P32754 (HPPD_HUMAN) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
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January 25, 2012.
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| Protein names | Recommended name: 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase EC=1.13.11.27 Alternative name(s): 4-hydroxyphenylpyruvic acid oxidase Short name=4HPPD Short name=HPD Short name=HPPDase | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 393 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Key enzyme in the degradation of tyrosine. |
| Catalytic activity | 4-hydroxyphenylpyruvate + O2 = homogentisate + CO2. |
| Cofactor | Binds 1 iron ion per subunit By similarity. |
| Pathway | |
| Subunit structure | Homodimer. |
| Involvement in disease | Defects in HPD are the cause of tyrosinemia type 3 (TYRO3) [MIM:276710]. TYRO3 is an inborn error of metabolism characterized by elevations of tyrosine in the blood and urine, seizures and mild mental retardation. Ref.8 Ref.9 Defects in HPD are a cause of hawkinsinuria (HAWK) [MIM:140350]. HAWK is an inborn error of tyrosine metabolism characterized by failure to thrive, persistent metabolic acidosis, fine and sparse hair, and excretion of the unusual cyclic amino acid metabolite, hawkinsin, in the urine. Ref.9 |
| Sequence similarities | Belongs to the 4HPPD family. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Phenylalanine catabolism Tyrosine catabolism |
| Coding sequence diversity | Polymorphism |
| Disease | Disease mutation Mental retardation |
| Ligand | Iron Metal-binding |
| Molecular function | Dioxygenase Oxidoreductase |
| PTM | Acetylation Phosphoprotein |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | L-phenylalanine catabolic process Traceable author statement. Source: Reactome tyrosine catabolic processInferred from sequence or structural similarity. Source: UniProtKB |
| Cellular component | cytosol Traceable author statement. Source: Reactome |
| Molecular function | 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase activity Inferred from sequence or structural similarity. Source: UniProtKB metal ion bindingInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Initiator methionine | 1 | 1 | Removed By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 2 – 393 | 392 | 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase | PRO_0000088388 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 183 | 1 | Iron Probable | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 266 | 1 | Iron Probable | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 349 | 1 | Iron Probable | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 2 | 1 | N-acetylthreonine By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 250 | 1 | Phosphoserine By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 33 | 1 | A → T in two patients with hawkinsinuria. Ref.8 Ref.9 Corresponds to variant rs1154510 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_015444 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 113 | 1 | R → Q. Corresponds to variant rs11833399 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_048101 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 160 | 1 | Y → C in TYRO3. Ref.8 Corresponds to variant rs28934278 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_015445 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 267 | 1 | I → F. Ref.8 | VAR_015446 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 268 | 1 | A → V in TYRO3. Ref.9 | VAR_015447 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 335 | 1 | I → M in TYRO3. Ref.8 | VAR_015448 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 340 | 1 | V → L. Ref.8 Corresponds to variant rs36023382 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_015449 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 162 | 1 | A → P in AAC73008. Ref.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 16 – 25 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 29 – 39 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 43 – 48 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 56 – 63 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 68 – 76 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 85 – 88 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 95 – 101 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 103 – 112 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 117 – 124 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 131 – 137 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 143 – 151 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 170 – 172 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 178 – 185 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 193 – 204 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 207 – 212 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 214 – 216 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 223 – 230 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 237 – 244 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 251 – 258 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 266 – 272 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 274 – 283 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 293 – 303 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 314 – 320 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 323 – 325 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 332 – 337 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 340 – 344 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 347 – 355 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 364 – 377 | 14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
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| + | Additional computationally mapped references. |
Web resources
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | D31628 Genomic DNA. Translation: BAA06498.1. X72389 mRNA. Translation: CAA51082.1. U29895 Genomic DNA. Translation: AAC73008.1. AK290826 mRNA. Translation: BAF83515.1. CH471054 Genomic DNA. Translation: EAW98292.1. BC024287 mRNA. Translation: AAH24287.1. | ||||||||||||
| IPI | IPI00218297. | ||||||||||||
| PIR | S32458. | ||||||||||||
| RefSeq | NP_001165464.1. NM_001171993.1. NP_002141.1. NM_002150.2. | ||||||||||||
| UniGene | Hs.2899. | ||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||
| ProteinModelPortal | P32754. | ||||||||||||
| SMR | P32754. Positions 9-384. | ||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||
| IntAct | P32754. 4 interactions. | ||||||||||||
| STRING | P32754. | ||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||
| PhosphoSite | P32754. | ||||||||||||
Polymorphism databases | |||||||||||||
| DMDM | 417144. | ||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||
| PRIDE | P32754. | ||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||
| Ensembl | ENST00000289004; ENSP00000289004; ENSG00000158104. | ||||||||||||
| GeneID | 3242. | ||||||||||||
| KEGG | hsa:3242. | ||||||||||||
| UCSC | uc001ubj.1. human. | ||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||
| CTD | 3242. | ||||||||||||
| GeneCards | GC12M122277. | ||||||||||||
| H-InvDB | HIX0011091. | ||||||||||||
| HGNC | HGNC:5147. HPD. | ||||||||||||
| HPA | HPA038322. | ||||||||||||
| MIM | 140350. phenotype. 276710. phenotype. 609695. gene. | ||||||||||||
| neXtProt | NX_P32754. | ||||||||||||
| Orphanet | 2118. Hawkinsinuria. 69723. Tyrosinemia type 3. | ||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||
| eggNOG | prNOG17767. | ||||||||||||
| GeneTree | ENSGT00530000063474. | ||||||||||||
| HOGENOM | HBG680392. | ||||||||||||
| HOVERGEN | HBG005987. | ||||||||||||
| InParanoid | P32754. | ||||||||||||
| OrthoDB | EOG4Q58PF. | ||||||||||||
| PhylomeDB | P32754. | ||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||
| BioCyc | MetaCyc:MONOMER-12030. | ||||||||||||
| Reactome | REACT_111217. Metabolism. | ||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||
| ArrayExpress | P32754. | ||||||||||||
| Bgee | P32754. | ||||||||||||
| CleanEx | HS_HPD. | ||||||||||||
| Genevestigator | P32754. | ||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000158104. Homo sapiens. | ||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||
| InterPro | IPR005956. 4OHPhenylPyrv_dOase. IPR004360. Glyas_Fos-R_dOase. [Graphical view] | ||||||||||||
| KO | K00457. | ||||||||||||
| PANTHER | PTHR11959. HPP_dOase. 1 hit. | ||||||||||||
| Pfam | PF00903. Glyoxalase. 2 hits. [Graphical view] | ||||||||||||
| PIRSF | PIRSF009283. HPP_dOase. 1 hit. | ||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR01263. 4HPPD. 1 hit. | ||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||
Other | |||||||||||||
| DrugBank | DB00348. Nitisinone. | ||||||||||||
| NextBio | 12905. | ||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||
Entry information
| Entry name | HPPD_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P32754 Secondary accession number(s): A8K461, Q13234 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Chordata Protein Annotation Program | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
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