P44492 (Y065_HAEIN) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
January 25, 2012.
Version 79.
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| Protein names | Recommended name: UPF0079 ATP-binding protein HI_0065 | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Haemophilus influenzae (strain ATCC 51907 / DSM 11121 / KW20 / Rd) | ||
| Taxonomic identifier | 71421 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Bacteria › Proteobacteria › Gammaproteobacteria › Pasteurellales › Pasteurellaceae › Haemophilus |
Protein attributes
| Sequence length | 158 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Sequence similarities | Belongs to the UPF0079 family. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Ligand | ATP-binding Nucleotide-binding |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Molecular function | ATP binding Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 158 | 158 | UPF0079 ATP-binding protein HI_0065 | PRO_0000096208 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 40 – 47 | 8 | ATP Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 3 – 8 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 11 – 28 | 18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 34 – 39 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 46 – 56 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 67 – 69 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 71 – 76 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 79 – 85 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 94 – 97 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 100 – 104 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 105 – 107 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 109 – 114 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 115 – 118 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 119 – 121 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 126 – 134 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 137 – 144 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 147 – 155 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "Whole-genome random sequencing and assembly of Haemophilus influenzae Rd." Fleischmann R.D., Adams M.D., White O., Clayton R.A., Kirkness E.F., Kerlavage A.R., Bult C.J., Tomb J.-F., Dougherty B.A., Merrick J.M., McKenney K., Sutton G.G., FitzHugh W., Fields C.A., Gocayne J.D., Scott J.D., Shirley R., Liu L.-I. Venter J.C.Science 269:496-512(1995) [PubMed: 7542800] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. Strain: ATCC 51907 / DSM 11121 / KW20 / Rd. |
| [2] | "Two-dimensional map of the proteome of Haemophilus influenzae." Langen H., Takacs B., Evers S., Berndt P., Lahm H.W., Wipf B., Gray C., Fountoulakis M. Electrophoresis 21:411-429(2000) [PubMed: 10675023] [Abstract] Cited for: IDENTIFICATION BY MASS SPECTROMETRY. Strain: ATCC 51907 / DSM 11121 / KW20 / Rd. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | L42023 Genomic DNA. Translation: AAC21743.1. | ||||||||||||||||||
| PIR | H64141. | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_438238.1. NC_000907.1. | ||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | P44492. | ||||||||||||||||||
| SMR | P44492. Positions 1-158. | ||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||
| GeneID | 950963. | ||||||||||||||||||
| GenomeReviews | Gene locus HI_0065 in contig L42023_GR. | ||||||||||||||||||
| KEGG | hin:HI0065. | ||||||||||||||||||
| PATRIC | 20188585. VBIHaeInf48452_0066. | ||||||||||||||||||
| TIGR | HI_0065. | ||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||
| HOGENOM | HBG734187. | ||||||||||||||||||
| OMA | ADIAIHI. | ||||||||||||||||||
| PhylomeDB | P44492. | ||||||||||||||||||
| ProtClustDB | CLSK2518354. | ||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||
| BioCyc | HINF71421:HI_0065-MONOMER. | ||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||
| InterPro | IPR003442. UPF0079_ATPase_bac. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| KO | K06925. | ||||||||||||||||||
| Pfam | PF02367. UPF0079. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR00150. HI0065_YjeE. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | Y065_HAEIN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P44492 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Prokaryotic Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| Uncharacterized protein families (UPF) List of uncharacterized protein family (UPF) entries |
| Haemophilus influenzae Haemophilus influenzae (strain Rd): entries and gene names |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with