SubmitCancel

Skip Header

You are using a version of browser that may not display all the features of this website. Please consider upgrading your browser.

P36022

- DYHC_YEAST

UniProt

P36022 - DYHC_YEAST

(max 400 entries)x

Your basket is currently empty.

Select item(s) and click on "Add to basket" to create your own collection here
(400 entries max)

Protein
Dynein heavy chain, cytoplasmic
Gene
DYN1, DHC1, YKR054C
Organism
Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast)
Status
Reviewed - Annotation score: 5 out of 5 - Experimental evidence at protein leveli

Functioni

Cytoplasmic dynein acts as a motor for the intracellular retrograde motility of vesicles and organelles along microtubules. Dynein has ATPase activity; the force-producing power stroke is thought to occur on release of ADP. Required to maintain uniform nuclear distribution in hyphae. May play an important role in the proper orientation of the mitotic spindle into the budding daughter cell yeast. Probably required for normal progression of the cell cycle.1 Publication

Regions

Feature keyPosition(s)LengthDescriptionGraphical viewFeature identifierActions
Nucleotide bindingi1796 – 18038ATP Reviewed prediction
Nucleotide bindingi2074 – 20818ATP Reviewed prediction
Nucleotide bindingi2418 – 24258ATP Reviewed prediction
Nucleotide bindingi2760 – 27678ATP Reviewed prediction

GO - Molecular functioni

  1. ATP binding Source: UniProtKB-KW
  2. ATPase activity Source: InterPro
  3. microtubule motor activity Source: SGD
  4. protein binding Source: IntAct

GO - Biological processi

  1. establishment of mitotic spindle localization Source: SGD
  2. establishment of mitotic spindle orientation Source: SGD
  3. karyogamy Source: UniProtKB-KW
  4. metabolic process Source: GOC
  5. mitotic sister chromatid segregation Source: SGD
  6. nuclear migration along microtubule Source: SGD
Complete GO annotation...

Keywords - Molecular functioni

Motor protein

Keywords - Biological processi

Karyogamy

Keywords - Ligandi

ATP-binding, Nucleotide-binding

Enzyme and pathway databases

BioCyciYEAST:G3O-32023-MONOMER.

Names & Taxonomyi

Protein namesi
Recommended name:
Dynein heavy chain, cytoplasmic
Alternative name(s):
Dynein heavy chain, cytosolic
Short name:
DYHC
Gene namesi
Name:DYN1
Synonyms:DHC1
Ordered Locus Names:YKR054C
OrganismiSaccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast)
Taxonomic identifieri559292 [NCBI]
Taxonomic lineageiEukaryotaFungiDikaryaAscomycotaSaccharomycotinaSaccharomycetesSaccharomycetalesSaccharomycetaceaeSaccharomyces
ProteomesiUP000002311: Chromosome XI

Organism-specific databases

CYGDiYKR054c.
SGDiS000001762. DYN1.

Subcellular locationi

Cytoplasmcytoskeleton
Note: Concentrates at motile dots in the cytoplasm corresponding to the plus ends of cytoplasmic microtubules.2 Publications

GO - Cellular componenti

  1. astral microtubule Source: SGD
  2. cell cortex Source: SGD
  3. cytoplasmic dynein complex Source: SGD
  4. cytoplasmic microtubule Source: SGD
  5. spindle pole body Source: SGD
Complete GO annotation...

Keywords - Cellular componenti

Cytoplasm, Cytoskeleton, Dynein, Microtubule

PTM / Processingi

Molecule processing

Feature keyPosition(s)LengthDescriptionGraphical viewFeature identifierActions
Chaini1 – 40924092Dynein heavy chain, cytoplasmic
PRO_0000114643Add
BLAST

Proteomic databases

MaxQBiP36022.
PaxDbiP36022.
PRIDEiP36022.

Expressioni

Gene expression databases

GenevestigatoriP36022.

Interactioni

Subunit structurei

The dynein complex consists of at least two heavy chains and a number of intermediate and light chains. Interacts with DYN3.1 Publication

Binary interactionsi

WithEntry#Exp.IntActNotes
SMC1P329083EBI-6230,EBI-17402

Protein-protein interaction databases

BioGridi34185. 225 interactions.
DIPiDIP-2644N.
IntActiP36022. 9 interactions.
MINTiMINT-427451.
STRINGi4932.YKR054C.

