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UniProtKB/Swiss-Prot P36897 (TGFR1_HUMAN)
Last modified
November 25, 2008.
Version 103.
History...
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90%,
50% identity |
Documents (7) |
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Names and origin
| Protein names | Recommended name: TGF-beta receptor type-1 EC=2.7.11.30 Alternative name(s): Transforming growth factor-beta receptor type I Short name=TGF-beta receptor type I TGF-beta type I receptor TbetaR-I TGFR-1 Serine/threonine-protein kinase receptor R4 Short name=SKR4 Activin receptor-like kinase 5 Short name=ALK-5 | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Homo sapiens (Human) | ||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 503 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | On ligand binding, forms a receptor complex consisting of two type II and two type I transmembrane serine/threonine kinases. Type II receptors phosphorylate and activate type I receptors which autophosphorylate, then bind and activate SMAD transcriptional regulators. Receptor for TGF-beta. |
| Catalytic activity | ATP + [receptor-protein] = ADP + [receptor-protein] phosphate. |
| Cofactor | Magnesium or manganese By similarity. |
| Subunit structure | Interacts with CD109. The unphosphorylated protein interacts with FKBP1A and is stabilized the inactive conformation. Phosphorylation of the GS region abrogates FKBP1A binding. Interacts with SMAD2 when phosphorylated on several residues in the GS region. |
| Subcellular location | |
| Tissue specificity | Found in all tissues examined, most abundant in placenta and least abundant in brain and heart. |
| Post-translational modification | Phosphorylated at basal levels in the absence of ligand binding. Activated by multiple phosphorylation, mainly in the GS region. |
| Involvement in disease | Defects in TGFBR1 are the cause of Loeys-Dietz syndrome type 1A (LDS1A) [MIM:609192]; also known as Furlong syndrome or Loeys-Dietz aortic aneurysm syndrome (LDAS). LDS1 is an aortic aneurysm syndrome with widespread systemic involvement. The disorder is characterized by arterial tortuosity and aneurysms, craniosynostosis, hypertelorism, and bifid uvula or cleft palate. Other findings include exotropy, micrognathia and retrognathia, structural brain abnormalities, intellectual deficit, congenital heart disease, translucent skin, joint hyperlaxity and aneurysm with dissection throughout the arterial tree. Defects in TGFBR1 are the cause of Loeys-Dietz syndrome type 2A (LDS2A) [MIM:608967]. LDS2 is an aortic aneurysm syndrome with widespread systemic involvement. Physical findings include prominent joint laxity, easy bruising, wide and atrophic scars, velvety and translucent skin with easily visible veins, spontaneous rupture of the spleen or bowel, diffuse arterial aneurysms and dissections, and catastrophic complications of pregnancy, including rupture of the gravid uterus and the arteries, either during pregnancy or in the immediate postpartum period. LDS2 is characterized by the absence of craniofacial abnormalities with the exception of bifid uvula that can be present in some patients. Defects in TGFBR1 are the cause of aortic aneurysm familial thoracic type 5 (AAT5) [MIM:608967]. Aneurysms and dissections of the aorta usually result from degenerative changes in the aortic wall. Thoracic aortic aneurysms and dissections are primarily associated with a characteristic histologic appearance known as 'medial necrosis' in which there is degeneration and fragmentation of elastic fibers, loss of smooth muscle cells, and an accumulation of basophilic ground substance. |
| Sequence similarities | Belongs to the protein kinase superfamily. TKL Ser/Thr protein kinase family. TGFB receptor subfamily. Contains 1 GS domain. Contains 1 protein kinase domain. |
Ontologies
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Signal peptide | 1 – 24 | 24 | Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 25 – 503 | 479 | TGF-beta receptor type-1 | PRO_0000024423 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 25 – 125 | 101 | Extracellular Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transmembrane | 126 – 147 | 22 | Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 148 – 503 | 356 | Cytoplasmic Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 175 – 204 | 30 | GS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 205 – 495 | 291 | Protein kinase | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 211 – 219 | 9 | ATP By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 333 | 1 | Proton acceptor By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 232 | 1 | ATP By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 185 | 1 | Phosphothreonine | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 186 | 1 | Phosphothreonine | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 187 | 1 | Phosphoserine | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 189 | 1 | Phosphoserine | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 191 | 1 | Phosphoserine | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 45 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 36 ↔ 54 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 38 ↔ 41 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 48 ↔ 71 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 86 ↔ 100 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 101 ↔ 106 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 24 – 26 | 3 | Missing in allele TGFBR1*6A; could be a tumor susceptibility allele. | VAR_022342 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 26 | 1 | A → AA in allele TGFBR1*10A; rare polymorphism. | VAR_022343 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 153 | 1 | V → I | VAR_041412 