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UniProtKB/Swiss-Prot P51955 (NEK2_HUMAN)
Last modified
November 25, 2008.
Version 95.
History...
Clusters with 100%,
90%,
50% identity |
Documents (7) |
Third-party data |
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Names and origin
| Protein names | Recommended name: Serine/threonine-protein kinase Nek2 EC=2.7.11.1 Alternative name(s): NimA-related protein kinase 2 NimA-like protein kinase 1 HSPK 21 | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 445 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is not processed. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | Protein kinase that is involved in mitotic regulation. May have a role at the G2-M transition. May also play a role in meiosis. Isoform 1 but not isoform 2 appears to play a role in centrosome splitting. Isoform 1 phosphorylates and activates NEK11 in G1/S-arrested cells. Isoform 2, which is not present in the nucleolus, does not. |
| Catalytic activity | ATP + a protein = ADP + a phosphoprotein. |
| Cofactor | Magnesium. |
| Subunit structure | Interacts with TERF1. Isoform 1 and isoform 2 form homo- and heterodimers. |
| Subcellular location | Isoform 1: Nucleus › nucleolus. Note= Has a nucleolar targeting/ retention activity via a coiled-coil domain at the C-terminal end. Isoform 2: Cytoplasm. Note= Predominantly cytoplasmic. |
| Tissue specificity | Isoform 1 and isoform 2 are expressed in peripheral blood T-cells and a wide variety of transformed cell types. |
| Developmental stage | Accumulates throughout S phase and shows maximal levels in late G2. This expression pattern is highly reminiscent of that of A and B cyclins. Expression of both isoform 1 and isoform 2 is low in the G1 phase and increases in the S/G2 phases. Isoform 1 is absent from cells arrested in the G2/M prometaphase, whereas isoform 2 remains present. |
| Post-translational modification | It is unsure whether Thr-170 or Ser-171 is phosphorylated. |
| Sequence similarities | Belongs to the protein kinase superfamily. NEK Ser/Thr protein kinase family. NIMA subfamily. Contains 1 protein kinase domain. |
| Sequence caution | The sequence AAH65932.1 differs from that shown. Reason: Frameshift at position 213. |
Ontologies
Binary interactions
With | Entry | #Exp. | IntAct | Notes |
|---|---|---|---|---|
| CDC27 | P30260 | 1 | EBI-633182,EBI-994813 | |
| NEK11 | Q8NG66 | 3 | EBI-633182,EBI-633195 | |
| NEK11 | Q8NG66 | 2 | EBI-687792,EBI-633195 |
Alternative products
| This entry describes 3 isoforms produced by alternative splicing. [Align] [Select] | ||||||
| Isoform 1 (identifier: P51955-1) Also known as: A; This isoform has been chosen as the 'canonical' sequence. All positional information in this entry refers to it. This is also the sequence that appears in the downloadable versions of the entry. | ||||||
| Notes: Has a nucleolar targeting/ retention activity via a coiled-coil domain at the C-terminal end. | ||||||
| Isoform 2 (identifier: P51955-2) Also known as: B; The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 371-384: ELLNLPSSVIKKKV → GMRINLVNRSWCYK 385-445: Missing. | ||||||
| Notes: Predominantly cytoplasmic. | ||||||
| Isoform 3 (identifier: P51955-3) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 323-326: REER → KKKK 327-445: Missing. | ||||||
| Notes: No experimental confirmation available. |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 445 | 445 | Serine/threonine-protein kinase Nek2 | PRO_0000086421 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 8 – 271 | 264 | Protein kinase | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 14 – 22 | 9 | ATP By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coiled coil | 303 – 362 | 60 | Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coiled coil | 406 – 430 | 25 | Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 141 | 1 | Proton acceptor By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 37 | 1 | ATP | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 170 | 1 | Phosphothreonine; by autocatalysis Probable | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 171 | 1 | Phosphoserine; by autocatalysis Probable | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 175 | 1 | Phosphothreonine; by autocatalysis | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 179 | 1 | Phosphothreonine; by autocatalysis | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 241 | 1 | Phosphoserine; by autocatalysis | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 356 | 1 | Phosphoserine | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 387 | 1 | Phosphoserine | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 390 | 1 | Phosphoserine | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 397 | 1 | Phosphoserine | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 402 | 1 | Phosphoserine | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 428 | 1 | Phosphoserine | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 