Structurei

Secondary structure

Legend: HelixTurnBeta strand
Show more details
Feature keyPosition(s)LengthDescriptionGraphical viewFeature identifierActions
Helixi1366 – 137813
Beta strandi1384 – 13874
Beta strandi1389 – 13913
Beta strandi1393 – 13964
Helixi1399 – 141416
Turni1420 – 14245
Helixi1425 – 145834
Helixi1464 – 14685
Helixi1470 – 149122
Helixi1497 – 15015
Helixi1505 – 153329
Helixi1537 – 15404
Helixi1542 – 15509
Turni1551 – 15544
Helixi1556 – 15583
Helixi1559 – 15657
Beta strandi1567 – 15748
Beta strandi1576 – 15849
Beta strandi1589 – 15979
Helixi1604 – 163128
Helixi1636 – 16405
Helixi1645 – 166622
Helixi1669 – 168820
Helixi1692 – 171726
Helixi1721 – 173010
Beta strandi1733 – 17364
Helixi1743 – 17453
Beta strandi1747 – 17515
Beta strandi1754 – 17574
Helixi1773 – 178715
Beta strandi1791 – 17955
Helixi1802 – 181110
Turni1812 – 18143
Beta strandi1818 – 18214
Helixi1828 – 184114
Beta strandi1844 – 18496
Helixi1855 – 187420
Beta strandi1877 – 18804
Beta strandi1882 – 18876
Beta strandi1893 – 18986
Beta strandi1902 – 19054
Helixi1910 – 19134
Beta strandi1916 – 19205
Helixi1926 – 193813
Helixi1942 – 195918
Helixi1970 – 198617
Helixi1991 – 200111
Helixi2003 – 20053
Helixi2008 – 202114
Beta strandi2029 – 20324
Helixi2033 – 204513
Helixi2051 – 206616
Beta strandi2068 – 20736
Helixi2080 – 209415
Beta strandi2098 – 21047
Turni2106 – 21083
Helixi2111 – 21144
Turni2120 – 21223
Helixi2130 – 21389
Beta strandi2146 – 21549
Helixi2160 – 21645
Helixi2167 – 21704
Beta strandi2175 – 21773
Beta strandi2179 – 21813
Beta strandi2183 – 21853
Beta strandi2188 – 219710
Helixi2204 – 22096
Beta strandi2210 – 22145
Helixi2222 – 223817
Helixi2243 – 225614
Helixi2259 – 227012
Helixi2280 – 229718
Helixi2300 – 23023
Beta strandi2303 – 23053
Helixi2307 – 232721
Helixi2333 – 234513
Beta strandi2348 – 23503
Beta strandi2363 – 23653
Helixi2383 – 23853
Helixi2395 – 241016
Beta strandi2413 – 24175
Helixi2424 – 243310
Beta strandi2439 – 24446
Helixi2451 – 246111
Beta strandi2465 – 24673
Turni2468 – 24703
Beta strandi2471 – 248010
Beta strandi2482 – 24876
Turni2488 – 24903
Beta strandi2496 – 24983
Helixi2501 – 251111
Beta strandi2513 – 25164
Turni2518 – 25203
Beta strandi2523 – 253513
Helixi2548 – 25514
Beta strandi2554 – 25585
Turni2563 – 25653
Helixi2566 – 257813
Helixi2583 – 25886
Helixi2589 – 260618
Turni2609 – 26113
Helixi2619 – 263416
Helixi2641 – 265616
Turni2657 – 26593
Helixi2664 – 268017
Turni2691 – 26933
Beta strandi2696 – 27038
Helixi2709 – 272618
Helixi2736 – 275015
Beta strandi2751 – 27599
Turni2761 – 27633
Helixi2766 – 277611
Beta strandi2780 – 27823
Helixi2792 – 280817
Beta strandi2813 – 28186
Turni2819 – 28213
Helixi2825 – 283612
Beta strandi2837 – 28393
Turni2841 – 28433
Helixi2847 – 286317
Helixi2870 – 288415
Beta strandi2886 – 28927
Helixi2897 – 29048
Helixi2906 – 29116
Beta strandi2912 – 29165
Helixi2922 – 293211
Helixi2961 – 297919
Beta strandi2983 – 29853
Helixi2991 – 302737
Helixi3300 – 33045
Turni3305 – 33073
Helixi3308 – 333326
Turni3334 – 33363
Helixi3339 – 335517
Helixi3366 – 33705
Helixi3373 – 338210
Helixi3388 – 339912
Beta strandi3402 – 34087
Helixi3414 – 34229
Helixi3423 – 34253
Beta strandi3426 – 34294
Helixi3436 – 344510
Beta strandi3449 – 34535
Beta strandi3455 – 34573
Helixi3463 – 34664
Beta strandi3477 – 34804
Beta strandi3482 – 34876
Beta strandi3493 – 34986
Helixi3507 – 35126
Beta strandi3513 – 35175
Helixi3523 – 353715
Helixi3539 – 357234
Beta strandi3573 – 35764
Helixi3580 – 363859
Helixi3646 – 365510
Helixi3670 – 368617
Helixi3692 – 371019
Helixi3713 – 372614
Beta strandi3727 – 37293
Turni3738 – 37403
Helixi3743 – 375210
Helixi3756 – 376510
Helixi3774 – 37807
Beta strandi3784 – 37907
Helixi3797 – 38059
Turni3806 – 38083
Beta strandi3813 – 38153
Helixi3819 – 383517
Beta strandi3839 – 38424
Helixi3844 – 38474
Helixi3848 – 38536
Helixi3855 – 38617
Turni3865 – 38673
Beta strandi3868 – 38703
Beta strandi3873 – 38764
Beta strandi3879 – 38813
Helixi3886 – 38916
Beta strandi3892 – 38976
Helixi3903 – 391311
Helixi3914 – 39174
Helixi3923 – 394422
Turni3946 – 39494
Beta strandi3950 – 39523
Helixi3958 – 397417
Helixi3980 – 39823
Helixi3983 – 39919
Turni3995 – 39973
Helixi4001 – 401414
Beta strandi4018 – 40203
Beta strandi4023 – 40264
Helixi4038 – 405114
Helixi4058 – 40614
Beta strandi4063 – 40653
Helixi4067 – 409024

