P30750 (METN_ECOLI) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
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May 1, 2013.
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| Protein names | Recommended name: Methionine import ATP-binding protein MetN EC=3.6.3.- | ||||||
| Gene names |
| ||||||
| Organism | Escherichia coli (strain K12) [Reference proteome] [HAMAP] | ||||||
| Taxonomic identifier | 83333 [NCBI] | ||||||
| Taxonomic lineage | Bacteria › Proteobacteria › Gammaproteobacteria › Enterobacteriales › Enterobacteriaceae › Escherichia › ![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 343 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Part of the ABC transporter complex MetNIQ involved in methionine import. Responsible for energy coupling to the transport system Probable. It has also been shown to be involved in formyl-L-methionine transport. Ref.7 Ref.8 |
| Subunit structure | The complex is composed of two ATP-binding proteins (MetN), two transmembrane proteins (MetI) and a solute-binding protein (MetQ) Potential. |
| Subcellular location | Cell inner membrane; Peripheral membrane protein By similarity. |
| Sequence similarities | Belongs to the ABC transporter superfamily. Methionine importer (TC 3.A.1.24) family. [View classification] Contains 1 ABC transporter domain. |
| Sequence caution | The sequence AAC36869.1 differs from that shown. Reason: Frameshift at position 200. The sequence BAA03659.1 differs from that shown. Reason: Frameshift at positions 106 and 156. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Amino-acid transport Transport |
| Cellular component | Cell inner membrane Cell membrane Membrane |
| Ligand | ATP-binding Nucleotide-binding |
| Molecular function | Hydrolase |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Cellular_component | Gram-negative-bacterium-type cell wall Inferred from electronic annotation. Source: InterPro plasma membraneInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-SubCell |
| Molecular_function | ATP binding Inferred from direct assay PubMed 18621668. Source: EcoliWiki ATPase activityInferred from direct assay PubMed 18621668. Source: EcoliWiki D-methionine transmembrane transporter activityInferred from direct assay PubMed 18621668. Source: EcoliWiki |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 343 | 343 | Methionine import ATP-binding protein MetN | PRO_0000092503 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 2 – 241 | 240 | ABC transporter | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 38 – 45 | 8 | ATP Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 165 | 1 | D → V in AAC36869. Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 2 – 12 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 14 – 28 | 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 33 – 37 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 44 – 51 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 58 – 64 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 74 – 81 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 84 – 87 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 99 – 109 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 114 – 127 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 131 – 133 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 138 – 140 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 143 – 154 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 155 – 157 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 160 – 166 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 167 – 170 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 173 – 189 | 17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 193 – 199 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 201 – 207 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 209 – 215 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 218 – 221 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 225 – 229 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 235 – 244 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 251 – 256 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 258 – 260 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 265 – 276 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 278 – 280 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 282 – 289 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 293 – 304 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 307 – 318 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 320 – 332 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 336 – 343 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "Nucleotide sequence of 5'flanking region of the ribosomal RNA gene (rrnH) in E. coli." Miyamoto K., Inokuchi H. Submitted (APR-1993) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA]. Strain: K12. |
| [2] | "Systematic sequencing of the Escherichia coli genome: analysis of the 4.0 - 6.0 min (189,987 - 281,416bp) region." Takemoto K., Mori H., Murayama N., Kataoka K., Yano M., Itoh T., Yamamoto Y., Inokuchi H., Miki T., Hatada E., Fukuda R., Ichihara S., Mizuno T., Makino K., Nakata A., Yura T., Sampei G., Mizobuchi K. Submitted (FEB-1996) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. Strain: K12 / W3110 / ATCC 27325 / DSM 5911. |
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| [6] | "Cloning and organization of the abc and mdl genes of Escherichia coli: relationship to eukaryotic multidrug resistance." Allikmets R., Gerrard B.C., Court D., Dean M.C. Gene 136:231-236(1993) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA] OF 1-231. Strain: TAP90 / ATCC 47037. |
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| [8] | "A transporter of Escherichia coli specific for L- and D-methionine is the prototype for a new family within the ABC superfamily." Zhang Z., Feige J.N., Chang A.B., Anderson I.J., Brodianski V.M., Vitreschak A.G., Gelfand M.S., Saier M.H. Jr. Arch. Microbiol. 180:88-100(2003) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: FUNCTION IN METHIONINE AND FORMYL-L-METHIONINE TRANSPORT. Strain: K12. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | D15061 Genomic DNA. Translation: BAA03659.1. Frameshift. U70214 Genomic DNA. Translation: AAB08627.1. U00096 Genomic DNA. Translation: AAC73310.1. AP009048 Genomic DNA. Translation: BAA77876.2. L08626 Unassigned DNA. Translation: AAC36869.1. Frameshift. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | G64744. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_414741.1. NC_000913.2. YP_488502.1. NC_007779.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | P30750. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMR | P30750. Positions 1-343. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DIP | DIP-9027N. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IntAct | P30750. 16 interactions. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MINT | MINT-1223626. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| STRING | 511145.b0199. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein family/group databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TCDB | 3.A.1.24.1. ATP-binding cassette (ABC) superfamily. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PaxDb | P30750. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| EnsemblBacteria | AAC73310; AAC73310; b0199. BAA77876; BAA77876; BAA77876. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 12930761. 944896. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | ecj:Y75_p0196. eco:b0199. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PATRIC | 32115511. VBIEscCol129921_0207. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| EchoBASE | EB1578. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| EcoGene | EG11621. metN. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| eggNOG | COG1135. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KO | K02071. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OMA | VNMLEAP. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtClustDB | PRK11153. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BioCyc | EcoCyc:ABC-MONOMER. ECOL316407:JW0195-MONOMER. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genevestigator | P30750. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR003593. AAA+_ATPase. IPR026253. ABC_MetN. IPR012692. ABC_MetN_proteobac. IPR003439. ABC_transporter-like. IPR017871. ABC_transporter_CS. IPR017908. ABC_transprt_methionine_MetN_C. IPR018449. NIL_domain. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PANTHER | PTHR24220:SF186. PTHR24220:SF186. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF00005. ABC_tran. 1 hit. PF09383. NIL. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMART | SM00382. AAA. 1 hit. SM00930. NIL. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR02314. ABC_MetN. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS00211. ABC_TRANSPORTER_1. 1 hit. PS50893. ABC_TRANSPORTER_2. 1 hit. PS51264. METN. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| EvolutionaryTrace | P30750. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | METN_ECOLI | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: P30750 Secondary accession number(s): P77517, Q47615 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Prokaryotic Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| Escherichia coli Escherichia coli (strain K12): entries and cross-references to EcoGene |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with
