtKB/Swiss-Prot: October 1, 1996
Last sequence update: November 1, 1997
Last modified: September 3, 2014
This is version 109 of the entry and version 2 of the sequence. [Complete history]
Entry statusiReviewed (UniProtKB/Swiss-Prot)
Annotation programProkaryotic Protein Annotation Program

Miscellaneousi

Keywords - Technical termi

3D-structure, Complete proteome, Reference proteome

Documents

  1. PATHWAY comments
    Index of metabolic and biosynthesis pathways
  2. PDB cross-references
    Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references
  3. SIMILARITY comments
    Index of protein domains and families
  4. Synechocystis PCC 6803
    Synechocystis (strain PCC 6803): entries and gene names

External Data

Dasty 3

Similar proteinsi