3D structure databases

Select the link destinations:
PDBe
RCSB PDB
PDBj
Links Updated
EntryMethodResolution (Å)ChainPositionsPDBsum
3J67electron microscopy34.00A1554-4092[»]
3J68electron microscopy30.00A1554-4092[»]
3QMZX-ray6.00A/B1364-4092[»]
4AI6X-ray3.40A/B1364-4092[»]
4AKGX-ray3.30A/B1364-4092[»]
4AKHX-ray3.60A/B1364-4092[»]
4AKIX-ray3.70A/B1364-4092[»]
ProteinModelPortaliP36022.
SMRiP36022. Positions 1795-1824, 2067-2092, 2406-2433, 2750-2820, 3083-3237, 3257-3653.

Family & Domainsi

Region

Feature keyPosition(s)LengthDescriptionGraphical viewFeature identifierActions
Regioni1 – 17571757Stem By similarity
Add
BLAST
Regioni1758 – 1979222AAA 1 By similarity
Add
BLAST
Regioni2036 – 2273238AAA 2 By similarity
Add
BLAST
Regioni2379 – 2628250AAA 3 By similarity
Add
BLAST
Regioni2722 – 2984263AAA 4 By similarity
Add
BLAST
Regioni2993 – 3300308Stalk By similarity
Add
BLAST
Regioni3370 – 3599230AAA 5 By similarity
Add
BLAST
Regioni3760 – 3970211AAA 6 By similarity
Add
BLAST

Coiled coil

Feature keyPosition(s)LengthDescriptionGraphical viewFeature identifierActions
Coiled coili154 – 17522 Reviewed prediction
Add
BLAST
Coiled coili486 – 50823 Reviewed prediction
Add
BLAST
Coiled coili542 – 56625 Reviewed prediction
Add
BLAST
Coiled coili932 – 95928 Reviewed prediction
Add
BLAST
Coiled coili1042 – 106322 Reviewed prediction
Add
BLAST
Coiled coili1681 – 170525 Reviewed prediction
Add
BLAST
Coiled coili2993 – 3092100 Reviewed prediction
Add
BLAST
Coiled coili3242 – 330059 Reviewed prediction
Add
BLAST
Coiled coili3532 – 360877 Reviewed prediction
Add
BLAST

Domaini

Dynein heavy chains probably consist of an N-terminal stem (which binds cargo and interacts with other dynein components), and the head or motor domain. The motor contains six tandemly-linked AAA domains in the head, which form a ring. A stalk-like structure (formed by two of the coiled coil domains) protrudes between AAA 4 and AAA 5 and terminates in a microtubule-binding site. A seventh domain may also contribute to this ring; it is not clear whether the N-terminus or the C-terminus forms this extra domain. There are four well-conserved and two non-conserved ATPase sites, one per AAA domain. Probably only one of these (within AAA 1) actually hydrolyzes ATP, the others may serve a regulatory function.

