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UniProtKB/Swiss-Prot P43489 (TNR4_HUMAN)
Last modified
November 4, 2008.
Version 77.
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Clusters with 100%,
90%,
50% identity |
Documents (8) |
Third-party data |
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Names and origin
| Protein names | Recommended name: Tumor necrosis factor receptor superfamily member 4 Alternative name(s): OX40L receptor ACT35 antigen TAX transcriptionally-activated glycoprotein 1 receptor CD_antigen=CD134 | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 277 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | Receptor for TNFSF4/OX40L/GP34. |
| Subunit structure | Interacts with TRAF2, TRAF3 and TRAF5. |
| Subcellular location | |
| Sequence similarities | Contains 4 TNFR-Cys repeats. |
Ontologies
Keywords | |
|---|---|
| Cellular component | Membrane |
| Coding sequence diversity | Polymorphism |
| Domain | Repeat Signal Transmembrane |
| Molecular function | Receptor |
| PTM | Glycoprotein |
| Technical term | 3D-structure |
Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | immune response Ref.1 Traceable author statement. Source: ProtInc |
| Cellular component | integral to plasma membrane Ref.1 Traceable author statement. Source: ProtInc |
| Molecular function | tumor necrosis factor receptor activity Traceable author statement. Source: ProtInc |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Signal peptide | 1 – 28 | 28 | Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 29 – 277 | 249 | Tumor necrosis factor receptor superfamily member 4 | PRO_0000034554 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 29 – 214 | 186 | Extracellular Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transmembrane | 215 – 235 | 21 | Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 236 – 277 | 42 | Cytoplasmic Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 30 – 65 | 36 | TNFR-Cys 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 66 – 107 | 42 | TNFR-Cys 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 108 – 126 | 19 | TNFR-Cys 3; truncated | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 127 – 167 | 41 | TNFR-Cys 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 146 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 160 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 31 ↔ 42 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 43 ↔ 56 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 46 ↔ 64 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 67 ↔ 81 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 84 ↔ 99 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 87 ↔ 107 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 109 ↔ 125 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 128 ↔ 141 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 147 ↔ 166 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 10 | 1 | R → C | VAR_025164 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 33 – 38 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 41 – 44 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 50 – 54 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 58 – 60 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 63 – 66 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 77 – 79 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 89 – 91 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 93 – 97 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 106 – 109 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 113 – 115 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 121 – 123 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 124 – 127 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 147 – 151 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 153 – 156 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 160 – 162 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 165 – 167 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
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| [8] | "Activation of OX40 signal transduction pathways leads to tumor necrosis factor receptor-associated factor (TRAF) 2- and TRAF5-mediated NF-kappaB activation." Kawamata S., Hori T., Imura A., Takaori-Kondo A., Uchiyama T. J. Biol. Chem. 273:5808-5814(1998) [PubMed: 9488716] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH TRAF2 AND TRAF5. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| X75962 mRNA. Translation: CAA53576.1. S76792 mRNA. Translation: AAB33944.1. Different initiation. AJ277151 Genomic DNA. Translation: CAB96543.1. DQ118974 Genomic DNA. Translation: AAZ15374.1. AL162741 Genomic DNA. Translation: CAI23250.1. BC105070 mRNA. Translation: AAI05071.1. BC105072 mRNA. Translation: AAI05073.1. | |||||||||||||||||||||||||
| PIR | I37552. | ||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_003318.1. | ||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.129780 | ||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||
| DIP | DIP:3024N. | ||||||||||||||||||||||||
Polymorphism databases | |||||||||||||||||||||||||
| NIEHS-SNPs | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENSG00000186827. Homo sapiens. [Contig view] | ||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 7293. | ||||||||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:7293. | ||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||
| H-InvDB | HIX0028755. HIX0074191. | ||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:11918. TNFRSF4. | ||||||||||||||||||||||||
| HPA | CAB016128. | ||||||||||||||||||||||||
| MIM | 600315. gene. | ||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA36611. | ||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | P43489. | ||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | P43489. | ||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | P43489. | ||||||||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_TNFRSF4. | ||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000186827. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR001368. TNFR_c6. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF00020. TNFR_c6. 2 hits. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| SMART | SM00208. TNFR. 3 hits. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS00652. TNFR_NGFR_1. 2 hits. PS50050. TNFR_NGFR_2. 2 hits. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Other Resources | |||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 28515. | ||||||||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | TNR4_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P43489 Secondary accession number(s): Q13663, Q2M312, Q5T7M0 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HPI (Human Proteome Initiative) | ||||||||
Relevant documents
| Human cell differentiation molecules CD nomenclature of surface proteins of human leucocytes and list of entries |
| Human chromosome 1 Human chromosome 1: entries, gene names and cross-references to MIM |
| Human entries with polymorphisms or disease mutations List of human entries with polymorphisms or disease mutations |
| Human polymorphisms and disease mutations Index of human polymorphisms and disease mutations |
| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| UniProtKB secondary accession numbers Index of UniProtKB secondary accession numbers |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

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