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UniProtKB/Swiss-Prot P35244 (RFA3_HUMAN)
Last modified
June 16, 2009.
Version 82.
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Clusters with 100%,
90%,
50% identity |
Documents (3) |
Third-party data |
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Names and origin
| Protein names | Recommended name: Replication protein A 14 kDa subunit Short name=RP-A p14 Alternative name(s): Replication factor A protein 3 Short name=RF-A protein 3 | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 121 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is not processed. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | Required for DNA recombination, repair and replication. The activity of RP-A is mediated by single-stranded DNA binding and protein interactions. |
| Subunit structure | Heterotrimer of 70, 32 and 14 kDa chains. The DNA-binding activity may reside exclusively on the 70 kDa subunit. Interacts with RPA4. Ref.6 |
| Subcellular location |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | DNA replication |
| Cellular component | Nucleus |
| Technical term | 3D-structure |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | DNA replication Ref.1 Inferred from Experiment. Source: Reactome nucleotide-excision repair, DNA damage removalInferred from Experiment. Source: Reactome nucleotide-excision repair, DNA gap fillingInferred from Experiment. Source: Reactome |
| Cellular component | DNA replication factor A complex Ref.1 Traceable author statement. Source: ProtInc cytoplasmInferred from direct assay. Source: HPA nucleoplasmInferred from Experiment. Source: Reactome |
| Molecular function | single-stranded DNA binding Ref.1 Traceable author statement. Source: ProtInc |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 121 | 121 | Replication protein A 14 kDa subunit | PRO_0000097276 | |||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 4 – 6 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 10 – 12 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 14 – 19 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 24 – 34 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 38 – 44 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 50 – 54 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 65 – 73 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 79 – 86 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 90 – 92 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 96 – 108 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 110 – 112 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "Cloning, overexpression, and genomic mapping of the 14-kDa subunit of human replication protein A." Umbricht C.B., Kelly T.J. J. Biol. Chem. 268:6131-6138(1993) [PubMed: 8454588] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA]. |
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| [3] | NIEHS SNPs program Submitted (APR-2005) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA]. |
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| [5] | "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)." The MGC Project Team Genome Res. 14:2121-2127(2004) [PubMed: 15489334] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA]. Tissue: Kidney and Lung. |
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| [7] | Colinge J., Superti-Furga G., Bennett K.L. Submitted (OCT-2008) to UniProtKB Cited for: IDENTIFICATION [LARGE SCALE ANALYSIS], MASS SPECTROMETRY. |
| [8] | "Structure of the RPA trimerization core and its role in the multistep DNA-binding mechanism of RPA." Bochkareva E., Korolev S., Lees-Miller S.P., Bochkarev A. EMBO J. 21:1855-1863(2002) [PubMed: 11927569] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.8 ANGSTROMS) IN COMPLEX WITH RPA1 AND RPA2. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| L07493 mRNA. Translation: AAA58350.1. BT007320 mRNA. Translation: AAP35984.1. DQ003136 Genomic DNA. Translation: AAX84517.1. AC004948 Genomic DNA. Translation: AAQ96878.1. BC005264 mRNA. Translation: AAH05264.1. BC009868 mRNA. Translation: AAH09868.1. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IPI | IPI00017373. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | A46008. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_002938.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.487540 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DIP | DIP:24190N. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IntAct | P35244. 3 interactions. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PeptideAtlas | P35244. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | P35244. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENSG00000106399. Homo sapiens. [Contig view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 6119. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:6119. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | GC07M007643. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| H-InvDB | HIX0017394. HIX0057108. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:10291. RPA3. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HPA | HPA005708. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MIM | 179837. gene. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA29357. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | P35244. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | P35244. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OMA | P35244. TIMCASY. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Reactome | REACT_152. Cell Cycle, Mitotic. REACT_1538. Cell Cycle Checkpoints. REACT_216. DNA Repair. REACT_383. DNA Replication. REACT_7970. Telomere Maintenance. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | P35244. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Bgee | P35244. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_RPA3. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000106399. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR012340. NA-bd_OB-fold. IPR013970. Rep_factor-A_3. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:2.40.50.140. OB_NA_bd_sub. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF08661. Rep_fac-A_3. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Resources | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 23763. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | RFA3_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P35244 Secondary accession number(s): Q549U6 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HPI (Human Proteome Initiative) | ||||||||
Relevant documents
| Human chromosome 7 Human chromosome 7: entries, gene names and cross-references to MIM |
| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |

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