Sequence similaritiesi

Keywords - Domaini

Coiled coil, Repeat

Phylogenomic databases

eggNOGiCOG5245.
GeneTreeiENSGT00750000117443.
HOGENOMiHOG000176055.
KOiK10413.
OMAiEMWITKA.
OrthoDBiEOG7MH16D.

Family and domain databases

Gene3Di3.40.50.300. 5 hits.
InterProiIPR003593. AAA+_ATPase.
IPR011704. ATPase_dyneun-rel_AAA.
IPR026983. DHC_fam.
IPR024743. Dynein_HC_stalk.
IPR024317. Dynein_heavy_chain_D4_dom.
IPR004273. Dynein_heavy_dom.
IPR013594. Dynein_heavy_dom-1.
IPR013602. Dynein_heavy_dom-2.
IPR027417. P-loop_NTPase.
[Graphical view]
PANTHERiPTHR10676. PTHR10676. 1 hit.
PfamiPF07728. AAA_5. 1 hit.
PF12780. AAA_8. 1 hit.
PF08385. DHC_N1. 1 hit.
PF08393. DHC_N2. 1 hit.
PF03028. Dynein_heavy. 1 hit.
PF12777. MT. 1 hit.
[Graphical view]
SMARTiSM00382. AAA. 3 hits.
[Graphical view]
SUPFAMiSSF52540. SSF52540. 5 hits.

Sequencei

Sequence statusi: Complete.