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 200 | 1 | T → I in LDS1A. | VAR_022344 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 232 | 1 | K → E in LDS2A. | VAR_029481 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 241 | 1 | S → L in LDS1A. | VAR_029482 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 267 | 1 | N → H in a patient with Marfan syndrome. | VAR_029483 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 291 | 1 | Y → C | VAR_041413 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 318 | 1 | M → R in LDS1A. | VAR_022345 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 400 | 1 | D → G in LDS1A. | VAR_022346 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 487 | 1 | R → P in LDS1A and LDS2A. | VAR_022347 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 487 | 1 | R → Q in LDS2A and AAT5. | VAR_029484 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 487 | 1 | R → W in LDS2A. | VAR_029485 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 185 – 186 | 2 | TT → VV: Loss of phosphorylation on threonine residues. Loss of threonine phosphorylation, reduced phosphorylation on serine residues and loss of response to TGF-beta; when associated with A-187; A-189 and A-191 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 187 | 1 | S → A: Loss of threonine phosphorylation, reduced phosphorylation on serine residues and loss of response to TGF-beta; when associated with 185-VV-186; A-189 and A-191 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 189 | 1 | S → A: Loss of threonine phosphorylation, reduced phosphorylation on serine residues and loss of response to TGF-beta; when associated with 185-VV-186; A-187 and A-191 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 191 | 1 | S → A: Loss of threonine phosphorylation, reduced phosphorylation on serine residues and loss of response to TGF-beta; when associated with 185-VV-186; A-187 and A-189 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 200 | 1 | T → D: Loss of response to TGF-beta | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 200 | 1 | T → V: Loss of phosphorylation. Loss of response to TGF-beta | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 204 | 1 | T → D: Constitutive activation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 204 | 1 | T → V: Reduced phosphorylation. Reduced response to TGF-beta | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 177 – 183 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 191 – 193 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 195 – 199 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 202 – 204 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 206 – 212 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 215 – 217 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 219 – 224 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 227 – 234 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 239 – 251 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 262 – 267 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 271 – 273 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 276 – 280 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 288 – 294 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 299 – 317 | 19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 328 – 330 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 336 – 338 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 339 – 341 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 347 – 349 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 356 – 359 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 360 – 363 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 364 – 366 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 376 – 378 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 381 – 384 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 393 – 413 | 21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 427 – 431 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 438 – 445 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 456 – 459 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 462 – 472 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 479 – 481 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 485 – 499 | 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
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References
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| [1] | "Cloning of a TGF beta type I receptor that forms a heteromeric complex with the TGF beta type II receptor." Franzen P., ten Dijke P., Ichijo H., Yamashita H., Schulz P., Heldin C.-H., Miyazono K. Cell 75:681-692(1993) [PubMed: 8242743] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA]. |
| [2] | "Cloning and genomic organization of the human transforming growth factor-beta type I receptor gene." Vellucci V.F., Reiss M. Genomics 46:278-283(1997) [PubMed: 9417915] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA]. |
| [3] | "The genomic structure of the gene encoding the human transforming growth factor beta type I receptor." Lynch M.A., Song H., DeGroff V.L., Alam K.Y., Adams E.M., Weghorst C.M. Submitted (NOV-1997) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA]. |
| [4] | "NIEHS-SNPs, environmental genome project, NIEHS ES15478, Department of Genome Sciences, Seattle, WA (URL: http://egp.gs.washington.edu)." Livingston R.J., Rieder M.J., Chung M.-W., Ritchie T.K., Olson A.N., Nguyen C.P., Nguyen D.A., Poel C.L., Robertson P.D., Schackwitz W.S., Sherwood J.K., Sherwood A.M., Leithauser B.J., Nickerson D.A. Submitted (DEC-2003) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA]. |
| [5] | "GS domain mutations that constitutively activate T beta R-I, the downstream signaling component in the TGF-beta receptor complex." Wieser R., Wrana J.L., |

Clusters with