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UniProtKB/Swiss-Prot P43405 (KSYK_HUMAN)
Last modified
November 25, 2008.
Version 105.
History...
Clusters with 100%,
90%,
50% identity |
Documents (7) |
Third-party data |
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Names and origin
| Protein names | Recommended name: Tyrosine-protein kinase SYK EC=2.7.10.2 Alternative name(s): Spleen tyrosine kinase | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Homo sapiens (Human) | ||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 635 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is not processed. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | Positive effector of BCR-stimulated responses. Couples the B-cell antigen receptor (BCR) to the mobilization of calcium ion either through a phosphoinositide 3-kinase-dependent pathway, when not phosphorylated on tyrosines of the linker region, or through a phospholipase C-gamma-dependent pathway, when phosphorylated on Tyr-348 and Tyr-352. Thus the differential phosphorylation of Syk can determine the pathway by which BCR is coupled to the regulation of intracellular calcium ion By similarity. |
| Catalytic activity | ATP + a [protein]-L-tyrosine = ADP + a [protein]-L-tyrosine phosphate. |
| Subunit structure | Interacts with CBL and SLA when it is phosphorylated. The interaction with SLA may link it to CBL, leading to its destruction. Interacts with phosphorylated NFAM1 By similarity. Interacts with Epstein-Barr virus LMP2A. Interacts through its SH2 domains with the phosphorylated ITAM domain of CD79A which stimulates SYK autophosphorylation and activation. Interacts with FCRL3. |
| Post-translational modification | Autophosphorylated. Phosphorylation on Tyr-323 creates a binding site for c-Cbl, an adapter protein that serves as a negative regulator of BCR-stimulated calcium ion signaling By similarity. Phosphorylation on Tyr-348 and Tyr-352 enhances the phosphorylation and activation of phospholipase C-gamma and the early phase of calcium ion mobilization via a phosphoinositide 3-kinase-independent pathway By similarity. Ubiquitinated by CBLB after BCR activation; which promotes proteasomal degradation By similarity. |
| Sequence similarities | Belongs to the protein kinase superfamily. Tyr protein kinase family. SYK/ZAP-70 subfamily. Contains 1 protein kinase domain. Contains 2 SH2 domains. |
Ontologies
Binary interactions
With | Entry | #Exp. | IntAct | Notes |
|---|---|---|---|---|
| CD22 | P20273 | 1 | EBI-78302,EBI-78277 | |
| FCER1G | P30273 | 1 | EBI-78302,EBI-515289 | |
| ITGB2 | P05107 | 1 | EBI-78302,EBI-300173 |
Alternative products
| This entry describes 2 isoforms produced by alternative splicing. [Align] [Select] | ||||||
| Isoform Long (identifier: P43405-1) This isoform has been chosen as the 'canonical' sequence. All positional information in this entry refers to it. This is also the sequence that appears in the downloadable versions of the entry. | ||||||
| Isoform Short (identifier: P43405-2) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 283-305: Missing. |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 635 | 635 | Tyrosine-protein kinase SYK | PRO_0000088165 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 15 – 107 | 93 | SH2 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 168 – 259 | 92 | SH2 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 371 – 631 | 261 | Protein kinase | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 377 – 385 | 9 | ATP By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 260 – 370 | 111 | Linker | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 494 | 1 | Proton acceptor By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 402 | 1 | ATP By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 296 | 1 | Phosphotyrosine | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 297 | 1 | Phosphoserine | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 316 | 1 | Phosphoserine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 319 | 1 | Phosphoserine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 323 | 1 | Phosphotyrosine; by LYN | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 348 | 1 | Phosphotyrosine | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 352 | 1 | Phosphotyrosine | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 525 | 1 | Phosphotyrosine; by autocatalysis By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 526 | 1 | Phosphotyrosine | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 546 | 1 | Phosphotyrosine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 629 | 1 | Phosphotyrosine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 630 | 1 | Phosphotyrosine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 283 – 305 | 23 | Missing in isoform Short. | VSP_005010 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 45 | 1 | R → H: dbSNP rs16906862. | VAR_033838 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 119 | 1 | P → A in CAA51970. Ref.4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 250 | 1 | G → P in CAA51970. Ref.4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 166 – 169 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 176 – 184 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 191 – 195 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 198 – 201 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 203 – 211 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 213 – 219 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 222 – 224 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 229 – 231 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 237 – 244 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 251 – 253 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 367 – 369 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 370 – 379 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 384 – 391 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 396 – 403 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 412 – 424 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 435 – 449 | 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 456 – 462 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 468 – 487 | 20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 497 – 499 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 500 – 504 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 507 – 510 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 524 – 527 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 536 – 538 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 541 – 546 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 548 – 550 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 551 – 566 | 16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 567 – 569 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 578 – 586 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 599 – 608 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 613 – 615 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 619 – 635 | 17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||||||||
References
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| + | Additional computationally mapped references. |

Clusters with