P36022-1 [UniParc]FASTAAdd to Basket

« Hide

MCKNEARLAN ELIEFVAATV TGIKNSPKEN EQAFIDYLHC QYLERFQFFL     50
GLLDGREFDT LFVFLFEELD RTIVTIDIGE EAIYDANLAN KKYSTLLIIK 100
SRSVIVDAEP IATQISAIYL PGPVNAGNLA SIITHGVSSV FGQLIKSDTK 150
TYSVETIDKT RRKLDDISKQ FQQLHTSIET PDLLAMVPSI IKLAVSKGAT 200
SHDYANYLPS NDLESMRFLN ILQSIANKWF LVLKQTLAID RDIKNGSFLD 250
EVEFWSNFYE VLKSLIEQTQ SQEFQVCLSV LTNAKRFHNL TNLLNEGSLS 300
DKFKLADKYN QFLSSIPIDE VRQASNLEDL QELFPVLASS LKKFRYSGYP 350
VQRFVVLMDK ISQEVMDAIL SNLSDLFQLE YGSFLGLYEK SAGMIEEWDD 400
IVQDVNLLIR EDLRKRAPQE LLIQKLTFTS ASVKATLDEI LSTRKRFFSL 450
AETIKSISPS TYHEEIQRLY HPFEQIHDIS VNFRLKLEQA ESEFSKNMLD 500
LEKKLQNTLA SFMDSDHCPT EKLSYLVKFK PLMELCPRIK VKVLENQQIL 550
LLEIKKDIRQ LETGLELLPK ILHVEALNNI PPISARISYF LNVQSRIDNI 600
VQYLEALFGS NWNDTLEGRS ISTSIVQLRK ETNPHDVFLH WLGNFPEKAT 650
ANLLTTPILK LIRNNEDDYE LKVNFDFALA AAYSELRSLT YMAFQVPSHI 700
VRIARTYMYL YPRAINLVEL IQTFFSLSKS LSYTFYTNIF LKRNVQTVWL 750
LLQQILITPW ESLQEESSEM SCSVHSLARL EKSIDGILSD YQILKNSEPQ 800
FAKEFSGLKS FDGTADDLHE VEEIISNIQA IFENLFTKGL TNVSDHISTF 850
NNLIISIILE KVRLNLKKMH FPKHVLKLSF NEGRITSSPS LAAMKRSLLK 900
DIEALLNKVV LINFLHDPDH PLSTTLTFNS LVIKLKDDIQ NCIEQVQNLH 950
CKINSYVKEW QKMEFLWQIT EEAFLEVVDN STQRCFGILK GLLDSQSKFD 1000
LIISRNNFSK NLVLHTEDAQ RHIRSKMDSW ILYVSKHLLT IYERDARKLH 1050
EDMNRDREAV EDMDINFTSL KNITVIIEAV NVNKRHLTER DIQIKLLGSV 1100
MRALTKLKVR FPSHFVYIDQ LDNDFSSLRQ SLSYVEQELQ KHRVVIAKSL 1150
EEGVENINNL SQSLNESWSV RKPISPTLTP PEALKILEFF NESITKLKKK 1200
MHSVAAAAKM LLIPVVLNDQ LTHVVEEVKT YDLVWRSIKN LWEDVQRTFE 1250
TPWCRVDVLL LQSDLANFLR RADELPRAVK QFEMYKSLFS QVNMLTSVNK 1300
ILVELKDGAL KPRHWNMIFR DIGKRQIQKN LLDKLEFSLK DVMVLNLTLN 1350
EILLTKIIER AQKEFVIEKS LNRIKKFWKE AQYEVIEHSS GLKLVREWDV 1400
LEQACKEDLE ELVSMKASNY YKIFEQDCLD LESKLTKLSE IQVNWVEVQF 1450
YWLDLYGILG ENLDIQNFLP LETSKFKSLT SEYKMITTRA FQLDTTIEVI 1500
HIPNFDTTLK LTIDSLKMIK SSLSTFLERQ RRQFPRFYFL GNDDLLKIIG 1550
SGKHHDQVSK FMKKMFGSIE SIIFLEDFIT GVRSVEGEVL NLNEKIELKD 1600
SIQAQEWLNI LDTEIKLSVF TQFRDCLGQL KDGTDIEVVV SKYIFQAILL 1650
SAQVMWTELV EKCLQTNQFS KYWKEVDMKI KGLLDKLNKS SDNVKKKIEA 1700
LLVEYLHFNN VIGQLKNCST KEEARLLWAK VQKFYQKNDT LDDLNSVFIS 1750
QSGYLLQYKF EYIGIPERLI YTPLLLIGFA TLTDSLHQKY GGCFFGPAGT 1800
GKTETVKAFG QNLGRVVVVF NCDDSFDYQV LSRLLVGITQ IGAWGCFDEF 1850
NRLDEKVLSA VSANIQQIQN GLQVGKSHIT LLEEETPLSP HTAVFITLNP 1900
GYNGRSELPE NLKKSFREFS MKSPQSGTIA EMILQIMGFE DSKSLASKIV 1950
HFLELLSSKC SSMNHYHFGL RTLKGVLRNC SPLISEFGEG EKTVVESLKR 2000
VILPSLGDTD ELVFKDELSK IFDSAGTPLN SKAIVQCLKD AGQRSGFSMS 2050
