##gff-version 3
P33076	UniProtKB	Chain	1	1130	.	.	.	ID=PRO_0000089241;Note=MHC class II transactivator	
P33076	UniProtKB	Domain	414	724	.	.	.	Note=NACHT;Ontology_term=ECO:0000255;evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00136	
P33076	UniProtKB	Repeat	985	1008	.	.	.	Note=LRR 1	
P33076	UniProtKB	Repeat	1016	1037	.	.	.	Note=LRR 2	
P33076	UniProtKB	Repeat	1045	1066	.	.	.	Note=LRR 3	
P33076	UniProtKB	Repeat	1073	1093	.	.	.	Note=LRR 4	
P33076	UniProtKB	Region	94	132	.	.	.	Note=Required for acetyltransferase activity;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:11172716;Dbxref=PMID:11172716	
P33076	UniProtKB	Region	269	303	.	.	.	Note=Disordered;Ontology_term=ECO:0000256;evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	
P33076	UniProtKB	Compositional bias	280	294	.	.	.	Note=Polar residues;Ontology_term=ECO:0000256;evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	
P33076	UniProtKB	Binding site	420	427	.	.	.	Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:11172716;Dbxref=PMID:11172716	
P33076	UniProtKB	Alternative sequence	161	210	.	.	.	ID=VSP_055099;Note=In isoform 2 and isoform 3. AEPPTVVTGSLLVRPVSDCSTLPCLPLPALFNQEPASGQMRLEKTDQIPM->V;Ontology_term=ECO:0000303,ECO:0000303;evidence=ECO:0000303|PubMed:12919287,ECO:0000303|PubMed:7749984;Dbxref=PMID:12919287,PMID:7749984	
P33076	UniProtKB	Alternative sequence	336	350	.	.	.	ID=VSP_055100;Note=In isoform 3. EPVEQFYRSLQDTYG->GLAWSPCLGLRPSLH;Ontology_term=ECO:0000303;evidence=ECO:0000303|PubMed:12919287;Dbxref=PMID:12919287	
P33076	UniProtKB	Alternative sequence	351	885	.	.	.	ID=VSP_055101;Note=In isoform 3. Missing;Ontology_term=ECO:0000303;evidence=ECO:0000303|PubMed:12919287;Dbxref=PMID:12919287	
P33076	UniProtKB	Alternative sequence	887	930	.	.	.	ID=VSP_055102;Note=In isoform 2 and isoform 4. AALSDTVALWESLQQHGETKLLQAAEEKFTIEPFKAKSLKDVED->WGEGLGRDILVLGINCGLGAKPSALWGPFSMQSSRVGQNGFSPF;Ontology_term=ECO:0000303,ECO:0000303;evidence=ECO:0000303|PubMed:12859996,ECO:0000303|PubMed:7749984;Dbxref=PMID:12859996,PMID:7749984	
P33076	UniProtKB	Alternative sequence	931	1128	.	.	.	ID=VSP_055103;Note=In isoform 2 and isoform 4. Missing;Ontology_term=ECO:0000303,ECO:0000303;evidence=ECO:0000303|PubMed:12859996,ECO:0000303|PubMed:7749984;Dbxref=PMID:12859996,PMID:7749984	
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P33076	UniProtKB	Natural variant	174	174	.	.	.	ID=VAR_047907;Note=R->G;Ontology_term=ECO:0000269,ECO:0000269,ECO:0000269,ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:12859996,ECO:0000269|PubMed:7749984,ECO:0000269|PubMed:8402893,ECO:0000269|Ref.5;Dbxref=dbSNP:rs8046121,PMID:12859996,PMID:7749984,PMID:8402893	
P33076	UniProtKB	Natural variant	469	469	.	.	.	ID=VAR_015551;Note=In BLS2%3B mild immunodeficiency%3B has residual MHC class II trans activation activity. L->P;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:11466404;Dbxref=PMID:11466404	
P33076	UniProtKB	Natural variant	500	500	.	.	.	ID=VAR_005128;Note=G->A;Ontology_term=ECO:0000269,ECO:0000269,ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:12859996,ECO:0000269|PubMed:7749984,ECO:0000269|PubMed:8402893;Dbxref=dbSNP:rs4774,PMID:12859996,PMID:7749984,PMID:8402893	
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P33076	UniProtKB	Natural variant	900	900	.	.	.	ID=VAR_047908;Note=Q->R;Ontology_term=ECO:0000269,ECO:0000269,ECO:0000269,ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:12919287,ECO:0000269|PubMed:7749984,ECO:0000269|PubMed:8402893,ECO:0000269|Ref.5;Dbxref=dbSNP:rs7197779,PMID:12919287,PMID:7749984,PMID:8402893	
P33076	UniProtKB	Natural variant	940	963	.	.	.	ID=VAR_005129;Note=In BLS2. Missing;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:8402893;Dbxref=PMID:8402893	
P33076	UniProtKB	Natural variant	962	962	.	.	.	ID=VAR_015553;Note=In BLS2. F->S;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:10501838;Dbxref=PMID:10501838	
P33076	UniProtKB	Natural variant	964	991	.	.	.	ID=VAR_015554;Note=In BLS2. Missing	
P33076	UniProtKB	Natural variant	1027	1027	.	.	.	ID=VAR_015555;Note=In BLS2. Missing;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:11862382;Dbxref=PMID:11862382	
P33076	UniProtKB	Mutagenesis	420	421	.	.	.	Note=Strongly reduces GTP-binding and abolishes transactivation at MHC promoters. Missing;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:10464099;Dbxref=PMID:10464099	
P33076	UniProtKB	Mutagenesis	561	561	.	.	.	Note=Strongly reduces GTP-binding and abolishes transactivation at MHC promoters. D->A;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:10464099;Dbxref=PMID:10464099	
P33076	UniProtKB	Sequence conflict	1020	1021	.	.	.	Note=LN->RS;Ontology_term=ECO:0000305;evidence=ECO:0000305