P54491 (YQGN_BACSU) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
May 1, 2013.
Version 91.
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| Protein names | Recommended name: Uncharacterized protein YqgN | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Bacillus subtilis (strain 168) [Reference proteome] [HAMAP] | ||||
| Taxonomic identifier | 224308 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Bacteria › Firmicutes › Bacilli › Bacillales › Bacillaceae › Bacillus › ![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 187 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Sequence similarities | Belongs to the 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase family. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Ligand | ATP-binding Nucleotide-binding |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological_process | folic acid-containing compound biosynthetic process Inferred from electronic annotation. Source: InterPro |
| Molecular_function | 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase activity Inferred from electronic annotation. Source: InterPro ATP bindingInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 187 | 187 | Uncharacterized protein YqgN | PRO_0000200281 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 2 – 6 | 5 | ATP Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 134 – 141 | 8 | ATP Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 170 | 1 | ATP Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 5 – 15 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 18 – 33 | 16 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 36 – 39 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 42 – 45 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 57 – 65 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 69 – 73 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 84 – 86 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 93 – 97 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 113 – 115 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 118 – 120 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 124 – 127 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 140 – 142 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 143 – 145 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 149 – 154 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 157 – 159 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 160 – 162 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 174 – 177 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 182 – 184 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "Systematic sequencing of the 283 kb 210 degrees-232 degrees region of the Bacillus subtilis genome containing the skin element and many sporulation genes." Mizuno M., Masuda S., Takemaru K., Hosono S., Sato T., Takeuchi M., Kobayashi Y. Microbiology 142:3103-3111(1996) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA]. Strain: 168 / JH642. |
| [2] | "The complete genome sequence of the Gram-positive bacterium Bacillus subtilis." Kunst F., Ogasawara N., Moszer I., Albertini A.M., Alloni G., Azevedo V., Bertero M.G., Bessieres P., Bolotin A., Borchert S., Borriss R., Boursier L., Brans A., Braun M., Brignell S.C., Bron S., Brouillet S., Bruschi C.V. Danchin A.Nature 390:249-256(1997) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. Strain: 168. |
| [3] | "X-ray structure of northeast structural genomics target SR44." Northeast structural genomics consortium (NESG) Submitted (FEB-2009) to the PDB data bank Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.5 ANGSTROMS). |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | D84432 Genomic DNA. Translation: BAA12517.1. AL009126 Genomic DNA. Translation: CAB14420.1. | ||||||||||||
| PIR | H69956. | ||||||||||||
| RefSeq | NP_390369.1. NC_000964.3. | ||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||
| ProteinModelPortal | P54491. | ||||||||||||
| SMR | P54491. Positions 4-186. | ||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||
| STRING | 224308.BSU24890. | ||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||
| PaxDb | P54491. | ||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||
| EnsemblBacteria | CAB14420; CAB14420; BSU24890. | ||||||||||||
| GeneID | 938208. | ||||||||||||
| KEGG | bsu:BSU24890. | ||||||||||||
| PATRIC | 18976814. VBIBacSub10457_2596. | ||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||
| GenoList | BSU24890. | ||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||
| eggNOG | COG0212. | ||||||||||||
| HOGENOM | HOG000007299. | ||||||||||||
| KO | K01934. | ||||||||||||
| OMA | STIYACQ. | ||||||||||||
| ProtClustDB | CLSK887576. | ||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||
| BioCyc | BSUB:BSU24890-MONOMER. | ||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||
| Gene3D | 3.40.50.10420. 1 hit. | ||||||||||||
| InterPro | IPR002698. FTHF_cligase. IPR024185. FTHF_cligase-like. [Graphical view] | ||||||||||||
| PANTHER | PTHR23407:SF1. PTHR23407:SF1. 1 hit. | ||||||||||||
| Pfam | PF01812. 5-FTHF_cyc-lig. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| PIRSF | PIRSF006806. FTHF_cligase. 1 hit. | ||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR02727. MTHFS_bact. 1 hit. | ||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||
Other | |||||||||||||
| EvolutionaryTrace | P54491. | ||||||||||||
Entry information
| Entry name | YQGN_BACSU | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P54491 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Prokaryotic Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| Bacillus subtilis Bacillus subtilis (strain 168): entries, gene names and cross-references to SubtiList |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with