EEFLKKCMQF YYMQKTQQAL ILVGKAGCGK TATWKTVIDA MAIFDGHANV 2100
VYVIDTKVLT KESLYGSMLK ATLEWRDGLF TSILRRVNDD ITGTFKNSRI 2150
WVVFDSDLDP EYVEAMNSVL DDNKILTLPN GERLPIPPNF RILFETDNLD 2200
HTTPATITRC GLLWFSTDVC SISSKIDHLL NKSYEALDNK LSMFELDKLK 2250
DLISDSFDMA SLTNIFTCSN DLVHILGVRT FNKLETAVQL AVHLISSYRQ 2300
WFQNLDDKSL KDVITLLIKR SLLYALAGDS TGESQRAFIQ TINTYFGHDS 2350
QELSDYSTIV IANDKLSFSS FCSEIPSVSL EAHEVMRPDI VIPTIDTIKH 2400
EKIFYDLLNS KRGIILCGPP GSGKTMIMNN ALRNSSLYDV VGINFSKDTT 2450
TEHILSALHR HTNYVTTSKG LTLLPKSDIK NLVLFCDEIN LPKLDKYGSQ 2500
NVVLFLRQLM EKQGFWKTPE NKWVTIERIH IVGACNPPTD PGRIPMSERF 2550
TRHAAILYLG YPSGKSLSQI YEIYYKAIFK LVPEFRSYTE PFARASVHLY 2600
NECKARYSTG LQSHYLFSPR ELTRLVRGVY TAINTGPRQT LRSLIRLWAY 2650
EAWRIFADRL VGVKEKNSFE QLLYETVDKY LPNQDLGNIS STSLLFSGLL 2700
SLDFKEVNKT DLVNFIEERF KTFCDEELEV PMVIHESMVD HILRIDRALK 2750
QVQGHMMLIG ASRTGKTILT RFVAWLNGLK IVQPKIHRHS NLSDFDMILK 2800
KAISDCSLKE SRTCLIIDES NILETAFLER MNTLLANADI PDLFQGEEYD 2850
KLLNNLRNKT RSLGLLLDTE QELYDWFVGE IAKNLHVVFT ICDPTNNKSS 2900
AMISSPALFN RCIINWMGDW DTKTMSQVAN NMVDVIPMEF TDFIVPEVNK 2950
ELVFTEPIQT IRDAVVNILI HFDRNFYQKM KVGVNPRSPG YFIDGLRALV 3000
KLVTAKYQDL QENQRFVNVG LEKLNESVLK VNELNKTLSK KSTELTEKEK 3050
EARSTLDKML MEQNESERKQ EATEEIKKIL KVQEEDIRKR KEVVMKSIQD 3100
IEPTILEAQR GVKNIKKQQL TEIRSMVNPP SGVKIVMEAV CAILGYQFSN 3150
WRDIQQFIRK DDFIHNIVHY DTTLHMKPQI RKYMEEEFLS DPNFTYETIN 3200
RASKACGPLY QWVNAQINFS KVLENVDPLR QEMKRIEFES LKTKANLLAA 3250
EEMTQDLEAS IEVSKRKYSL LIRDVEAIKT EMSNVQANLD RSISLVKSLT 3300
FEKERWLNTT KQFSKTSQEL IGNCIISSIY ETYFGHLNER ERADMLVILK 3350
RLLGKFAVKY DVNYRFIDYL VTLDEKMKWL ECGLDKNDYF LENMSIVMNS 3400
QDAVPFLLDP SSHMITVISN YYGNKTVLLS FLEEGFVKRL ENAIRFGSVV 3450
IIQDGEFFDP IISRLISREF NHAGNRVTVE IGDHEVDVSG DFKLFIHSCD 3500
PSGDIPIFLR SRVRLVHFVT NKESIETRIF DITLTEENAE MQRKREDLIK 3550
LNTEYKLKLK NLEKRLLEEL NNSQGNMLEN DELMVTLNNL KKEAMNIEKK 3600
LSESEEFFPQ FDNLVEEYSI IGKHSVKIFS MLEKFGQFHW FYGISIGQFL 3650
SCFKRVFIKK SRETRAARTR VDEILWLLYQ EVYCQFSTAL DKKFKMIMAM 3700
TMFCLYKFDI ESEQYKEAVL TMIGVLSESS DGVPKLTVDT NNDLRYLWDY 3750
VTTKSYISAL NWFKNEFFVD EWNIADVVAN SENNYFTMAS ERDVDGTFKL 3800
IELAKASKES LKIIPLGSIE NLNYAQEEIS KSKIEGGWIL LQNIQMSLSW 3850
VKTYLHKHVE ETKAAEEHEK FKMFMTCHLT GDKLPAPLLQ RTDRFVYEDI 3900
PGILDTVKDL WGSQFFTGKI SGVWSVYCTF LLSWFHALIT ARTRLVPHGF 3950
SKKYYFNDCD FQFASVYLEN VLATNSTNNI PWAQVRDHIA TIVYGGKIDE 4000
EKDLEVVAKL CAHVFCGSDN LQIVPGVRIP QPLLQQSEEE ERARLTAILS 4050
NTIEPADSLS SWLQLPRESI LNYERLQAKE VASSTEQLLQ EM 4092
Length:4,092
Mass (Da):471,348
Last modified:June 1, 1994 - v1
Checksum:i3D9DF447E8E2D6BB
GO