323 – 326 | 4 | REER → KKKK in isoform 3. | VSP_015576 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 327 – 445 | 119 | Missing in isoform 3. | VSP_015577 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 371 – 384 | 14 | ELLNL…IKKKV → GMRINLVNRSWCYK in isoform 2. | VSP_015578 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 385 – 445 | 61 | Missing in isoform 2. | VSP_015579 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 354 | 1 | N → S: dbSNP rs2230489. | VAR_019990 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 410 | 1 | C → Y | VAR_040907 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 37 | 1 | K → R: Loss of kinase activity and of ability to activate NEK11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 141 | 1 | D → A: Loss of autophosphorylation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 170 | 1 | T → A: No effect on kinase activity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 170 | 1 | T → E: Kinase activity increased by two fold | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 171 | 1 | S → A: No effect on kinase activity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 171 | 1 | S → D: Kinase activity increased by two fold | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 175 | 1 | T → A: Kinase activity decreased by two fold | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 175 | 1 | T → E: Kinase activity increased by two fold | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 179 | 1 | T → A: Loss of kinase activity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 179 | 1 | T → E: Loss of kinase activity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 241 | 1 | S → A: Loss of kinase activity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 241 | 1 | S → D: Loss of kinase activity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 84 – 85 | 2 | IV → LY in CAA80912. Ref.8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 325 | 1 | E → K in BAD97073. Ref.5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 5 – 7 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 8 – 16 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 18 – 27 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 28 – 30 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 33 – 39 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 46 – 58 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 70 – 75 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 82 – 87 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 94 – 104 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 110 – 130 | 21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 144 – 146 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 147 – 149 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 155 – 157 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 160 – 165 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 185 – 188 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 195 – 211 | 17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 221 – 230 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 242 – 251 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 256 – 258 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 262 – 266 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||||||||||||||
References
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| [1] | "Cell cycle-dependent expression of Nek2, a novel human protein kinase related to the NIMA mitotic regulator of Aspergillus nidulans." Schultz S.J., Fry A.M., Suetterlin C., Ried T., Nigg E.A. Cell Growth Differ. 5:625-635(1994) [PubMed: 7522034] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ISOFORM 1). Tissue: Nasopharynx, Placenta and T-cell. |
| [2] | "Alternative splice variants of the human centrosome kinase Nek2 exhibit distinct patterns of expression in mitosis." Hames R.S., Fry A.M. Biochem. J. 361:77-85(2002) [PubMed: 11742531] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ISOFORMS 1 AND 2), FUNCTION, TISSUE SPECIFICITY, SUBCELLULAR LOCATION, DEVELOPMENTAL STAGE, DIMERIZATION. |
| [3] | "Molecular cloning and expression of NLK1, a human NIMA-like kinase." Lu K.P., Hunter T. Submitted (JUL-1994) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ISOFORM 1). |
| [4] | "Cloning of human full-length CDSs in BD Creator(TM) system donor vector." Kalnine N., Chen X., Rolfs A., Halleck A., Hines L., Eisenstein S., Koundinya M., Raphael J., Moreira D., Kelley T., LaBaer J., Lin Y., Phelan M., Farmer A. Submitted (OCT-2004) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA] (ISOFORM 1). |
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| [6] | "The DNA sequence and biological annotation of human chromosome 1." Gregory S.G., Barlow K.F., McLay K.E., Kaul R., Swarbreck D., Dunham A., Scott C.E., Howe K.L., Woodfine K., Spencer C.C.A., Jones M.C., Gillson C., Searle S., Zhou Y., Kokocinski F., McDonald L., Evans R., Phillips K. |

Clusters with