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UniProtKB/Swiss-Prot P35202 (THI80_YEAST)
Last modified
November 25, 2008.
Version 73.
History...
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90%,
50% identity |
Documents (4) |
Third-party data |
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Names and origin
| Protein names | Recommended name: Thiamine pyrophosphokinase Short name=TPK Short name=Thiamine kinase EC=2.7.6.2 | ||||||
| Gene names |
| ||||||
| Organism | Saccharomyces cerevisiae (Baker's yeast) [Complete proteome] | ||||||
| Taxonomic identifier | 4932 [NCBI] | ||||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Fungi › Dikarya › Ascomycota › Saccharomycotina › Saccharomycetes › Saccharomycetales › Saccharomycetaceae › Saccharomyces |
Protein attributes
| Sequence length | 319 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is not processed. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | Essential protein, it is the only enzyme in yeast capable of synthesizing thiamine pyrophosphate (TPP). |
| Catalytic activity | ATP + thiamine = AMP + thiamine diphosphate. |
| Pathway | |
| Subunit structure | Homodimer. |
| Induction | Expression requires the positive regulatory factors THI2 and THI3. Incompletely repressed by exogenous thiamine pyrophosphokinase. |
| Miscellaneous | Present with 3320 molecules/cell in log phase SD medium. |
| Sequence similarities | Belongs to the thiamine pyrophosphokinase family. |
Ontologies
Keywords | |
|---|---|
| Ligand | ATP-binding Nucleotide-binding |
| Molecular function | Kinase Transferase |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome |
Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | thiamin diphosphate biosynthetic process Ref.1 Inferred from electronic annotation. Source: InterPro thiamin metabolic processInferred from electronic annotation. Source: InterPro |
| Cellular component | cytoplasm Inferred from direct assay. Source: SGD |
| Molecular function | ATP binding Inferred from electronic annotation. Source: InterPro kinase activityInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW protein bindingInferred from physical interaction. Source: IntAct thiamin diphosphokinase activity Ref.1Inferred from electronic annotation. Source: InterPro |
| Complete GO annotation... | |
Binary interactions
With | Entry | #Exp. | IntAct | Notes |
|---|---|---|---|---|
| AUS1 | Q08409 | 1 | EBI-19195,EBI-35723 | |
| PRP40 | P33203 | 1 | EBI-19195,EBI-701 | |
| RSP5 | P39940 | 1 | EBI-19195,EBI-16219 | |
| SSM4 | P40318 | 1 | EBI-19195,EBI-18208 | |
| URN1 | Q06525 | 1 | EBI-19195,EBI-35138 |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 319 | 319 | Thiamine pyrophosphokinase | PRO_0000072513 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 4 – 7 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 10 – 12 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 23 – 27 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 28 – 30 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 37 – 43 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 52 – 61 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 63 – 68 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 71 – 78 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 83 – 86 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 92 – 96 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 103 – 111 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 115 – 118 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 122 – 124 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 126 – 139 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 141 – 147 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 153 – 155 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 156 – 158 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 161 – 163 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 164 – 173 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 178 – 180 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 184 – 195 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 196 – 212 | 17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 216 – 221 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 223 – 230 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 235 – 238 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 241 – 247 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 248 – 254 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 260 – 278 | 19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 279 – 282 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 285 – 288 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 292 – 302 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 304 – 310 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 312 – 315 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 316 – 318 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "Isolation and characterization of a thiamin pyrophosphokinase gene, THI80, from Saccharomyces cerevisiae." Nosaka K., Kaneko Y., Nishimura H., Iwashima A. J. Biol. Chem. 268:17440-17447(1993) [PubMed: 8394343] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA]. |
| [2] | "DNA sequencing and analysis of 130 kb from yeast chromosome XV." Voss H., Benes V., Andrade M.A., Valencia A., Rechmann S., Teodoru C., Schwager C., Paces V., Sander C., Ansorge W. Yeast 13:655-672(1997) [PubMed: 9200815] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA]. |
| [3] | "The nucleotide sequence of Saccharomyces cerevisiae chromosome XV." Dujon B., Albermann K., Aldea M., Alexandraki D., Ansorge W., Arino J., Benes V., Bohn C., Bolotin-Fukuhara M., Bordonne R., Boyer J., Camasses A., Casamayor A., Casas C., Cheret G., Cziepluch C., Daignan-Fornier B., Dang V.-D. Kleine K.Nature 387:98-102(1997) [PubMed: 9169874] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. Strain: ATCC 96604 / S288c / FY1679. |
| [4] | "Global analysis of protein expression in yeast." Ghaemmaghami S., Huh W.-K., Bower K., Howson R.W., Belle A., Dephoure N., O'Shea E.K., Weissman J.S. Nature 425:737-741(2003) [PubMed: 14562106] [Abstract] Cited for: LEVEL OF PROTEIN EXPRESSION [LARGE SCALE ANALYSIS]. |
| [5] | "The crystal structure of yeast thiamin pyrophosphokinase." Baker L.-J., Dorocke J.A., Harris R.A., Timm D.E. Structure 9:539-546(2001) [PubMed: 11435118] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (1.8 ANGSTROMS). |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| D14417 Genomic DNA. Translation: BAA03312.1. X94335 Genomic DNA. Translation: CAA64061.1. Z75051 Genomic DNA. Translation: CAA99346.1. | |||||||||||||
| PIR | A47499. | ||||||||||||
| RefSeq | NP_014786.1. | ||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||
| |||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||
| DIP | DIP:5324N. | ||||||||||||
| IntAct | P35202. | ||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||
| Ensembl | YOR143C. Saccharomyces cerevisiae. [Contig view] | ||||||||||||
| GeneID | 854314. | ||||||||||||
| GenomeReviews | Gene locus YOR143C in contig Y13140_GR. | ||||||||||||
| KEGG | sce:YOR143C. | ||||||||||||
| NMPDR | fig|4932.3.peg.5891. | ||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||
| CYGD | YOR143c. | ||||||||||||
| SGD | S000005669. THI80. | ||||||||||||
| Yeast-GFP | Search... | ||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||
| HOGENOM | P35202. | ||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||
| GermOnline | YOR143C. Saccharomyces cerevisiae. | ||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||
| InterPro | IPR006282. Thi_PPkinase. IPR016966. Thiamin_pyrophosphokinase_euk. IPR007373. TPK_B1_bd. IPR007371. TPK_catalytic. [Graphical view] | ||||||||||||
| Pfam | PF04265. TPK_B1_binding. 1 hit. PF04263. TPK_catalytic. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| PIRSF | PIRSF031057. Thiamin_pyrophosphokinase. 1 hit. | ||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR01378. thi_PPkinase. 1 hit. | ||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||
Other Resources | |||||||||||||
| DrugBank | DB00152. Thiamine. | ||||||||||||
| LinkHub | P35202. | ||||||||||||
| NextBio | 976339. | ||||||||||||
Entry information
| Entry name | THI80_YEAST | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P35202 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | FPAP (Fungal Proteome Annotation Project) | ||||||||
Relevant documents
| PATHWAY comments Index of metabolic and biosynthesis pathways |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |
| Yeast Yeast (Saccharomyces cerevisiae): entries, gene names and cross-references to SGD |

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