Sequence conflict

Feature keyPosition(s)LengthDescriptionGraphical viewFeature identifierActions
Sequence conflicti589 – 5891Y → C in AAA16055. 1 Publication
Sequence conflicti601 – 6011V → A in AAA16055. 1 Publication
Sequence conflicti1364 – 13641E → A in AAA16055. 1 Publication
Sequence conflicti2118 – 21192ML → IV in CAA79923. 1 Publication

Sequence databases

Select the link destinations:
EMBL
GenBank
DDBJ
Links Updated
Z21877 Genomic DNA. Translation: CAA79923.1.
L15626 Unassigned DNA. Translation: AAA16055.1.
Z28279 Genomic DNA. Translation: CAA82132.1.
BK006944 Genomic DNA. Translation: DAA09205.1.
PIRiS38128.
RefSeqiNP_012980.1. NM_001179844.1.

Genome annotation databases

EnsemblFungiiYKR054C; YKR054C; YKR054C.
GeneIDi853928.
KEGGisce:YKR054C.

Cross-referencesi

Sequence databases

Select the link destinations:
EMBL
GenBank
DDBJ
Links Updated
Z21877 Genomic DNA. Translation: CAA79923.1 .
L15626 Unassigned DNA. Translation: AAA16055.1 .
Z28279 Genomic DNA. Translation: CAA82132.1 .
BK006944 Genomic DNA. Translation: DAA09205.1 .
PIRi S38128.
RefSeqi NP_012980.1. NM_001179844.1.

3D structure databases

Select the link destinations:
PDBe
RCSB PDB
PDBj
Links Updated
Entry Method Resolution (Å) Chain Positions PDBsum
3J67 electron microscopy 34.00 A 1554-4092 [» ]
3J68 electron microscopy 30.00 A 1554-4092 [» ]
3QMZ X-ray 6.00 A/B 1364-4092 [» ]
4AI6 X-ray 3.40 A/B 1364-4092 [» ]
4AKG X-ray 3.30 A/B 1364-4092 [» ]
4AKH X-ray 3.60 A/B 1364-4092 [» ]
4AKI X-ray 3.70 A/B 1364-4092 [» ]
ProteinModelPortali P36022.
SMRi P36022. Positions 1795-1824, 2067-2092, 2406-2433, 2750-2820, 3083-3237, 3257-3653.
ModBasei Search...
MobiDBi Search...

Protein-protein interaction databases

BioGridi 34185. 225 interactions.
DIPi DIP-2644N.
IntActi P36022. 9 interactions.
MINTi MINT-427451.
STRINGi 4932.YKR054C.

Proteomic databases

MaxQBi P36022.
PaxDbi P36022.
PRIDEi P36022.

Protocols and materials databases

Structural Biology Knowledgebase Search...

Genome annotation databases

EnsemblFungii YKR054C ; YKR054C ; YKR054C .
GeneIDi 853928.
KEGGi sce:YKR054C.

Organism-specific databases

CYGDi YKR054c.
SGDi S000001762. DYN1.

Phylogenomic databases

eggNOGi COG5245.
GeneTreei ENSGT00750000117443.
HOGENOMi HOG000176055.
KOi K10413.
OMAi EMWITKA.
OrthoDBi EOG7MH16D.

Enzyme and pathway databases

BioCyci YEAST:G3O-32023-MONOMER.

Miscellaneous databases

NextBioi 975291.
PROi P36022.

Gene expression databases

Genevestigatori P36022.

Family and domain databases

Gene3Di 3.40.50.300. 5 hits.
InterProi IPR003593. AAA+_ATPase.
IPR011704. ATPase_dyneun-rel_AAA.
IPR026983. DHC_fam.
IPR024743. Dynein_HC_stalk.
IPR024317. Dynein_heavy_chain_D4_dom.
IPR004273. Dynein_heavy_dom.
IPR013594. Dynein_heavy_dom-1.
IPR013602. Dynein_heavy_dom-2.
IPR027417. P-loop_NTPase.
[Graphical view ]
PANTHERi PTHR10676. PTHR10676. 1 hit.
Pfami PF07728. AAA_5. 1 hit.
PF12780. AAA_8. 1 hit.
PF08385. DHC_N1. 1 hit.
PF08393. DHC_N2. 1 hit.
PF03028. Dynein_heavy. 1 hit.
PF12777. MT. 1 hit.
[Graphical view ]
SMARTi SM00382. AAA. 3 hits.
[Graphical view ]
SUPFAMi SSF52540. SSF52540. 5 hits.
ProtoNeti Search...

