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UniProtKB/Swiss-Prot P47736 (RPGP1_HUMAN)
Last modified
January 19, 2010.
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90%,
50% identity |
Documents (6) |
Third-party data |
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Names and origin
| Protein names | Recommended name: Rap1 GTPase-activating protein 1 Short name=Rap1GAP1 Short name=Rap1GAP | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Complete proteome] | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 663 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | GTPase activator for the nuclear Ras-related regulatory protein RAP-1A (KREV-1), converting it to the putatively inactive GDP-bound state. |
| Subunit structure | Homodimer and heterodimer with RAP1B. Ref.9 |
| Subcellular location | |
| Tissue specificity | Significant expression seen in the brain, kidney and pancreas. Abundant in the cerebral cortex and expressed at much lower levels in the spinal cord. Not detected in the lymphoid tissues. Ref.5 |
| Induction | By 12-O-tetradecanoylphorbol-13-acetate (TPA) in promyelocytic HL-60 cells. Ref.5 |
| Sequence similarities | Contains 1 GoLoco domain. Contains 1 Rap-GAP domain. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Cellular component | Golgi apparatus Membrane |
| Coding sequence diversity | Alternative splicing Polymorphism |
| Molecular function | GTPase activation |
| PTM | Acetylation Phosphoprotein |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | regulation of Ras GTPase activity Ref.9 Inferred from direct assay. Source: UniProtKB signal transduction Ref.1Traceable author statement. Source: ProtInc |
| Cellular component | Golgi apparatus Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW extrinsic to membraneInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-SubCell |
| Molecular function | GTPase activator activity Ref.1 Traceable author statement. Source: ProtInc Ras GTPase binding Ref.9Inferred from physical interaction. Source: UniProtKB protein homodimerization activity Ref.9Inferred from physical interaction. Source: UniProtKB |
| Complete GO annotation... | |
Alternative products
| This entry describes 2 isoforms produced by alternative splicing. [Align] [Select] | ||||||
| Isoform 1 (identifier: P47736-1) This isoform has been chosen as the 'canonical' sequence. All positional information in this entry refers to it. This is also the sequence that appears in the downloadable versions of the entry. | ||||||
| Isoform 2 (identifier: P47736-2) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 476-476: I → ISLLIPGKSASRFGRRGSAIGIGTVEE 626-633: Missing. |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 663 | 663 | Rap1 GTPase-activating protein 1 | PRO_0000056743 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 1 – 17 | 17 | GoLoco | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 181 – 397 | 217 | Rap-GAP | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 262 | 1 | N6-acetyllysine Ref.8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 384 | 1 | N6-acetyllysine Ref.8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 441 | 1 | Phosphoserine Ref.7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 484 | 1 | Phosphoserine Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 499 | 1 | Phosphoserine Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 476 | 1 | I → ISLLIPGKSASRFGRRGSAI GIGTVEE in isoform 2. | VSP_035256 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 626 – 633 | 8 | Missing in isoform 2. | VSP_035257 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 107 | 1 | A → T: dbSNP rs2275363. Ref.1 | VAR_047792 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 257 | 1 | C → R in a breast cancer sample; somatic mutation. Ref.10 | VAR_035547 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 609 | 1 | Y → C in a breast cancer sample; somatic mutation. Ref.10 | VAR_035548 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 85 – 88 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 89 – 93 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 94 – 96 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 100 – 106 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 107 – 109 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 110 – 121 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 124 – 132 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 137 – 143 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 153 – 160 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 177 – 186 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 192 – 200 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 207 – 211 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 218 – 227 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 228 – 233 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 245 – 247 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 252 – 258 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 263 – 268 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 269 – 271 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 282 – 288 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 292 – 300 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 306 – 308 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 316 – 323 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 331 – 338 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 354 – 358 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 359 – 376 | 18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 380 – 409 | 30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
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| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | M64788 mRNA. Translation: AAA60252.1. AB007943 mRNA. Translation: BAA32319.3. Different initiation. AL359815 Genomic DNA. Translation: CAI16250.1. CH471134 Genomic DNA. Translation: EAW94980.1. | ||||||||||||||||||
| IPI | IPI00386930. IPI00843926. | ||||||||||||||||||
| PIR | A39897. B39897. | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_001139129.1. NP_002876.2. | ||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.148178 | ||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||
| IntAct | P47736. 2 interactions. | ||||||||||||||||||
| STRING | P47736. | ||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||
| PhosphoSite | P47736. | ||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||
| PRIDE | P47736. | ||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||
| Ensembl | ENST00000374761; ENSP00000363893; ENSG00000076864; Homo sapiens. [Genome view] ENST00000374765; ENSP00000363897; ENSG00000076864; Homo sapiens. [Genome view] | ||||||||||||||||||
| GeneID | 5909. | ||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:5909. | ||||||||||||||||||
| UCSC | uc001bex.1. human. | ||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||
| CTD | 5909. | ||||||||||||||||||
| GeneCards | GC01M021796. | ||||||||||||||||||
| H-InvDB | HIX0000226. | ||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:9858. RAP1GAP. | ||||||||||||||||||
| HPA | CAB003851. HPA001922. | ||||||||||||||||||
| MIM | 600278. gene. | ||||||||||||||||||
| HUGE | Search... | ||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||
| HOGENOM | HBG445308. | ||||||||||||||||||
| HOVERGEN | P47736. | ||||||||||||||||||
| PhylomeDB | P47736. | ||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||
| ArrayExpress | P47736. | ||||||||||||||||||
| Bgee | P47736. | ||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_RAP1GAP. | ||||||||||||||||||
| Genevestigator | P47736. | ||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000076864. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||
| InterPro | IPR003109. GoLoco_motif. IPR000331. Rap_GAP. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| Pfam | PF02188. GoLoco. 1 hit. PF02145. Rap_GAP. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| SMART | SM00390. GoLoco. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| PROSITE | PS50877. GOLOCO. 1 hit. PS50085. RAPGAP. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||
Other Resources | |||||||||||||||||||
| NextBio | 22986. | ||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | RPGP1_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P47736 Secondary accession number(s): O75062, Q5T3T4 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HPI (Human Proteome Initiative) | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
Relevant documents
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