Reviewed,
UniProtKB/Swiss-Prot P36186 (TPI1_GIALA)
Last modified
June 16, 2009.
Version 49.
History...
Clusters with 100%,
90%,
50% identity |
Documents (3) |
Third-party data |
Customize display | text xml rdf/xml gff fasta |
Names and origin
| Protein names | Recommended name: Triosephosphate isomerase Short name=TIM EC=5.3.1.1 Alternative name(s): Triose-phosphate isomerase |
| Organism | Giardia lamblia (Giardia intestinalis) |
| Taxonomic identifier | 5741 [NCBI] |
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Diplomonadida › Hexamitidae › Giardiinae › Giardia |
Protein attributes
| Sequence length | 257 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is not processed. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Catalytic activity | D-glyceraldehyde 3-phosphate = glycerone phosphate. |
| Pathway | |
| Subunit structure | Homodimer By similarity. |
| Sequence similarities | Belongs to the triosephosphate isomerase family. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Fatty acid biosynthesis Gluconeogenesis Glycolysis Lipid synthesis Pentose shunt |
| Molecular function | Isomerase |
| Technical term | 3D-structure |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | fatty acid biosynthetic process Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW gluconeogenesisInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW glycolysisInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW pentose-phosphate shuntInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Molecular function | triose-phosphate isomerase activity Inferred from electronic annotation. Source: EC |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 257 | 257 | Triosephosphate isomerase | PRO_0000090135 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 96 | 1 | Electrophile By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 170 | 1 | Proton acceptor By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 11 | 1 | Substrate By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 13 | 1 | Substrate By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 7 – 11 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 18 – 29 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 37 – 42 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 45 – 47 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 48 – 54 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 61 – 65 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 72 – 74 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 81 – 86 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 91 – 94 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 97 – 101 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 107 – 119 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 123 – 128 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 132 – 136 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 140 – 155 | 16 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 159 – 164 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 165 – 169 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 172 – 174 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 175 – 177 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 183 – 200 | 18 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 203 – 208 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 209 – 216 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 219 – 221 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 222 – 226 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 233 – 237 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 238 – 241 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 244 – 255 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| [1] | "Complementation of an Escherichia coli glycolysis mutant by Giardia lamblia triosephosphate isomerase." Mowatt M.R., Weinbach E.C., Howard T.C., Nash T.E. Exp. Parasitol. 78:85-92(1994) [PubMed: 8299763] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE. Strain: ATCC 30957 / WB. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| L02120 Unassigned DNA. Translation: AAA18203.1. | |||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||
| |||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||
| BRENDA | 5.3.1.1. 322. | ||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||
| InterPro | IPR013785. Aldolase_TIM. IPR000652. Triosephosphate_isomerase. [Graphical view] | ||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:3.20.20.70. Aldolase_TIM. 1 hit. | ||||||||||||
| PANTHER | PTHR21139. Triophos_ismrse. 1 hit. | ||||||||||||
| Pfam | PF00121. TIM. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| ProDom | PD001005. Triophos_ismrse. 1 hit. [Graphical view] [Entries sharing at least one domain] | ||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR00419. tim. 1 hit. | ||||||||||||
| PROSITE | PS00171. TIM_1. 1 hit. PS51440. TIM_2. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||
Entry information
| Entry name | TPI1_GIALA | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P36186 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
Relevant documents
| PATHWAY comments Index of metabolic and biosynthesis pathways |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with