Publicationsi

« Hide 'large scale' publications
  1. Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA].
  2. "Complete DNA sequence of yeast chromosome XI."
    Dujon B., Alexandraki D., Andre B., Ansorge W., Baladron V., Ballesta J.P.G., Banrevi A., Bolle P.-A., Bolotin-Fukuhara M., Bossier P., Bou G., Boyer J., Buitrago M.J., Cheret G., Colleaux L., Daignan-Fornier B., del Rey F., Dion C.
    , Domdey H., Duesterhoeft A., Duesterhus S., Entian K.-D., Erfle H., Esteban P.F., Feldmann H., Fernandes L., Fobo G.M., Fritz C., Fukuhara H., Gabel C., Gaillon L., Garcia-Cantalejo J.M., Garcia-Ramirez J.J., Gent M.E., Ghazvini M., Goffeau A., Gonzalez A., Grothues D., Guerreiro P., Hegemann J.H., Hewitt N., Hilger F., Hollenberg C.P., Horaitis O., Indge K.J., Jacquier A., James C.M., Jauniaux J.-C., Jimenez A., Keuchel H., Kirchrath L., Kleine K., Koetter P., Legrain P., Liebl S., Louis E.J., Maia e Silva A., Marck C., Monnier A.-L., Moestl D., Mueller S., Obermaier B., Oliver S.G., Pallier C., Pascolo S., Pfeiffer F., Philippsen P., Planta R.J., Pohl F.M., Pohl T.M., Poehlmann R., Portetelle D., Purnelle B., Puzos V., Ramezani Rad M., Rasmussen S.W., Remacha M.A., Revuelta J.L., Richard G.-F., Rieger M., Rodrigues-Pousada C., Rose M., Rupp T., Santos M.A., Schwager C., Sensen C., Skala J., Soares H., Sor F., Stegemann J., Tettelin H., Thierry A., Tzermia M., Urrestarazu L.A., van Dyck L., van Vliet-Reedijk J.C., Valens M., Vandenbol M., Vilela C., Vissers S., von Wettstein D., Voss H., Wiemann S., Xu G., Zimmermann J., Haasemann M., Becker I., Mewes H.-W.
    Nature 369:371-378(1994) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract]
    Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA].
    Strain: ATCC 204508 / S288c.
  3. Cited for: GENOME REANNOTATION.
    Strain: ATCC 204508 / S288c.
  4. "Disruption of mitotic spindle orientation in a yeast dynein mutant."
    Li Y.-Y., Yeh E.Y., Hays T., Bloom K.S.
    Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90:10096-10100(1993) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract]
    Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE OF 1-3457.
  5. Cited for: SUBCELLULAR LOCATION [LARGE SCALE ANALYSIS].
  6. Cited for: LEVEL OF PROTEIN EXPRESSION [LARGE SCALE ANALYSIS].
  7. "The offloading model for dynein function: differential function of motor subunits."
    Lee W.-L., Kaiser M.A., Cooper J.A.
    J. Cell Biol. 168:201-207(2005) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract]
    Cited for: FUNCTION, SUBCELLULAR LOCATION, INTERACTION WITH DYN3.

Entry informationi

Entry nameiDYHC_YEAST
AccessioniPrimary (citable) accession number: P36022
Secondary accession number(s): D6VXB5
Entry historyi
Integrated into UniProtKB/Swiss-Prot: June 1, 1994
Last sequence update: June 1, 1994
Last modified: July 9, 2014
This is version 126 of the entry and version 1 of the sequence. [Complete history]
Entry statusiReviewed (UniProtKB/Swiss-Prot)
Annotation programFungal Protein Annotation Program

Miscellaneousi

Miscellaneous

Present with 195 molecules/cell in log phase SD medium.

Keywords - Technical termi

3D-structure, Complete proteome, Reference proteome

Documents

  1. PDB cross-references
    Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references
  2. SIMILARITY comments
    Index of protein domains and families
  3. Yeast
    Yeast (Saccharomyces cerevisiae): entries, gene names and cross-references to SGD
  4. Yeast chromosome XI
    Yeast (Saccharomyces cerevisiae) chromosome XI: entries and gene names

External Data

Dasty 3

Similar proteinsi