P42335 (IP3KB_RAT) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
November 16, 2011.
Version 85.
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Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Sequence annotation·Sequences·References·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize orderNames and origin
| Protein names | Recommended name: Inositol-trisphosphate 3-kinase B EC=2.7.1.127 Alternative name(s): Inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase B Short name=IP3 3-kinase B Short name=IP3K B Short name=InsP 3-kinase B | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Rattus norvegicus (Rat) | ||
| Taxonomic identifier | 10116 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Glires › Rodentia › Sciurognathi › Muroidea › Muridae › Murinae › Rattus |
Protein attributes
| Sequence length | 934 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Catalytic activity | ATP + 1D-myo-inositol 1,4,5-trisphosphate = ADP + 1D-myo-inositol 1,3,4,5-tetrakisphosphate. |
| Enzyme regulation | IP3K is activated by calmodulin. |
| Sequence similarities | Belongs to the inositol phosphokinase (IPK) family. |
| Sequence caution | The sequence CAA52298.1 differs from that shown. Reason: Frameshift at position 175. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Ligand | ATP-binding Calmodulin-binding Nucleotide-binding |
| Molecular function | Kinase Transferase |
| PTM | Phosphoprotein |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Molecular function | ATP binding Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW calmodulin bindingInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW inositol-1,4,5-trisphosphate 3-kinase activityInferred from electronic annotation. Source: EC |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 934 | 934 | Inositol-trisphosphate 3-kinase B | PRO_0000066869 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 718 – 720 | 3 | ATP By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 756 – 764 | 9 | Calmodulin-binding By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 781 – 788 | 8 | Substrate binding By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 667 | 1 | ATP By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 678 | 1 | ATP By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 731 | 1 | ATP By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 733 | 1 | Substrate By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 754 | 1 | Substrate By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 805 | 1 | ATP By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 885 | 1 | ATP By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 888 | 1 | Substrate By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 42 | 1 | Phosphoserine By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 48 | 1 | Phosphoserine By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 64 | 1 | Phosphoserine By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 70 | 1 | Phosphoserine By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 179 | 1 | Phosphoserine By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 181 | 1 | Phosphoserine By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 63 – 68 | 6 | LSLEEP → ATKVPW Ref.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 643 – 645 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 647 – 657 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 667 – 670 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 675 – 679 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 682 – 691 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 697 – 699 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 703 – 709 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 712 – 718 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 720 – 723 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 728 – 736 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 741 – 747 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 755 – 764 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 771 – 776 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 781 – 788 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 791 – 793 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 794 – 797 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 798 – 805 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 821 – 832 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 836 – 853 | 18 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 857 – 860 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 862 – 864 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 868 – 873 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 879 – 884 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 889 – 891 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 900 – 902 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 913 – 929 | 17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| [1] | "Cloning of the complete protein coding regions for inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase B-isoforms from rat and human." Bertsch U., Suesse S., Frerk S., Fanick W. Submitted (MAY-1999) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA]. Tissue: Brain. |
| [2] | "Isolation and sequence of a full length cDNA encoding a novel rat inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase." Thomas S., Brake B., Luzio J.P., Stanley K., Banting G. Biochim. Biophys. Acta 1220:219-222(1994) [PubMed: 8312366] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] OF 63-934. Tissue: Liver. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | AJ242781 mRNA. Translation: CAC40660.1. X74227 mRNA. Translation: CAA52298.1. Frameshift. | ||||||||||||
| IPI | IPI00231739. | ||||||||||||
| PIR | S41053. | ||||||||||||
| RefSeq | NP_062185.2. NM_019312.2. | ||||||||||||
| UniGene | Rn.22498. | ||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||
| ProteinModelPortal | P42335. | ||||||||||||
| SMR | P42335. Positions 642-930. | ||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||
| STRING | P42335. | ||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||
| PRIDE | P42335. | ||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||
| Ensembl | ENSRNOT00000004032; ENSRNOP00000004032; ENSRNOG00000002969. | ||||||||||||
| GeneID | 54260. | ||||||||||||
| KEGG | rno:54260. | ||||||||||||
| UCSC | AJ242781. rat. | ||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||
| CTD | 3707. | ||||||||||||
| RGD | 2932. Itpkb. | ||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||
| eggNOG | roNOG11709. | ||||||||||||
| GeneTree | ENSGT00390000017438. | ||||||||||||
| HOVERGEN | HBG052139. | ||||||||||||
| InParanoid | P42335. | ||||||||||||
| OMA | QGQFLGS. | ||||||||||||
| OrthoDB | EOG4Q2DG1. | ||||||||||||
| PhylomeDB | P42335. | ||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||
| BRENDA | 2.7.1.127. 5301. | ||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||
| ArrayExpress | P42335. | ||||||||||||
| Genevestigator | P42335. | ||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||
| InterPro | IPR005522. IPK. [Graphical view] | ||||||||||||
| KO | K00911. | ||||||||||||
| PANTHER | PTHR12400. IPK. 1 hit. | ||||||||||||
| Pfam | PF03770. IPK. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||
Other | |||||||||||||
| NextBio | 610782. | ||||||||||||
Entry information
| Entry name | IP3KB_RAT | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P42335 Secondary accession number(s): Q91XW1 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Chordata Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with