P43902 (TYRA_HAEIN) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
May 1, 2013.
Version 105.
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Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Sequence annotation·Sequences·References·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize orderNames and origin
| Protein names | Recommended name: T-protein | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Haemophilus influenzae (strain ATCC 51907 / DSM 11121 / KW20 / Rd) [Reference proteome] [HAMAP] | ||||
| Taxonomic identifier | 71421 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Bacteria › Proteobacteria › Gammaproteobacteria › Pasteurellales › Pasteurellaceae › Haemophilus › ![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 377 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Catalytic activity | Chorismate = prephenate. Prephenate + NAD+ = 4-hydroxyphenylpyruvate + CO2 + NADH. |
| Pathway | Metabolic intermediate biosynthesis; prephenate biosynthesis; prephenate from chorismate: step 1/1. |
| Subcellular location | |
| Sequence similarities | Contains 1 chorismate mutase domain. Contains 1 prephenate/arogenate dehydrogenase domain. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Amino-acid biosynthesis Aromatic amino acid biosynthesis Tyrosine biosynthesis |
| Cellular component | Cytoplasm |
| Ligand | NAD |
| Molecular function | Isomerase Oxidoreductase |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Multifunctional enzyme Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological_process | chorismate metabolic process Inferred from electronic annotation. Source: InterPro tyrosine biosynthetic processInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-UniPathway |
| Cellular_component | cytoplasm Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-SubCell |
| Molecular_function | chorismate mutase activity Inferred from electronic annotation. Source: EC nucleotide bindingInferred from electronic annotation. Source: InterPro prephenate dehydrogenase (NADP+) activityInferred from electronic annotation. Source: InterPro prephenate dehydrogenase activityInferred from electronic annotation. Source: EC |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 377 | 377 | T-protein | PRO_0000119197 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 1 – 92 | 92 | Chorismate mutase | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 101 – 364 | 264 | Prephenate/arogenate dehydrogenase | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 103 – 106 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 107 – 109 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 111 – 121 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 122 – 124 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 127 – 130 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 135 – 137 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 138 – 142 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 146 – 150 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 154 – 156 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 157 – 164 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 165 – 167 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 172 – 176 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 182 – 191 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 193 – 201 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 214 – 221 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 223 – 225 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 227 – 235 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 239 – 242 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 245 – 255 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 257 – 270 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 277 – 282 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 286 – 299 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 303 – 310 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 317 – 335 | 19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 339 – 353 | 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 356 – 370 | 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| [1] | "Whole-genome random sequencing and assembly of Haemophilus influenzae Rd." Fleischmann R.D., Adams M.D., White O., Clayton R.A., Kirkness E.F., Kerlavage A.R., Bult C.J., Tomb J.-F., Dougherty B.A., Merrick J.M., McKenney K., Sutton G.G., FitzHugh W., Fields C.A., Gocayne J.D., Scott J.D., Shirley R., Liu L.-I. Venter J.C.Science 269:496-512(1995) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. Strain: ATCC 51907 / DSM 11121 / KW20 / Rd. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | L42023 Genomic DNA. Translation: AAC22939.1. | ||||||||||||
| PIR | H64114. | ||||||||||||
| RefSeq | NP_439442.1. NC_000907.1. | ||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||
| ProteinModelPortal | P43902. | ||||||||||||
| SMR | P43902. Positions 92-370. | ||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||
| STRING | 71421.HI1290. | ||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||
| DNASU | 950220. | ||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||
| EnsemblBacteria | AAC22939; AAC22939; HI_1290. | ||||||||||||
| GeneID | 950220. | ||||||||||||
| KEGG | hin:HI1290. | ||||||||||||
| PATRIC | 20191263. VBIHaeInf48452_1342. | ||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||
| eggNOG | COG0287. | ||||||||||||
| KO | K14187. | ||||||||||||
| OMA | QRFGEAI. | ||||||||||||
| ProtClustDB | PRK11199. | ||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||
| UniPathway | UPA00120; UER00203. UPA00122; UER00961. | ||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||
| Gene3D | 1.20.59.10. 1 hit. 3.40.50.720. 1 hit. | ||||||||||||
| InterPro | IPR008927. 6-PGluconate_DH_C-like. IPR008244. Chor_mut/prephenate_DH_T. IPR002701. Chorismate_mutase. IPR020822. Chorismate_mutase_type_II. IPR011277. CM_T. IPR016040. NAD(P)-bd_dom. IPR003099. Prephen_DH. [Graphical view] | ||||||||||||
| Pfam | PF01817. CM_2. 1 hit. PF02153. PDH. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| PIRSF | PIRSF001499. Chor_mut_pdh_Tpr. 1 hit. | ||||||||||||
| SMART | SM00830. CM_2. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| SUPFAM | SSF48179. 6DGDH_C_like. 1 hit. SSF48600. Chorismate_mut. 1 hit. | ||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR01799. CM_T. 1 hit. | ||||||||||||
| PROSITE | PS51168. CHORISMATE_MUT_2. 1 hit. PS51176. PDH_ADH. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||
Other | |||||||||||||
| EvolutionaryTrace | P43902. | ||||||||||||
Entry information
| Entry name | TYRA_HAEIN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P43902 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Prokaryotic Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| Haemophilus influenzae Haemophilus influenzae (strain Rd): entries and gene names |
| PATHWAY comments Index of metabolic and biosynthesis pathways |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with
