P54687 (BCAT1_HUMAN) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
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May 1, 2013.
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| Protein names | Recommended name: Branched-chain-amino-acid aminotransferase, cytosolic Short name=BCAT(c) EC=2.6.1.42 Alternative name(s): Protein ECA39 | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Reference proteome] | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 386 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Catalyzes the first reaction in the catabolism of the essential branched chain amino acids leucine, isoleucine, and valine. |
| Catalytic activity | L-leucine + 2-oxoglutarate = 4-methyl-2-oxopentanoate + L-glutamate. L-isoleucine + 2-oxoglutarate = (S)-3-methyl-2-oxopentanoate + L-glutamate. L-valine + 2-oxoglutarate = 3-methyl-2-oxobutanoate + L-glutamate. |
| Cofactor | Pyridoxal phosphate. |
| Subunit structure | Homodimer By similarity. |
| Subcellular location | |
| Tissue specificity | During embryogenesis, expressed in the brain and kidney. Overexpressed in MYC-induced tumors such as Burkitt's lymphoma. |
| Sequence similarities | Belongs to the class-IV pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase family. |
Ontologies
Alternative products
| This entry describes 5 isoforms produced by alternative splicing. [Align] [Select] | ||||||
| Isoform 1 (identifier: P54687-1) This isoform has been chosen as the 'canonical' sequence. All positional information in this entry refers to it. This is also the sequence that appears in the downloadable versions of the entry. | ||||||
| Isoform 2 (identifier: P54687-2) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 1-25: MKDCSNGCSAECTGEGGSKEVVGTF → M 94-130: Missing. | ||||||
| Note: No experimental confirmation available. | ||||||
| Isoform 3 (identifier: P54687-3) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 94-130: Missing. | ||||||
| Note: No experimental confirmation available. | ||||||
| Isoform 4 (identifier: P54687-4) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 1-2: MK → M | ||||||
| Note: No experimental confirmation available. | ||||||
| Isoform 5 (identifier: P54687-5) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 1-2: MK → MASPLRSAAALARQ | ||||||
| Note: No experimental confirmation available. |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 386 | 386 | Branched-chain-amino-acid aminotransferase, cytosolic | PRO_0000103292 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 222 | 1 | N6-(pyridoxal phosphate)lysine By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 1 – 25 | 25 | MKDCS…VVGTF → M in isoform 2. | VSP_042651 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 1 – 2 | 2 | MK → M in isoform 4. | VSP_043560 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 1 – 2 | 2 | MK → MASPLRSAAALARQ in isoform 5. | VSP_046057 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 94 – 130 | 37 | Missing in isoform 2 and isoform 3. | VSP_042652 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 59 | 1 | T → M. Corresponds to variant rs17374285 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_047681 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 321 | 1 | E → K. Corresponds to variant rs7313020 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_019614 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 330 | 1 | G → S. Ref.1 Corresponds to variant rs1057204 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_047682 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 2 | 1 | Missing in AAB08528. Ref.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 8 | 1 | Missing in AAB08528. Ref.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 165 | 1 | T → A in AAB08528. Ref.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 237 | 1 | A → D in AAB08528. Ref.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 251 | 1 | E → R in AAB08528. Ref.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 300 | 1 | Q → P in BAH11911. Ref.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 317 | 1 | T → S in BAB71129. Ref.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 27 – 29 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 44 – 46 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 49 – 51 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 55 – 63 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 64 – 66 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 72 – 75 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 79 – 81 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 86 – 89 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 93 – 95 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 98 – 102 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 108 – 112 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 113 – 126 | 14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 134 – 147 | 14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 149 – 151 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 154 – 157 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 159 – 168 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 179 – 190 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 202 – 206 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 225 – 228 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 231 – 238 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 239 – 241 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 243 – 249 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 250 – 253 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 254 – 258 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 261 – 268 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 274 – 278 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 282 – 285 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 289 – 301 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 303 – 308 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 313 – 320 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 321 – 323 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 325 – 332 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 333 – 335 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 336 – 351 | 16 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 353 – 357 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 360 – 373 | 14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 382 – 384 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References
Web resources
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | U21551 mRNA. Translation: AAB08528.1. AK056255 mRNA. Translation: BAB71129.1. AK128527 mRNA. Translation: BAG54689.1. AK294879 mRNA. Translation: BAH11911.1. AK299088 mRNA. Translation: BAH12946.1. CR749308 mRNA. Translation: CAH18163.1. AC023796 Genomic DNA. No translation available. AC026310 Genomic DNA. No translation available. AC092867 Genomic DNA. No translation available. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| IPI | IPI00382412. IPI00798272. IPI00940330. IPI00976652. IPI00983406. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_001171562.1. NM_001178091.1. NP_001171563.1. NM_001178092.1. NP_001171564.1. NM_001178093.1. NP_001171565.1. NM_001178094.1. NP_005495.2. NM_005504.6. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.438993. | ||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | P54687. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| MINT | MINT-1180265. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| STRING | 9606.ENSP00000261192. | ||||||||||||||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | P54687. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| DMDM | 215274162. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| PaxDb | P54687. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | P54687. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENST00000261192; ENSP00000261192; ENSG00000060982. ENST00000342945; ENSP00000339805; ENSG00000060982. ENST00000538118; ENSP00000440817; ENSG00000060982. ENST00000539282; ENSP00000443459; ENSG00000060982. ENST00000539780; ENSP00000440827; ENSG00000060982. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 586. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:586. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| UCSC | uc001rgd.4. human. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| CTD | 586. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | GC12M024868. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:976. BCAT1. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| HPA | HPA048592. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| MIM | 113520. gene. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| neXtProt | NX_P54687. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA25288. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| eggNOG | COG0115. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | HOG000276704. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | HBG050678. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| InParanoid | P54687. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| KO | K00826. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| OrthoDB | EOG4BZN2N. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| PhylomeDB | P54687. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| BRENDA | 2.6.1.42. 4472. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Reactome | REACT_111217. Metabolism. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| SABIO-RK | P54687. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | P54687. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Bgee | P54687. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_BCAT1. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Genevestigator | P54687. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000060982. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR001544. Aminotrans_IV. IPR018300. Aminotrans_IV_CS. IPR005786. B_amino_transII. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||
| PANTHER | PTHR11825. PTHR11825. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF01063. Aminotran_4. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||
| PIRSF | PIRSF006468. BCAT1. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| SUPFAM | SSF56752. Aminotrans_IV. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR01123. ilvE_II. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS00770. AA_TRANSFER_CLASS_4. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||
Other | |||||||||||||||||||||||||||||||
| BindingDB | P54687. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| ChEMBL | CHEMBL4679. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| DrugBank | DB00996. Gabapentin. DB00142. L-Glutamic Acid. DB00167. L-Isoleucine. DB00149. L-Leucine. DB00161. L-Valine. DB00114. Pyridoxal Phosphate. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| EvolutionaryTrace | P54687. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| GenomeRNAi | 586. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 2395. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | BCAT1_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P54687 Secondary accession number(s): B3KY27 Q96MY9 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Chordata Protein Annotation Program | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
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